Molecular Cell Biology

Molecular Cell Biology · 68

小胞体におけるタンパク質品質管理;ミスフォールドタンパク質の運命;ERAD

Protein quality control in the endoplasmic reticulum; the fate of misfolded proteins; ERAD

🧠 ERのは「を時計として使う」という発想で成り立っている——N結合型からグルコースを1つずつ削っては足す/のサイクルが、タンパク質が/に「まだ折り畳み中」として留め置かれる期間を決め、さらに遅い除去が「もう十分待った、諦めろ」という最終タイマーとして働く。 をくぐり抜けられなかったタンパク質(実に最大80%にも上る)はERAD複合体によって細胞質側へ引き戻され、E3によってタグ付けされプロテアソームで分解される——ERの中で完結しない「してから壊す」という一風変わった分解戦略である。

ERにおけるタンパク質フォールディング制御

ERは脂質とタンパク質のの両方において中心的役割を果たす:

  • いくつかの機構がタンパク質の適切なプロセシングと折り畳みを保証するために機能する
  • 折り畳まれていない/誤って折り畳まれたタンパク質はER内に留め置かれ、ER関連分解により分解される
  • 折り畳まれていないタンパク質がER内に蓄積すると、はERとERAD機構の構成要素の発現を上方調節し、折り畳みと分解の能力を高める——保護機構であるUPR(unfolded protein response)を通じて(67-endoplasmic-reticulum-stress-connection-between-the-unfolded-protein-response参照)

rERで合成される+可溶性分泌タンパク質は、最終目的地に到達する前に4つの主要な修飾を受ける:

  1. 炭水化物の共有結合的付加+プロセシング():ER・ゴルジ複合体で
  2. ER内でのの形成:ER内の酸化的環境がによる遊離(SH)基の酸化を介した(S-S)形成を触媒することを可能にする
  3. ER内でのポリペプチド鎖の適切な折り畳みと多サブユニットタンパク質の組み立て
  4. ER、ゴルジ、分泌小胞での質分解性切断

グリコシル化

タンパク質へのの共有結合的付加はERの主要な機能であり——タンパク質のにおいて重要である。

前駆体(2つのN-、9つの、3つのグルコースから構成される)があらかじめ形成されタンパク質へ転移される。このはタンパク質中の残基の側鎖NH2基へ転移されるため、N結合型として知られる。

  • この転移は酵素複合体であるにより触媒される
  • 特殊な脂質分子であるが前駆体を膜内に係留する
  • 前駆体は、そのアミノ酸がの間にER内腔に到達した直後、単一の酵素段階で標的へ転移される
  • 前駆体脂質に高エネルギー結合により連結されており、これが反応を駆動するを提供する
  • 前駆体糖の組み立ては最初ERの細胞質側表面で形成され、その後この糖中間体が反転してER内腔に位置するようになる

はタンパク質成熟の次の段階にとって決定的である。糖質部分と相互作用することで、の過程が開始されうる→機構として働く。

フォールディング:カルネキシンとカルレティキュリン

ERタンパク質であるは、いずれも活性化にCa²⁺を要する。これらのは炭水化物結合タンパク質()であり、不完全に折り畳まれたタンパク質上のに結合しこれらをER内に留める。これによって不完全に折り畳まれたタンパク質が不可逆的に凝集するのを防ぐ。

  • は末端に単一のグルコースを含むN結合型を認識する。したがって、前駆体上の3つのグルコースのうち2つがERによる「グルコーストリミング」で除去された後にのみ、これらのタンパク質に結合する
  • 別のERタンパク質であるは誤って折り畳まれたタンパク質を区別でき、最後のグルコースを失ったにグルコースを付加し続ける。これは折り畳まれていないタンパク質に結合したにのみグルコースを付加する
  • したがって、折り畳まれていないタンパク質は(による)グルコーストリミングと(による)グルコース付加の連続したサイクルを経て、完全に折り畳まれた状態に達するまでへの親和性を維持する=ERのタンパク質

の機構は、タンパク質成熟過程における最も重要な機構の1つと考えられている。

flowchart TD
  A["前駆体<span class='jp-term jp-term-diagram' title='oligosaccharide'>オリゴ糖</span>がAsn残基へ転移(N結合型<span class='jp-term jp-term-diagram' title='glycosylation'>グリコシル化</span>)"] --> B["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='glucosidase'>グルコシダーゼ</span>によるグルコーストリミング(3→1個)"]
  B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='calnexin'>カルネキシン</span>/<span class='jp-term jp-term-diagram' title='calreticulin'>カルレティキュリン</span>が単一末端グルコースを認識し結合"]
  C --> D{"タンパク質は正しく折り畳まれたか?"}
  D -->|"未完成"| E["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='glucosyltransferase'>グルコシルトランスフェラーゼ</span>がグルコースを再付加"]
  E --> C
  D -->|"完成"| F["ERを退出しゴルジへ"]

機構との助けにもかかわらず、ERへ転位されるタンパク質の多く(一部の型では最大80%)は、適切に折り畳まれた状態あるいはオリゴマー状態を達成できない。このようなタンパク質はERから細胞質へ戻して輸出され、そこでされプロテアソームで分解される。

(プロテアソームは内(細胞質+核に局在)のタンパク質複合体であり、不要または損傷したタンパク質を(ペプチド結合の加水分解)により分解する責任を持つ。ユビキチンタグは、タンパク質をプロテアソームでの破壊の標的としてマークする識別特徴として働く。31-structure-and-function-of-the-proteasome-role-of-immune-proteasome-and-tap参照)

ER関連分解

誤って折り畳まれたタンパク質は、ER膜を通じた逆行性輸送を受けて細胞質へ移り、そこでポリを受ける。少なくとも4つのからなる複合体(ERAD複合体として知られる)がこの輸送を媒介する。

  • この複合体はE3を含み、これが折り畳まれていないタンパク質が細胞質へ出てくる際にポリタグを付加する
  • この過程はATP加水分解によって駆動され、AAA-ATPaseファミリーのATPaseにより媒介される——これが未折り畳みタンパク質をを通じて細胞質へ引き込む

誤って折り畳まれたタンパク質や組み立てられていないタンパク質サブユニットは分解されるべきだが、新規合成タンパク質の折り畳み途中の中間体は分解されるべきではない。

  • この2つを区別するため、N結合型が用いられ、タンパク質がERにどれだけの時間を費やしたかを測定する「タイマー」として機能する
  • ER内の酵素()によるコアツリー上の特定のの緩やかなトリミングが、ERAD複合体が認識する新しい構造を作り出す

→ タンパク質は転位され、され、脱される→分解される。

flowchart TD
  A["ERに長期間留まったタンパク質:<span class='jp-term jp-term-diagram' title='mannosidase'>マンノシダーゼ</span>による緩やかな<span class='jp-term jp-term-diagram' title='mannose'>マンノース</span>除去"] --> B["ERAD複合体が新しい<span class='jp-term jp-term-diagram' title='oligosaccharide'>オリゴ糖</span>構造を認識"]
  B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='chaperone'>シャペロン</span>に結合した誤折り畳みタンパク質がER<span class='jp-term jp-term-diagram' title='translocator'>トランスロケーター</span>を通じて細胞質へ転位"]
  C --> D["N-グリカナーゼがN結合型<span class='jp-term jp-term-diagram' title='glycan (sugar chain)'>糖鎖</span>を除去(脱<span class='jp-term jp-term-diagram' title='glycosylation'>グリコシル化</span>)"]
  D --> E["E3<span class='jp-term jp-term-diagram' title='ubiquitin ligase'>ユビキチンリガーゼ</span>によるポリ<span class='jp-term jp-term-diagram' title='ubiquitination'>ユビキチン化</span>"]
  E --> F["26Sプロテアソームでの分解"]
  1. からを1つ除去する
  2. に結合した誤って折り畳まれたタンパク質をERから細胞質へ移動させる
  3. N-からN結合型を除去する
  4. 誤って折り畳まれたタンパク質の
  5. プロテアソームによる分解

まとめ

  • ERは(N結合型、-を介する)、、フォールディングとサブユニット組み立て、質分解性切断という4つの主要な修飾を担う。
  • というは、によるグルコーストリミングとによる再付加のサイクルを通じて未完成タンパク質を認識し続け、完全に折り畳まれるまでERに留め置く機構を形成する。
  • を通過できなかったタンパク質(最大80%にも及ぶ)はERADにより細胞質へ逆行性輸送され、による緩やかな除去を「タイマー」としてERAD複合体に認識され、脱・ポリを経てプロテアソームで分解される。