便培養

🧠 全体像：便培養 stool culture 便培養（stool culture） stool culture（便培養） は「下痢の原因菌を捕まえて名前と薬剤感受性を確定する」検査であり、感染性下痢infectious diarrhea 感染性下痢（infectious diarrhea）infectious diarrhea（感染性下痢） のすべてに一律で行うものではない。発熱・血便・重症感といった「培養で治療方針 treatment strategy 治療方針（treatment strategy） treatment strategy（治療方針） が変わりうる」所見がある患者に絞って行うのが原則で、多くの急性下痢は自然軽快するため、無症候の下痢や軽症の水様便 watery stool 水様便（watery stool） watery stool（水様便） に一律に提出しても収穫は乏しい。

何を検出しているか

選択培地selective medium選択培地（selective medium）selective medium（選択培地）・鑑別培地を用いて便検体からサルモネラ・赤痢菌Shigella赤痢菌（Shigella）Shigella（赤痢菌）・カンピロバクターCampylobacterカンピロバクター（Campylobacter）Campylobacter（カンピロバクター）・大腸菌（志賀毒素Shiga toxin 志賀毒素（Shiga toxin）Shiga toxin（志賀毒素） 産生株を含む）・エルシニアYersinia エルシニア（Yersinia）Yersinia（エルシニア） などの腸管病原細菌を分離し、生きた菌株として同定・薬剤感受性検査drug susceptibility testing 薬剤感受性検査（drug susceptibility testing）drug susceptibility testing（薬剤感受性検査） に供する。近年は核酸増幅法 nucleic acid amplification test 核酸増幅法（nucleic acid amplification test） nucleic acid amplification test（核酸増幅法） を用いた培養非依存検査（CIDT）がパネル検査として普及しているが、これはDNADNA（deoxyribonucleic acid）の検出であり生存菌の証明ではない——培養と役割が異なる。

検体の採り方・適応と読み方

• 適応：発熱・血便または粘液便 mucoid stool粘液便（mucoid stool） mucoid stool（粘液便）・高度の腹部圧痛や痙攣・敗血症徴候を伴う下痢、渡航歴や食品曝露などの疫学的リスクがある下痢、集団発生が疑われる状況で行う¹
• 検体：「容器の形をとる」下痢便が最適な検体で、迅速に液状便を採取できない場合は直腸スワブ rectal swab 直腸スワブ（rectal swab） rectal swab（直腸スワブ） で代用できる¹
• 採取数：単一検体で十分という推奨はClostridioides difficile毒素検査（核酸増幅法nucleic acid amplification test核酸増幅法（nucleic acid amplification test）nucleic acid amplification test（核酸増幅法））に限った規定であり、細菌培養そのものについて複数回採取の要否を定めた明確な根拠はない¹
• 鮮度：新鮮 fresh 新鮮（fresh） fresh（新鮮） な検体であることが検出感度に直結する。採取から検査室到着までの時間が長いほど菌の生存性が落ち、偽陰性の原因になる

陽性・陰性の意味

• 陽性：病原体が分離されれば、薬剤感受性まで確認したうえで標的治療 targeted therapy 標的治療（targeted therapy） targeted therapy（標的治療） へ絞り込める。赤痢では超多剤耐性 extensively drug-resistant (XDR) 超多剤耐性（extensively drug-resistant (XDR)） extensively drug-resistant (XDR)（超多剤耐性） （XDR）株が2011〜2015年の0%から2023年には8.5%へ増加しており、経験的な単剤選択に頼らず培養・感受性検査susceptibility test 感受性検査（susceptibility test）susceptibility test（感受性検査） の結果を待つ意義が増している²
• 陰性：単一の便培養 stool culture 便培養（stool culture） stool culture（便培養） が陰性でも、検体の質・鮮度・提出時期によっては病原体を見逃しうる。臨床的に細菌性を強く疑うなら、症状の推移とともに再評価する

測定上の注意

⚠️ CIDT陽性は培養で確認する。 培養非依存検査（CIDT）陽性の検体を培養にかけると、実際に病原体が分離できるのは57%にとどまり、培養そのものから得られた分離株 isolate 分離株（isolate） isolate（分離株） の回収率95%と大きな差がある³。CIDTはDNAを検出するのであって生存菌を証明するものではなく、薬剤感受性検査drug susceptibility testing薬剤感受性検査（drug susceptibility testing）drug susceptibility testing（薬剤感受性検査）・パルスドフィールドゲル電気泳動 gel electrophoresis ゲル電気泳動（gel electrophoresis） gel electrophoresis（ゲル電気泳動） や全ゲノムシーケンシング whole genome sequencing 全ゲノムシーケンシング（whole genome sequencing） whole genome sequencing（全ゲノムシーケンシング） による分子疫学 molecular epidemiology 分子疫学（molecular epidemiology） molecular epidemiology（分子疫学） 解析・アウトブレイクoutbreak アウトブレイク（outbreak）outbreak（アウトブレイク） のクラスター cluster クラスター（cluster） cluster（クラスター） 識別にはいずれも生きた分離株 isolate 分離株（isolate） isolate（分離株） が必要になる。CIDTが陽性でも、公衆衛生public health 公衆衛生（public health）public health（公衆衛生） 報告が必要な状況や治療方針 treatment strategy 治療方針（treatment strategy） treatment strategy（治療方針） を左右する場面では培養での確認提出を省略しない¹³。

• 抗菌薬投与後に採取すると、菌の生存性が落ち偽陰性になりやすい。可能なら投与前に採取する
• セレニー試験Sereny test セレニー試験（Sereny test）Sereny test（セレニー試験） のような動物実験 animal testing 動物実験（animal testing） animal testing（動物実験） を要する歴史的な補助検査は、現在は培養・分子生物学的検査molecular methods 分子生物学的検査（molecular methods）molecular methods（分子生物学的検査） に置き換えられている

経時変化とモニタリング

便培養stool culture 便培養（stool culture）stool culture（便培養） は診断確定のための単回検査として用い、治癒確認のための反復 test of cure 反復（test of cure） test of cure（反復） は通常の細菌性腸炎 Bacterial Enterocolitis 細菌性腸炎（Bacterial Enterocolitis） Bacterial Enterocolitis（細菌性腸炎） では推奨されない。慢性保菌が疑われる場合や集団発生の終息 resolution 終息（resolution） resolution（終息） 確認など、公衆衛生public health 公衆衛生（public health）public health（公衆衛生） 上の必要がある場合に限って再検を検討する。

まとめ

• 便培養stool culture 便培養（stool culture）stool culture（便培養） は感染性下痢 infectious diarrhea 感染性下痢（infectious diarrhea） infectious diarrhea（感染性下痢） のうち、発熱・血便・重症感など治療方針 treatment strategy 治療方針（treatment strategy） treatment strategy（治療方針） が変わりうる患者に絞って提出する
• 検体は「容器の形をとる」新鮮 fresh 新鮮（fresh） fresh（新鮮） な下痢便が最適で、単一検体の採取で足りる
• 陽性なら薬剤感受性まで確認でき、XDR赤痢菌 Shigella 赤痢菌（Shigella） Shigella（赤痢菌） のような耐性菌の増加を踏まえると経験的治療 empiric therapy 経験的治療（empiric therapy） empiric therapy（経験的治療） より重要性が増している
• CIDT陽性を培養で確認する意義は、薬剤感受性検査drug susceptibility testing薬剤感受性検査（drug susceptibility testing）drug susceptibility testing（薬剤感受性検査）・分子疫学molecular epidemiology 分子疫学（molecular epidemiology）molecular epidemiology（分子疫学） 解析・アウトブレイクoutbreak アウトブレイク（outbreak）outbreak（アウトブレイク） 対応にある。CIDTは生存菌を証明しない
• 抗菌薬投与後の採取や検体の鮮度低下は偽陰性の原因になる