Genetics · 4.1
単一遺伝子遺伝
Monogenic inheritance
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🧠 単一遺伝子遺伝monogenic inheritance単一遺伝子遺伝(monogenic inheritance)monogenic inheritance(単一遺伝子遺伝)は「メンデルMendelメンデル(Mendel)Mendel(メンデル)の法則に従う」という一言で定義されるが、実際には優性・劣性という単純な二分法dichotomy二分法(dichotomy)dichotomy(二分法)を崩す現象(表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)・浸透率penetrance浸透率(penetrance)penetrance(浸透率)・遺伝的異質性genetic heterogeneity遺伝的異質性(genetic heterogeneity)genetic heterogeneity(遺伝的異質性)・エピジェネティックepigeneticエピジェネティック(epigenetic)epigenetic(エピジェネティック)効果)に満ちている、と読む。 軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症)(機能獲得gain of function機能獲得(gain of function)gain of function(機能獲得)型)・家族性高コレステロール血症familial hypercholesterolemia, FH家族性高コレステロール血症(familial hypercholesterolemia, FH)familial hypercholesterolemia, FH(家族性高コレステロール血症)(半数不全haploinsufficiency半数不全(haploinsufficiency)haploinsufficiency(半数不全))・ハンチントン病Huntington's diseaseハンチントン病(Huntington's disease)Huntington's disease(ハンチントン病)(動的変異dynamic mutation動的変異(dynamic mutation)dynamic mutation(動的変異))・SMA/嚢胞性線維症(劣性、創始者効果founder effect創始者効果(founder effect)founder effect(創始者効果))という4つの疾患群disease group疾患群(disease group)disease group(疾患群)を軸に、優性/劣性を決める分子機序molecular mechanism分子機序(molecular mechanism)molecular mechanism(分子機序)と、それを修飾する現象を体系的に押さえる。
遺伝形式の3分類
| 型 | 遺伝子数 | 頻度 | メンデルMendelメンデル(Mendel)Mendel(メンデル)の法則 |
|---|---|---|---|
| 単一遺伝子遺伝monogenic inheritance単一遺伝子遺伝(monogenic inheritance)monogenic inheritance(単一遺伝子遺伝) | 1つ | — | 従う |
| オリゴジェニック遺伝oligogenic inheritanceオリゴジェニック遺伝(oligogenic inheritance)oligogenic inheritance(オリゴジェニック遺伝) | 少数 | — | 部分的に従わない |
| 多因子遺伝(polygenic/multifactorial inheritance) | 多数+環境 | — | 従わない(環境効果を含む) |
遺伝性疾患の頻度比較
| 分類 | 疾患 | 頻度 |
|---|---|---|
| 多因子性multifactorial (polygenic)多因子性(multifactorial (polygenic))multifactorial (polygenic)(多因子性) | 統合失調症schizophrenia統合失調症(schizophrenia)schizophrenia(統合失調症) | 1:100 |
| 2型糖尿病 | 1:50 | |
| 双極性障害bipolar disorder双極性障害(bipolar disorder)bipolar disorder(双極性障害) | 1:10 | |
| 乳がん(女性) | 1:10 | |
| 単一遺伝子性monogenic単一遺伝子性(monogenic)monogenic(単一遺伝子性) | ハンチントン舞踏病Huntington choreaハンチントン舞踏病(Huntington chorea)Huntington chorea(ハンチントン舞踏病)(AD) | 1:10,000 |
| 骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症)(AD) | 1:10,000 | |
| 家族性高コレステロール血症familial hypercholesterolemia, FH家族性高コレステロール血症(familial hypercholesterolemia, FH)familial hypercholesterolemia, FH(家族性高コレステロール血症)(AD) | 1:500 | |
| 多発性嚢胞腎polycystic kidney disease多発性嚢胞腎(polycystic kidney disease)polycystic kidney disease(多発性嚢胞腎)(AD) | 1:800 | |
| 嚢胞性線維症(AR) | 1:3,600 | |
| フェニルケトン尿症phenylketonuria, PKUフェニルケトン尿症(phenylketonuria, PKU)phenylketonuria, PKU(フェニルケトン尿症)(AR) | 1:12,000 | |
| アルビニズムalbinismアルビニズム(albinism)albinism(アルビニズム)(AR) | 1:1,000〜10,000 | |
| 脊髄性筋萎縮症spinal muscular atrophy脊髄性筋萎縮症(spinal muscular atrophy)spinal muscular atrophy(脊髄性筋萎縮症)(AR) | 1:8,000 | |
| デュシェンヌ型筋ジストロフィーDuchenne muscular dystrophy (DMD)デュシェンヌ型筋ジストロフィー(Duchenne muscular dystrophy (DMD))Duchenne muscular dystrophy (DMD)(デュシェンヌ型筋ジストロフィー)(XR、男児) | 1:4,500 | |
| ミトコンドリア性 | レーバー遺伝性視神経症Leber hereditary optic neuropathy (LHON)レーバー遺伝性視神経症(Leber hereditary optic neuropathy (LHON))Leber hereditary optic neuropathy (LHON)(レーバー遺伝性視神経症) | 1:50,000 |
| 染色体性 | プラダー・ウィリー症候群Prader-Willi syndromeプラダー・ウィリー症候群(Prader-Willi syndrome)Prader-Willi syndrome(プラダー・ウィリー症候群)(欠失) | 1:30,000 |
| ダウン症候群Down syndromeダウン症候群(Down syndrome)Down syndrome(ダウン症候群)(トリソミー) | 1:500(通常は非遺伝性) |
💡 染色体異常と単一遺伝子疾患monogenic disease単一遺伝子疾患(monogenic disease)monogenic disease(単一遺伝子疾患)は「変異の規模」で区別される。 ゲノム変異genome mutationゲノム変異(genome mutation)genome mutation(ゲノム変異)(染色体数の変化:ダウン症候群Down syndromeダウン症候群(Down syndrome)Down syndrome(ダウン症候群)・クラインフェルター症候群Klinefelter syndromeクラインフェルター症候群(Klinefelter syndrome)Klinefelter syndrome(クラインフェルター症候群))・染色体変異(構造変化conformational change構造変化(conformational change)conformational change(構造変化):猫鳴き症候群cri-du-chat syndrome猫鳴き症候群(cri-du-chat syndrome)cri-du-chat syndrome(猫鳴き症候群)、微小欠失microdeletion微小欠失(microdeletion)microdeletion(微小欠失):アンジェルマン/プラダー・ウィリー症候群Prader-Willi syndromeプラダー・ウィリー症候群(Prader-Willi syndrome)Prader-Willi syndrome(プラダー・ウィリー症候群))は光学顕微鏡light microscopy, LM光学顕微鏡(light microscopy, LM)light microscopy, LM(光学顕微鏡)または高分解能high resolution, HR高分解能(high resolution, HR)high resolution, HR(高分解能)技術で検出できる規模の変化だが、単一遺伝子疾患monogenic disease単一遺伝子疾患(monogenic disease)monogenic disease(単一遺伝子疾患)(嚢胞性線維症・血友病等)は純粋な遺伝子変異が背景にある——両者は変異の「大きさ」という同じ物差しの延長線上にある。
遺伝子-環境相互作用スペクトラム
⚠️ 「純粋に遺伝的」「純粋に環境的」な疾患は実質的に存在しない。 落雷lightning strike落雷(lightning strike)lightning strike(落雷)に打たれる・交通事故のような純粋環境要因と、(理論上の)純粋遺伝要因の間に、実際の疾患はすべて分布する——デュシェンヌ型筋ジストロフィーDuchenne muscular dystrophy (DMD)デュシェンヌ型筋ジストロフィー(Duchenne muscular dystrophy (DMD))Duchenne muscular dystrophy (DMD)(デュシェンヌ型筋ジストロフィー)・嚢胞性線維症は遺伝寄与が非常に大きい側、結核・髄膜炎菌感染症meningococcal infection髄膜炎菌感染症(meningococcal infection)meningococcal infection(髄膜炎菌感染症)は環境寄与が大きい側、心疾患・がん・統合失調症schizophrenia統合失調症(schizophrenia)schizophrenia(統合失調症)・糖尿病・肥満・喘息・関節リウマチ・PKU・アルツハイマー病Alzheimer's diseaseアルツハイマー病(Alzheimer's disease)Alzheimer's disease(アルツハイマー病)・脆弱X症候群fragile X syndrome脆弱X症候群(fragile X syndrome)fragile X syndrome(脆弱X症候群)・自閉症・多発性硬化症multiple sclerosis多発性硬化症(multiple sclerosis)multiple sclerosis(多発性硬化症)はその中間に分布する。表現型=遺伝子型+エピジェネティック変化epigenetic alterationsエピジェネティック変化(epigenetic alterations)epigenetic alterations(エピジェネティック変化)+環境+他の遺伝子という多因子方程式で決まる。
基本用語:対立遺伝子と遺伝的異質性
対立opposition対立(opposition)opposition(対立)遺伝子=同一遺伝子座same locus同一遺伝子座(same locus)same locus(同一遺伝子座)上の、父方・母方染色体それぞれに存在するDNA配列の別バージョン。2倍体細胞では同一遺伝子につき2つの対立opposition対立(opposition)opposition(対立)遺伝子が存在し、それらの関係性により遺伝形式が優性か劣性かが決まる。
| 用語 | 定義 | 例 |
|---|---|---|
| 遺伝的異質性genetic heterogeneity遺伝的異質性(genetic heterogeneity)genetic heterogeneity(遺伝的異質性) | 異なる遺伝的機序が同一・類似の表現型を生む総称 | — |
| 遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性) | 異なる遺伝子座の変異が同一・類似の表現型を生む | 網膜色素変性症retinitis pigmentosa網膜色素変性症(retinitis pigmentosa)retinitis pigmentosa(網膜色素変性症)(原因遺伝子causative gene原因遺伝子(causative gene)causative gene(原因遺伝子)100種以上)、難聴(原因遺伝子causative gene原因遺伝子(causative gene)causative gene(原因遺伝子)120種以上) |
| 対立遺伝子異質性allelic heterogeneity対立遺伝子異質性(allelic heterogeneity)allelic heterogeneity(対立遺伝子異質性) | 同一遺伝子座same locus同一遺伝子座(same locus)same locus(同一遺伝子座)内の異なる変異が同一・類似の表現型を生む | 軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症)、デュシェンヌ型筋ジストロフィーDuchenne muscular dystrophy (DMD)デュシェンヌ型筋ジストロフィー(Duchenne muscular dystrophy (DMD))Duchenne muscular dystrophy (DMD)(デュシェンヌ型筋ジストロフィー) |
| 多重対立遺伝子性multiple allelism多重対立遺伝子性(multiple allelism)multiple allelism(多重対立遺伝子性) | ある形質の遺伝子が集団レベルで2つを超える対立opposition対立(opposition)opposition(対立)遺伝子をもつ(表現型が異なる場合のみ) | ABO血液型(3つの健常型)、MHC遺伝子(世界人口で数百のアレル) |
単一遺伝子(メンデル型)遺伝の定義
メンデルMendelメンデル(Mendel)Mendel(メンデル)の法則に従い、同一染色体遺伝子座上の1対の対立opposition対立(opposition)opposition(対立)遺伝子が形質・疾患の責任を負う。既知のメンデルMendelメンデル(Mendel)Mendel(メンデル)型ヒト形質・疾患は7,000種を超えるが、原因遺伝子causative gene原因遺伝子(causative gene)causative gene(原因遺伝子)は7,000種未満(同一遺伝子の異なる変異・微小欠失microdeletion微小欠失(microdeletion)microdeletion(微小欠失)などが複数疾患に対応するため)。
⚠️ 優性・劣性は「表現型」の性質であって「遺伝子」の性質ではない——この混同は頻出の誤り。 「優性遺伝子」「劣性遺伝子」という言い方は不正確——優性・劣性はその対立opposition対立(opposition)opposition(対立)遺伝子が生み出す表現型を記述する概念である。
なぜ優性か、なぜ劣性か——分子機序
flowchart TD
A["変異の種類"]
A --> B["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='gain-of-function mutation'>機能獲得型変異</span><br>新規の有害タンパクが作られる、または本来不活性であるべき状態でタンパクが働き続ける<br>→ 一般に優性"]
A --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='loss-of-function mutation'>機能喪失型変異</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='nonsense mutation'>ナンセンス変異</span>・<span class='jp-term jp-term-diagram' title='frameshift mutation'>フレームシフト変異</span>、タンパクが正常な機能を果たせない<br>→ 一般に劣性(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='heterozygote'>ヘテロ接合体</span>で発現しないことが多い)"]
C --> D["例外:<span class='jp-term jp-term-diagram' title='haploinsufficiency'>半数不全</span><br>1コピーでは正常機能に不十分 → 優性"]
C --> E["例外:<span class='jp-term jp-term-diagram' title='dominant negative effect'>優性阻害効果</span><br>変異産物が正常アレルの産物の機能まで妨げる → 優性"]
💡 機能喪失型変異loss-of-function mutation機能喪失型変異(loss-of-function mutation)loss-of-function mutation(機能喪失型変異)でも優性になるかどうかは「失われた機能が生体にどう影響するか」で決まる。 一般に劣性表現型recessive phenotype劣性表現型(recessive phenotype)recessive phenotype(劣性表現型)を示すが、①半数不全haploinsufficiency半数不全(haploinsufficiency)haploinsufficiency(半数不全)(正常量の半分では正常機能を維持できない)、②優性阻害効果dominant negative effect優性阻害効果(dominant negative effect)dominant negative effect(優性阻害効果)(変異タンパクが正常タンパクの働きまで積極的に阻害する)という2つの機序では、ヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)でも表現型が現れ優性になる。
偽優性pseudodominance偽優性(pseudodominance)pseudodominance(偽優性): ヘテロ接合heterozygousヘテロ接合(heterozygous)heterozygous(ヘテロ接合)性の消失——優性アレル側の(微小)欠失により、本来隠れているはずの劣性アレルの表現型が顕在化する現象。半数不全haploinsufficiency半数不全(haploinsufficiency)haploinsufficiency(半数不全)も偽優性pseudodominance偽優性(pseudodominance)pseudodominance(偽優性)も染色体(微小)欠失が原因になりうる——「古典的なメンデルMendelメンデル(Mendel)Mendel(メンデル)遺伝はほとんど存在しない」というこの講義の裏テーマを象徴する現象。
古典的メンデル表現型を修飾する現象
| 現象 | 内容 |
|---|---|
| 表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度) | 同じ遺伝子型でも症状の重症度が個体間で変動する |
| 浸透率penetrance浸透率(penetrance)penetrance(浸透率) | 変異アレルをもつ個体のうち実際に表現型を示す割合(不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透)=incomplete penetrance) |
| ヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性) | ヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)が特定環境下でホモ接合体homozygoteホモ接合体(homozygote)homozygote(ホモ接合体)より生存上有利 |
| 表現促進anticipation表現促進(anticipation)anticipation(表現促進) | 世代を重ねるごとに発症年齢が早まる・重症化する |
| 複合ヘテロ接合性compound heterozygosity複合ヘテロ接合性(compound heterozygosity)compound heterozygosity(複合ヘテロ接合性) | 同一遺伝子の2つの異なる変異アレルを組み合わせてもつ状態 |
| 加齢の影響influence of age影響(influence of age)influence of age(影響) | 発症・表現型が年齢に依存する |
| 多面発現pleiotropy多面発現(pleiotropy)pleiotropy(多面発現) | 1つの遺伝子変異が複数の器官系に影響する |
| 遺伝的異質性genetic heterogeneity遺伝的異質性(genetic heterogeneity)genetic heterogeneity(遺伝的異質性) | 上記参照 |
| 表現型模写phenocopy表現型模写(phenocopy)phenocopy(表現型模写) | 遺伝子変異なしに環境要因だけで遺伝性疾患と同じ表現型が生じる |
モノアレリック発現
遺伝子の約15〜20%は複数組織で片方の対立opposition対立(opposition)opposition(対立)遺伝子のみが発現する(モノアレリック発現monoallelic expression, MAEモノアレリック発現(monoallelic expression, MAE)monoallelic expression, MAE(モノアレリック発現))——組織・細胞ごとに発現するアレルは異なりうるが、集団平均としては両アレルが混在するため、ヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)では実質的にヘテロ接合heterozygousヘテロ接合(heterozygous)heterozygous(ヘテロ接合)効果が保たれる。
| 型 | 決定タイミング | 決定機序 |
|---|---|---|
| インプリンティング遺伝子imprinted geneインプリンティング遺伝子(imprinted gene)imprinted gene(インプリンティング遺伝子) | 胚発生embryogenesis胚発生(embryogenesis)embryogenesis(胚発生)早期 | 母性maternal母性(maternal)maternal(母性)・父性paternal父性(paternal)paternal(父性)、厳密に決定(03-2-epigenetics参照) |
| 非インプリンティング遺伝子imprinted geneインプリンティング遺伝子(imprinted gene)imprinted gene(インプリンティング遺伝子) | 生涯を通じたどの時点でも | ランダム |
モノアレリック発現monoallelic expression, MAEモノアレリック発現(monoallelic expression, MAE)monoallelic expression, MAE(モノアレリック発現)は、ヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性)・表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)の変動・不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透)という現象の説明候補の1つになる。
モディファイア遺伝子の例:眼の色
💡 青い目は「なぜ生まれたか」に答えのない、進化の気まぐれ(game of nature)。 6,000〜10,000年前、HERC2遺伝子内の調節領域に生じたSNPがOCA2遺伝子(メラニン産生)の発現を抑制する創始者変異founder mutation創始者変異(founder mutation)founder mutation(創始者変異)として生じ、青い目という表現型を作った——有利でも不利でもない中立的な変異が、単一の起源から広まった好例。メラノソームmelanosomeメラノソーム(melanosome)melanosome(メラノソーム)成熟に関わる8個以上の追加遺伝子(モディファイア遺伝子modifier geneモディファイア遺伝子(modifier gene)modifier gene(モディファイア遺伝子)、modifier gene:他の遺伝子の表現型・分子発現に影響する遺伝子)も眼の色に関与する。
オリゴジェニック遺伝
遺伝子産物は転写・スプライシング・翻訳・タンパク質フォールディングprotein foldingタンパク質フォールディング(protein folding)protein folding(タンパク質フォールディング)・オリゴマー形成・代謝・調節性regulated調節性(regulated)regulated(調節性)RNA(エピジェネティックepigeneticエピジェネティック(epigenetic)epigenetic(エピジェネティック)効果)という緻密に制御された相互作用を通じて効果を発揮する——嚢胞性線維症・多発性嚢胞腎polycystic kidney disease多発性嚢胞腎(polycystic kidney disease)polycystic kidney disease(多発性嚢胞腎)はオリゴジェニック効果が証明されている実例で、今後も増加が見込まれる。
常染色体優性遺伝
既知の優性形質2,200種超、疾患頻度は出生1,000件あたり0.1〜3件。好発臓器系organ system臓器系(organ system)organ system(臓器系):骨格系・結合組織・神経系。AD変異の起こりやすい遺伝子種類:受容体遺伝子receptor gene受容体遺伝子(receptor gene)receptor gene(受容体遺伝子)・構造タンパク遺伝子structural protein gene構造タンパク遺伝子(structural protein gene)structural protein gene(構造タンパク遺伝子)・調節タンパク遺伝子regulatory protein gene調節タンパク遺伝子(regulatory protein gene)regulatory protein gene(調節タンパク遺伝子)・がん原遺伝子。
AD遺伝の特徴
- AA・Aaいずれの遺伝子型でも疾患が発現(ホモ接合体homozygoteホモ接合体(homozygote)homozygote(ホモ接合体)・ヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)の両方)。
- ホモ接合体homozygoteホモ接合体(homozygote)homozygote(ホモ接合体)表現型はヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)よりしばしば重症(例:家族性高コレステロール血症familial hypercholesterolemia, FH家族性高コレステロール血症(familial hypercholesterolemia, FH)familial hypercholesterolemia, FH(家族性高コレステロール血症))、時に致死的(例:骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症))。
- 重症度・頻度は男女で同等。
- 父親の年齢が新規変異new mutation新規変異(new mutation)new mutation(新規変異)の発生を促進しうる。
- 表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)の変動・不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透)をしばしば伴う。
- ヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)でも発現する理由:半数不全haploinsufficiency半数不全(haploinsufficiency)haploinsufficiency(半数不全)、優性阻害効果dominant negative effect優性阻害効果(dominant negative effect)dominant negative effect(優性阻害効果)、機能獲得型変異gain-of-function mutation機能獲得型変異(gain-of-function mutation)gain-of-function mutation(機能獲得型変異)。
AD疾患の分子機序別分類
| 変異遺伝子の種類 | 疾患例 | 主な修飾現象 |
|---|---|---|
| 受容体遺伝子receptor gene受容体遺伝子(receptor gene)receptor gene(受容体遺伝子) | 軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症)、家族性高コレステロール血症familial hypercholesterolemia, FH家族性高コレステロール血症(familial hypercholesterolemia, FH)familial hypercholesterolemia, FH(家族性高コレステロール血症) | 対立遺伝子異質性allelic heterogeneity対立遺伝子異質性(allelic heterogeneity)allelic heterogeneity(対立遺伝子異質性) |
| 調節タンパク遺伝子regulatory protein gene調節タンパク遺伝子(regulatory protein gene)regulatory protein gene(調節タンパク遺伝子) | 多指症polydactyly多指症(polydactyly)polydactyly(多指症)、短指症brachydactyly短指症(brachydactyly)brachydactyly(短指症)、爪甲欠損症anonychia爪甲欠損症(anonychia)anonychia(爪甲欠損症)、ワーデンブルグ症候群Waardenburg syndromeワーデンブルグ症候群(Waardenburg syndrome)Waardenburg syndrome(ワーデンブルグ症候群) | 遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性) |
| 構造タンパク遺伝子structural protein gene構造タンパク遺伝子(structural protein gene)structural protein gene(構造タンパク遺伝子) | 骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症)、マルファン症候群Marfan syndromeマルファン症候群(Marfan syndrome)Marfan syndrome(マルファン症候群) | 表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)変動、不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透)、多面発現pleiotropy多面発現(pleiotropy)pleiotropy(多面発現) |
| 動的変異dynamic mutation動的変異(dynamic mutation)dynamic mutation(動的変異)(三塩基反復trinucleotide repeat三塩基反復(trinucleotide repeat)trinucleotide repeat(三塩基反復)) | ハンチントン舞踏病Huntington choreaハンチントン舞踏病(Huntington chorea)Huntington chorea(ハンチントン舞踏病) | 表現促進anticipation表現促進(anticipation)anticipation(表現促進) |
症例:軟骨無形成症
FGFR3(線維芽細胞増殖因子受容体3fibroblast growth factor receptor 3線維芽細胞増殖因子受容体3(fibroblast growth factor receptor 3)fibroblast growth factor receptor 3(線維芽細胞増殖因子受容体3))遺伝子(4p16.3)の変異——大半は孤発例(新規変異new mutation新規変異(new mutation)new mutation(新規変異))。FGFR3はチロシンキナーゼ受容体receptor tyrosine kinase (RTK)チロシンキナーゼ受容体(receptor tyrosine kinase (RTK))receptor tyrosine kinase (RTK)(チロシンキナーゼ受容体)として細胞周期・細胞分裂cell division細胞分裂(cell division)cell division(細胞分裂)を制御する。機能獲得型変異gain-of-function mutation機能獲得型変異(gain-of-function mutation)gain-of-function mutation(機能獲得型変異):受容体がリガンド非存在下でも活性化されたままになる。
⭐ 同じFGFR3遺伝子の「どこに」変異が入るかで、3つの異なる重症度の疾患が生まれる——対立遺伝子異質性allelic heterogeneity対立遺伝子異質性(allelic heterogeneity)allelic heterogeneity(対立遺伝子異質性)の教科書例。 変異部位により軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症)・軟骨低形成症hypochondroplasia軟骨低形成症(hypochondroplasia)hypochondroplasia(軟骨低形成症)・致死性骨異形成症thanatophoric dysplasia致死性骨異形成症(thanatophoric dysplasia)thanatophoric dysplasia(致死性骨異形成症)という重症度の異なる3疾患が生じる。
⚠️ なぜ父親の年齢が孤発性sporadic孤発性(sporadic)sporadic(孤発性)AD疾患のリスク因子になるのか——生殖細胞系列モザイシズムgermline mosaicism生殖細胞系列モザイシズム(germline mosaicism)germline mosaicism(生殖細胞系列モザイシズム)が鍵。 新規変異new mutation新規変異(new mutation)new mutation(新規変異)は生殖細胞系列の有糸分裂中に発生しうる——父親自身は表現型的に健康だが変異を保有し、子に伝達しうる(次子の再発リスクは約5%)。精子形成が生涯継続する男性では、加齢に伴い生殖細胞系列に変異が蓄積しやすい。
症例:多指症
GLI3遺伝子(zinc finger転写因子、Sonic Hedgehogシグナル伝達を仲介mediate仲介(mediate)mediate(仲介))の調節タンパク変異——表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)の変動・不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透)・遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性)(複数の異なる遺伝子が変異しうる)を示す代表例。
症例:骨形成不全症
I型コラーゲン遺伝子(7q)の構造タンパクstructural protein構造タンパク(structural protein)structural protein(構造タンパク)変異——脆弱骨折・難聴・青色強膜blue sclera青色強膜(blue sclera)blue sclera(青色強膜)を呈する。表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)の変動・不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透)・多面発現pleiotropy多面発現(pleiotropy)pleiotropy(多面発現)を示す。
症例:ハンチントン舞踏病
機能獲得型変異gain-of-function mutation機能獲得型変異(gain-of-function mutation)gain-of-function mutation(機能獲得型変異)(正常ハンチンチンHuntingtinハンチンチン(Huntingtin)Huntingtin(ハンチンチン)タンパクの機能自体は未解明)——トリヌクレオチドtrinucleotideトリヌクレオチド(trinucleotide)trinucleotide(トリヌクレオチド)反復変異(03-1-genetic-variations参照)、DNAすべり(DNA slippage)が原因。ニューロン死の機序は完全には解明されていないが、凝集体形成aggregation凝集体形成(aggregation)aggregation(凝集体形成)と活発なアポトーシスを伴う。
⭐ 「CAGリピート数が多いほど発症が早い」——表現促進anticipation表現促進(anticipation)anticipation(表現促進)の分子的説明そのもの。 世代を経るごとに反復数が拡大し発症年齢が早まる現象がトリヌクレオチドtrinucleotideトリヌクレオチド(trinucleotide)trinucleotide(トリヌクレオチド)反復疾患の特徴——X連鎖優性・常染色体優性・X連鎖劣性・常染色体優性という複数の遺伝形式でこの現象が起こりうる(反復数は正常上限upper limit of normal (ULN)正常上限(upper limit of normal (ULN))upper limit of normal (ULN)(正常上限)を基準に判定される)。
AD疾患の現象別まとめ
| 現象 | 代表疾患 |
|---|---|
| 多面発現pleiotropy多面発現(pleiotropy)pleiotropy(多面発現) | マルファン症候群Marfan syndromeマルファン症候群(Marfan syndrome)Marfan syndrome(マルファン症候群)、骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症) |
| 表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)の変動 | マルファン症候群Marfan syndromeマルファン症候群(Marfan syndrome)Marfan syndrome(マルファン症候群)、骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症)、多指症polydactyly多指症(polydactyly)polydactyly(多指症)、家族性高コレステロール血症familial hypercholesterolemia, FH家族性高コレステロール血症(familial hypercholesterolemia, FH)familial hypercholesterolemia, FH(家族性高コレステロール血症) |
| 不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透) | 骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症)、多指症polydactyly多指症(polydactyly)polydactyly(多指症) |
| 新規変異new mutation新規変異(new mutation)new mutation(新規変異)/父親年齢の影響 | 軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症)、マルファン症候群Marfan syndromeマルファン症候群(Marfan syndrome)Marfan syndrome(マルファン症候群) |
| 対立遺伝子異質性allelic heterogeneity対立遺伝子異質性(allelic heterogeneity)allelic heterogeneity(対立遺伝子異質性) | 軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症) |
| 表現促進anticipation表現促進(anticipation)anticipation(表現促進) | ハンチントン病Huntington's diseaseハンチントン病(Huntington's disease)Huntington's disease(ハンチントン病) |
| 遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性) | 冠動脈疾患、多指症polydactyly多指症(polydactyly)polydactyly(多指症)、(肥満) |
症例:家族性高コレステロール血症と冠動脈疾患の原因分類
| 遺伝子型 | 頻度 | 血中コレステロール |
|---|---|---|
| Aa(ヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)) | 1:500 | 高コレステロール血症Hypercholesterolemia高コレステロール血症(Hypercholesterolemia)Hypercholesterolemia(高コレステロール血症) |
| AA(ホモ接合体homozygoteホモ接合体(homozygote)homozygote(ホモ接合体)) | 1:100万 | 極めて高いLDL値 |
LDLR遺伝子(19p)の変異部位により、①小胞体からの輸送障害、②細胞膜結合障害、③内在化internalization内在化(internalization)internalization(内在化)障害、④mRNA産生障害という異なる機序でLDL受容体機能が失われ、コレステロールが細胞内に取り込まれなくなる。
| 遺伝子 | 機序 |
|---|---|
| LDLR | LDL受容体そのものの変異 |
| ApoB | LDLRのリガンドであるApoBタンパクの変異——肝細胞でのコレステロール合成は正常だが細胞外への排出が過剰 |
| PCSK9 | 受容体レベルを分解によって調節する酵素の変異——新規抗体療法の標的 |
| HMG-CoA還元酵素HMG-CoA reductaseHMG-CoA還元酵素(HMG-CoA reductase)HMG-CoA reductase(HMG-CoA還元酵素) | コレステロール合成の律速酵素rate-limiting enzyme律速酵素(rate-limiting enzyme)rate-limiting enzyme(律速酵素)——スタチンの標的 |
⭐ 冠動脈疾患は「単一遺伝子型」と「多因子型」の両方の顔をもつ——遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性)の臨床的縮図。 LDLR・ApoB・PCSK9いずれの変異も高コレステロール血症Hypercholesterolemia高コレステロール血症(Hypercholesterolemia)Hypercholesterolemia(高コレステロール血症)を介してCADを起こしうる単一遺伝子性monogenic単一遺伝子性(monogenic)monogenic(単一遺伝子性)の経路だが、CAD全体としては多因子性multifactorial (polygenic)多因子性(multifactorial (polygenic))multifactorial (polygenic)(多因子性)の疾患でもある——同じ臨床像に、単一遺伝子性monogenic単一遺伝子性(monogenic)monogenic(単一遺伝子性)の稀な原因と多因子性multifactorial (polygenic)多因子性(multifactorial (polygenic))multifactorial (polygenic)(多因子性)のありふれた原因が共存する。
症例:肥満とレプチン遺伝子
若年発症の重症肥満の7%が単一遺伝子性monogenic単一遺伝子性(monogenic)monogenic(単一遺伝子性)変異に起因し、11の遺伝子が関与しうる(遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性))。レプチンleptinレプチン(leptin)leptin(レプチン)遺伝子変異(AD)の場合、視床下部の満腹感satiety満腹感(satiety)satiety(満腹感)シグナルが機能せず過食hyperphagia過食(hyperphagia)hyperphagia(過食)を来す。
常染色体劣性遺伝
AR遺伝の特徴
- 疾患はホモ接合体homozygoteホモ接合体(homozygote)homozygote(ホモ接合体)(aa)でのみ発現。
- 頻度・重症度は男女で同等。
- 複合ヘテロ接合性compound heterozygosity複合ヘテロ接合性(compound heterozygosity)compound heterozygosity(複合ヘテロ接合性)が特徴的(2つの異なる変異アレルの組み合わせ)。
- 変異の大半は酵素遺伝子、ヘモグロビン遺伝子、その他のタンパク遺伝子(CFTR、SMN等)に生じる。
- 進化の過程で創始者効果founder effect創始者効果(founder effect)founder effect(創始者効果)とヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性)が、特定集団での疾患頻度の拡大を招くことがある。
⭐ 一部のAR疾患が特定集団に多いのは「地理的・宗教的隔離+ヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性)」の組み合わせ。 鎌状赤血球症・サラセミアThalassemiasサラセミア(Thalassemias)Thalassemias(サラセミア)・先天性副腎過形成congenital adrenal hyperplasia, CAH先天性副腎過形成(congenital adrenal hyperplasia, CAH)congenital adrenal hyperplasia, CAH(先天性副腎過形成)・嚢胞性線維症はいずれも特定集団での高頻度を示し、創始者効果founder effect創始者効果(founder effect)founder effect(創始者効果)(地理的隔離・宗教的隔離)とヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性)(マラリア耐性等、08-2-evolution-genetics参照)の両方が背景にある。
症例:脊髄性筋萎縮症
α運動ニューロンの変性による進行性筋萎縮muscle wasting (muscle atrophy)筋萎縮(muscle wasting (muscle atrophy))muscle wasting (muscle atrophy)(筋萎縮)・麻痺。保因者頻度carrier frequency保因者頻度(carrier frequency)carrier frequency(保因者頻度)約1:35〜40、罹患率incidence rate罹患率(incidence rate)incidence rate(罹患率)1:6,000〜8,000出生——小児期における最も頻度の高い遺伝性死因。原因遺伝子causative gene原因遺伝子(causative gene)causative gene(原因遺伝子)座:5q13.2。
⚠️ SMN2遺伝子は「ほとんど役に立たないバックアップ」——ただしこの「ほとんど」が遺伝子治療の標的になる。 機能的SMNタンパクはSMN1遺伝子SMN1 geneSMN1遺伝子(SMN1 gene)SMN1 gene(SMN1遺伝子)がコードするが、ヒトには1塩基だけ異なるパラログparalogueパラログ(paralogue)paralogue(パラログ)SMN2遺伝子も存在する。この1塩基の違い(C>T転位)により、SMN2由来の転写産物の大半で選択的スプライシングalternative splicing選択的スプライシング(alternative splicing)alternative splicing(選択的スプライシング)によりエクソン7が脱落し、5〜10%しか機能タンパクを産生できない。健常者ではSMN1が正常に機能するため問題にならないが、SMN1のエクソン7ホモ接合性homozygousホモ接合性(homozygous)homozygous(ホモ接合性)欠失によりSMAを発症した患者では、SMN2のコピー数copy numberコピー数(copy number)copy number(コピー数)が多いほど症状が軽い(重症度とSMN2コピー数copy numberコピー数(copy number)copy number(コピー数)は逆相関)。SMA1型(最重症型)は生後6〜8か月で呼吸不全により死亡する。
遺伝子治療の実例: SMN遺伝子は1995年にSMAとの関連が同定され、現在は効果的な遺伝子治療が存在する——ヌシネルセンnusinersenヌシネルセン(nusinersen)nusinersen(ヌシネルセン)はアンチセンスオリゴヌクレオチドASOアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)ASO(アンチセンスオリゴヌクレオチド)で、SMN2のエクソン7を排除する異常スプライシングを阻害し、機能的SMNタンパクの産生量を増加させる。症候性治療より発症前スクリーニングでの早期治療の方が効果が高い。
症例:嚢胞性線維症
CFTR遺伝子(7q31.2)の変異——Cl⁻・Na⁺・水の輸送ができず粘稠な粘液のみが分泌される。最頻変異はΔF508(フェニルアラニンphenylalanineフェニルアラニン(phenylalanine)phenylalanine(フェニルアラニン)欠失)。CFTR遺伝子変異は1,000種類を超え、複合ヘテロ接合性compound heterozygosity複合ヘテロ接合性(compound heterozygosity)compound heterozygosity(複合ヘテロ接合性)が特徴的、多面発現pleiotropy多面発現(pleiotropy)pleiotropy(多面発現)を示し、オリゴジェニック効果が証明されている(CF自体もオリゴジェニックとみなしうる)。
| 集団 | 頻度 |
|---|---|
| 中央ヨーロッパ | 1:2,000 |
| 黒人アフリカ系 | 1:17,000 |
| アジア系 | 1:90,000 |
⭐ CFヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)はコレラcholeraコレラ(cholera)cholera(コレラ)に対する耐性をもつ——AR疾患のヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性)の実例。 ヘテロ接合体heterozygoteヘテロ接合体(heterozygote)heterozygote(ヘテロ接合体)はCFTRの部分機能を保つことでコレラ毒素cholera toxinコレラ毒素(cholera toxin)cholera toxin(コレラ毒素)による過剰な水分喪失(分泌性下痢secretory diarrhea分泌性下痢(secretory diarrhea)secretory diarrhea(分泌性下痢))から一定の保護を受ける——高頻度キャリア率carrier frequencyキャリア率(carrier frequency)carrier frequency(キャリア率)の進化的説明。新生児スクリーニングnewborn screening新生児スクリーニング(newborn screening)newborn screening(新生児スクリーニング)の対象疾患target disease対象疾患(target disease)target disease(対象疾患)。
まとめ
- 単一遺伝子遺伝monogenic inheritance単一遺伝子遺伝(monogenic inheritance)monogenic inheritance(単一遺伝子遺伝)はメンデルMendelメンデル(Mendel)Mendel(メンデル)の法則に従うが、優性・劣性は表現型の性質であり遺伝子そのものの性質ではない。機能獲得型変異gain-of-function mutation機能獲得型変異(gain-of-function mutation)gain-of-function mutation(機能獲得型変異)は一般に優性、機能喪失型変異loss-of-function mutation機能喪失型変異(loss-of-function mutation)loss-of-function mutation(機能喪失型変異)は一般に劣性だが、半数不全haploinsufficiency半数不全(haploinsufficiency)haploinsufficiency(半数不全)・優性阻害効果dominant negative effect優性阻害効果(dominant negative effect)dominant negative effect(優性阻害効果)という例外で優性になりうる。偽優性pseudodominance偽優性(pseudodominance)pseudodominance(偽優性)(ヘテロ接合heterozygousヘテロ接合(heterozygous)heterozygous(ヘテロ接合)性の消失)も染色体微小欠失microdeletion微小欠失(microdeletion)microdeletion(微小欠失)で生じうる。
- 遺伝的異質性genetic heterogeneity遺伝的異質性(genetic heterogeneity)genetic heterogeneity(遺伝的異質性)(遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性)・対立遺伝子異質性allelic heterogeneity対立遺伝子異質性(allelic heterogeneity)allelic heterogeneity(対立遺伝子異質性))、多重対立遺伝子性multiple allelism多重対立遺伝子性(multiple allelism)multiple allelism(多重対立遺伝子性)、表現度expressivity表現度(expressivity)expressivity(表現度)・浸透率penetrance浸透率(penetrance)penetrance(浸透率)・ヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性)・表現促進anticipation表現促進(anticipation)anticipation(表現促進)・複合ヘテロ接合性compound heterozygosity複合ヘテロ接合性(compound heterozygosity)compound heterozygosity(複合ヘテロ接合性)・多面発現pleiotropy多面発現(pleiotropy)pleiotropy(多面発現)・表現型模写phenocopy表現型模写(phenocopy)phenocopy(表現型模写)という現象群が「古典的メンデルMendelメンデル(Mendel)Mendel(メンデル)遺伝」を大きく修飾する。モノアレリック発現monoallelic expression, MAEモノアレリック発現(monoallelic expression, MAE)monoallelic expression, MAE(モノアレリック発現)(遺伝子の15〜20%)もこれらの説明候補になる。
- AD疾患は受容体遺伝子receptor gene受容体遺伝子(receptor gene)receptor gene(受容体遺伝子)(軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症))・調節タンパク遺伝子regulatory protein gene調節タンパク遺伝子(regulatory protein gene)regulatory protein gene(調節タンパク遺伝子)(多指症polydactyly多指症(polydactyly)polydactyly(多指症))・構造タンパク遺伝子structural protein gene構造タンパク遺伝子(structural protein gene)structural protein gene(構造タンパク遺伝子)(骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症))・動的変異dynamic mutation動的変異(dynamic mutation)dynamic mutation(動的変異)(ハンチントン病Huntington's diseaseハンチントン病(Huntington's disease)Huntington's disease(ハンチントン病))に分類され、それぞれ対立遺伝子異質性allelic heterogeneity対立遺伝子異質性(allelic heterogeneity)allelic heterogeneity(対立遺伝子異質性)・遺伝子座異質性locus heterogeneity遺伝子座異質性(locus heterogeneity)locus heterogeneity(遺伝子座異質性)・多面発現pleiotropy多面発現(pleiotropy)pleiotropy(多面発現)/不完全浸透incomplete penetrance不完全浸透(incomplete penetrance)incomplete penetrance(不完全浸透)・表現促進anticipation表現促進(anticipation)anticipation(表現促進)という特徴的な現象を伴う。軟骨無形成症achondroplasia軟骨無形成症(achondroplasia)achondroplasia(軟骨無形成症)の父親年齢効果は生殖細胞系列モザイシズムgermline mosaicism生殖細胞系列モザイシズム(germline mosaicism)germline mosaicism(生殖細胞系列モザイシズム)で説明される。
- 家族性高コレステロール血症familial hypercholesterolemia, FH家族性高コレステロール血症(familial hypercholesterolemia, FH)familial hypercholesterolemia, FH(家族性高コレステロール血症)・冠動脈疾患はLDLR・ApoB・PCSK9という複数遺伝子座(単一遺伝子性monogenic単一遺伝子性(monogenic)monogenic(単一遺伝子性))と多因子性multifactorial (polygenic)多因子性(multifactorial (polygenic))multifactorial (polygenic)(多因子性)の両方の顔をもち、HMG-CoA還元酵素HMG-CoA reductaseHMG-CoA還元酵素(HMG-CoA reductase)HMG-CoA reductase(HMG-CoA還元酵素)(スタチン標的)・PCSK9(抗体療法標的)という治療標的を提供する。
- AR疾患はホモ接合体homozygoteホモ接合体(homozygote)homozygote(ホモ接合体)でのみ発現し、複合ヘテロ接合性compound heterozygosity複合ヘテロ接合性(compound heterozygosity)compound heterozygosity(複合ヘテロ接合性)が特徴的。創始者効果founder effect創始者効果(founder effect)founder effect(創始者効果)とヘテロ接合体優位性heterozygote advantageヘテロ接合体優位性(heterozygote advantage)heterozygote advantage(ヘテロ接合体優位性)が特定集団での高頻度を説明する(CFのコレラcholeraコレラ(cholera)cholera(コレラ)耐性が好例)。SMAはSMN1/SMN2パラログparalogueパラログ(paralogue)paralogue(パラログ)の1塩基差という分子機序molecular mechanism分子機序(molecular mechanism)molecular mechanism(分子機序)から、ヌシネルセンnusinersenヌシネルセン(nusinersen)nusinersen(ヌシネルセン)という核酸医薬nucleic acid therapeutic核酸医薬(nucleic acid therapeutic)nucleic acid therapeutic(核酸医薬)による遺伝子治療まで到達した好例。