Biophysics · 25.05
医療における質量分析:プロテオミクス(proteomics)・診断・iKnife
Mass spectrometry in medicine — proteomics, diagnostics, iKnife
🧠 医療における質量分析mass spectrometry質量分析(mass spectrometry)mass spectrometry(質量分析)は、分子の と断片化fragmentation断片化(fragmentation)fragmentation(断片化)パターンを、タンパク質同定・代謝疾患スクリーニング・術中組織判別へ変換する分析系である。
プロテオミクス
プロテオミクスproteomicsプロテオミクス(proteomics)proteomics(プロテオミクス)では、タンパク質をペプチドへ消化し、質量とタンデム質量分析tandem mass spectrometry, MS/MSタンデム質量分析(tandem mass spectrometry, MS/MS)tandem mass spectrometry, MS/MS(タンデム質量分析)の断片スペクトルをデータベースと照合して同定する。ピーク強度や同位体isotope同位体(isotope)isotope(同位体)標識、内部標準を用いれば相対・絶対定量もできる。
この解析の前段ではESIまたはMALDIで分子をイオン化ionizationイオン化(ionization)ionization(イオン化)し、TOFなどの質量分析mass spectrometry質量分析(mass spectrometry)mass spectrometry(質量分析)器で分離する。
診断・スクリーニングへの応用
新生児マススクリーニングnewborn mass screening新生児マススクリーニング(newborn mass screening)newborn mass screening(新生児マススクリーニング)では、MS/MSによりアミノ酸やアシルカルニチンacylcarnitineアシルカルニチン(acylcarnitine)acylcarnitine(アシルカルニチン)を一斉測定し、代謝異常の候補を抽出する。臨床微生物検査ではMALDI-TOFによるスペクトルパターンを参照データベースと比較し、培養した微生物の同定を補助できる。
| 応用 | 主な入力 | 出力と役割 |
|---|---|---|
| プロテオミクスproteomicsプロテオミクス(proteomics)proteomics(プロテオミクス) | 組織・体液由来ペプチド | タンパク質の同定・定量 |
| 新生児スクリーニングnewborn screening新生児スクリーニング(newborn screening)newborn screening(新生児スクリーニング) | 乾燥ろ紙血dried blood spot (DBS)乾燥ろ紙血(dried blood spot (DBS))dried blood spot (DBS)(乾燥ろ紙血) | 代謝異常の候補抽出 |
| MALDI-TOF微生物同定 | 培養コロニー | 参照スペクトルとの類似度 |
| iKnife | 電気手術煙 | 術中組織の化学プロファイル |
iKnifeによる術中判別
iKnifeは、電気手術で生じるエアロゾルaerosolエアロゾル(aerosol)aerosol(エアロゾル)をリアルタイムに質量分析mass spectrometry質量分析(mass spectrometry)mass spectrometry(質量分析)し、主に脂質プロファイルlipid profile脂質プロファイル(lipid profile)lipid profile(脂質プロファイル)を学習済み参照データと比較する。これにより、切離中の組織分類を迅速に支援することを目指す。
flowchart TD
A["電気手術で組織<span class='jp-term jp-term-diagram' title='aerosol'>エアロゾル</span>発生"] --> B["吸引して<span class='jp-term jp-term-diagram' title='ionization'>イオン化</span>"]
B --> C["質量スペクトルを取得"]
C --> D["検証済み参照データと比較"]
D --> E["術中の組織判別を支援"]
臨床解釈と品質管理
スペクトル一致だけで診断は確定しない。試料採取sample collection試料採取(sample collection)sample collection(試料採取)・前処理、内部標準、装置校正proofreading校正(proofreading)proofreading(校正)、データベースの代表性、判定閾値、偽陽性・偽陰性を含む分析系全体の検証が必要である。
まとめ
- MS/MSの断片スペクトルは、タンパク質や代謝物の同定・定量に使われる。
- 新生児スクリーニングnewborn screening新生児スクリーニング(newborn screening)newborn screening(新生児スクリーニング)、微生物同定、iKnifeは入力試料と判定目的が異なる。
- 臨床利用には前処理・校正proofreading校正(proofreading)proofreading(校正)・参照データ・判定性能を含む品質管理quality control品質管理(quality control)quality control(品質管理)が不可欠である。