Biophysics · 24.11
モータータンパク質の連続運動性(processivity)・力・移動距離(working distance)
Processivity, force range, working distance of motor proteins
🧠 モータータンパク質motor proteinモータータンパク質(motor protein)motor protein(モータータンパク質)の機能は、1歩の大きさだけでなく、解離までに何歩進むか・どの負荷まで動けるかで定量する。
運動を表す三つの尺度
| 尺度 | 定義 | 典型的な単位 |
|---|---|---|
| ステップ長step sizeステップ長(step size)step size(ステップ長) | 1回の化学力学周期で進む距離 | nm |
| 連続運動性processivity連続運動性(processivity)processivity(連続運動性) | 線維から解離するまでの歩数・距離 | steps、nm〜µm |
| 失速力stall force失速力(stall force)stall force(失速力) | 平均速度が0になる逆向き負荷 | pN |
1ステップで行う力学的仕事は で見積もれる。これは単分子力学と同じpN・nmの尺度であり、 である。
連続運動性を決める要因
デューティー比duty ratioデューティー比(duty ratio)duty ratio(デューティー比)は、1周期のうちモーターが線維へ強く結合している時間の割合である。二量体キネシンkinesinキネシン(kinesin)kinesin(キネシン)では、片方の頭部が結合している間に他方が前へ移るため、線維から外れにくい。
flowchart TD
A["一方の頭部が微小管へ結合"] --> B["ATP依存的に他方の頭部が前進"]
B --> C["前方の頭部が結合"]
C --> D["後方の頭部が解離"]
D --> A
一方、筋ミオシンIIは低いデューティー比duty ratioデューティー比(duty ratio)duty ratio(デューティー比)をもち、1分子では解離しやすい。多数の分子が並列に働くことで、常に一部がアクチンへ結合して張力を維持する。これはモーターの種類に応じた機能設計であり、低い連続運動性processivity連続運動性(processivity)processivity(連続運動性)は機能不全ではない。
負荷と運動速度
逆向き負荷が増えるほど前進確率と速度は低下し、失速力stall force失速力(stall force)stall force(失速力)で平均速度が0になる。さらに大きな負荷では後退retraction後退(retraction)retraction(後退)が起こりうる。この負荷依存性は、筋全体の力–速度関係へ階層的につながる。
まとめ
- ステップ長step sizeステップ長(step size)step size(ステップ長)・連続運動性processivity連続運動性(processivity)processivity(連続運動性)・失速力stall force失速力(stall force)stall force(失速力)は、分子モーターの異なる性能を表す。
- 高い連続運動性processivity連続運動性(processivity)processivity(連続運動性)には、デューティー比duty ratioデューティー比(duty ratio)duty ratio(デューティー比)と複数頭部の協調が重要である。
- 筋ミオシンIIは多数分子の協働に適した低デューティー比duty ratioデューティー比(duty ratio)duty ratio(デューティー比)モーターである。