Genetics

Genetics · 10.1

配偶子形成

Gametogenesis

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W13Practice / 実習

🧠 このセミナーは「の原因を突き止める」という臨床課題を軸に、の細胞生物学(のリスク)→という3段階のロジックで読む。 2つの実症例(D-精子症)はいずれも「不妊の原因を全ゲノム規模の検査で遡って突き止める」という同じ探偵仕事のパターンを示す。

配偶子形成のリスク

生殖細胞が接合体になるというの本質的リスクは、——の原因(02-1-genetic-aspects-of-atypical-mitosis-and-meiosisも参照)。

の起こりやすさは「染色体の種類」と「どちらのか」で系統的に異なる。 常染色体トリソミーの大半は減数分裂Iのエラーに由来する(02-2-chromosomal-aberrations別頻度表も参照)。一方、は精子形成でより高頻度——常染色体とで「どちらの親でリスクが高いか」が逆転する点に注意。

受精のプロセス

減数分裂IIの完了→雄の脱凝縮→の形成→→接合体——は2つのをもつ状態で観察される(Day 1、直径約0.1mm)。卵管を通じて輸送される。

症例1:不妊と診断オデッセイ——D-二機能性タンパク欠損症

35歳男性、小児期から進行する障害・感音難聴・不妊。のないに健常な両親の息子で、健常・妊孕性のある姉妹が1人。

不妊の疫学: 12か月後に妊娠しないカップルの割合を不妊と定義——1年以内の妊娠成功率85〜90%、カップルの約15%が不妊

精査: (spermiogram:肉眼的検査・+白血球・細菌の有無)でを確認。非閉塞性の稀なでも全体の5%未満——(既知変異は少数)、、転座を伴う男性(偽、SRY転座、04-2-role-of-sex-in-inheritance参照)、点変異/CNV(USP26・SOX3・TEX11・TEX14・MEIOB・DNAH6・DAZL・DAX-1・DMRT1等)。

内分泌検査: テストステロン低値(164 ng/dL、基準270〜1100)、FSH高値(15 mIU/mL、基準1〜8)、LH・・プロラクチンは正常範囲。血中アミノ酸プロファイル異常・グルタミン酸・・リジン・が軒並み超)。

の経過: ①ミトコンドリア・症関連18遺伝子のパネル検査(SCA1〜17・DRPLA・FRDA・AOA1/2・POLG・MELAS・MERRF・NARP)は陰性、②検査は正常、③標的シーケンシング(mtDNA+核遺伝子1,598個のエクソン)で1,569個のSNV・InDelを検出——HSD17B4遺伝子(17β-ヒドロキシステロイド脱水素酵素IV、に関与)のエクソン11-13の13kb欠失+SNV(c.587C>T; p.A196V)を同定。

——2つの異なる変異(欠失+)の組み合わせがこの疾患の正体だった。 を、遺伝子特異的PCR(野生型386bp vs 欠失特異的785bp)で欠失を確認——診断:D-、通常生後2年以内に致死的なの重篤な障害。HSD17B4の劣性変異は(Perrault syndrome:卵巣形成異常+感音難聴、末梢神経障害・を伴うことがある)の原因としても最近同定されている——1つの遺伝子が複数の臨床像(の変動)を生む例(04-1-monogenic-inheritance参照)。

生殖補助医療

不妊治療に用いられる医療技術——3つの軸で分類される:①配偶子の由来(夫婦 or ドナー)、②受精の場(妻の体内、検査室、代理母)、③妊娠の担い手(妻、代理母)。

分類 内容
夫=父、妻=母(第三者を介さない)
第三者(ドナー・代理母等)が関与

主な技術:

適応: (精子異常:精子症・)、を要する場合、女性不妊+健常精子(卵管等:通常のIVF)。も受精に利用可能な場合がある。

胚培養の基本要件: 培養液(20種のアミノ酸を含む)、低酸素濃度、低/無VOC環境、最長培養5日間——EmbryoScope(内蔵・顕微鏡によるモニタリング)は形態・に基づく胚選択を支援する。胚は接合体から(blastocyst、Day 5)まで発生し、通常Day3またはDay5で移植される。

着床前遺伝学的検査

胚が抱える遺伝的リスクには(sporadic:無作為、加齢関連)再発性(の遺伝による)の2種がある。

PGT(2017年に導入された総称)=・胚の、またはHLA型を判定するすべてのDNA検査。

目的
PGT-A のスクリーニング
PGT-M のスクリーニング
PGT-SR のスクリーニング
PGT-HLA HLA型判定(同胞のHLAマッチング)

生検組織の種類と比較

組織 採取時期 利点 欠点
卵/期(E0.5) 倫理的・法的に受容されやすい、によるがない、検査時間を確保しやすい、胚への影響が少ない 母方由来の情報のみ
(1〜2個) 期(E3) 一部PGT適応に広く適用可能、エラー検出可能 が多い、着床率が低下(39%)、全胚が同日にに達するわけではない
(5〜10細胞) (E5) 多細胞→DNA量が多くの影響が少ない、胚生検の影響が少ない/なし、単一を後押し、・ガラス化保存いずれにも対応 法では洗浄が必要、6〜8細胞期胚までしか検査できない場合がある、胚の凍結保存が必要

PGTの の家族歴、片親のリスク)、反復IVF不成功、習慣流産、同胞のHLAマッチングを目的とした胚選択。

PGT/PGS で用いられる分子遺伝学的手法

(G分染、、QF-PCR、FISH、04-8-sex-linked-inheritance参照)、aCGH(array comparative genomic hybridization)、NGS。

💡 aCGH(比較ゲノム)は「2色の蛍光シグナルの相対強度」でを読む手法。 被検試料と対照試料をそれぞれ異なるで標識し、健常人のスプレッド(またはアレイ)ににハイブリダイズさせる——シグナル比率が均等(=1)なら正常、相対比>1.2で余剰コピー(重複)<0.85で欠損と判定する。分解能は約100kb——(5〜10Mb)よりはるかにだが、FISHと異なりあらかじめ選んだ領域に限定されない全ゲノム的な検査が可能。欠点:腫瘍検体では健常細胞の混入()が結果に影響しうる。 疾患特化型アレイ(DMDアレイ等)、血液腫瘍・がんアレイ、出生前アレイ、着床前アレイ。

症例: ある症例では胎児で第11染色体q22.3-q23.3領域に8.97Mbの欠失がaCGHで検出された。

症例3:家族性球状精子症とSPATA16遺伝子

生殖医療センターを受診した家系——6人の兄弟(罹患3人・健常3人)と4人の姉妹。健常な3人の兄弟はそれぞれ7人・6人・5人の子をもうけたが、罹患した3人の兄弟は子をもたず、を伴う完全精子症(円頭・欠損:roundheadedness and acrosomelessness)を呈した。

ICSIを実施したが受精率は不良で妊娠に至らなかった。 Y染色体04-8-sex-linked-inheritanceのAZF領域も参照)は検出されず、核型は46,XYと正常。

10Kの全ゲノムSNPアレイが「」という隠れた背景を暴いた。 6人の兄弟全員に広範なホモ接合領域が観察され、家系内の2〜3親等のが示唆された——SPATA16遺伝子(精子形成関連16)エクソン4のSNP(c.848G>A)が原因変異として同定され、認識部位(NciI/HpaII)を破壊するであることが確認された。がホモ接合劣性疾患の発見に果たす役割を、実際の家系解析で示す好例(04-6-autosomal-recessive-inheritance-ar-iの議論、06-1-population-geneticsの家族内ゲノム類似性の項も参照)。

まとめ

  • の本質的リスクはで、常染色体トリソミーは減数分裂Iに、は精子形成により多く由来する。受精は減数分裂II完了→→融合という経過をたどる。
  • 症例1(DBP欠損症/)は、・内分泌異常・血中アミノ酸異常から出発し、標的シーケンシングでHSD17B4遺伝子の変異(欠失+)にたどり着く診断オデッセイを示す。
  • ARTは相同的/異型的の別、GIFT/IVF/ICSIという技術、EmbryoScopeによる胚モニタリングを含み、PGT(A/M/SR/HLA)はという3種の生検組織(それぞれ異なる利点・欠点)を対象に、からaCGH・NGSまでの手法で実施される。
  • aCGHは2色蛍光シグナル比により変化を約100kb分解能で検出する。症例3(家族性精子症)はSNPアレイによるマッピングがの同定とSPATA16遺伝子変異の発見に直結した実例。