Genetics

Genetics · 4.1

単一遺伝子遺伝

Monogenic inheritance

タグ
W5Lecture / 講義
応用トピック
単一遺伝子疾患の遺伝形式
薬剤
ボレチゲン ネパルボベク
疾患
Bardet-Biedl症候群Leber先天黒内障Usher症候群フェニルケトン尿症網膜色素変性

🧠 は「の法則に従う」という一言で定義されるが、実際には優性・劣性という単純なを崩す現象(効果)に満ちている、と読む。 型)・)・)・SMA/嚢胞性線維症(劣性、)という4つのを軸に、優性/劣性を決めると、それを修飾する現象を体系的に押さえる。

遺伝形式の3分類

遺伝子数 頻度 の法則
1つ 従う
少数 部分的に従わない
多因子遺伝(polygenic/multifactorial inheritance) 多数+環境 従わない(環境効果を含む)

遺伝性疾患の頻度比較

分類 疾患 頻度
1:100
2型糖尿病 1:50
1:10
乳がん(女性) 1:10
(AD) 1:10,000
(AD) 1:10,000
(AD) 1:500
(AD) 1:800
嚢胞性線維症(AR) 1:3,600
(AR) 1:12,000
(AR) 1:1,000〜10,000
(AR) 1:8,000
(XR、男児) 1:4,500
ミトコンドリア性 1:50,000
染色体性 (欠失) 1:30,000
(トリソミー) 1:500(通常は非遺伝性)

💡 染色体異常とは「変異の規模」で区別される。 (染色体数の変化:)・染色体変異(:アンジェルマン/)はまたは技術で検出できる規模の変化だが、(嚢胞性線維症・血友病等)は純粋な遺伝子変異が背景にある——両者は変異の「大きさ」という同じ物差しの延長線上にある。

遺伝子-環境相互作用スペクトラム

⚠️ 「純粋に遺伝的」「純粋に環境的」な疾患は実質的に存在しない。 に打たれる・交通事故のような純粋環境要因と、(理論上の)純粋遺伝要因の間に、実際の疾患はすべて分布する——・嚢胞性線維症は遺伝寄与が非常に大きい側、結核・は環境寄与が大きい側、心疾患・がん・糖尿病・肥満・喘息・関節リウマチ・PKU・・自閉症・はその中間に分布する。表現型=遺伝子型++環境+他の遺伝子という多因子方程式で決まる。

基本用語:対立遺伝子と遺伝的異質性

遺伝子上の、父方・母方染色体それぞれに存在するDNA配列の別バージョン。2倍体細胞では同一遺伝子につき2つの遺伝子が存在し、それらの関係性により遺伝形式が優性か劣性かが決まる。

用語 定義
異なる遺伝的機序が同一・類似の表現型を生む総称
異なる遺伝子座の変異が同一・類似の表現型を生む 100種以上)、難聴(120種以上)
内の異なる変異が同一・類似の表現型を生む
ある形質の遺伝子が集団レベルで2つを超える遺伝子をもつ(表現型が異なる場合のみ) ABO血液型(3つの健常型)、MHC遺伝子(世界人口で数百のアレル)

単一遺伝子(メンデル型)遺伝の定義

の法則に従い、同一染色体遺伝子座上の1対の遺伝子が形質・疾患の責任を負う。既知の型ヒト形質・疾患は7,000種を超えるが、は7,000種未満(同一遺伝子の異なる変異・などが複数疾患に対応するため)。

⚠️ 優性・劣性は「表現型」の性質であって「遺伝子」の性質ではない——この混同は頻出の誤り。 「優性遺伝子」「劣性遺伝子」という言い方は不正確——優性・劣性はその遺伝子が生み出す表現型を記述する概念である。

なぜ優性か、なぜ劣性か——分子機序

flowchart TD
  A["変異の種類"]
  A --> B["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='gain-of-function mutation'>機能獲得型変異</span><br>新規の有害タンパクが作られる、または本来不活性であるべき状態でタンパクが働き続ける<br>→ 一般に優性"]
  A --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='loss-of-function mutation'>機能喪失型変異</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='nonsense mutation'>ナンセンス変異</span>・<span class='jp-term jp-term-diagram' title='frameshift mutation'>フレームシフト変異</span>、タンパクが正常な機能を果たせない<br>→ 一般に劣性(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='heterozygote'>ヘテロ接合体</span>で発現しないことが多い)"]
  C --> D["例外:<span class='jp-term jp-term-diagram' title='haploinsufficiency'>半数不全</span><br>1コピーでは正常機能に不十分 → 優性"]
  C --> E["例外:<span class='jp-term jp-term-diagram' title='dominant negative effect'>優性阻害効果</span><br>変異産物が正常アレルの産物の機能まで妨げる → 優性"]

💡 でも優性になるかどうかは「失われた機能が生体にどう影響するか」で決まる。 一般にを示すが、①(正常量の半分では正常機能を維持できない)、②(変異タンパクが正常タンパクの働きまで積極的に阻害する)という2つの機序では、でも表現型が現れ優性になる。

性の消失——優性アレル側の(微小)欠失により、本来隠れているはずの劣性アレルの表現型が顕在化する現象。染色体(微小)欠失が原因になりうる——「古典的な遺伝はほとんど存在しない」というこの講義の裏テーマを象徴する現象。

古典的メンデル表現型を修飾する現象

現象 内容
同じ遺伝子型でも症状の重症度が個体間で変動する
変異アレルをもつ個体のうち実際に表現型を示す割合(=incomplete penetrance)
が特定環境下でより生存上有利
世代を重ねるごとに発症年齢が早まる・重症化する
同一遺伝子の2つの異なる変異アレルを組み合わせてもつ状態
加齢の 発症・表現型が年齢に依存する
1つの遺伝子変異が複数の器官系に影響する
上記参照
遺伝子変異なしに環境要因だけで遺伝性疾患と同じ表現型が生じる

モノアレリック発現

遺伝子の約15〜20%は複数組織で片方の遺伝子のみが発現する()——組織・細胞ごとに発現するアレルは異なりうるが、集団平均としては両アレルが混在するため、では実質的に効果が保たれる。

決定タイミング 決定機序
早期 、厳密に決定(03-2-epigenetics参照)
生涯を通じたどの時点でも ランダム

は、の変動・という現象の説明候補の1つになる。

モディファイア遺伝子の例:眼の色

💡 青い目は「なぜ生まれたか」に答えのない、進化の気まぐれ(game of nature)。 6,000〜10,000年前、HERC2遺伝子内の調節領域に生じたSNPがOCA2遺伝子(メラニン産生)の発現を抑制するとして生じ、青い目という表現型を作った——有利でも不利でもない中立的な変異が、単一の起源から広まった好例。成熟に関わる8個以上の追加遺伝子(、modifier gene:他の遺伝子の表現型・分子発現に影響する遺伝子)も眼の色に関与する。

オリゴジェニック遺伝

遺伝子産物は転写・スプライシング・翻訳・・オリゴマー形成・代謝・RNA(効果)という緻密に制御された相互作用を通じて効果を発揮する——嚢胞性線維症・はオリゴジェニック効果が証明されている実例で、今後も増加が見込まれる。

常染色体優性遺伝

既知の優性形質2,200種超、疾患頻度は出生1,000件あたり0.1〜3件。好発:骨格系・結合組織・神経系。AD変異の起こりやすい遺伝子種類:・がん原遺伝子。

AD遺伝の特徴

  • AA・Aaいずれの遺伝子型でも疾患が発現の両方)。
  • 表現型はよりしばしば重症(例:)、時に致死的(例:)。
  • 重症度・頻度は男女で同等
  • 父親の年齢の発生を促進しうる。
  • の変動・をしばしば伴う。
  • でも発現する理由:

AD疾患の分子機序別分類

変異遺伝子の種類 疾患例 主な修飾現象
変動、

症例:軟骨無形成症

FGFR3()遺伝子(4p16.3)の変異——大半は孤発例(。FGFR3はとして細胞周期・を制御する。:受容体がリガンド非存在下でも活性化されたままになる。

同じFGFR3遺伝子の「どこに」変異が入るかで、3つの異なる重症度の疾患が生まれる——の教科書例。 変異部位によりという重症度の異なる3疾患が生じる。

⚠️ なぜ父親の年齢がAD疾患のリスク因子になるのか——が鍵。 は生殖細胞系列の有糸分裂中に発生しうる——父親自身は表現型的に健康だが変異を保有し、子に伝達しうる(次子の再発リスクは約5%)。精子形成が生涯継続する男性では、加齢に伴い生殖細胞系列に変異が蓄積しやすい。

症例:多指症

GLI3遺伝子(zinc finger転写因子、Sonic Hedgehogシグナル伝達を)の調節タンパク変異——の変動・(複数の異なる遺伝子が変異しうる)を示す代表例。

症例:骨形成不全症

I型コラーゲン遺伝子(7q)の変異——脆弱骨折・難聴・を呈する。の変動・を示す。

症例:ハンチントン舞踏病

(正常タンパクの機能自体は未解明)——反復変異03-1-genetic-variations参照)、DNAすべり(DNA slippage)が原因。ニューロン死の機序は完全には解明されていないが、と活発なアポトーシスを伴う。

「CAGリピート数が多いほど発症が早い」——の分子的説明そのもの。 世代を経るごとに反復数が拡大し発症年齢が早まる現象が反復疾患の特徴——X連鎖優性・常染色体優性・X連鎖劣性・常染色体優性という複数の遺伝形式でこの現象が起こりうる(反復数はを基準に判定される)。

AD疾患の現象別まとめ

現象 代表疾患
の変動
/父親年齢の影響
冠動脈疾患、、(肥満)

症例:家族性高コレステロール血症と冠動脈疾患の原因分類

遺伝子型 頻度 血中コレステロール
Aa( 1:500
AA( 1:100万 極めて高いLDL値

LDLR遺伝子(19p)の変異部位により、①小胞体からの輸送障害、②細胞膜結合障害、③障害、④mRNA産生障害という異なる機序でLDL受容体機能が失われ、コレステロールが細胞内に取り込まれなくなる。

遺伝子 機序
LDLR LDL受容体そのものの変異
ApoB LDLRのリガンドであるApoBタンパクの変異——肝細胞でのコレステロール合成は正常だが細胞外への排出が過剰
PCSK9 受容体レベルを分解によって調節する酵素の変異——新規抗体療法の標的
コレステロール合成の——スタチンの標的

冠動脈疾患は「単一遺伝子型」と「多因子型」の両方の顔をもつ——の臨床的縮図。 LDLR・ApoB・PCSK9いずれの変異もを介してCADを起こしうるの経路だが、CAD全体としてはの疾患でもある——同じ臨床像に、の稀な原因とのありふれた原因が共存する。

症例:肥満とレプチン遺伝子

若年発症の重症肥満の7%が変異に起因し、11の遺伝子が関与しうる()。遺伝子変異(AD)の場合、視床下部のシグナルが機能せずを来す。

常染色体劣性遺伝

AR遺伝の特徴

  • 疾患は(aa)でのみ発現
  • 頻度・重症度は男女で同等
  • が特徴的(2つの異なる変異アレルの組み合わせ)。
  • 変異の大半は酵素遺伝子、ヘモグロビン遺伝子、その他のタンパク遺伝子(CFTR、SMN等)に生じる。
  • 進化の過程でが、特定集団での疾患頻度の拡大を招くことがある。

一部のAR疾患が特定集団に多いのは「地理的・宗教的隔離+」の組み合わせ。 鎌状赤血球症・・嚢胞性線維症はいずれも特定集団での高頻度を示し、(地理的隔離・宗教的隔離)と(マラリア耐性等、08-2-evolution-genetics参照)の両方が背景にある。

症例:脊髄性筋萎縮症

α運動ニューロンの変性による進行性・麻痺。約1:35〜401:6,000〜8,000出生——小児期における最も頻度の高い遺伝性死因座:5q13.2

⚠️ SMN2遺伝子は「ほとんど役に立たないバックアップ」——ただしこの「ほとんど」が遺伝子治療の標的になる。 機能的SMNタンパクはがコードするが、ヒトには1塩基だけ異なるSMN2遺伝子も存在する。この1塩基の違い(C>T転位)により、SMN2由来の転写産物の大半でによりエクソン7が脱落し、5〜10%しか機能タンパクを産生できない。健常者ではSMN1が正常に機能するため問題にならないが、SMN1のエクソン7欠失によりSMAを発症した患者では、SMN2のが多いほど症状が軽い(重症度とSMN2は逆相関)。SMA1型(最重症型)は生後6〜8か月で呼吸不全により死亡する。

遺伝子治療の実例: SMN遺伝子は1995年にSMAとの関連が同定され、現在は効果的な遺伝子治療が存在する——で、SMN2のエクソン7を排除する異常スプライシングを阻害し、機能的SMNタンパクの産生量を増加させる。症候性治療より発症前スクリーニングでの早期治療の方が効果が高い。

症例:嚢胞性線維症

CFTR遺伝子(7q31.2)の変異——Cl⁻・Na⁺・水の輸送ができず粘稠な粘液のみが分泌される。最頻変異はΔF508欠失)。CFTR遺伝子変異は1,000種類を超え、が特徴的を示し、オリゴジェニック効果が証明されている(CF自体もオリゴジェニックとみなしうる)。

集団 頻度
中央ヨーロッパ 1:2,000
黒人アフリカ系 1:17,000
アジア系 1:90,000

CFに対する耐性をもつ——AR疾患のの実例。 はCFTRの部分機能を保つことでによる過剰な水分喪失()から一定の保護を受ける——高頻度の進化的説明。

まとめ

  • の法則に従うが、優性・劣性は表現型の性質であり遺伝子そのものの性質ではない。は一般に優性、は一般に劣性だが、という例外で優性になりうる。性の消失)も染色体で生じうる。
  • )、という現象群が「古典的遺伝」を大きく修飾する。(遺伝子の15〜20%)もこれらの説明候補になる。
  • AD疾患は)・)・)・)に分類され、それぞれ/という特徴的な現象を伴う。の父親年齢効果はで説明される。
  • ・冠動脈疾患はLDLR・ApoB・PCSK9という複数遺伝子座()との両方の顔をもち、(スタチン標的)・PCSK9(抗体療法標的)という治療標的を提供する。
  • AR疾患はでのみ発現し、が特徴的。が特定集団での高頻度を説明する(CFの耐性が好例)。SMAはSMN1/SMN2の1塩基差というから、というによる遺伝子治療まで到達した好例。