Biochemistry · 3/1
生化学的経路の熱力学;可逆・不可逆反応;吸エルゴン反応と発エルゴン反応の共役;高エネルギー化合物;ATPの中心的役割;還元当量
Thermodynamics of biochemical pathways; reversible/irreversible reactions; coupling of endergonic and exergonic reactions; high-energy compounds; central role of ATP; reducing equivalents — L I
🧠 生体エネルギー論は「ATPという共通通貨currency通貨(currency)currency(通貨)で、発エルゴン反応exergonic reaction発エルゴン反応(exergonic reaction)exergonic reaction(発エルゴン反応)の発熱を吸エルゴン反応endergonic reaction吸エルゴン反応(endergonic reaction)endergonic reaction(吸エルゴン反応)に受け渡す」と読む。 生体は等温系で、化学エネルギーchemical energy化学エネルギー(chemical energy)chemical energy(化学エネルギー)を使う。ATPは貯蔵ではなく通貨currency通貨(currency)currency(通貨)で、加水分解の大きな負のΔGで不利な反応を駆動する。還元当量NADH/FADH₂還元当量(NADH/FADH₂)NADH/FADH₂(還元当量)は「電子の運び手」として酸化的リン酸化oxidative phosphorylation酸化的リン酸化(oxidative phosphorylation)oxidative phosphorylation(酸化的リン酸化)につながる。
生体エネルギー論の基本
生体エネルギー論(=生化学的熱力学)は、生化学反応chemical reaction化学反応(chemical reaction)chemical reaction(化学反応)に伴うエネルギー変化を扱う。生体はほぼ等温で、化学エネルギーchemical energy化学エネルギー(chemical energy)chemical energy(化学エネルギー)を生命活動に使う。
- 発エルゴン反応exergonic reaction発エルゴン反応(exergonic reaction)exergonic reaction(発エルゴン反応)(ΔG<0): 自発的。エネルギーを放出。
- 吸エルゴン反応endergonic reaction吸エルゴン反応(endergonic reaction)endergonic reaction(吸エルゴン反応)(endergonic, ΔG>0): 非自発的。エネルギーを要する。
- 生体は両者を共役させ、発エルゴン反応exergonic reaction発エルゴン反応(exergonic reaction)exergonic reaction(発エルゴン反応)の自由エネルギーfree energy自由エネルギー(free energy)free energy(自由エネルギー)で吸エルゴン反応endergonic reaction吸エルゴン反応(endergonic reaction)endergonic reaction(吸エルゴン反応)を進める。ATPがこの受け渡しの中心。
ATP=エネルギー通貨
ATPは「貯蔵形storage form貯蔵形(storage form)storage form(貯蔵形)」ではなく、発エルゴンと吸エルゴンの過程の間で自由エネルギーfree energy自由エネルギー(free energy)free energy(自由エネルギー)を転送する通貨currency通貨(currency)currency(通貨)である。
| ATPの数値 | 値 |
|---|---|
| 標準加水分解 ΔG°′ | −30.5 kJ/mol |
| 実際のΔG(筋細胞) | 約 −54.7 kJ/mol |
| 実際のΔG(赤血球) | 約 −51.8 kJ/mol |
| 細胞内濃度 | 2–10 mM |
| 体内総量 | 約50 g |
| 代謝回転turnover代謝回転(turnover)turnover(代謝回転) | 安静時 約50 kg/日、運動時 約0.5 kg/分 |
💡 ATP加水分解のΔGが大きいのは「電荷反発charge repulsion電荷反発(charge repulsion)charge repulsion(電荷反発)の解消」と「共鳴安定化resonance stabilization共鳴安定化(resonance stabilization)resonance stabilization(共鳴安定化)」。 隣接する負電荷リン酸酸素の反発が加水分解で解消され、生成物(特にリン酸)が共鳴混成体resonance hybrid共鳴混成体(resonance hybrid)resonance hybrid(共鳴混成体)として安定化する。標準値(−30.5)より細胞内の実際値の方が負に大きい(ADP・Piが低濃度のため)。
なぜATPが必要か
- エネルギー通貨ATP is the energy currencyエネルギー通貨(ATP is the energy currency)ATP is the energy currency(エネルギー通貨)。
- リン酸化反応のリン酸供与体donor供与体(donor)donor(供与体)(受容体・タンパク質など)。
- cAMPの前駆体。
- 細胞外に放出されプリン作動性(purinergic)受容体に作用する共伝達物質。
- 他のNTP(GTP・ITP)へのトランスホスホリル化transphosphorylationトランスホスホリル化(transphosphorylation)transphosphorylation(トランスホスホリル化)。
高エネルギーリン酸化合物とリン酸転移ポテンシャル
化合物は「リン酸基転移ポテンシャルphosphoryl-group transfer potentialリン酸基転移ポテンシャル(phosphoryl-group transfer potential)phosphoryl-group transfer potential(リン酸基転移ポテンシャル)」の高低で並ぶ。高ポテンシャル供与体donor供与体(donor)donor(供与体)→ATP→低ポテンシャル受容体(グルコースなど)へ、キナーゼが触媒して流れる。
| 高エネルギー化合物 | 例 |
|---|---|
| リン酸無水物 | ATP、GTP |
| チオエステル | アセチルCoA(acetyl-CoA、CoAが関与) |
| その他 | S-アデノシルメチオニンS-adenosylmethionine (SAM)アデノシルメチオニン(S-adenosylmethionine (SAM))S-adenosylmethionine (SAM)(アデノシルメチオニン)、UDP-グルコース、PRPP |
| ホスファゲンphosphagenホスファゲン(phosphagen)phosphagen(ホスファゲン)(貯蔵形storage form貯蔵形(storage form)storage form(貯蔵形)) | クレアチンリン酸creatine phosphateクレアチンリン酸(creatine phosphate)creatine phosphate(クレアチンリン酸)(脊椎動物)、アルギニンarginine (Arg)アルギニン(arginine (Arg))arginine (Arg)(アルギニン)リン酸(無脊椎動物) |
⭐ クレアチンリン酸creatine phosphateクレアチンリン酸(creatine phosphate)creatine phosphate(クレアチンリン酸)は筋・脳のATP緩衝。 クレアチンキナーゼcreatine kinase (CK)クレアチンキナーゼ(creatine kinase (CK))creatine kinase (CK)(クレアチンキナーゼ)が、安静時にATPのリン酸をクレアチンに預け、運動時に素早くATPを再生する。ATPそのものより多く貯められる「エネルギーの貯金」。
高エネルギーリン酸の供給源
| 供給源 | 内容 |
|---|---|
| 酸化的リン酸化oxidative phosphorylation酸化的リン酸化(oxidative phosphorylation)oxidative phosphorylation(酸化的リン酸化) | ミトコンドリアでのATP産生(最大) |
| 解糖 | 基質レベルのリン酸化substrate-level phosphorylation基質レベルのリン酸化(substrate-level phosphorylation)substrate-level phosphorylation(基質レベルのリン酸化)でATP |
| クエン酸回路citric acid cycle (TCA cycle)クエン酸回路(citric acid cycle (TCA cycle))citric acid cycle (TCA cycle)(クエン酸回路) | 基質レベルのリン酸化substrate-level phosphorylation基質レベルのリン酸化(substrate-level phosphorylation)substrate-level phosphorylation(基質レベルのリン酸化) |
| ミトコンドリアPEPCK | mitoPEPCK |
| 相互変換 | アデニル酸キナーゼadenylate kinaseアデニル酸キナーゼ(adenylate kinase)adenylate kinase(アデニル酸キナーゼ)、ヌクレオシド二リン酸キナーゼnucleoside diphosphate kinase (NDPK)ヌクレオシド二リン酸キナーゼ(nucleoside diphosphate kinase (NDPK))nucleoside diphosphate kinase (NDPK)(ヌクレオシド二リン酸キナーゼ)(新規の高エネルギーリン酸は作らない) |
還元当量
還元当量Reducing equivalents還元当量(Reducing equivalents)Reducing equivalents(還元当量)は電子(水素)の運び手。酸化還元oxidoreduction (redox)酸化還元(oxidoreduction (redox))oxidoreduction (redox)(酸化還元)反応でNAD⁺/NADP⁺・FADが電子を受け取り、酸化的リン酸化oxidative phosphorylation酸化的リン酸化(oxidative phosphorylation)oxidative phosphorylation(酸化的リン酸化)や還元的生合成biosynthesis生合成(biosynthesis)biosynthesis(生合成)に使われる。
| 運び手 | 英語 | 役割・標準酸化還元電位redox potential酸化還元電位(redox potential)redox potential(酸化還元電位) |
|---|---|---|
| NAD⁺ | nicotinamide adenine dinucleotide | 異化catabolism異化(catabolism)catabolism(異化)(分解)の電子受容体。E°′≈−0.32 V |
| NADP⁺ | nicotinamide adenine dinucleotide phosphate | 同化anabolic同化(anabolic)anabolic(同化)(還元的生合成biosynthesis生合成(biosynthesis)biosynthesis(生合成))に使う |
| FAD/FMN | flavin nucleotides | 酵素結合の補欠分子族prosthetic group補欠分子族(prosthetic group)prosthetic group(補欠分子族)。E°′≈−0.22 V |
💡 NADHは異化catabolism異化(catabolism)catabolism(異化)、NADPHは同化anabolic同化(anabolic)anabolic(同化)。 構造は似るが役割を使い分ける。NADHは電子伝達系electron transport chain電子伝達系(electron transport chain)electron transport chain(電子伝達系)に電子を渡してATPを作る(分解系)、NADPHは脂肪酸・コレステロール合成など還元的生合成biosynthesis生合成(biosynthesis)biosynthesis(生合成)に使う。
エネルギーチャージ
アデニンヌクレオチドAMP+ADP+ATPアデニンヌクレオチド(AMP+ADP+ATP)AMP+ADP+ATP(アデニンヌクレオチド)の濃度比は細胞のエネルギー状態を反映する。エネルギーチャージenergy chargeエネルギーチャージ(energy charge)energy charge(エネルギーチャージ)が高い(ATP多い)と異化catabolism異化(catabolism)catabolism(異化)が抑制され同化anabolic同化(anabolic)anabolic(同化)が促進、低いと逆になる。
flowchart TD
A["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='exergonic reaction'>発エルゴン反応</span>(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='catabolism'>異化</span>:栄養素分解)"]
A --> B["ATP合成・NADH/FADH₂生成"]
B --> C["ATP=<span class='jp-term jp-term-diagram' title='ATP is the energy currency'>エネルギー通貨</span>"]
C --> D["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='endergonic reaction'>吸エルゴン反応</span>(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='anabolic'>同化</span>・輸送・運動)"]
B --> E["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='Reducing equivalents'>還元当量</span> → <span class='jp-term jp-term-diagram' title='oxidative phosphorylation'>酸化的リン酸化</span> / <span class='jp-term jp-term-diagram' title='biosynthesis'>生合成</span>"]
まとめ
- 生体は発エルゴン反応exergonic reaction発エルゴン反応(exergonic reaction)exergonic reaction(発エルゴン反応)と吸エルゴン反応endergonic reaction吸エルゴン反応(endergonic reaction)endergonic reaction(吸エルゴン反応)を共役させ、ATPが自由エネルギーfree energy自由エネルギー(free energy)free energy(自由エネルギー)を受け渡す通貨currency通貨(currency)currency(通貨)。
- ATP加水分解ΔG°′=−30.5 kJ/mol(実際はより負)。電荷反発charge repulsion電荷反発(charge repulsion)charge repulsion(電荷反発)解消と共鳴安定化resonance stabilization共鳴安定化(resonance stabilization)resonance stabilization(共鳴安定化)による。
- 高エネルギー化合物はリン酸転移ポテンシャルphosphate transfer potentialリン酸転移ポテンシャル(phosphate transfer potential)phosphate transfer potential(リン酸転移ポテンシャル)で並ぶ。クレアチンリン酸creatine phosphateクレアチンリン酸(creatine phosphate)creatine phosphate(クレアチンリン酸)は筋・脳のATP貯金。
- 供給源は酸化的リン酸化oxidative phosphorylation酸化的リン酸化(oxidative phosphorylation)oxidative phosphorylation(酸化的リン酸化)・解糖・クエン酸回路citric acid cycle (TCA cycle)クエン酸回路(citric acid cycle (TCA cycle))citric acid cycle (TCA cycle)(クエン酸回路)の基質レベルリン酸化など。
- 還元当量Reducing equivalents還元当量(Reducing equivalents)Reducing equivalents(還元当量)はNADH(異化catabolism異化(catabolism)catabolism(異化))とNADPH(同化anabolic同化(anabolic)anabolic(同化))で使い分け、FADは酵素結合。
- エネルギーチャージenergy chargeエネルギーチャージ(energy charge)energy charge(エネルギーチャージ)が代謝の方向を制御する。