Molecular Cell Biology · 28
コラーゲンの種類・構造・合成
Types, structure and synthesis of collagen
🧠 コラーゲンの全ての性質は「3本のポリプロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)らせんが束ねられた超らせん構造supercoiled structure超らせん構造(supercoiled structure)supercoiled structure(超らせん構造)の中心にできる、たった1個の陽子(H⁺)しか入らない極小の穴」という1点に由来する。 その穴に収まれるのはグリシンの側鎖(H原子1個)だけであるため、「3残基に1つは必ずグリシン」という一次構造primary structure一次構造(primary structure)primary structure(一次構造)の制約Limitations制約(Limitations)Limitations(制約)が生まれ、さらに水酸化の程度が超らせんの融解温度(体温のすぐ上に維持される)を調節することで、コラーゲンは「常に少し不安定=リモデリング可能」という絶妙なバランスを保っている。
コラーゲンとは
コラーゲンは結合組織(CT)細胞により分泌される線維性タンパク質で、体内の全タンパク質の25%を占める。伸展抵抗性を持ち、4つの主要な型がある。
| 型 | 構造 | 存在部位 |
|---|---|---|
| I型 | 太い線維 | 腱、骨 |
| II型 | 細い線維、架橋あり | 軟骨、硝子体vitreous body硝子体(vitreous body)vitreous body(硝子体) |
| III型 | より弾性に富む | 血管、皮膚 |
| IV型 | 広範な架橋 | 基底膜 |
コラーゲンの一次構造
特徴的な一次構造primary structure一次構造(primary structure)primary structure(一次構造)は(Gly-Pro-Hyp)ₙ(Hyp=4-ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン))である。
- 配列中の3残基ごとに1つはグリシンでなければならない。その他の置換基はアラニンalanineアラニン(alanine)alanine(アラニン)・プロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)・ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)
- コラーゲンはグリシン・プロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)に非常に富む
- グリシンは全アミノ酸中最小の側鎖(H原子1個のみ)を持ち、タンパク質に過剰に含まれるとそれを非常に弾力性豊かにする。グリシンはコラーゲンの約1/3を構成する
- タンパク質中の過剰なグリシンは非常に高い柔軟性をもたらすため、コラーゲンを除いて通常タンパク質の大部分を占めることはない
- プロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)は特殊なアミノ酸である——αアミノ基amino groupアミノ基(amino group)amino group(アミノ基)が環構造の一部をなす→プロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)を非常に剛直にする、そのためプロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)は通常タンパク質中に豊富には存在しない
→ グリシン(非常に柔軟)とプロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)(非常に剛直)の組み合わせ=良好なバランス
コラーゲンの二次構造
ポリプロリンヘリックスpolyproline helixポリプロリンヘリックス(polyproline helix)polyproline helix(ポリプロリンヘリックス)の形成を指し、αヘリックスに似るがより緩い——ポリプロリンヘリックスpolyproline helixポリプロリンヘリックス(polyproline helix)polyproline helix(ポリプロリンヘリックス)1回転はαヘリックスより大きい。
ポリプロリンヘリックスpolyproline helixポリプロリンヘリックス(polyproline helix)polyproline helix(ポリプロリンヘリックス)が緩い構造をとる理由は、プロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)のH結合供与体donor供与体(donor)donor(供与体)/受容体原子同士の反発により、これらが互いに離れすぎてしまうためである——このH結合供与体donor供与体(donor)donor(供与体)・受容体原子間の大きな距離が、ポリプロリンヘリックスpolyproline helixポリプロリンヘリックス(polyproline helix)polyproline helix(ポリプロリンヘリックス)を不安定にする。
解決策: 3本のポリプロリンヘリックスpolyproline helixポリプロリンヘリックス(polyproline helix)polyproline helix(ポリプロリンヘリックス)が束ねられ(重合し)、鎖間水素結合によりより安定な構造——3本のポリプロリンヘリックスpolyproline helixポリプロリンヘリックス(polyproline helix)polyproline helix(ポリプロリンヘリックス)からなるコラーゲン超らせん(superhelix)を形成する。
- 鎖間H結合はペプチド結合の-NH(アミノ)基と-CO(カルボキシル)基の間に形成される——これらの水素結合はらせん軸に対し垂直(αヘリックスのH結合はらせん軸に平行であるのと対照的)
- 組み立てられたコラーゲン超らせんは中心に極めて小さな核/穴を持ち、これは単一のプロトン(H⁺)しか収まらないほど小さい=グリシンの側鎖
- これが3残基ごとに1つがグリシンでなければならない理由である——3番目ごとのアミノ酸はコラーゲン超らせんの中心核に面することになり、グリシンの側鎖のみがこの極小の穴に収まりうる
コラーゲンの合成
コラーゲンは最初、大きな前駆体ポリペプチド——プロコラーゲンprocollagenプロコラーゲン(procollagen)procollagen(プロコラーゲン)として合成される。
- プロコラーゲンprocollagenプロコラーゲン(procollagen)procollagen(プロコラーゲン)は3本のコラーゲンペプチドを含み、超らせんの一部ではない球状spherical球状(spherical)spherical(球状)のC末端・N末端を持つコラーゲン超らせんを形成する(フォールディングを助ける)
- 球状spherical球状(spherical)spherical(球状)ドメインは超らせんをまとめ、鎖間H結合を安定化する機能を持つ:
- N末端: 三重らせんの形成を助けるαヘリックスを形成する
- C末端: 新たに形成されたコラーゲン三重らせんの巻き戻り(unfolding)を防ぐ
- 球状spherical球状(spherical)spherical(球状)末端ドメインはプロコラーゲンペプチダーゼprocollagen peptidaseプロコラーゲンペプチダーゼ(procollagen peptidase)procollagen peptidase(プロコラーゲンペプチダーゼ)により切断されトロポコラーゲンtropocollagenトロポコラーゲン(tropocollagen)tropocollagen(トロポコラーゲン)を形成する——これはコラーゲン超らせんのみからなる
- トロポコラーゲンtropocollagenトロポコラーゲン(tropocollagen)tropocollagen(トロポコラーゲン)がコラーゲンの単量体monomer単量体(monomer)monomer(単量体)である→トロポコラーゲンtropocollagenトロポコラーゲン(tropocollagen)tropocollagen(トロポコラーゲン)同士が平行に会合しコラーゲン線維collagen fibersコラーゲン線維(collagen fibers)collagen fibers(コラーゲン線維)を形成する。同じ位置で開始/終了しないよう互いに「ずらされ(slided)」ている(同じ位置で揃うと構造が不安定になるため)
- 連続するトロポコラーゲンtropocollagenトロポコラーゲン(tropocollagen)tropocollagen(トロポコラーゲン)単量体monomer単量体(monomer)monomer(単量体)間の小さな隙間は様々な物質で満たされ、異なる組織型への分化を引き起こしうる:
- ヒドロキシアパタイトhydroxyapatiteヒドロキシアパタイト(hydroxyapatite)hydroxyapatite(ヒドロキシアパタイト): 骨への分化
- 多糖類polysaccharide多糖類(polysaccharide)polysaccharide(多糖類): 皮膚/腱への分化
flowchart TD
A["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='procollagen'>プロコラーゲン</span>(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='spherical'>球状</span>N/C末端+コラーゲン超らせん)"] --> B["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='procollagen peptidase'>プロコラーゲンペプチダーゼ</span>が<span class='jp-term jp-term-diagram' title='spherical'>球状</span>末端を切断"]
B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='tropocollagen'>トロポコラーゲン</span>(コラーゲン超らせんのみ)=コラーゲン<span class='jp-term jp-term-diagram' title='monomer'>単量体</span>"]
C --> D["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='tropocollagen'>トロポコラーゲン</span>同士が互いにずれて平行会合"]
D --> E["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='collagen fibril'>コラーゲン原線維</span>の形成"]
E --> F["隙間を<span class='jp-term jp-term-diagram' title='hydroxyapatite'>ヒドロキシアパタイト</span>(骨)または<span class='jp-term jp-term-diagram' title='polysaccharide'>多糖類</span>(皮膚/腱)が充填→組織分化"]
コラーゲンの水酸化
コラーゲンの水酸化はプロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)→ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)への変換を担う。
- 酵素: プロリル水酸化酵素prolyl hydroxylaseプロリル水酸化酵素(prolyl hydroxylase)prolyl hydroxylase(プロリル水酸化酵素)
- 必要因子: O₂、α-ケトグルタル酸alpha-ketoglutarate (α-KG)ケトグルタル酸(alpha-ketoglutarate (α-KG))alpha-ketoglutarate (α-KG)(ケトグルタル酸)、Fe²⁺、アスコルビン酸ascorbic acid (vitamin C)アスコルビン酸(ascorbic acid (vitamin C))ascorbic acid (vitamin C)(アスコルビン酸)(ビタミンC)
- 生成物: 4-ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)+CO₂、H₂O₂、コハク酸succinic acidコハク酸(succinic acid)succinic acid(コハク酸)
⚠️ アスコルビン酸ascorbic acid (vitamin C)アスコルビン酸(ascorbic acid (vitamin C))ascorbic acid (vitamin C)(アスコルビン酸)(ビタミンC)欠乏(壊血病scurvy壊血病(scurvy)scurvy(壊血病)、scurvy)では結合組織が緩くなる——ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)なしでは結合組織が完全性completeness完全性(completeness)completeness(完全性)を失うため。水酸化はコラーゲンらせんの融解温度(安定性)を変化させる。コラーゲンの融解温度は常に体温のすぐ上に保たれている:
- 水酸化なし=融解(不安定すぎる)
- 水酸化過多=剛直すぎる
→ コラーゲンは「不安定である必要がある」——融解温度に近い状態を保つことで、必要に応じて再配置(リモデリング)が可能になる。これは水酸化の程度によって調節される。
(リジンの水酸化も同様の機序で起こる。)
コラーゲン線維の老化
- コラーゲンの老化は三重らせん間の酸化誘導性架橋oxidation-induced crosslink酸化誘導性架橋(oxidation-induced crosslink)oxidation-induced crosslink(酸化誘導性架橋)により起こる
- 酸化は活性酸素種reactive oxygen species (ROS)活性酸素種(reactive oxygen species (ROS))reactive oxygen species (ROS)(活性酸素種)の蓄積/産生増加により、老化の主要な原因となる
- ROSはトロポコラーゲンtropocollagenトロポコラーゲン(tropocollagen)tropocollagen(トロポコラーゲン)単量体monomer単量体(monomer)monomer(単量体)間に架橋を作り、より剛直にする。剛直性の増加=弾力性の低下→高齢者が骨折しやすい理由(骨の弾力性低下→より脆弱になる)
コラーゲン異化
コラゲナーゼcollagenaseコラゲナーゼ(collagenase)collagenase(コラゲナーゼ)酵素が関与する。ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)の40%は尿中に分泌される——このデータは異化catabolism異化(catabolism)catabolism(異化)過程の診断(例:関節リウマチ、骨転移bone metastasis骨転移(bone metastasis)bone metastasis(骨転移)、また妊娠中)に利用できる。
コラーゲンの病態生化学
| 分類 | 疾患 | 機序 |
|---|---|---|
| 代謝性疾患 | 壊血病scurvy壊血病(scurvy)scurvy(壊血病) | プロリルprolylプロリル(prolyl)prolyl(プロリル)・リシルlysylリシル(lysyl)lysyl(リシル)水酸化酵素に必要なビタミンCの食事性欠乏の結果。ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)・ヒドロキシリジンhydroxylysine (Hyl)ヒドロキシリジン(hydroxylysine (Hyl))hydroxylysine (Hyl)(ヒドロキシリジン)残基数の欠損がコラーゲン線維collagen fibersコラーゲン線維(collagen fibers)collagen fibers(コラーゲン線維)の構造的安定性を損ない、歯肉出血gingival bleeding歯肉出血(gingival bleeding)gingival bleeding(歯肉出血)・関節腫脹・創傷治癒不良・最終的には死に至る |
| 代謝性疾患 | メンケス症候群Menkes syndromeメンケス症候群(Menkes syndrome)Menkes syndrome(メンケス症候群) | リシルオキシダーゼlysyl oxidaseリシルオキシダーゼ(lysyl oxidase)lysyl oxidase(リシルオキシダーゼ)に必要な銅copper銅(copper)copper(銅)の食事性欠乏——コラーゲン線維collagen fibersコラーゲン線維(collagen fibers)collagen fibers(コラーゲン線維)を強化する共有結合架橋形成cross-link formation架橋形成(cross-link formation)cross-link formation(架橋形成)の重要な段階を触媒する酵素。縮れ毛と成長遅延growth retardation成長遅延(growth retardation)growth retardation(成長遅延)が特徴 |
| 遺伝性疾患 | エーラス・ダンロス症候群Ehlers-Danlos syndromeダンロス症候群(Ehlers-Danlos syndrome)Ehlers-Danlos syndrome(ダンロス症候群) | プロコラーゲンペプチダーゼprocollagen peptidaseプロコラーゲンペプチダーゼ(procollagen peptidase)procollagen peptidase(プロコラーゲンペプチダーゼ)とリジン水酸化酵素をコードする遺伝子の欠陥。関節可動性亢進、脆弱組織、皮膚異常(「ゴム人間」)が特徴 |
| 遺伝性疾患 | 骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症) | I型コラーゲン遺伝子の欠失。三重らせんの誤フォールディング。重篤な子宮内骨変形が特徴 |
エラスチン——「柔軟なコラーゲン」
多くの脊椎動物組織(皮膚、血管、肺)は機能するために強靭かつ弾力的である必要がある。これらの組織の細胞外基質extracellular matrix細胞外基質(extracellular matrix)extracellular matrix(細胞外基質)にある弾性線維のネットワークが、一過性の伸展後に回復する弾力性を与える。
弾性線維の主成分main component主成分(main component)main component(主成分)はエラスチンelastinエラスチン(elastin)elastin(エラスチン)——非常に疎水性の高いタンパク質(約750アミノ酸長)である。グリシントリプレットの配列はコラーゲンに似るが、ヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)を欠く(これが柔軟性を説明する)。
分泌後、トロポエラスチンtropoelastinトロポエラスチン(tropoelastin)tropoelastin(トロポエラスチン)(エラスチンelastinエラスチン(elastin)elastin(エラスチン)の生合成前駆体biosynthetic precursor生合成前駆体(biosynthetic precursor)biosynthetic precursor(生合成前駆体))分子は互いに高度に架橋し、エラスチンelastinエラスチン(elastin)elastin(エラスチン)線維とシートの広範なネットワークを生成する。
エラスチンelastinエラスチン(elastin)elastin(エラスチン)ポリペプチド鎖の一部は、通常のゴムの高分子鎖と同様、緩い「ランダムコイル」を形成すると考えられる。このランダムコイルの性質を持つ構成分子が架橋してできる弾性線維ネットワークが、ゴムバンドのように伸展・回復できる仕組みを作っている。
まとめ
- コラーゲンは(Gly-Pro-Hyp)ₙの一次構造primary structure一次構造(primary structure)primary structure(一次構造)を持ち、グリシン(柔軟)とプロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)(剛直)の組み合わせが、3本のポリプロリンヘリックスpolyproline helixポリプロリンヘリックス(polyproline helix)polyproline helix(ポリプロリンヘリックス)からなる超らせん構造supercoiled structure超らせん構造(supercoiled structure)supercoiled structure(超らせん構造)を可能にする——超らせん中心の極小の穴(H⁺1個分)にグリシン側鎖のみが収まるため、3残基ごとのグリシンが必須となる。
- コラーゲンはプロコラーゲンprocollagenプロコラーゲン(procollagen)procollagen(プロコラーゲン)(球状spherical球状(spherical)spherical(球状)N/C末端付き)として合成され、プロコラーゲンペプチダーゼprocollagen peptidaseプロコラーゲンペプチダーゼ(procollagen peptidase)procollagen peptidase(プロコラーゲンペプチダーゼ)による切断でトロポコラーゲンtropocollagenトロポコラーゲン(tropocollagen)tropocollagen(トロポコラーゲン)(単量体monomer単量体(monomer)monomer(単量体))となり、これがずれて平行会合しコラーゲン線維collagen fibersコラーゲン線維(collagen fibers)collagen fibers(コラーゲン線維)を形成する。
- ビタミンC依存性のプロリル水酸化酵素prolyl hydroxylaseプロリル水酸化酵素(prolyl hydroxylase)prolyl hydroxylase(プロリル水酸化酵素)による水酸化は、コラーゲンの融解温度(体温のすぐ上に維持)を調節し「安定と不安定のバランス」を保つ——欠乏は壊血病scurvy壊血病(scurvy)scurvy(壊血病)を招く。
- コラーゲン病態には代謝性(壊血病scurvy壊血病(scurvy)scurvy(壊血病)、メンケス症候群Menkes syndromeメンケス症候群(Menkes syndrome)Menkes syndrome(メンケス症候群))と遺伝性(エーラス・ダンロス症候群Ehlers-Danlos syndromeダンロス症候群(Ehlers-Danlos syndrome)Ehlers-Danlos syndrome(ダンロス症候群)、骨形成不全症Osteogenesis imperfecta骨形成不全症(Osteogenesis imperfecta)Osteogenesis imperfecta(骨形成不全症))があり、加齢に伴う酸化誘導性架橋oxidation-induced crosslink酸化誘導性架橋(oxidation-induced crosslink)oxidation-induced crosslink(酸化誘導性架橋)は組織の弾力性低下(骨折しやすさ)につながる。
- エラスチンelastinエラスチン(elastin)elastin(エラスチン)はヒドロキシプロリンhydroxyproline (Hyp)ヒドロキシプロリン(hydroxyproline (Hyp))hydroxyproline (Hyp)(ヒドロキシプロリン)を欠くコラーゲン類似タンパク質で、ランダムコイル構造の架橋ネットワークにより組織に伸展-回復性(弾力性)を与える。