Genetics

Genetics · 9.1

生物学的過程の遺伝学

Genetics of biological processes

タグ
W7Lecture / 講義
疾患
Kallmann症候群Li-Fraumeni症候群

🧠 この講義は「(細胞はどう自分の運命を知るか)」「性の遺伝学(SRY1つで性が決まる)」「がん遺伝学(正常な発生プログラムが暴走するとがんになる)」という3つの柱で読む。 発生・性決定・がんは一見バラな主題に見えるが、いずれも同じ論理装置——の濃度勾配、遺伝子発現の精密な調節、の蓄積——で貫かれている。

発生遺伝学

は、・細胞specification・精密に統御された遺伝子発現ネットワーク・マークの組み合わせによって特徴づけられる。

初期胚発生

受精→着床→16日でへと発生が進む。Oct4・Nanog・Sox2を与え、の形成に必須。にはNODAL・FGF8、SNAI群転写因子、Tボックス転写因子EOMES、塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子MESP1・MESP2が関与する。

分化能の階層

分化能 該当細胞 状態
接合体 DNAの全体的メチル化
、胚、iP 活性X染色体、分化関連遺伝子の抑制
成体の幹細胞 プロモーター、X不活性化、生殖細胞系列特異的遺伝子の抑制
分化した細胞

のiP(誘導幹細胞)は「転写因子の力だけで、時間を巻き戻せる」ことを証明した——2012年ノーベル賞。 転写因子(Oct4・Sox2・Klf4・c-Myc等)を導入するだけで、分化済みの体細胞を状態へできる——再生医療への応用が期待される一方、現時点で安全性・有効性が確立された幹はごくわずかという現実的な限界も認識すべき。

細胞は「自分が誰で、どこにいるか」をどう知るか

問い 機構
私は誰か(Who am I?) による受容体・転写因子の不均等分配
私はどこにいるか(Where am I?) (morphogen=シグナル分子)、細胞-細胞相互作用、細胞-相互作用、

・胚由来の可溶性因子——濃度勾配が発生方向を決める情報の担い手。主要なファミリー:Hedgehogタンパクファミリー、TGF-βファミリー、WNTファミリー(Winglessの変異に由来)、FGF。

症例:ソニックヘッジホッグによる神経管パターン形成

SHH遺伝子をコードし、、後に腹側神経管ので発現——中枢神経系・筋・四肢の発生、左右非対称性に関与する。

flowchart TD
  A["腹側神経管<span class='jp-term jp-term-diagram' title='Centrocytes'>中心細胞</span>(フロアプレート)がSonic hedgehogタンパクを分泌"]
  A --> B["濃度勾配が形成される"]
  B --> C["高濃度:運動ニューロンに分化"]
  B --> D["中程度:運動ニューロンに分化"]
  B --> E["低濃度:<span class='jp-term jp-term-diagram' title='sensory neuron'>感覚ニューロン</span>に分化"]
  B --> F["SHHが欠損:運動ニューロンが形成されず致死"]

⚠️ Sonic hedgehogは「両目を分離させる」役割も担う——シグナルが弱いとになる。 胚の顔面は本来1つの長く幅広い目をもつ構造から出発し、Sonic hedgehogのシグナル伝達によって左右の目が分離する——ヘッジホッグシグナル伝達が低下すると目が分離せず、を来す。

頻度100万人に1人、を示す(04-1-monogenic-inheritance参照)。

ホメオボックス遺伝子

Hox遺伝子(homeobox配列を含む):60アミノ酸のヘリックス-ターン-ヘリックスをコードし、体軸に沿ったを与える(最大13ボックス、空間的共直線性=spatial colinearity)。

HOXD13変異は「拡大+」というと同じ分子文法をもつ——ただし帰結はではなく指の形成異常。 II型はHOXD13遺伝子のコード領域拡大(ポリ病)が原因(03-1-genetic-variationsの項も参照)。SHH遺伝子とHOXD遺伝子の相互作用の変異はを引き起こす——は独立ではなく、互いに協調して発生パターンを作る。

体細胞モザイシズムと発生初期の変異蓄積

💡 「体のすべての細胞は同じDNAをもつ」は正確ではない——ヒトの最中から、細胞は少しずつ違うゲノムを蓄積し始める。 ヒトでは、1回あたり約3個の塩基置換変異が生じると推定される(主に2つの既知の変異シグネチャーに起因)——一生を通じて体細胞は独自の変異を蓄積し続ける(03-1-genetic-variationsの項も参照)。

症例: 遺伝子(心臓の電気活動に関わる)を心臓の異なる部位から採取した細胞で解析したところ、右心では5%超、左心ではほぼ12%の細胞が変異遺伝子をもっていた——同一個体の同一臓器内でも、部位によりの分布が大きく異なりうる。

性の遺伝学:性決定

性決定の2要因: 遺伝的要因(SRY等の遺伝子)と環境要因(温度・体格・、爬虫類等での卵性決定など)。SOX9(SRY関連HMGボックス遺伝子9、第17染色体上)——だけでなく常染色体も性決定に関与する好例。

SRY:精巣決定因子

SRYは「通常の転写因子」ではない——HMGボックスでDNAを曲げることで、他の因子の結合を助ける建築家のような働きをする。 かつてTDF(testis determining factor)と呼ばれたSRYは、DNAに結合して構造を変化させる(曲げる)ことで他の転写因子の機能を助ける、因子。

flowchart TD
  A["Y染色体上のSRY遺伝子"]
  A --> B["SOX9活性化"]
  B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='Sertoli cells'>セルトリ細胞</span>の分化<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='anti-Müllerian hormone (AMH)'>抗ミュラー管ホルモン</span>分泌 → 女性生殖器分化の抑制"]
  B --> D["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='Leydig cells'>ライディッヒ細胞</span>の分化<br>テストステロン分泌 → 男性生殖器分化の誘導"]

性発達異常

⚠️ はSRYの「引っ越し」で起こる——染色体数ではなくSRYの所在地がすべてを決める(02-2-chromosomal-aberrationsも参照)。 男性減数分裂I(雄性)中の異常な交差組換えにより、SRY遺伝子がY染色体からX染色体のへ転座すると46,XX男性、SRYがY染色体から失われると46,XY女性が生じる。

疾患 遺伝形式 機序 臨床像
X連鎖劣性 テストステロン受容体変異 46,XY核型、血中テストステロン正常、女性の外性器、不妊(04-8-sex-linked-inheritanceも参照)
多くはX連鎖(KAL1遺伝子、X染色体PAR1) KAL1がコードするの変異——神経細胞の移動(一部はへ、一部は視床下部へ)が障害される→GnRH()欠如→性腺分化不全 ——で治療

がん遺伝学

38組織・2,600超の腫瘍を対象とした国際的な研究により、がんの遺伝的基盤に関する膨大な知見が得られている。生涯でのがん罹患確率は約40%。 腫瘍の10%未満が型遺伝だが、遺伝子型()は全体のがんリスクに影響する(複合形質、05-1-complex-inheritance参照)。

💡 がんは「単一細胞に由来する、の蓄積による多段階」——クローン性がその本質。 がんゲノムは平均して4〜5個のをもち、これが選択的増殖優位性を細胞に与える(研究対象腫瘍のわずか5%のみが既知のドライバー異常をもたなかった)。多くのがんは(17.8%)(22.3%)と呼ばれる「ゲノム的大災害」の痕跡を示す——1回の破局的事象で多数のが生じ、染色体断片が寄せ集められて再構成される現象。

生殖細胞系列変異 vs 体細胞変異

定義
両親のいずれかから遺伝しうるDNA配列の変化
精子・以外の細胞に生じる変化——がん細胞とその子孫細胞にのみ存在し、患者の正常細胞には存在しない

がんの5〜10%のみが明確な遺伝性成分をもつ(例:乳がんにおけるBRCA1・BRCA2)——遺伝性の素因が明確な場合でも、がんの発症には体細胞変化が必要。アンジェリーナ・ジョリーがBRCA1変異による乳がんリスク上昇を理由に予防的乳房切除を選択した事例が広く知られる。

vs =クローンに選択的増殖優位性を与える、=クローンの適応度に03-1-genetic-variationsも参照)。タンパクコード領域のの多くは既知のホットスポット(KRAS・BRAF・PIK3CA・TP53・IDH1)に集中する。大腸腺がんでは、APC変異が最も早期に生じ、続いてKRAS、17p欠失、TP53、SMAD4という順序で蓄積する——全ゲノム重複はが複数蓄積した後に起こる。

がん関連遺伝子の3分類

分類 遺伝形式 内容
がん遺伝子 優性、通常体細胞性 原がん遺伝子の
がん抑制遺伝子 では劣性だが、しばしば優性遺伝性素因を生む ——両アレルの変異(性の消失、LOH:loss of heterozygosity)を要する
DNA修復に関与、生殖細胞系列・体細胞両方の変異率に影響(例:BRCA1・BRCA2)

よりずっと頻度が高い——両アレルが変異していても。 がん抑制遺伝子の不活性化には両アレルの変異を要するにもかかわらず、実際の頻度は型(がん遺伝子)変異より高い。Ras遺伝子(HRAS・NRAS・KRAS)の点変異(例:Gly12Val)は最も頻度の高いがん遺伝子変異——活性化RasタンパクのGTP加水分解能が低下し、外部リガンドとにシグナル伝達が持続的に活性化される。がん患者の25%がRas変異を保有し、膵がんでは90%に達することもある。RAS原がん遺伝子とP53がん抑制遺伝子の変異はがんの60%超に見られる、最も頻度の高い変異。

症例:p53とリー・フラウメニ症候群、網膜芽細胞腫の2ヒットモデル

TP53がん抑制遺伝子はヒトがんの約60%で変異している。片方の変異p53アレルを生殖細胞系列に受け継ぐとリー・——複数臓器に稀ながんを発症する。2番目のアレルがで失われて初めて腫瘍が発生するため、常染色体優性の家系内遺伝形式をとる(実際の腫瘍発生機序はで劣性)。

の「」の原型——遺伝性かかで、必要な変異回数が変わる。 片側性・は家族歴のない小児に発生する(2回のが必要)。両側性・遺伝性のは、アルフレッド・の「2ヒット変異モデル」の原型——1回目の変異(RB遺伝子)は生殖細胞系列で既に受け継がれており、体細胞での2回目の変異だけで発症する。手術・放射線治療のは90%。

ミューテーター遺伝子と環境発がん物質

がんは変異によって引き起こされるため、変異率を上昇させる因子は発がん率を上昇させる——(例:BRCA1・BRCA2)の変異はこの経路の代表例。多くの環境因子(、carcinogen)もDNA損傷・変異を引き起こしがんにつながる。

転座による融合遺伝子:フィラデルフィア染色体

t(9;22)転座によるBCR-ABL融合タンパクはチロシンキナーゼ活性の亢進を招き、の一部を引き起こす——(グリベック)という分子標的薬による治療が可能(02-2-chromosomal-aberrationsも参照)。

💡 がん患者の血液からは、健常者には見られない染色体異常が検出される——「血液によるがん検査」への応用が期待される所以。 ある研究では、調べたがん患者全員の血液に染色体異常が検出された一方、10人の健常対照者は誰一人陽性を示さなかった——普遍的な血液がん検査への一歩として位置づけられる。

エピジェネティクスとがん

プロモーターの(がん抑制遺伝子の不活性化)・(がん遺伝子の活性化)・——IGF2(インスリン様2)遺伝子は正常細胞ではアレルのみが発現するが、大腸がんではアレルも発現する(03-2-epigenetics参照)。

ウイルスと発がん感受性

DNAがんウイルス(例:ヒトパピローマウイルス、HPV)は典型的にp53・Rbを不活化することでがん抑制機構を阻害する——HPVは粘膜・その下の前駆細胞に感染し、ウイルス亜型に応じ子宮頸がん・頭頸部がんのリスクを高める。ウイルス由来のプロモーター/の挿入が、がん遺伝子近傍に入り込むことで発がんに寄与することもある。

がん進化における遺伝的異質性

とその内、あるいは同一組織型の異なる腫瘍間(腫瘍内=intra-tumour、腫瘍間=inter-tumour)に、異なる遺伝子型・表現型・生物学的挙動をもつ細胞亜集団が存在すること——単一の腫瘍でさえ「1つのがん」ではなく、進化するクローンの集合体として理解される。

まとめ

  • は、遺伝子発現ネットワーク・シグナル伝達・マークの組み合わせでを決定する。(Sonic hedgehogが代表例)の濃度勾配とが細胞の「自己認識」を可能にし、iP技術(山中因子)はこの分化の方向を人為的に逆転できることを示した。ヒトの最初期からは蓄積し始める。
  • 性決定はSRY→SOX9→セルトリ/分化という経路で進み、SRYの染色体間転座(PAR1への移動・Yからの脱落)だけでが起こる。AIS・はこの経路の破綻例。
  • がんは単一細胞由来のクローン性・多段階で、の蓄積(平均4〜5個)と/という染色体大変動を特徴とする。がん遺伝子(優性、)・がん抑制遺伝子(で劣性、LOHを要する)・(DNA修復)の3分類が体系を作る。
  • p53/リー・は、の組み合わせが「見かけ上優性」の遺伝パターンを作る仕組みを説明する。・DNAがんウイルスは、それぞれ異なる経路でがん抑制機構を阻害する。は、単一腫瘍内にも進化するクローンの集合が存在することを示す。