Medical Microbiology · 3/2
ウイルスの増殖。ウイルス生合成の分子基盤:産生感染
Propagation of viruses. Molecular bases of the biosynthesis of viruses: productive infection
🧠 ウイルスの複製サイクルreplication cycle複製サイクル(replication cycle)replication cycle(複製サイクル)は「吸着→侵入→脱殻uncoating脱殻(uncoating)uncoating(脱殻)→複製→組み立て→放出」の6段階の一本道であり、途中の分岐点branch point分岐点(branch point)branch point(分岐点)は「genomeの型が何か」だけで決まる。 前トピックで整理したgenomeの分類(DNA/RNA、ss/ds、極性)がそのまま「mRNAを作るまでに何ステップ要するか」を決定する——この6段階のフレームに、ゲノム型ごとの複製戦略を当てはめて理解する。
ウイルスの培養法
ウイルスは絶対細胞内寄生体であるため、生きた細胞内でのみ培養できる。
| 培養法 | 特徴 |
|---|---|
| 動物接種animal inoculation動物接種(animal inoculation)animal inoculation(動物接種) | マウス・ニワトリ・ラットratラット(rat)rat(ラット)・サルなどを使用。例:新生マウスはコクサッキーCoxsackievirusコクサッキー(Coxsackievirus)Coxsackievirus(コクサッキー)A・B ウイルスの鑑別に使われた。現在は診断には用いられず、研究目的のみ |
| 発育鶏卵での培養 | インフルエンザワクチンInfluenza virus vaccinesインフルエンザワクチン(Influenza virus vaccines)Influenza virus vaccines(インフルエンザワクチン)製造に使用。実験動物より安価かつ簡便 |
| 細胞培養cell culture細胞培養(cell culture)cell culture(細胞培養) | 現在最も用いられる増殖法。ヒト・動物由来zoono-動物由来(zoono-)zoono-(動物由来)の細胞を培養フラスコ/シャーレで培養する |
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細胞培養cell culture細胞培養(cell culture)cell culture(細胞培養)には2種類ある。
- 初代培養細胞primary cell lines初代培養細胞(primary cell lines)primary cell lines(初代培養細胞):寿命が短い
- 不死化腫瘍細胞immortalized tumor cells不死化腫瘍細胞(immortalized tumor cells)immortalized tumor cells(不死化腫瘍細胞):例として子宮頸癌cervical cancer子宮頸癌(cervical cancer)cervical cancer(子宮頸癌)由来のHeLa細胞株cell line細胞株(cell line)cell line(細胞株)が挙げられ、呼吸器合胞体ウイルスrespiratory syncytial virus, RSV呼吸器合胞体ウイルス(respiratory syncytial virus, RSV)respiratory syncytial virus, RSV(呼吸器合胞体ウイルス)・アデノウイルスAdenovirusアデノウイルス(Adenovirus)Adenovirus(アデノウイルス)・単純ヘルペスウイルスherpes simplex virus, HSV単純ヘルペスウイルス(herpes simplex virus, HSV)herpes simplex virus, HSV(単純ヘルペスウイルス)の回収に優れる
ウイルスの生合成
産生感染productive infection産生感染(productive infection)productive infection(産生感染)とは、宿主細胞のプログラムが切り替わり、宿主自身の物質の代わりにウイルスを産生し始めることをいう。感染性の子孫ウイルス粒子の産生(=ウイルスの複製)を特徴とする。
ウイルス複製サイクルの6段階
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吸着:ウイルス表面タンパク質(スパイクspikeスパイク(spike)spike(スパイク)など)が、宿主細胞膜cell membrane宿主細胞膜(cell membrane)cell membrane(宿主細胞膜)の受容体や他の構造に結合する。
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侵入:ビリオンvirionビリオン(virion)virion(ビリオン)が細胞内に入る。
- enveloped virus:エンベロープが細胞膜と融合し、capsidが細胞内に放出される
- non-enveloped virus:受容体依存性エンドサイトーシスreceptor-mediated endocytosis受容体依存性エンドサイトーシス(receptor-mediated endocytosis)receptor-mediated endocytosis(受容体依存性エンドサイトーシス)で侵入する
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脱殻uncoating脱殻(uncoating)uncoating(脱殻):細胞質でcapsidが分解され、ウイルス核酸が放出される。
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核内移行nuclear translocation核内移行(nuclear translocation)nuclear translocation(核内移行)と複製
- 暗黒期eclipse period暗黒期(eclipse period)eclipse period(暗黒期):感染したウイルス自身は検出できなくなる時期。感染ウイルスのタンパク質はすでに分解され、新しいウイルスはまだ産生されていない
- ほとんどのDNAウイルスは宿主酵素を用いて核内で複製し、RNAウイルスは細胞質で複製する
- ウイルス核酸 → mRNAへ転写 → ウイルスタンパク質翻訳 → 合成されたポリペプチド鎖は早期タンパク質(early proteins、複製に関与)と後期タンパク質(late proteins、構造タンパクstructural protein構造タンパク(structural protein)structural protein(構造タンパク)質)に分かれる → genomeの複製
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組み立て(assembly):複製されたウイルスgenomeとcapsidタンパク質が自己組織化self-assembly自己組織化(self-assembly)self-assembly(自己組織化)し、新しいウイルス粒子を形成する。
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放出:ウイルス粒子は以下のいずれかで放出される。
- 開口分泌exocytosis開口分泌(exocytosis)exocytosis(開口分泌)
- 出芽:エンベロープは細胞膜・小胞体(ER)・ゴルジ体Golgi apparatusゴルジ体(Golgi apparatus)Golgi apparatus(ゴルジ体)から取り込まれる
- 細胞融解cell lysis (cytolysis)細胞融解(cell lysis (cytolysis))cell lysis (cytolysis)(細胞融解)
flowchart TD
A["吸着<br>Attachment"] --> B["侵入<br>Penetration"]
B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='uncoating'>脱殻</span><br>Uncoating"]
C --> D["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nuclear translocation'>核内移行</span>・複製<br>Nuclear entry & replication<br>(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='eclipse period'>暗黒期</span>)"]
D --> E["組み立て<br>Assembly"]
E --> F["放出<br>Release<br>(出芽 / <span class='jp-term jp-term-diagram' title='cell lysis (cytolysis)'>細胞融解</span> / <span class='jp-term jp-term-diagram' title='exocytosis'>開口分泌</span>)"]
ウイルスの複製戦略
genomeの型によって、mRNAを合成するまでの経路(=複製戦略)が異なる。
💡 ここでの分類は、いわゆるボルチモア分類Baltimore systemボルチモア分類(Baltimore system)Baltimore system(ボルチモア分類)の考え方と対応する。 「genomeからmRNAまで何段階かかるか」を軸にすると、複製戦略の違いが整理しやすい。
| genome型 | 複製の要点 | 複製部位 | 代表例 |
|---|---|---|---|
| ssDNA | 核内で複製。マイナス鎖negative-sense strandマイナス鎖(negative-sense strand)negative-sense strand(マイナス鎖)を鋳型とし、DNA依存性RNAポリメラーゼDNA-dependent RNA polymeraseDNA依存性RNAポリメラーゼ(DNA-dependent RNA polymerase)DNA-dependent RNA polymerase(DNA依存性RNAポリメラーゼ)を用いる | 核 | パルボウイルス科Parvoviridaeパルボウイルス科(Parvoviridae)Parvoviridae(パルボウイルス科)など |
| dsDNA | 核内で複製し、宿主の通常のRNAポリメラーゼを利用 | 核 | ヘルペスウイルス科Herpesviridaeヘルペスウイルス科(Herpesviridae)Herpesviridae(ヘルペスウイルス科)など |
| ポックスウイルスpoxvirusポックスウイルス(poxvirus)poxvirus(ポックスウイルス) | 複製に必要な因子をすべて自前で持ち、細胞質で複製 | 細胞質 | ポックスウイルス科Poxviridaeポックスウイルス科(Poxviridae)Poxviridae(ポックスウイルス科) |
| ヘパドナウイルスhepadnavirusヘパドナウイルス(hepadnavirus)hepadnavirus(ヘパドナウイルス) | 不完全なDNA鎖を持ち、まず修復されてから転写される | 核 | B型肝炎ウイルス |
| ssRNA(+) | そのままmRNAとして使われる。ウイルスポリメラーゼは感染後に新規合成される | 細胞質 | ピコルナウイルス科Picornaviridaeピコルナウイルス科(Picornaviridae)Picornaviridae(ピコルナウイルス科)など |
| ssRNA(−) | マイナス鎖negative-sense strandマイナス鎖(negative-sense strand)negative-sense strand(マイナス鎖)を鋳型としてmRNAが合成される。自身のRNA依存性RNAポリメラーゼRNA-dependent RNA polymeraseRNA依存性RNAポリメラーゼ(RNA-dependent RNA polymerase)RNA-dependent RNA polymerase(RNA依存性RNAポリメラーゼ)を内包internal capsule内包(internal capsule)internal capsule(内包)する | 細胞質(オルソミクソウイルスOrthomyxovirusesオルソミクソウイルス(Orthomyxoviruses)Orthomyxoviruses(オルソミクソウイルス)を除く) | パラミクソウイルス科Paramyxoviridaeパラミクソウイルス科(Paramyxoviridae)Paramyxoviridae(パラミクソウイルス科)など |
| dsRNA | マイナス鎖negative-sense strandマイナス鎖(negative-sense strand)negative-sense strand(マイナス鎖)がmRNA合成に使われる。ビリオンvirionビリオン(virion)virion(ビリオン)が自身のポリメラーゼを内包internal capsule内包(internal capsule)internal capsule(内包)する | 細胞質 | レオウイルス科Reoviridaeレオウイルス科(Reoviridae)Reoviridae(レオウイルス科)など |
| レトロretroレトロ(retro)retro(レトロ)ウイルス | 逆転写酵素によりssRNAがdsDNAへ逆転写され、dsDNAがmRNAへ転写される。逆転写は細胞質で起こり、ウイルス特異的RNAの合成は核内で行われる | 細胞質+核 | レトロretroレトロ(retro)retro(レトロ)ウイルス科(ヒト免疫不全ウイルスhuman immunodeficiency virus, HIVヒト免疫不全ウイルス(human immunodeficiency virus, HIV)human immunodeficiency virus, HIV(ヒト免疫不全ウイルス)など) |
まとめ
- ウイルスは生きた細胞内でのみ培養でき、動物接種animal inoculation動物接種(animal inoculation)animal inoculation(動物接種)・発育鶏卵・細胞培養cell culture細胞培養(cell culture)cell culture(細胞培養)(現在の主流、初代培養primary culture初代培養(primary culture)primary culture(初代培養)/不死化immortalization不死化(immortalization)immortalization(不死化)細胞株cell line細胞株(cell line)cell line(細胞株))の3法がある。
- 産生感染productive infection産生感染(productive infection)productive infection(産生感染)とは、宿主細胞のプログラムがウイルス産生に切り替わり、感染性の子孫ウイルスが作られる過程である。
- 複製サイクルreplication cycle複製サイクル(replication cycle)replication cycle(複製サイクル)は吸着→侵入→脱殻uncoating脱殻(uncoating)uncoating(脱殻)→核内移行nuclear translocation核内移行(nuclear translocation)nuclear translocation(核内移行)・複製(暗黒期eclipse period暗黒期(eclipse period)eclipse period(暗黒期)を含む)→組み立て→放出の6段階からなる一本道のプロセスprocessプロセス(process)process(プロセス)である。
- 侵入様式はエンベロープの有無で異なり(enveloped virusは膜融合membrane fusion膜融合(membrane fusion)membrane fusion(膜融合)、non-enveloped virusは受容体依存性エンドサイトーシスreceptor-mediated endocytosis受容体依存性エンドサイトーシス(receptor-mediated endocytosis)receptor-mediated endocytosis(受容体依存性エンドサイトーシス))、放出様式も出芽・細胞融解cell lysis (cytolysis)細胞融解(cell lysis (cytolysis))cell lysis (cytolysis)(細胞融解)・開口分泌exocytosis開口分泌(exocytosis)exocytosis(開口分泌)のいずれかをとる。
- 複製戦略(mRNAをどう作るか)はgenome型(ssDNA/dsDNA/ssRNA(+)/ssRNA(−)/dsRNA/レトロretroレトロ(retro)retro(レトロ)ウイルス)ごとに異なり、複製部位(核 vs 細胞質)や必要な酵素(RNA依存性RNAポリメラーゼRNA-dependent RNA polymeraseRNA依存性RNAポリメラーゼ(RNA-dependent RNA polymerase)RNA-dependent RNA polymerase(RNA依存性RNAポリメラーゼ)、逆転写酵素など)が変わる。
- 早期タンパク質(複製関連)と後期タンパク質(構造タンパクstructural protein構造タンパク(structural protein)structural protein(構造タンパク)質)の分業が、genomeの複製と粒子の組み立てを時間的に整理している。