Biochemistry · 7/4
アミノ酸の分解:炭素骨格の運命;アミノ酸代謝におけるビタミンの役割
Degradation of amino acids: fate of the carbon skeleton; role of vitamins in amino acid metabolism — L II
🧠 アミノ酸の炭素骨格carbon skeleton炭素骨格(carbon skeleton)carbon skeleton(炭素骨格)は「最終的にクエン酸回路citric acid cycle (TCA cycle)クエン酸回路(citric acid cycle (TCA cycle))citric acid cycle (TCA cycle)(クエン酸回路)の7つの入口のどれかに合流する」と読み、糖原性glucogenic糖原性(glucogenic)glucogenic(糖原性)か ケト原性ketogenicケト原性(ketogenic)ketogenic(ケト原性)かはその入口で決まる。 ビタミンはこの過程の随所で補酵素coenzyme補酵素(coenzyme)coenzyme(補酵素)として働く:葉酸は1炭素単位one-carbon unit炭素単位(one-carbon unit)one-carbon unit(炭素単位)の運搬、B12はメチル基転移methyl group transferメチル基転移(methyl group transfer)methyl group transfer(メチル基転移)とメチルマロニルCoAmethylmalonyl-CoAメチルマロニルCoA(methylmalonyl-CoA)methylmalonyl-CoA(メチルマロニルCoA)代謝、B6はアミノ基転移transaminationアミノ基転移(transamination)transamination(アミノ基転移)。BCAA代謝異常とB12/葉酸欠損(高ホモシステイン血症Hyperhomocysteinemia高ホモシステイン血症(Hyperhomocysteinemia)Hyperhomocysteinemia(高ホモシステイン血症))が臨床的ハイライト。
糖原性アミノ酸とケト原性アミノ酸
炭素骨格carbon skeleton炭素骨格(carbon skeleton)carbon skeleton(炭素骨格)がクエン酸回路citric acid cycle (TCA cycle)クエン酸回路(citric acid cycle (TCA cycle))citric acid cycle (TCA cycle)(クエン酸回路)のどの中間体(またはピルビン酸)に合流するかで、糖新生に使えるか(糖原性glucogenic糖原性(glucogenic)glucogenic(糖原性))、アセチルCoA/アセトアセチルCoAにしかならないか(ケト原性ketogenicケト原性(ketogenic)ketogenic(ケト原性))が決まる。
| 分類 | 入口 | 代表アミノ酸 |
|---|---|---|
| 糖原性glucogenic糖原性(glucogenic)glucogenic(糖原性)(大多数) | ピルビン酸、オキサロ酢酸oxaloacetateオキサロ酢酸(oxaloacetate)oxaloacetate(オキサロ酢酸)、α-ケトグルタル酸alpha-ketoglutarate (α-KG)ケトグルタル酸(alpha-ketoglutarate (α-KG))alpha-ketoglutarate (α-KG)(ケトグルタル酸)、スクシニルCoAsuccinyl-CoAスクシニルCoA(succinyl-CoA)succinyl-CoA(スクシニルCoA)、フマル酸fumarateフマル酸(fumarate)fumarate(フマル酸) | Ala, Gly, Ser, Asp, Glu, Argなど大半 |
| 純ケト原性ketogenicケト原性(ketogenic)ketogenic(ケト原性)(2つのみ) | アセチルCoA/アセトアセチルCoAのみ | Leu, Lys |
| 両方(糖原性glucogenic糖原性(glucogenic)glucogenic(糖原性)+ケト原性ketogenicケト原性(ketogenic)ketogenic(ケト原性)) | 一部が糖原性glucogenic糖原性(glucogenic)glucogenic(糖原性)入口、一部がアセチルCoA | Ile, Phe, Tyr, Trp, Thr |
1炭素単位の転移:葉酸系
多くのアミノ酸代謝反応で、1つの炭素単位one-carbon unit炭素単位(one-carbon unit)one-carbon unit(炭素単位)(メチル基methyl groupメチル基(methyl group)methyl group(メチル基)・メチレン基methylene groupメチレン基(methylene group)methylene group(メチレン基)・ホルミル基formyl groupホルミル基(formyl group)formyl group(ホルミル基)など)の受け渡しが必要になる。この運搬を担うのがテトラヒドロ葉酸tetrahydrofolate (THF)テトラヒドロ葉酸(tetrahydrofolate (THF))tetrahydrofolate (THF)(テトラヒドロ葉酸)。
⭐ セリンが1炭素単位one-carbon unit炭素単位(one-carbon unit)one-carbon unit(炭素単位)の主要な供給源。 セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼserine hydroxymethyltransferase (SHMT)セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ(serine hydroxymethyltransferase (SHMT))serine hydroxymethyltransferase (SHMT)(セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ)が、セリンの側鎖炭素side-chain carbon側鎖炭素(side-chain carbon)side-chain carbon(側鎖炭素)をTHFに渡してグリシン+N5,N10-メチレンTHFを作る。この反応が細胞内の1炭素プールを支える中心的な入口。
- THF誘導体(N5-メチルTHF、N5,N10-メチレンTHF、N10-ホルミルTHFなど)は、相互変換されながらプリン合成purine synthesisプリン合成(purine synthesis)purine synthesis(プリン合成)・チミジル酸合成thymidylate synthesisチミジル酸合成(thymidylate synthesis)thymidylate synthesis(チミジル酸合成)・メチオニン再生methionine regenerationメチオニン再生(methionine regeneration)methionine regeneration(メチオニン再生)などに1炭素単位one-carbon unit炭素単位(one-carbon unit)one-carbon unit(炭素単位)を供給する。
グリシンの直接脱アミノ化:グリシン開裂系
グリシンは、グリシン開裂系glycine cleavage systemグリシン開裂系(glycine cleavage system)glycine cleavage system(グリシン開裂系)(複合酵素、リポ酸lipoic acidリポ酸(lipoic acid)lipoic acid(リポ酸)・THF・FAD・PLPを補因子とする)により直接分解され、CO₂・NH₃・N5,N10-メチレンTHFを生じる。
ヒスチジン・スレオニンの代謝
- ヒスチジンhistidineヒスチジン(histidine)histidine(ヒスチジン): 分解の一部でグルタミン酸へ合流するとともに、1炭素単位one-carbon unit炭素単位(one-carbon unit)one-carbon unit(炭素単位)(ホルムイミノ基 formimino group)をTHFへ供与する(FIGLU経路FIGLU (formiminoglutamate) pathwayFIGLU経路(FIGLU (formiminoglutamate) pathway)FIGLU (formiminoglutamate) pathway(FIGLU経路)、葉酸欠乏の診断に使われるヒスチジンhistidineヒスチジン(histidine)histidine(ヒスチジン)負荷試験challenge test負荷試験(challenge test)challenge test(負荷試験) histidine loading test の基盤)。
- スレオニンthreonineスレオニン(threonine)threonine(スレオニン): 複数の経路で分解されうる複雑な代謝(グリシンやアセチルCoA、プロピオニルCoApropionyl-CoAプロピオニルCoA(propionyl-CoA)propionyl-CoA(プロピオニルCoA)などに至る)。
葉酸・コバラミン(B12)・B6の相互関係
3つのビタミンは、独立した経路でありながら密接にリンクする。
flowchart TD
A["N5,N10-メチレンTHF"]
A --> B["N5-メチルTHF(還元、ほぼ不可逆)"]
B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='methionine synthase'>メチオニン合成酵素</span>(B12依存):<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='homocysteine'>ホモシステイン</span> + N5-メチルTHF → <span class='jp-term jp-term-diagram' title='methionine'>メチオニン</span> + THF"]
C --> D["THF再生 → 葉酸プール回復"]
C --> E["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='methionine'>メチオニン</span> → SAM(メチル<span class='jp-term jp-term-diagram' title='donor'>供与体</span>)"]
⚠️ 「メチルトラップmethyl trapメチルトラップ(methyl trap)methyl trap(メチルトラップ)」がB12欠乏で葉酸欠乏症状を起こす機序。 N5-メチルTHFへの還元はほぼ不可逆で、そこから抜け出すにはB12依存性メチオニン合成酵素methionine synthaseメチオニン合成酵素(methionine synthase)methionine synthase(メチオニン合成酵素)の反応(ホモシステインhomocysteineホモシステイン(homocysteine)homocysteine(ホモシステイン)→メチオニンmethionineメチオニン(methionine)methionine(メチオニン))が必須。B12が欠乏するとN5-メチルTHFの形で葉酸が「トラップ」され、他の葉酸依存反応(プリン・チミジル酸合成thymidylate synthesisチミジル酸合成(thymidylate synthesis)thymidylate synthesis(チミジル酸合成))に使えなくなる。これがB12欠乏がしばしば葉酸欠乏様の巨赤芽球性貧血Megaloblastic anemia巨赤芽球性貧血(Megaloblastic anemia)Megaloblastic anemia(巨赤芽球性貧血)を起こす理由。
高ホモシステイン血症
原因は主に3つ。
| 原因 | 機序 |
|---|---|
| MTHFR熱不安定変異体 | N5,N10-メチレンTHF還元酵素の活性低下 |
| ビタミン欠乏vitamin deficiencyビタミン欠乏(vitamin deficiency)vitamin deficiency(ビタミン欠乏) | B12・葉酸(B9)欠乏 |
| (B6欠乏) | ホモシステインhomocysteineホモシステイン(homocysteine)homocysteine(ホモシステイン)のトランススルフレーション経路transsulfuration pathwayトランススルフレーション経路(transsulfuration pathway)transsulfuration pathway(トランススルフレーション経路)(→システイン)の障害 |
⚠️ 高ホモシステイン血症Hyperhomocysteinemia高ホモシステイン血症(Hyperhomocysteinemia)Hyperhomocysteinemia(高ホモシステイン血症)は血管障害のリスク因子。 メチオニンmethionineメチオニン(methionine)methionine(メチオニン)代謝の停滞によりホモシステインhomocysteineホモシステイン(homocysteine)homocysteine(ホモシステイン)が蓄積し、血管内皮障害vascular endothelial damage血管内皮障害(vascular endothelial damage)vascular endothelial damage(血管内皮障害)・血栓傾向prothrombotic tendency血栓傾向(prothrombotic tendency)prothrombotic tendency(血栓傾向)に関連するとされる。
分岐鎖アミノ酸の分解とMSUD
バリンvalineバリン(valine)valine(バリン)・イソロイシンisoleucine (Ile)イソロイシン(isoleucine (Ile))isoleucine (Ile)(イソロイシン)・スレオニンthreonineスレオニン(threonine)threonine(スレオニン)・メチオニンmethionineメチオニン(methionine)methionine(メチオニン)の分解は、共通の最終段階としてプロピオニルCoApropionyl-CoAプロピオニルCoA(propionyl-CoA)propionyl-CoA(プロピオニルCoA)→メチルマロニルCoAmethylmalonyl-CoAメチルマロニルCoA(methylmalonyl-CoA)methylmalonyl-CoA(メチルマロニルCoA)→スクシニルCoAsuccinyl-CoAスクシニルCoA(succinyl-CoA)succinyl-CoA(スクシニルCoA)(B12依存のメチルマロニルCoAムターゼmethylmalonyl-CoA mutaseメチルマロニルCoAムターゼ(methylmalonyl-CoA mutase)methylmalonyl-CoA mutase(メチルマロニルCoAムターゼ)が触媒)に収束する(詳細は07-05-vitamin-b12-deficiency-and-methylmalonic-acidemias-s-ii)。
BCAA(分枝鎖アミノ酸branched-chain amino acid, BCAA分枝鎖アミノ酸(branched-chain amino acid, BCAA)branched-chain amino acid, BCAA(分枝鎖アミノ酸):Val, Ile, Leu)の分解は共通の分枝鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex (BCKDC)分枝鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体(branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex (BCKDC))branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex (BCKDC)(分枝鎖α-ケト酸脱水素酵素複合体)(PDH・KGDHCと同族の複合体)が担う。
⚠️ メープルシロップ尿症maple syrup urine disease, MSUDメープルシロップ尿症(maple syrup urine disease, MSUD)maple syrup urine disease, MSUD(メープルシロップ尿症)はBCKDC欠損。 BCAA由来のα-ケト酸が蓄積し、尿・汗にメープルシロップ様の甘い臭いを呈する。未治療では重篤な神経障害を来す。
プロピオニルCoA・メチルマロニルCoAの毒性
Val・Ile・Thr・Metの分解終末段階で生じるプロピオニルCoApropionyl-CoAプロピオニルCoA(propionyl-CoA)propionyl-CoA(プロピオニルCoA)・メチルマロニルCoAmethylmalonyl-CoAメチルマロニルCoA(methylmalonyl-CoA)methylmalonyl-CoA(メチルマロニルCoA)の代謝異常(酵素欠損)は、低血糖・高アンモニア血症hyperammonemia高アンモニア血症(hyperammonemia)hyperammonemia(高アンモニア血症)・高グリシン血症hyperglycinemia高グリシン血症(hyperglycinemia)hyperglycinemia(高グリシン血症)・ケトアシドーシスketoacidosisケトアシドーシス(ketoacidosis)ketoacidosis(ケトアシドーシス)(ketoacidosis;ケトン体によらない)・二次性カルニチン欠乏secondary carnitine deficiency二次性カルニチン欠乏(secondary carnitine deficiency)secondary carnitine deficiency(二次性カルニチン欠乏)を来しうる。
グルタミン・グルタミン酸:「オールラウンド化合物」
グルタミン酸・グルタミンは、アミノ基amino groupアミノ基(amino group)amino group(アミノ基)の受け渡し・貯蔵の中枢的存在。
- 血漿遊離アミノ酸free amino acid血漿遊離アミノ酸(free amino acid)free amino acid(血漿遊離アミノ酸)の約25%、筋肉内intramuscular筋肉内(intramuscular)intramuscular(筋肉内)遊離アミノ酸の約60%をグルタミンが占める(体内で最も豊富な遊離アミノ酸)。
- 小腸上皮細胞small intestinal epithelial cell小腸上皮細胞(small intestinal epithelial cell)small intestinal epithelial cell(小腸上皮細胞)の主要なエネルギー源としても利用される。
- がん細胞(例:メラノーマmelanomaメラノーマ(melanoma)melanoma(メラノーマ) melanoma)が好むアミノ酸でもあり、腫瘍代謝tumor metabolism腫瘍代謝(tumor metabolism)tumor metabolism(腫瘍代謝)でグルタミン依存性が注目される(15-01-molecules-of-central-importance-and-drug-targets-of-proliferationと関連)。
- アンモニアの一時的な「無毒化・運搬形」としての役割(グルタミン酸+NH₃→グルタミン)は07-03-elimination-of-ammonia-s-iiの肝小葉hepatic lobule肝小葉(hepatic lobule)hepatic lobule(肝小葉)分業と直結する。
プロリン・オルニチン・アルギニン・ヒスチジンの相互関係
これらのアミノ酸は代謝的に相互に変換しうる関連ファミリーを形成する(グルタミン酸-セミアルデヒドglutamate semialdehydeグルタミン酸-セミアルデヒド(glutamate semialdehyde)glutamate semialdehyde(グルタミン酸-セミアルデヒド)/ピロリン-5-カルボキシラートpyrroline-5-carboxylateピロリン-5-カルボキシラート(pyrroline-5-carboxylate)pyrroline-5-carboxylate(ピロリン-5-カルボキシラート)を介した相互変換)。
⚠️ 円錐角膜keratoconus円錐角膜(keratoconus)keratoconus(円錐角膜)の病態機序に関連。 角膜実質細胞keratocyte角膜実質細胞(keratocyte)keratocyte(角膜実質細胞)でアルギナーゼarginaseアルギナーゼ(arginase)arginase(アルギナーゼ)→プロリンprolineプロリン(proline)proline(プロリン)→コラーゲンという経路が、円錐角膜keratoconus円錐角膜(keratoconus)keratoconus(円錐角膜)の角膜変形の病態機序として提案されている(ピロリン-5-カルボキシラートpyrroline-5-carboxylateピロリン-5-カルボキシラート(pyrroline-5-carboxylate)pyrroline-5-carboxylate(ピロリン-5-カルボキシラート)合成酵素が関与)。
まとめ
- アミノ酸の炭素骨格carbon skeleton炭素骨格(carbon skeleton)carbon skeleton(炭素骨格)はクエン酸回路citric acid cycle (TCA cycle)クエン酸回路(citric acid cycle (TCA cycle))citric acid cycle (TCA cycle)(クエン酸回路)の入口(ピルビン酸・OAA・αKG・スクシニルCoAsuccinyl-CoAスクシニルCoA(succinyl-CoA)succinyl-CoA(スクシニルCoA)・フマル酸fumarateフマル酸(fumarate)fumarate(フマル酸))またはアセチルCoAに合流し、糖原性glucogenic糖原性(glucogenic)glucogenic(糖原性)/ケト原性ketogenicケト原性(ketogenic)ketogenic(ケト原性)が決まる(Leu・Lysのみ純ケト原性ketogenicケト原性(ketogenic)ketogenic(ケト原性))。
- セリンが1炭素単位one-carbon unit炭素単位(one-carbon unit)one-carbon unit(炭素単位)(THF系)の主要供給源。グリシン開裂系glycine cleavage systemグリシン開裂系(glycine cleavage system)glycine cleavage system(グリシン開裂系)・ヒスチジンhistidineヒスチジン(histidine)histidine(ヒスチジン)代謝もTHFに関わる。
- B12依存性メチオニン合成酵素methionine synthaseメチオニン合成酵素(methionine synthase)methionine synthase(メチオニン合成酵素)がN5-メチルTHFから葉酸を「解放」する。B12欠乏はメチルトラップmethyl trapメチルトラップ(methyl trap)methyl trap(メチルトラップ)で葉酸欠乏様症状を起こす。
- 高ホモシステイン血症Hyperhomocysteinemia高ホモシステイン血症(Hyperhomocysteinemia)Hyperhomocysteinemia(高ホモシステイン血症)はMTHFR変異・B12/葉酸欠乏で起こり血管障害リスクとなる。
- BCKDC欠損はMSUD。Val/Ile/Thr/Metの終末代謝はプロピオニルCoApropionyl-CoAプロピオニルCoA(propionyl-CoA)propionyl-CoA(プロピオニルCoA)→メチルマロニルCoAmethylmalonyl-CoAメチルマロニルCoA(methylmalonyl-CoA)methylmalonyl-CoA(メチルマロニルCoA)(B12依存)に収束する。
- グルタミン/グルタミン酸はアミノ基amino groupアミノ基(amino group)amino group(アミノ基)代謝の中枢で、体内最多の遊離アミノ酸かつがん細胞の好む燃料でもある。