Biochemistry · 3/6
P/O比の実験的決定
Experimental determination of the P/O ratio — P I
🧠 実習は「単離ミトコンドリアの酸素消費を酸素電極で追い、ADPを加えたときの反応から呼吸調節acceptor / respiratory control呼吸調節(acceptor / respiratory control)acceptor / respiratory control(呼吸調節)とP/O比を測る」と読む。 クラーク型酸素電極Clark-type oxygen electrodeクラーク型酸素電極(Clark-type oxygen electrode)Clark-type oxygen electrode(クラーク型酸素電極)で酸素消費速度を記録。ADP添加で呼吸が加速(呼吸調節acceptor / respiratory control呼吸調節(acceptor / respiratory control)acceptor / respiratory control(呼吸調節))し、消費した酸素と合成したATPの比からP/O比を求める。阻害薬・脱共役剤uncoupler脱共役剤(uncoupler)uncoupler(脱共役剤)で共役の仕組みを実証する。
原理:化学浸透説
化学浸透説chemiosmotic theory化学浸透説(chemiosmotic theory)chemiosmotic theory(化学浸透説)によれば、呼吸基質の酸化・ADPのリン酸化・イオン輸送は、すべてプロトン濃度勾配proton gradientプロトン濃度勾配(proton gradient)proton gradient(プロトン濃度勾配)を共通の中間体として共役している。呼吸鎖respiratory chain呼吸鎖(respiratory chain)respiratory chain(呼吸鎖)の酸化還元oxidoreduction (redox)酸化還元(oxidoreduction (redox))oxidoreduction (redox)(酸化還元)反応が生む自由エネルギーfree energy自由エネルギー(free energy)free energy(自由エネルギー)で、H⁺をマトリックスから膜間腔intermembrane space膜間腔(intermembrane space)intermembrane space(膜間腔)へ輸送し、プロトン駆動力proton motive forceプロトン駆動力(proton motive force)proton motive force(プロトン駆動力)(proton motive force = ΔpH と膜電位ΔEₘ の和)を作る。1 mol ADP→ATPのリン酸化で約2 mol H⁺がマトリックスへ戻る。
呼吸調節とP/O比
無傷のミトコンドリアが呼吸基質を酸化しADPをリン酸化するとき、酸素消費速度とATP合成量の両方を測れる。
- 呼吸調節acceptor / respiratory control呼吸調節(acceptor / respiratory control)acceptor / respiratory control(呼吸調節): 至適条件(飽和基質・Pi・O₂・中性pH)での基質酸化速度は、ADPの有無だけに依存する。ADPが呼吸を加速する。
- 呼吸調節比respiratory control ratio (RCR)呼吸調節比(respiratory control ratio (RCR))respiratory control ratio (RCR)(呼吸調節比)= v(+ADP) / v(−ADP)。 呼吸とATP合成の共役の良さを表す。
- P/O比 = 合成された[³²P]-ATP / 消費された酸素原子。 ³²Pの取り込みと酸素消費を同時記録して算出する。基質が電子伝達系electron transport chain電子伝達系(electron transport chain)electron transport chain(電子伝達系)に入る位置(NADH vs FADH₂連結)で値が異なる。
flowchart TD
A["ミトコンドリア+基質(酸素消費なし)"]
A --> B["ADP添加 → <span class='jp-term jp-term-diagram' title='State 3'>呼吸加速</span>"]
B --> C["ADP枯渇 → <span class='jp-term jp-term-diagram' title='State 4'>呼吸減速</span>"]
C --> D["消費O₂とATP合成量から P/O比"]
B --> E["RCR = v(+ADP)/v(−ADP)"]
阻害薬・脱共役剤の効果
各薬剤の効果を酸素電極で観察し、共役の仕組みを実証する。
| 薬剤 | 作用 | 呼吸への効果 |
|---|---|---|
| 脱共役剤uncoupler脱共役剤(uncoupler)uncoupler(脱共役剤) | プロトンを漏らす | RC・P/O低下、ADPなしでも呼吸速いがATP合成なし |
| オリゴマイシンoligomycinオリゴマイシン(oligomycin)oligomycin(オリゴマイシン) | ATP合成酵素ATP synthaseATP合成酵素(ATP synthase)ATP synthase(ATP合成酵素)阻害 | 呼吸も抑制(勾配が限界に達する)。DNP添加で呼吸再開 |
| カルボキシアトラクチロシドcarboxyatractylosideカルボキシアトラクチロシド(carboxyatractyloside)carboxyatractyloside(カルボキシアトラクチロシド) | ANT(ADP/ATP輸送体)阻害 | 呼吸抑制(駆動力driving force駆動力(driving force)driving force(駆動力)は高いまま)。DNPで再開 |
| 呼吸鎖阻害薬respiratory chain inhibitor呼吸鎖阻害薬(respiratory chain inhibitor)respiratory chain inhibitor(呼吸鎖阻害薬)(KCN, マロン酸malonateマロン酸(malonate)malonate(マロン酸)など) | 特定部位を遮断 | 酸素消費停止。ADPやDNPを加えても再開しない |
⚠️ 「再開するかどうか」で作用点target作用点(target)target(作用点)が分かる。 脱共役剤uncoupler脱共役剤(uncoupler)uncoupler(脱共役剤)やANT阻害では、駆動力driving force駆動力(driving force)driving force(駆動力)/電子伝達electron transport電子伝達(electron transport)electron transport(電子伝達)自体は生きているので、うまく操作すれば呼吸が戻る。呼吸鎖respiratory chain呼吸鎖(respiratory chain)respiratory chain(呼吸鎖)そのものの阻害(KCN=複合体IV、マロン酸malonateマロン酸(malonate)malonate(マロン酸)=複合体II)では電子が流れず、ADPや脱共役剤uncoupler脱共役剤(uncoupler)uncoupler(脱共役剤)を加えても呼吸は戻らない。阻害薬より下流はすべて酸化型、上流はすべて還元型になる。
クラーク型酸素電極
溶存酸素を電気化学的に測る装置。
- 構成: 参照電極(銀/塩化銀)と白金電極(負極)を飽和KCl中に置き、ポリエチレン膜で反応液と隔てる。
- 原理: 一定の分極電圧(0.6 V)をかけると、膜を通った酸素が白金電極で電解還元され、電流が酸素濃度に比例する(拡散律速diffusion-limited拡散律速(diffusion-limited)diffusion-limited(拡散律速)電流のプラトーplateauプラトー(plateau)plateau(プラトー)領域を利用)。
- 反応槽は恒温・撹拌し、気泡air bubble気泡(air bubble)air bubble(気泡)を入れない。ジチオナイトdithioniteジチオナイト(dithionite)dithionite(ジチオナイト)添加で酸素ゼロ点を校正proofreading校正(proofreading)proofreading(校正)する。
実験の流れ
- 反応液KCl/Tris/EGTA/KH₂PO₄, pH 7.2反応液(KCl/Tris/EGTA/KH₂PO₄, pH 7.2)KCl/Tris/EGTA/KH₂PO₄, pH 7.2(反応液)に基質(グルタミン酸+リンゴ酸malateリンゴ酸(malate)malate(リンゴ酸)、またはコハク酸succinic acidコハク酸(succinic acid)succinic acid(コハク酸))を加える。
- ラットratラット(rat)rat(ラット)肝から単離したミトコンドリアを添加、呼吸速度(傾き)を記録。
- 既知量のADPを添加し、加速した酸素消費を記録 → 消費O₂とADP量からP/O(ADP/O)比を算出。
- オリゴマイシンoligomycinオリゴマイシン(oligomycin)oligomycin(オリゴマイシン)・DNP・KCN・カルボキシアトラクチロシドcarboxyatractylosideカルボキシアトラクチロシド(carboxyatractyloside)carboxyatractyloside(カルボキシアトラクチロシド)・マロン酸malonateマロン酸(malonate)malonate(マロン酸)を順に加え、効果を観察。
まとめ
- 化学浸透説chemiosmotic theory化学浸透説(chemiosmotic theory)chemiosmotic theory(化学浸透説):酸化・リン酸化・イオン輸送はプロトン駆動力proton motive forceプロトン駆動力(proton motive force)proton motive force(プロトン駆動力)を共通中間体として共役。
- 単離ミトコンドリアの酸素消費をクラーク型酸素電極Clark-type oxygen electrodeクラーク型酸素電極(Clark-type oxygen electrode)Clark-type oxygen electrode(クラーク型酸素電極)で追う。ADPが呼吸を加速(呼吸調節acceptor / respiratory control呼吸調節(acceptor / respiratory control)acceptor / respiratory control(呼吸調節))。
- RCR=v(+ADP)/v(−ADP)、P/O比=合成ATP/消費酸素原子。基質の入る位置で値が異なる。
- DNP(脱共役uncoupling脱共役(uncoupling)uncoupling(脱共役))・オリゴマイシンoligomycinオリゴマイシン(oligomycin)oligomycin(オリゴマイシン)(ATP合成酵素ATP synthaseATP合成酵素(ATP synthase)ATP synthase(ATP合成酵素))・アトラクチロシドatractyloside (ANT inhibitor)アトラクチロシド(atractyloside (ANT inhibitor))atractyloside (ANT inhibitor)(アトラクチロシド)・KCN/マロン酸malonateマロン酸(malonate)malonate(マロン酸)(呼吸鎖respiratory chain呼吸鎖(respiratory chain)respiratory chain(呼吸鎖))で共役を実証。
- 呼吸鎖respiratory chain呼吸鎖(respiratory chain)respiratory chain(呼吸鎖)阻害ではADP・脱共役剤uncoupler脱共役剤(uncoupler)uncoupler(脱共役剤)を加えても呼吸は戻らない。