血清型別とファージ型別

🧠 血清型別serotyping血清型別（serotyping）serotyping（血清型別）とファージ型別phage typingファージ型別（phage typing）phage typing（ファージ型別）は、同じ問い「この菌株は同種homologous同種（homologous）homologous（同種）の中でもどのサブタイプSubtypeサブタイプ（Subtype）Subtype（サブタイプ）か」に、それぞれ「表面抗原surface antigen表面抗原（surface antigen）surface antigen（表面抗原）の違い」と「感染するファージの好みの違い」という別の切り口で答える手法である。 どちらも菌種同定species-level identification菌種同定（species-level identification）species-level identification（菌種同定）のさらに一段階下、亜種subspecies亜種（subspecies）subspecies（亜種）レベルの識別に用いる——5/29の検査室ワークフローでいう「型別」のステップに相当する。

血清型別

• 血清型：特定の抗原セットによって区別される、近縁微生物の一群。
• 血清型別serotyping血清型別（serotyping）serotyping（血清型別）：血清型に基づいて微生物を分類する手法。
• 細菌の型別：由来の異なる菌株を識別すること全般を指す上位upper上位（upper）upper（上位）概念。
• 分類はO抗原O antigen (somatic antigen)O抗原（O antigen (somatic antigen)）O antigen (somatic antigen)（O抗原）（菌体抗原somatic antigen菌体抗原（somatic antigen）somatic antigen（菌体抗原））・H抗原H antigenH抗原（H antigen）H antigen（H抗原）（鞭毛抗原flagellar antigen (H antigen)鞭毛抗原（flagellar antigen (H antigen)）flagellar antigen (H antigen)（鞭毛抗原））・K抗原K antigenK抗原（K antigen）K antigen（K抗原）（莢膜抗原）などの細胞表面抗原cell-surface antigen細胞表面抗原（cell-surface antigen）cell-surface antigen（細胞表面抗原）に基づく。
• これにより、菌種・ウイルス・細胞を亜種subspecies亜種（subspecies）subspecies（亜種）レベルまで分類できる。
• 代表的な検出法はスライド凝集法slide agglutinationスライド凝集法（slide agglutination）slide agglutination（スライド凝集法）・ラテックス凝集法latex agglutinationラテックス凝集法（latex agglutination）latex agglutination（ラテックス凝集法）。

ファージ型別

• 細菌に感染するウイルスをバクテリオファージbacteriophageバクテリオファージ（bacteriophage）bacteriophage（バクテリオファージ）（略して“phage”）と呼び、その一部は単一の菌株にしか感染しない高い特異性を持つ。
• この特異性を利用して、同一菌種内の異なる株を識別する。

flowchart TD
    A["対象株を寒天培地上に塗布し培養・乾燥させる"] --> B["シャーレの底面にグリッド線を引き<br>区画を作る"]
    B --> C["各区画に異なるファージを<br>1種類ずつ<span class='jp-term jp-term-diagram' title='dribbling'>滴下</span>する"]
    C --> D["ファージ液を乾燥させたのち培養する"]
    D --> E{"各区画の結果は？"}
    E -->|"そのファージに感受性あり"| F["円形の<span class='jp-term jp-term-diagram' title='clearing'>溶菌斑</span>が出現<br>＝菌が<span class='jp-term jp-term-diagram' title='bacteriolysis (lysis)'>溶菌</span>された"]
    E -->|"そのファージに感受性なし"| G["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='plaque (clear zone)'>溶菌斑</span>なし"]
    F --> H["感受性パターン（＝ファージ型）から<br>株を識別する"]
    G --> H

まとめ

• 血清型別serotyping血清型別（serotyping）serotyping（血清型別）・ファージ型別phage typingファージ型別（phage typing）phage typing（ファージ型別）はいずれも菌種同定species-level identification菌種同定（species-level identification）species-level identification（菌種同定）よりさらに下の亜種subspecies亜種（subspecies）subspecies（亜種）レベルの識別手法である。
• 血清型別serotyping血清型別（serotyping）serotyping（血清型別）はO・H・K抗原K antigenK抗原（K antigen）K antigen（K抗原）などの表面抗原surface antigen表面抗原（surface antigen）surface antigen（表面抗原）の違いを、スライド凝集法slide agglutinationスライド凝集法（slide agglutination）slide agglutination（スライド凝集法）またはラテックス凝集法latex agglutinationラテックス凝集法（latex agglutination）latex agglutination（ラテックス凝集法）（より高感度）で検出する。
• ファージ型別phage typingファージ型別（phage typing）phage typing（ファージ型別）は、単一菌single causative organism (monomicrobial)単一菌（single causative organism (monomicrobial)）single causative organism (monomicrobial)（単一菌）株にしか感染しないバクテリオファージbacteriophageバクテリオファージ（bacteriophage）bacteriophage（バクテリオファージ）への感受性パターン（グリッド上の溶菌斑plaque (clear zone)溶菌斑（plaque (clear zone)）plaque (clear zone)（溶菌斑）の有無）を利用して株を識別する。
• どちらも検査室ワークフロー（5/29）における「型別」ステップに位置づけられる。