Biochemistry · 1/5
ヘモグロビンとミオグロビンの構造-機能相関
Structure–function relationships of hemoglobin and myoglobin — L I
🧠 ミオグロビンmyoglobin, Mbミオグロビン(myoglobin, Mb)myoglobin, Mb(ミオグロビン)は「単量体monomer単量体(monomer)monomer(単量体)の酸素貯蔵タンク(双曲線hyperbolic双曲線(hyperbolic)hyperbolic(双曲線))」、ヘモグロビンは「四量体tetramer四量体(tetramer)tetramer(四量体)の酸素運搬oxygen transport酸素運搬(oxygen transport)oxygen transport(酸素運搬)トラック(S字+アロステリーallosteryアロステリー(allostery)allostery(アロステリー))」と対比して読む。 両者ともヘムのFe²⁺でO₂を結合するが、Hbは協同性Cooperativity, Hill協同性(Cooperativity, Hill)Cooperativity, Hill(協同性)と3種のアロステリーallosteryアロステリー(allostery)allostery(アロステリー)(O₂・CO₂/H⁺・BPG)で親和性を可変にし、肺で満載・組織で放出を実現する。
気体の溶解
- 分圧: ある気体が単独で同体積を占めたときの圧力。pₐ = xₐ·P(xₐ=モル分率)。
- Henryの法則: 液中の気体濃度は接する気相の分圧に比例。[A](aq) = αₐ·pₐ。
| 部位 | pO₂ | pCO₂ |
|---|---|---|
| 肺 | 100 mmHg | 40 mmHg |
| 組織 | 40 mmHg | 45 mmHg |
ヘムと酸素結合
酸素はヘム(protoporphyrin IX + Fe²⁺)のFe²⁺に結合する。Fe²⁺の6配位coordinate配位(coordinate)coordinate(配位)のうち、
- 4つは面内in-plane面内(in-plane)in-plane(面内): ポルフィリンporphyrinポルフィリン(porphyrin)porphyrin(ポルフィリン)のピロール窒素pyrrole Nピロール窒素(pyrrole N)pyrrole N(ピロール窒素)。
- 5番目: 近位ヒスチジンproximal histidine近位ヒスチジン(proximal histidine)proximal histidine(近位ヒスチジン)(Fe²⁺を配位coordinate配位(coordinate)coordinate(配位))。
- 6番目: O₂結合部位(遠位ヒスチジンdistal histidine遠位ヒスチジン(distal histidine)distal histidine(遠位ヒスチジン)側)。
⚠️ 遠位ヒスチジンdistal histidine遠位ヒスチジン(distal histidine)distal histidine(遠位ヒスチジン)がCOの毒性を「和らげる」。 COは遊離ヘムfree heme遊離ヘム(free heme)free heme(遊離ヘム)にO₂の25,000倍強く結合するが、遠位Hisの立体障害steric hindrance立体障害(steric hindrance)steric hindrance(立体障害)でMbでは差が200倍まで縮む。それでもCO中毒は致命的になりうる。
ミオグロビン
Mbはαヘリックスに富む球状spherical球状(spherical)spherical(球状)の金属タンパク質で、割れ目にヘムを1個もつ。
- O₂結合曲線は双曲線hyperbolic双曲線(hyperbolic)hyperbolic(双曲線):飽和度 Y = pO₂/(pO₂ + p50)。
- p50 ≈ 3 mmHg(非常に高い親和性)。
- 安静時の筋ではほぼ飽和し、激しい運動や重度の低酸素でのみO₂を放出する。酸素貯蔵に向く。
ヘモグロビン
Hbはヘテロ四量体heterotetramerヘテロ四量体(heterotetramer)heterotetramer(ヘテロ四量体)。サブユニットの組成は生涯で変化する。
| 時期 | 組成 |
|---|---|
| 胚 | ζ₂ε₂ |
| 胎児 | α₂γ₂ |
| 成人 | α₂β₂(α₂δ₂ <4%) |
βサブユニットはMbに似る。四次構造quaternary structure四次構造(quaternary structure)quaternary structure(四次構造)は「αβ二量体の二量体」。
T状態とR状態
flowchart TD
A["脱酸素 deoxy-Hb(T状態=<span class='jp-term jp-term-diagram' title='low affinity'>低親和性</span>)"]
A --> B["O₂結合でFe²⁺がヘム<span class='jp-term jp-term-diagram' title='in-plane'>面内</span>へ移動"]
B --> C["Fe²⁺が近位Hisを引く"]
C --> D["サブユニット間の<span class='jp-term jp-term-diagram' title='salt bridge'>塩橋</span>が切れる<br>α₁β₁が約15°回転"]
D --> E["oxy-Hb(R状態=<span class='jp-term jp-term-diagram' title='high affinity'>高親和性</span>)"]
アロステリー1:ホモトロピック効果(O₂–O₂)
4つのヘムへのO₂結合が独立なら双曲線hyperbolic双曲線(hyperbolic)hyperbolic(双曲線)(Mb様)、完全に同期ならHill式でS字。実際は協同的だが完全同期ではないS字型。
- S字曲線は急峻steep (dose gradient)急峻(steep (dose gradient))steep (dose gradient)(急峻)で、組織でより多くのO₂を放出できる(p50 ≈ 26 mmHg)。
- 分子基盤:誘導適合induced fit誘導適合(induced fit)induced fit(誘導適合)+詳細釣り合いの原理principle of detailed balance詳細釣り合いの原理(principle of detailed balance)principle of detailed balance(詳細釣り合いの原理)。O₂結合はR状態を安定化し、R状態はO₂をより強く結合する。
- 協同性Cooperativity, Hill協同性(Cooperativity, Hill)Cooperativity, Hill(協同性)は誘導適合induced fit誘導適合(induced fit)induced fit(誘導適合)の構造変化conformational change構造変化(conformational change)conformational change(構造変化)がサブユニット界面を越えて伝わることによる。
| モデル | 英語 | 特徴 |
|---|---|---|
| 協奏モデルconcerted model (MWC)協奏モデル(concerted model (MWC))concerted model (MWC)(協奏モデル) | concerted (Monod-Wyman-Changeux, MWC) | 全サブユニットが同期してT⇔R転換。各O₂結合でR/T平衡が同じ倍率で移動 |
| 逐次モデルsequential model (KNF)逐次モデル(sequential model (KNF))sequential model (KNF)(逐次モデル) | sequential (Koshland-Némethy-Filmer, KNF) | 各サブユニットが個別にT→R転換。各O₂結合で次の結合定数が上がる |
⭐ S字型が「肺で満載・組織で放出」を可能にする。 高親和のMb(双曲線hyperbolic双曲線(hyperbolic)hyperbolic(双曲線))は貯蔵向きだが放出できない。Hbは協同性Cooperativity, Hill協同性(Cooperativity, Hill)Cooperativity, Hill(協同性)で急峻steep (dose gradient)急峻(steep (dose gradient))steep (dose gradient)(急峻)なS字を描き、生理条件下で結合O₂の60%以上を組織で放出する。
アロステリー2:ヘテロトロピック効果
代謝が盛んな組織(CO₂↑・H⁺↑=pH↓)で、O₂親和性を下げる。
- CO₂: βサブユニットのN末端に結合しカルバメートcarbamateカルバメート(carbamate)carbamate(カルバメート)(−NH−COO⁻)を形成。負電荷N末端がα鎖alpha chainα鎖(alpha chain)alpha chain(α鎖)と塩橋salt bridge塩橋(salt bridge)salt bridge(塩橋)を作りT状態を安定化。
- H⁺: βサブユニットのHis側鎖に結合し、同じβ鎖beta chainβ鎖(beta chain)beta chain(β鎖)のAsp⁻と塩橋salt bridge塩橋(salt bridge)salt bridge(塩橋)を作りT状態を安定化。
- いずれもO₂結合曲線を右方偏位rightward shift (deviation to the right)右方偏位(rightward shift (deviation to the right))rightward shift (deviation to the right)(右方偏位)させ、組織でのO₂放出を増やす(Bohr効果)。CO₂とH⁺は加算的に働く。
アロステリー3:ヘテロトロピック効果(2,3-BPG)
2,3-ビスホスホグリセリン酸2,3-bisphosphoglycerate (2,3-BPG)2,3-ビスホスホグリセリン酸(2,3-bisphosphoglycerate (2,3-BPG))2,3-bisphosphoglycerate (2,3-BPG)(2,3-ビスホスホグリセリン酸)は、4サブユニットの中央空洞central cavity中央空洞(central cavity)central cavity(中央空洞)(T型)に結合し、βN末端と3つの塩基性側鎖(His143を含む)と塩橋salt bridge塩橋(salt bridge)salt bridge(塩橋)を作りT状態を安定化する。R型では空洞が狭すぎてBPGは押し出される。
⭐ 胎児ヘモグロビンfetal hemoglobin (HbF)胎児ヘモグロビン(fetal hemoglobin (HbF))fetal hemoglobin (HbF)(胎児ヘモグロビン)はBPGへの親和性が低い。 γサブユニットではβ-His143がSerに置換され、HbFはBPGを弱く結合する→O₂親和性が高い→組織pO₂でHbAからO₂を受け取れる。高地では血中BPGが増え、O₂放出が促される。
アロステリー総括
| エフェクター | 効果 |
|---|---|
| O₂ | 正のホモトロピック効果homotropic effectホモトロピック効果(homotropic effect)homotropic effect(ホモトロピック効果)(協同性Cooperativity, Hill協同性(Cooperativity, Hill)Cooperativity, Hill(協同性)) |
| CO₂・H⁺(Bohr)・BPG | 負のヘテロトロピック効果heterotropic effectヘテロトロピック効果(heterotropic effect)heterotropic effect(ヘテロトロピック効果)(T安定化、右方偏位rightward shift (deviation to the right)右方偏位(rightward shift (deviation to the right))rightward shift (deviation to the right)(右方偏位)) |
臨床との関連
- 鎌状赤血球症: β鎖beta chainβ鎖(beta chain)beta chain(β鎖)6位 Glu→Val(一次構造primary structure一次構造(primary structure)primary structure(一次構造)の1置換)。脱酸素時にHbSが重合。
- メトヘモグロビン血症Methemoglobinemiaメトヘモグロビン血症(Methemoglobinemia)Methemoglobinemia(メトヘモグロビン血症): Fe²⁺→Fe³⁺で酸素運搬能oxygen-carrying capacity酸素運搬能(oxygen-carrying capacity)oxygen-carrying capacity(酸素運搬能)低下。
まとめ
- Mbは単量体monomer単量体(monomer)monomer(単量体)・貯蔵・双曲線hyperbolic双曲線(hyperbolic)hyperbolic(双曲線)(p50≈3)、Hbは四量体tetramer四量体(tetramer)tetramer(四量体)・運搬・S字(p50≈26)。
- O₂はヘムのFe²⁺(面内in-plane面内(in-plane)in-plane(面内)4+近位His+O₂の6配位coordinate配位(coordinate)coordinate(配位))に結合。遠位HisがCO毒性を緩和。
- Hbは協同性Cooperativity, Hill協同性(Cooperativity, Hill)Cooperativity, Hill(協同性)でT⇔R転換(O₂結合でFeが面内in-plane面内(in-plane)in-plane(面内)へ→15°回転)。MWC(協奏)とKNF(逐次)モデル。
- Bohr効果:CO₂(βN末端カルバメートcarbamateカルバメート(carbamate)carbamate(カルバメート))・H⁺(βHis-Asp塩橋salt bridge塩橋(salt bridge)salt bridge(塩橋))がT安定化し右方偏位rightward shift (deviation to the right)右方偏位(rightward shift (deviation to the right))rightward shift (deviation to the right)(右方偏位)。
- 2,3-BPGは中央空洞His143中央空洞(His143)His143(中央空洞)でT安定化。HbFはHis143→SerでBPG親和性が低く、O₂親和性が高い。