Medical Microbiology · 1/23
抗菌薬耐性の機構(例)
Resistance mechanisms against antibiotics (examples)
- 応用トピック
- 薬剤耐性と抗菌薬適正使用多剤耐性菌と医療関連感染
🧠 耐性は「元から持っている(内因性)」か「後から獲得した(外因性)」かの2択、機序は「壊す・出す・変える・逃げる・迂回する」の5パターンに集約できる。 酵素で薬を不活化する(β-ラクタマーゼ)、ポンプで薬を排出する(efflux pump)、標的を変える(PBP・リボソーム結合部位ribosome binding siteリボソーム結合部位(ribosome binding site)ribosome binding site(リボソーム結合部位)の変異)、薬が届く前に透過性を落とす(porin変異)、そして代謝経路自体を迂回する(葉酸合成folate synthesis葉酸合成(folate synthesis)folate synthesis(葉酸合成)の別経路)——この5つのレンズで個々の薬剤の耐性機序resistance mechanism耐性機序(resistance mechanism)resistance mechanism(耐性機序)を読み解くと暗記量が激減する。
耐性の定義
耐性とは、治療濃度の抗菌薬の効果に抵抗し耐える(withstand / tolerate)細菌の能力である。臨床的には、MIC(minimum inhibitory concentration、最小発育阻止濃度minimum inhibitory concentration, MIC最小発育阻止濃度(minimum inhibitory concentration, MIC)minimum inhibitory concentration, MIC(最小発育阻止濃度))が宿主に投与可能な最大用量を上回っている状態を指す。
- 耐性は自然現象であり、一部の病原体は特定の抗菌薬クラスに元来抵抗性を持つ
- すべての細菌は耐性を発達または獲得する能力を持つ
- 抗菌薬の使用そのものが選択圧selective pressure選択圧(selective pressure)selective pressure(選択圧)を生み、耐性の拡大を促す
| 用語 | 定義 |
|---|---|
| 多剤耐性 | 化学構造の異なる複数の抗菌薬に同時に耐性を持つ |
| 交差耐性cross resistance交差耐性(cross resistance)cross resistance(交差耐性) | 同一構造を持つ誘導体すべてに耐性を持つ |
抗菌薬耐性サイクル
抗菌薬の使用そのものが耐性拡大の悪循環を生む。
flowchart TD
A["抗菌薬使用の増加"] --> B["耐性株の増加"]
B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='empiric therapy'>経験的治療</span>の無効化<br>→ <span class='jp-term jp-term-diagram' title='incidence rate'>罹患率</span>上昇・抗菌薬追加"]
C --> D["入院の増加"]
D --> E["医療資源使用の増加"]
E --> F["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='therapeutic options'>治療選択</span>肢の枯渇<br>→ 抗菌薬追加・死亡率上昇"]
F --> A
耐性の遺伝的基盤——水平伝播
異なる菌種間で耐性遺伝子が広がる仕組みを水平伝播horizontal transmission (of genes: horizontal gene transfer)水平伝播(horizontal transmission (of genes: horizontal gene transfer))horizontal transmission (of genes: horizontal gene transfer)(水平伝播)という。
| 機構 | 内容 |
|---|---|
| 接合 | 性線毛sex pilus性線毛(sex pilus)sex pilus(性線毛)を介した細胞間の直接接触によるプラスミドの伝達 |
| 形質導入transduction形質導入(transduction)transduction(形質導入) | バクテリオファージbacteriophageバクテリオファージ(bacteriophage)bacteriophage(バクテリオファージ)を介した遺伝子の伝達(ファージ放出による) |
| 形質転換 | 環境中の遊離DNAを細菌が直接取り込む |
💡 トランスポゾンtransposonトランスポゾン(transposon)transposon(トランスポゾン)(可動遺伝因子)はプラスミドと染色体の間を「飛び移る」ことができる遺伝因子で、上記いずれの伝播経路にも便乗して運ばれうる。複数の耐性遺伝子をひとまとめにして伝播させるため、多剤耐性の拡大に大きく寄与する。
- 薬剤耐性antimicrobial resistance, AMR薬剤耐性(antimicrobial resistance, AMR)antimicrobial resistance, AMR(薬剤耐性)変異株variant strain変異株(variant strain)variant strain(変異株)の選択:変異は抗菌薬の有無に関わらず自然に生じる。抗菌薬は感受性株より耐性株の生存を有利にする「選択剤」として働くにすぎない。耐性化した菌は死滅せず分裂を続け、最終的に集団全体が耐性化する
- プラスミド媒介耐性:プラスミドは複数薬剤への耐性を同時に媒介することが多く、細胞間の伝達率が非常に高い。宿主染色体とは独立に複製するため、菌体内に多コピー存在しうる。同種homologous同種(homologous)homologous(同種)だけでなく異なる種・属にも伝達されうる
- トランスポゾンtransposonトランスポゾン(transposon)transposon(トランスポゾン)媒介耐性
内因性耐性の基本機序
内因性耐性intrinsic resistance内因性耐性(intrinsic resistance)intrinsic resistance(内因性耐性)とは、その細菌が遺伝的にもともとその抗菌薬に抵抗性であることを意味する。
- 受容体(標的)が存在しない
- 細菌自身がその抗菌薬を産生している(自己耐性)
- 細胞壁がバリアとなる(グラム陰性菌)、または細胞壁自体が存在しない(マイコプラズマMycoplasmaマイコプラズマ(Mycoplasma)Mycoplasma(マイコプラズマ))
- 薬剤の輸送システムを欠く
- 受容体部位での薬剤濃度が低い
| 機構 | 具体例 |
|---|---|
| 標的が存在しない | 細菌の細胞膜にはステロールが存在しないため、抗真菌ポリエン系Polyenesポリエン系(Polyenes)Polyenes(ポリエン系)(アムホテリシンBAmphotericin BアムホテリシンB(Amphotericin B)Amphotericin B(アムホテリシンB)、ナイスタチンnystatinナイスタチン(nystatin)nystatin(ナイスタチン))に抵抗性 |
| 標的が存在しない | マイコプラズマMycoplasmaマイコプラズマ(Mycoplasma)Mycoplasma(マイコプラズマ)は細胞壁を持たないため、βラクタム系は無効 |
| 標的が存在しない | イソニアジドisoniazid, Hイソニアジド(isoniazid, H)isoniazid, H(イソニアジド)はミコール酸mycolic acidミコール酸(mycolic acid)mycolic acid(ミコール酸)合成を阻害するが、ミコール酸mycolic acidミコール酸(mycolic acid)mycolic acid(ミコール酸)は抗酸菌の細胞壁にのみ存在する成分であるため、他の細菌は自然耐性intrinsic resistance自然耐性(intrinsic resistance)intrinsic resistance(自然耐性) |
| 標的部位の薬剤濃度が低い | グラム陰性菌は複雑な細胞壁構造を持ち、ペニシリンGbenzylpenicillinペニシリンG(benzylpenicillin)benzylpenicillin(ペニシリンG)がPBP(ペニシリン結合蛋白penicillin-binding protein, PBPペニシリン結合蛋白(penicillin-binding protein, PBP)penicillin-binding protein, PBP(ペニシリン結合蛋白), penicillin-binding protein)に到達できない |
| 標的部位の薬剤濃度が低い | リファンピシン(DNA依存性RNAポリメラーゼDNA-dependent RNA polymeraseDNA依存性RNAポリメラーゼ(DNA-dependent RNA polymerase)DNA-dependent RNA polymerase(DNA依存性RNAポリメラーゼ)阻害薬)は真菌の細胞壁を透過できず無効 |
| 標的部位の薬剤濃度が低い | アミノグリコシド系の取り込みには細菌の電子伝達系electron transport chain電子伝達系(electron transport chain)electron transport chain(電子伝達系)が維持する膜電位のエネルギーが必要であり、この輸送系の阻害(嫌気性環境など)は耐性につながる |
外因性耐性
外因性耐性acquired resistance外因性耐性(acquired resistance)acquired resistance(外因性耐性)とは、本来感受性であった細菌が新たに耐性を獲得することを指す。遺伝子発現の変化はプラスミド(染色体外)または染色体にコードされ、他の菌に伝達されうる。
耐性拡大の素因
- 抗菌薬の過剰使用(不要・無効な軽症感染への使用)
- 抗菌薬の誤用(処方された治療コースを完遂completion (of a treatment course)完遂(completion (of a treatment course))completion (of a treatment course)(完遂)しない)
- 感染原因菌に特異的でない抗菌薬の使用
- 院内感染対策プロトコルの不徹底
- 新規抗菌薬開発の困難さ
- 世界的な拡散の容易さ
- 獣医領域での抗菌薬の過剰使用
獲得耐性の4つの分子機序
| 機序 | 説明 | 具体例 |
|---|---|---|
| 酵素による不活化 | 新規遺伝子の獲得により合成された細菌の酵素(β-ラクタマーゼ/ペニシリナーゼpenicillinaseペニシリナーゼ(penicillinase)penicillinase(ペニシリナーゼ)など)が薬剤を化学的に分解し不活化する | β-ラクタマーゼがβ-ラクタム環beta-lactam ringラクタム環(beta-lactam ring)beta-lactam ring(ラクタム環)を加水分解しペニシリン・セファロスポリンを不活化 |
| 透過性・取り込みの低下 | 変異により薬剤の受容体の形が変化し、取り込みが低下する | 受容体の形状変化による薬剤結合の阻害 |
| 薬剤の能動的排出efflux能動的排出(efflux)efflux(能動的排出) | 新規遺伝子の獲得により、多剤耐性ポンプが薬剤を細胞外へ能動輸送する | グラム陽性・陰性いずれにも存在するMDRポンプ |
| 標的結合部位の変化 | 変異または新規遺伝子獲得により、結合部位の数・親和性が低下する | エリスロマイシンerythromycinエリスロマイシン(erythromycin)erythromycin(エリスロマイシン)・クリンダマイシン耐性は50Sリボソーム50S ribosome50Sリボソーム(50S ribosome)50S ribosome(50Sリボソーム)結合部位の変化による |
| 代謝経路の変更・迂回 | 変異により本来の酵素の働きが変わり、影響を受けた経路を遮断または別経路を利用する | サルファ剤sulfonamidesサルファ剤(sulfonamides)sulfonamides(サルファ剤)・トリメトプリムtrimethoprimトリメトプリム(trimethoprim)trimethoprim(トリメトプリム)耐性は、菌が通常と異なる葉酸合成経路folate synthesis pathway葉酸合成経路(folate synthesis pathway)folate synthesis pathway(葉酸合成経路)を利用することで生じる |
具体的な抗菌薬ごとの耐性機序
| 抗菌薬 | 耐性機序resistance mechanism耐性機序(resistance mechanism)resistance mechanism(耐性機序) |
|---|---|
| βラクタム系 | ①外膜の孔(ポリン)を形成する蛋白の変異により薬剤の透過が減少 ②PBPの修飾(新規PBPの獲得、または既存PBPの組換えによる修飾) ③β-ラクタマーゼの産生(200種類以上が報告されており、ペニシリナーゼpenicillinaseペニシリナーゼ(penicillinase)penicillinase(ペニシリナーゼ)・セファロスポリナーゼ・カルバペネマーゼcarbapenemaseカルバペネマーゼ(carbapenemase)carbapenemase(カルバペネマーゼ)など基質特異性substrate specificity基質特異性(substrate specificity)substrate specificity(基質特異性)の狭いものから、ESBL(extended-spectrum β-lactamases、基質特異性拡張型βラクタマーゼextended-spectrum beta-lactamase (ESBL)基質特異性拡張型βラクタマーゼ(extended-spectrum beta-lactamase (ESBL))extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)(基質特異性拡張型βラクタマーゼ))・class Cβ-ラクタマーゼ・MBL(metallo-β-lactamases、メタロβラクタマーゼmetallo-beta-lactamaseメタロβラクタマーゼ(metallo-beta-lactamase)metallo-beta-lactamase(メタロβラクタマーゼ))など広範な基質を分解するものまで存在する) |
| バンコマイシン(グリコペプチド系Glycopeptidesグリコペプチド系(Glycopeptides)Glycopeptides(グリコペプチド系)) | グラム陰性菌は分子が大きすぎて外膜孔membrane pore膜孔(membrane pore)membrane pore(膜孔)を通過しペプチドグリカン標的に到達できないため内因性耐性intrinsic resistance内因性耐性(intrinsic resistance)intrinsic resistance(内因性耐性)。一部の菌はペプチド末端が本来D-Ala-D-乳酸D-lactateD-乳酸(D-lactate)D-lactate(D-乳酸)/D-Ala-D-セリンであり、バンコマイシンが結合できない(内因性)。外因性(獲得)耐性は、プラスミド上の遺伝子によるペンタペプチド末端の変化で生じ、腸球菌感染の治療価値を大きく損なっている |
| アミノグリコシド系 | ①リボソーム結合部位ribosome binding siteリボソーム結合部位(ribosome binding site)ribosome binding site(リボソーム結合部位)の変異②細胞内取り込みの低下③薬剤の排出増加④ホスホトランスフェラーゼ酵素による薬剤の酵素修飾(アセチル基転移酵素acetyltransferaseアセチル基転移酵素(acetyltransferase)acetyltransferase(アセチル基転移酵素)・アデニル基転移酵素による修飾も同様の原理で働く) |
| テトラサイクリン系 | 耐性遺伝子が細胞からの能動的排出efflux能動的排出(efflux)efflux(能動的排出)を制御する |
| マクロライド系 | ①23SリボソームRNAのメチル化により抗菌薬の結合を妨げる②23S rRNAおよびリボソーム蛋白の変異 |
| クロラムフェニコールchloramphenicolクロラムフェニコール(chloramphenicol)chloramphenicol(クロラムフェニコール) | ①プラスミドにコードされたクロラムフェニコールchloramphenicolクロラムフェニコール(chloramphenicol)chloramphenicol(クロラムフェニコール)アセチル基転移酵素acetyltransferaseアセチル基転移酵素(acetyltransferase)acetyltransferase(アセチル基転移酵素)がクロラムフェニコールchloramphenicolクロラムフェニコール(chloramphenicol)chloramphenicol(クロラムフェニコール)をアセチル化し、50Sサブユニットへの結合を不能にする②染色体変異により外膜ポリン蛋白が変化し、グラム陰性桿菌の透過性が低下する |
| クリンダマイシン | 23S rRNAのメチル化 |
| キノロン系 | ①DNAジャイレースDNA gyraseDNAジャイレース(DNA gyrase)DNA gyrase(DNAジャイレース)・トポイソメラーゼIVtopoisomerase IVトポイソメラーゼIV(topoisomerase IV)topoisomerase IV(トポイソメラーゼIV)の構造遺伝子の染色体変異②膜透過性membrane permeability膜透過性(membrane permeability)membrane permeability(膜透過性)を制御する遺伝子の変異による取り込み低下③排出ポンプefflux pumps排出ポンプ(efflux pumps)efflux pumps(排出ポンプ)の過剰発現overexpression過剰発現(overexpression)overexpression(過剰発現) |
耐性菌の略語
| 略語 | 正式名称 |
|---|---|
| MRSA | Methicillin-resistant S. aureus(メチシリンmethicillinメチシリン(methicillin)methicillin(メチシリン)耐性黄色ブドウ球菌) |
| PRP | Penicillin-resistant Pneumococcus(ペニシリン耐性肺炎球菌) |
| ESBL | Extended-spectrum β-lactamases(基質特異性拡張型βラクタマーゼextended-spectrum beta-lactamase (ESBL)基質特異性拡張型βラクタマーゼ(extended-spectrum beta-lactamase (ESBL))extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)(基質特異性拡張型βラクタマーゼ)) |
| VRE | Vancomycin-resistant Enterococci(バンコマイシン耐性腸球菌vancomycin-resistant Enterococcus, VREバンコマイシン耐性腸球菌(vancomycin-resistant Enterococcus, VRE)vancomycin-resistant Enterococcus, VRE(バンコマイシン耐性腸球菌)) |
| MBL | Metallo-β-lactamases(メタロβラクタマーゼmetallo-beta-lactamaseメタロβラクタマーゼ(metallo-beta-lactamase)metallo-beta-lactamase(メタロβラクタマーゼ)、カルバペネム系carbapenemsカルバペネム系(carbapenems)carbapenems(カルバペネム系)を分解) |
| VRSA | Vancomycin-resistant S. aureus(バンコマイシン耐性vancomycin resistanceバンコマイシン耐性(vancomycin resistance)vancomycin resistance(バンコマイシン耐性)黄色ブドウ球菌) |
| VISA | Vancomycin-intermediate S. aureus(バンコマイシン低感受性黄色ブドウ球菌) |
まとめ
- 耐性は自然現象であり、抗菌薬の使用そのものが選択圧selective pressure選択圧(selective pressure)selective pressure(選択圧)となって耐性株を拡大させる「抗菌薬耐性サイクルantibiotic resistance cycle抗菌薬耐性サイクル(antibiotic resistance cycle)antibiotic resistance cycle(抗菌薬耐性サイクル)」を生む。
- 耐性遺伝子は接合(プラスミド)・形質導入transduction形質導入(transduction)transduction(形質導入)(ファージ)・形質転換(遊離DNA取り込み)という水平伝播horizontal transmission (of genes: horizontal gene transfer)水平伝播(horizontal transmission (of genes: horizontal gene transfer))horizontal transmission (of genes: horizontal gene transfer)(水平伝播)により菌種を超えて拡散し、トランスポゾンtransposonトランスポゾン(transposon)transposon(トランスポゾン)がこれに便乗する。
- 内因性耐性intrinsic resistance内因性耐性(intrinsic resistance)intrinsic resistance(内因性耐性)は標的の不在・細胞壁バリア・輸送系の欠如など、その菌に元から備わった性質による。
- 外因性(獲得)耐性の分子機序molecular mechanism分子機序(molecular mechanism)molecular mechanism(分子機序)は、酵素不活化・透過性低下・排出ポンプefflux pumps排出ポンプ(efflux pumps)efflux pumps(排出ポンプ)・標的変化・代謝経路迂回の5つに整理できる。
- βラクタム系(β-ラクタマーゼ、ESBL、MBL)、バンコマイシン(VRE・VISA・VRSA)、アミノグリコシド系、マクロライド系、キノロン系はそれぞれ固有の耐性機序resistance mechanism耐性機序(resistance mechanism)resistance mechanism(耐性機序)を持ち、MRSA・PRPなどの略語とセットで押さえておくと臨床問題に強くなる。