分子細胞生物学 · 22

真核生物転写のエピジェネティック調節：DNAメチル化とヒストン修飾の役割

Epigenetic regulation of eukaryotic transcription: the role of DNA methylation and histone modifications

🧠 エピジェネティクスEpigenetics エピジェネティクス（Epigenetics）Epigenetics（エピジェネティクス）は「DNADNA（deoxyribonucleic acid）配列を変えずに表現型を変える」遺伝——DNAメチル化とヒストン修飾 histone modification ヒストン修飾（histone modification） histone modification（ヒストン修飾）という2つの独立した経路が、最終的には同じ変数 variables 変数（variables） variables（変数）（クロマチン構造）に収束する。 DNAメチル化はMBDタンパク質を介してHDACHDAC（histone deacetylase）を呼び込み、ヒストン修飾histone modification ヒストン修飾（histone modification）histone modification（ヒストン修飾）（アセチル化・メチル化・リン酸化）は「ヒストンコードhistone codeヒストンコード（histone code）histone code（ヒストンコード）」として直接クロマチンの開閉 gating 開閉（gating） gating（開閉）を決める——両者は独立に働きながら、互いを補強し合う相補的な系である。

エピジェネティクスとは

遺伝子型は生物の全遺伝情報である。表現型は形態・発生・行動など、生物の実際に観察される性質である。生物の表現型はその遺伝子型によって決定される。

エピジェネティクスEpigeneticsエピジェネティクス（Epigenetics）Epigenetics（エピジェネティクス）という用語は、DNA配列の変化に由来しない、細胞の表現型における遺伝性の変化の研究を指す。エピジェネティクスEpigenetics エピジェネティクス（Epigenetics）Epigenetics（エピジェネティクス）とは、ゲノムを構成するヌクレオチド配列以外の手段による情報の遺伝的伝達である。

真核生物細胞は、DNA配列を変えることなく、遺伝性のエピジェネティック修飾 epigenetic modification エピジェネティック修飾（epigenetic modification） epigenetic modification（エピジェネティック修飾）（DNAメチル化・クロマチン凝縮）を追加の遺伝子発現機構として利用できる。DNAメチル化とヒストン修飾 histone modification ヒストン修飾（histone modification） histone modification（ヒストン修飾）はクロマチン構造を決定する上で相補的な過程である。最終的に、転写が起こるか否かを決定するのはクロマチン構造である。

DNAメチル化

メチル化＝DNA分子へのメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）（CH₃）の付加。メチル化は配列を変えることなくDNAセグメントの活性を変化させうる。遺伝子プロモーターに位置する場合、DNAメチル化は典型的に遺伝子転写を抑制する。

メチル化が起こるのはCpG（CG）ジヌクレオチドのシトシンである——5′→3′方向の線状塩基配列中でシトシン（C）の直後にグアニン guanine グアニン（guanine） guanine（グアニン）（G）ヌクレオチドが続く並びを指す。このCpGが高密度に集積したDNA領域をCpGアイランドCpG islandCpGアイランド（CpG island）CpG island（CpGアイランド）と呼ぶ
多くの遺伝子は遺伝子開始部位（プロモーター領域promoter regionプロモーター領域（promoter region）promoter region（プロモーター領域））に関連したCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）を持つ
活性なCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）プロモーターは配列中に非メチル化のCを持つ→非メチル化CpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）プロモーターはヒストンオクタマー octamer オクタマー（octamer） octamer（オクタマー）への親和性が低下する
DNMT（DNAメチル基転移酵素 methyltransferaseメチル基転移酵素（methyltransferase） methyltransferase（メチル基転移酵素）、DNA methyltransferase）がCpG上のCピリミジンに（5-）メチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）を共有結合的に修飾する（S-アデノシルメチオニンS-adenosylmethionineS-アデノシルメチオニン（S-adenosylmethionine）S-adenosylmethionine（S-アデノシルメチオニン）、SAM→S-アデノシルホモシステイン S-adenosylhomocysteineアデノシルホモシステイン（S-adenosylhomocysteine） S-adenosylhomocysteine（アデノシルホモシステイン）、SAH；SAM＝メチル供与体 methyl donorメチル供与体（methyl donor） methyl donor（メチル供与体））
MBD（5-メチルシトシンに富むDNA配列を持つタンパク質）が5-メチルシトシンで印付けられたプロモーターに結合し、HDAC（ヒストン脱アセチル化酵素histone deacetylase, HDACヒストン脱アセチル化酵素（histone deacetylase, HDAC）histone deacetylase, HDAC（ヒストン脱アセチル化酵素））＋抑制性クロマチンリモデリング chromatin remodeling クロマチンリモデリング（chromatin remodeling） chromatin remodeling（クロマチンリモデリング）複合体と会合する→クロマチンを凝縮→転写抑制

メチル化シトシン上のメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）はDNAの主溝 major groove 主溝（major groove） major groove（主溝）に位置し、転写開始transcription initiation 転写開始（transcription initiation）transcription initiation（転写開始）に必要なタンパク質（例：TF）の結合に直接干渉する。

⚠️ 既定値は逆である——「ゲノム全体はメチル化されており、CpGアイランドCpG island CpGアイランド（CpG island）CpG island（CpGアイランド）だけが非メチル化に保たれている」。「メチル化はCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）で起こる」と覚えると向きを取り違える。バルクDNAはそもそもCpGが枯渇しているが、そこに残る少数のCpGのシトシンは大半がメチル化されている。逆にCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）は、不活性X染色体上の遺伝子とインプリント座位を例外として、正常組織では非メチル化に維持されている¹。造血幹・前駆細胞のゲノムワイド解析ではプロモーター上のCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）の98%が低メチル化 hypomethylation低メチル化（hypomethylation） hypomethylation（低メチル化）で、メチル化されているのはむしろプロモーター外のCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）（20〜25%）の側である²。したがって「CpGアイランドCpG island CpGアイランド（CpG island）CpG island（CpGアイランド）がメチル化される」のは、腫瘍で癌抑制遺伝子 tumor suppressor gene 癌抑制遺伝子（tumor suppressor gene） tumor suppressor gene（癌抑制遺伝子）が沈黙するときのような異常事態として起こることが多い。

⚠️ 「メチル化＝発現抑制」も、当てはまるのはプロモーター上のCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）に限られる。遺伝子本体gene body 遺伝子本体（gene body）gene body（遺伝子本体）の内部のメチル化は逆に発現量と正の相関を示し、よく転写されている遺伝子ほど本体がメチル化されている²。抑制の向きは「メチル化されたかどうか」ではなく「ゲノムのどこがメチル化されたか」で決まる。

DNA脱メチル化

シトシンからのメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）除去の過程。

様式	内容
受動的	新しいDNA鎖の複数回の複製中に、メチル化を欠く状態で進行する過程
能動的	酵素反応でメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）を外す。ただし5mCから直接メチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）を切り取る酵素は知られておらず、TET（ten-eleven translocation）蛋白が2-オキソグルタル酸とFe(II)を補因子として5mCを段階的に酸化する経路を通る³

様式

内容

受動的

新しいDNA鎖の複数回の複製中に、メチル化を欠く状態で進行する過程

能動的

酵素反応でメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）を外す。ただし5mCから直接メチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）を切り取る酵素は知られておらず、TET（ten-eleven translocation）蛋白が2-オキソグルタル酸とFe(II)を補因子として5mCを段階的に酸化する経路を通る³

💡 能動的脱メチル化 demethylation 脱メチル化（demethylation） demethylation（脱メチル化）は「酸化してから捨てる」。 TETは5mC→5hmC（5-ヒドロキシメチルシトシン hydroxymethylcytosineヒドロキシメチルシトシン（hydroxymethylcytosine） hydroxymethylcytosine（ヒドロキシメチルシトシン））→5fC（5-ホルミルシトシン）→5caC（5-カルボキシルシトシン）と順に酸化し、5fC・5caCはTDGによる塩基除去と塩基除去修復 base excision repair塩基除去修復（base excision repair） base excision repair（塩基除去修復）、あるいは脱炭酸 decarboxylation 脱炭酸（decarboxylation） decarboxylation（脱炭酸）を経て非メチル化シトシンに戻る⁴。単なる通過点ではなく、5hmCはそれ自体が細胞内に安定に存在する塩基で、プルキンエ細胞では全ヌクレオチドの0.6%、顆粒細胞granule cell 顆粒細胞（granule cell）granule cell（顆粒細胞）では0.2%を占める⁵。5mCと5hmCは通常のバイサルファイト法では区別できないため、「メチル化」として測られてきた分の一部は実は5hmCである。

DNAメチル化の役割

X染色体不活性化： 雌性哺乳類 mammal 哺乳類（mammal） mammal（哺乳類）においてX染色体の1コピーが不活性化される過程。単一コピーのX染色体しか持たない雄と比べ、雌が2倍の遺伝子産物を持つことを防ぐ。

ゲノムインプリンティングgenomic imprinting ゲノムインプリンティング（genomic imprinting）genomic imprinting（ゲノムインプリンティング）： 特定の遺伝子が親由来 parent-of-origin 親由来（parent-of-origin） parent-of-origin（親由来）特異的な様式で発現するエピジェネティック epigenetic エピジェネティック（epigenetic） epigenetic（エピジェネティック）現象。

父由来のアレルがインプリントされている場合、それは抑制され母由来のアレルのみが発現する
母由来のアレルがインプリントされている場合、父由来のアレルのみが発現する

→ ゲノムインプリンティングgenomic imprinting ゲノムインプリンティング（genomic imprinting）genomic imprinting（ゲノムインプリンティング）は、遺伝配列を変化させることなくDNAメチル化とヒストンメチル化を伴うエピジェネティック epigenetic エピジェネティック（epigenetic） epigenetic（エピジェネティック）過程である。

ゲノムインプリンティングgenomic imprinting ゲノムインプリンティング（genomic imprinting）genomic imprinting（ゲノムインプリンティング）に関連する疾患：

疾患	機序
プラダー・ウィリー症候群Prader-Willi syndromeプラダー・ウィリー症候群（Prader-Willi syndrome）Prader-Willi syndrome（プラダー・ウィリー症候群）	父由来染色体15の特定座位の欠失
アンジェルマン症候群Angelman syndromeアンジェルマン症候群（Angelman syndrome）Angelman syndrome（アンジェルマン症候群）	母由来染色体15の特定座位の欠失

ヒストン修飾

ヒストンコードhistone codeヒストンコード（histone code）histone code（ヒストンコード）は、クロマチン-DNA相互作用がヒストン修飾 histone modification ヒストン修飾（histone modification） histone modification（ヒストン修飾）の組み合わせによって導かれるという仮説である。これらの修飾はヒストンテール（主にN末端）で起こり、ヒストン上の様々なタンパク質複合体を調節することで転写やその他の過程を制御する多くの組み合わせを生む→ヒストン修飾 histone modification ヒストン修飾（histone modification） histone modification（ヒストン修飾）がDNAの発現を決定する。

役割	機能
ライターwriterライター（writer）writer（ライター）	修飾を付加する
イレーサーeraserイレーサー（eraser）eraser（イレーサー）	修飾を除去する
リーダーreaderリーダー（reader）reader（リーダー）	存在する特定の修飾に応じて適切なタンパク質を動員する（ブロモドメイン、クロモドメイン、PHDフィンガー、WD40リピートなど）

ヒストンのアセチル化・脱アセチル化

ヒストンテールのリジンは、ヒストンN末端の特定リジンに作用する酵素により可逆的なアセチル化・脱アセチル化deacetylation 脱アセチル化（deacetylation）deacetylation（脱アセチル化）を受ける。

状態	機序	結果
アセチル化型	ヒストンアセチル基転移酵素histone acetyltransferase (HAT)ヒストンアセチル基転移酵素（histone acetyltransferase (HAT)）histone acetyltransferase (HAT)（ヒストンアセチル基転移酵素）により付加。リジンの正電荷が中和される	負電荷DNAへの引力 attractive force 引力（attractive force） attractive force（引力）が減弱→クロマチンがより凝縮していない「ビーズ・オン・ア・ストリングstringストリング（string）string（ストリング）」構造をとる→開いた遺伝子＝転写活性 transcriptional activity 転写活性（transcriptional activity） transcriptional activity（転写活性）化
脱アセチル化deacetylation 脱アセチル化（deacetylation）deacetylation（脱アセチル化）型	ヒストン脱アセチル化酵素histone deacetylase, HDACヒストン脱アセチル化酵素（histone deacetylase, HDAC）histone deacetylase, HDAC（ヒストン脱アセチル化酵素）により正電荷が回復	負電荷DNAへの引力 attractive force 引力（attractive force） attractive force（引力）が増加→さらなるクロマチン凝縮→閉じた遺伝子

ヒストンのメチル化・脱メチル化

特定ヒストンのメチル化は遺伝子発現と関連している。リジンはN末端に1、2、または3個のメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）が付加され（メチル基転移酵素methyltransferase メチル基転移酵素（methyltransferase）methyltransferase（メチル基転移酵素）による）、モノ・ジ・トリメチル化リジンを生成し、いずれも単一の正電荷を帯びる。ヒストン上のメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）は非常に安定だがヒストンリジン脱メチル化 demethylation 脱メチル化（demethylation） demethylation（脱メチル化）酵素により除去されうる。

⭐ ヒストンメチル化は、メチル化されるアミノ酸に応じて転写活性 transcriptional activity 転写活性（transcriptional activity） transcriptional activity（転写活性）化にも抑制にもなりうる。

H3ヒストンリジン9メチル化： 一部の共抑制因子 co-repressor 共抑制因子（co-repressor） co-repressor（共抑制因子）複合体はヒストンメチル基転移酵素 histone methyltransferase ヒストンメチル基転移酵素（histone methyltransferase） histone methyltransferase（ヒストンメチル基転移酵素）サブユニットを含み、H3リジン9をメチル化してジ・トリメチルリジンを生成する——これは染色体複製後も維持される。これらのメチル化リジンは、ヘテロクロマチンheterochromatin ヘテロクロマチン（heterochromatin）heterochromatin（ヘテロクロマチン）の凝縮に機能するHP1タンパク質のアイソフォーム isoform アイソフォーム（isoform） isoform（アイソフォーム）の結合部位となる。

ヒストンリン酸化（リン酸基PO₄²⁻の付加）

セリン・スレオニンthreonine スレオニン（threonine）threonine（スレオニン）側鎖のヒドロキシル基 hydroxyl group ヒドロキシル基（hydroxyl group） hydroxyl group（ヒドロキシル基）（-OH）の酸素は可逆的にリン酸化され、2つの負電荷を導入しうる。これらの翻訳後修飾 post-translational modification 翻訳後修飾（post-translational modification） post-translational modification（翻訳後修飾）はそれぞれ、クロマチン折りたたみの制御とDNA・RNARNA（ribonucleic acid）ポリメラーゼによる関連DNAの複製/転写能力に関与するクロマチン結合タンパク質の結合に寄与する。

修飾	酵素	効果
アセチル化——上方調節 upregulation上方調節（upregulation） upregulation（上方調節）	ヒストンアセチル基転移酵素histone acetyltransferase (HAT) ヒストンアセチル基転移酵素（histone acetyltransferase (HAT)）histone acetyltransferase (HAT)（ヒストンアセチル基転移酵素）：アセチル-補酵素 coenzyme 補酵素（coenzyme） coenzyme（補酵素） Aからアセチル基 acetyl group アセチル基（acetyl group） acetyl group（アセチル基）を転移	ヒストンテールのアセチル化は正味電荷を正から低正へ変化させる。これによりヒストンタンパク質とDNAの結合親和性 binding affinity 結合親和性（binding affinity） binding affinity（結合親和性）が一般に弱まり、DNAがよりアクセス可能になり、より多くの転写因子がDNA鎖に到達できるようになる
脱アセチル化deacetylation 脱アセチル化（deacetylation）deacetylation（脱アセチル化） ——下方調節 downregulation下方調節（downregulation） downregulation（下方調節）	ヒストン脱アセチル化酵素histone deacetylase, HDAC ヒストン脱アセチル化酵素（histone deacetylase, HDAC）histone deacetylase, HDAC（ヒストン脱アセチル化酵素）：Zn²⁺補因子（クラスI、II、IV）、NAD⁺（サーチュインSirtuinsサーチュイン（Sirtuins）Sirtuins（サーチュイン））依存性補因子（クラスIII、NAD加水分解に共役）	アセチル基acetyl group アセチル基（acetyl group）acetyl group（アセチル基）が外れてリジンの正電荷が戻ると、ヒストンと負電荷DNAの結合親和性 binding affinity 結合親和性（binding affinity） binding affinity（結合親和性）が上がり、クロマチンが凝縮してDNAが転写因子から遮蔽 shield 遮蔽（shield） shield（遮蔽）される
メチル化	リジンメチル基転移酵素 methyltransferaseメチル基転移酵素（methyltransferase） methyltransferase（メチル基転移酵素）/アルギニンarginine (Arg) アルギニン（arginine (Arg)）arginine (Arg)（アルギニン）メチル基転移酵素 methyltransferase メチル基転移酵素（methyltransferase） methyltransferase（メチル基転移酵素）：S-アデノシルメチオニン S-adenosylmethionine S-アデノシルメチオニン（S-adenosylmethionine） S-adenosylmethionine（S-アデノシルメチオニン） →S-アデノシルホモシステイン S-adenosylhomocysteineアデノシルホモシステイン（S-adenosylhomocysteine） S-adenosylhomocysteine（アデノシルホモシステイン）	ヒストンへのメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）付加は、メチル化されるアミノ酸と周囲の他のメチル/アセチル基acetyl group アセチル基（acetyl group）acetyl group（アセチル基）の存在に応じて、転写を活性化または抑制しうる
脱メチル化demethylation脱メチル化（demethylation）demethylation（脱メチル化）	リジン特異的脱メチル化 demethylation 脱メチル化（demethylation） demethylation（脱メチル化）酵素/アルギニンarginine (Arg) アルギニン（arginine (Arg)）arginine (Arg)（アルギニン）特異的脱メチル化 demethylation 脱メチル化（demethylation） demethylation（脱メチル化）酵素	—

flowchart TD
  A["活性<span class='jp-term jp-term-diagram' title='euchromatin'>ユークロマチン</span>：アセチル化ヒストン（Ac）"] -->|"ヒストン<span class='jp-term jp-term-diagram' title='deacetylation'>脱アセチル化</span>（<span class='jp-term jp-term-diagram' title='histone deacetylase'>HDAC</span>）"| B["凝縮<span class='jp-term jp-term-diagram' title='heterochromatin'>ヘテロクロマチン</span>：メチル化ヒストン（M）+<span class='jp-term jp-term-diagram' title='deoxyribonucleic acid'>DNA</span>メチル化"]
  B -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='histone acetylation'>ヒストンアセチル化</span>（<span class='jp-term jp-term-diagram' title='human African trypanosomiasis'>HAT</span>）+ <span class='jp-term jp-term-diagram' title='deoxyribonucleic acid'>DNA</span><span class='jp-term jp-term-diagram' title='demethylation'>脱メチル化</span>"| A
  C["DNMT（DNMT1/3A/3B）"] --> D["シトシン→5-メチルシトシン（SAM→SAH）"]
  D --> E["MBDタンパク質が5-メチルシトシンに結合"]
  E --> F["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='histone deacetylase'>HDAC</span>+抑制性<span class='jp-term jp-term-diagram' title='chromatin remodeling'>クロマチンリモデリング</span>複合体を動員"]
  F --> B

まとめ

エピジェネティクスEpigenetics エピジェネティクス（Epigenetics）Epigenetics（エピジェネティクス）はDNA配列を変えずに表現型を遺伝的に伝達する機構であり、DNAメチル化とヒストン修飾 histone modification ヒストン修飾（histone modification） histone modification（ヒストン修飾）という2つの相補的経路がクロマチン構造（延いては転写の可否）を決定する。
DNAメチル化はDNMTによりCpGのシトシンをメチル化し、MBDタンパク質がHDACを動員することで転写を抑制する——X染色体不活性化やゲノムインプリンティング genomic imprinting ゲノムインプリンティング（genomic imprinting） genomic imprinting（ゲノムインプリンティング）（Prader-Willi症候群Prader-Willi syndromePrader-Willi症候群（Prader-Willi syndrome）Prader-Willi syndrome（Prader-Willi症候群）、Angelman症候群）に関与する。ただし正常細胞ではプロモーター上のCpGアイランド CpG island CpGアイランド（CpG island） CpG island（CpGアイランド）は非メチル化に保たれ（98%が低メチル化 hypomethylation低メチル化（hypomethylation） hypomethylation（低メチル化））、メチル化されているのはバルクDNA側である¹²。
能動的脱メチル化 demethylation 脱メチル化（demethylation） demethylation（脱メチル化）はメチル基 methyl group メチル基（methyl group） methyl group（メチル基）の直接除去ではなく、TETによる5mC→5hmC→5fC→5caCの酸化とそれに続く除去修復 excision repair 除去修復（excision repair） excision repair（除去修復）として進む³⁴。
ヒストン修飾histone modification ヒストン修飾（histone modification）histone modification（ヒストン修飾）はヒストンコード仮説 histone code hypothesis ヒストンコード仮説（histone code hypothesis） histone code hypothesis（ヒストンコード仮説）のもとアセチル化（HATHAT（human African trypanosomiasis）、活性化）・脱アセチル化deacetylation 脱アセチル化（deacetylation）deacetylation（脱アセチル化）（HDAC、抑制）・メチル化（活性化/抑制どちらもありうる）・リン酸化として働き、ライターwriterライター（writer）writer（ライター）・イレーサーeraserイレーサー（eraser）eraser（イレーサー）・リーダーreader リーダー（reader）reader（リーダー）というタンパク質群がこれを制御する。
DNAメチル化とヒストン修飾 histone modification ヒストン修飾（histone modification） histone modification（ヒストン修飾）は独立して働きながら相互に補強し合い、ユークロマチンeuchromatin ユークロマチン（euchromatin）euchromatin（ユークロマチン） ⇄ヘテロクロマチン heterochromatin ヘテロクロマチン（heterochromatin） heterochromatin（ヘテロクロマチン）の可逆的な転換を通じて遺伝子発現の最終的なオン/オフを決定する。

出典

1.De novo methylation of the MyoD1 CpG island during the establishment of immortal cell lines（Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America・1990）バルクDNAはCpGが枯渇しており、そこに残るCpGのシトシンは大半がメチル化されている。一方CpGアイランドは、不活性X染色体上の遺伝子を例外として、正常組織では非メチル化に保たれている閲覧 2026-08-22
2.Genome-wide DNA methylation profiles in hematopoietic stem and progenitor cells reveal overrepresentation of ETS transcription factor binding sites（Genome Research・2012）プロモーター上のCpGアイランドは98%が低メチル化である一方、プロモーター外のCpGアイランドは20〜25%がメチル化されており、遺伝子本体（gene body）のメチル化は造血幹細胞・骨髄系前駆細胞で遺伝子発現と正の相関を示す閲覧 2026-08-22
3.Conversion of 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine in mammalian DNA by MLL partner TET1（Science・2009）TET1は2-オキソグルタル酸とFe(II)に依存する酵素で、5-メチルシトシンを5-ヒドロキシメチルシトシンへ酸化する閲覧 2026-08-22
4.Tet proteins can convert 5-methylcytosine to 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine（Science・2011）TET蛋白は5mCを5hmCに加えて5-ホルミルシトシン・5-カルボキシルシトシンへも酸化し、能動的脱メチル化はこの酸化とそれに続く除去（脱炭酸／塩基除去修復）を経て進む閲覧 2026-08-22
5.The nuclear DNA base 5-hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain（Science・2009）5-ヒドロキシメチルシトシンは全ヌクレオチドの0.6%（プルキンエ細胞）・0.2%（顆粒細胞）を占め、脳に豊富に存在する内在性のDNA塩基である閲覧 2026-08-22