微生物学 · 3/22
コロナウイルスとフィロウイルス
Corona- and Filoviruses
🧠 この2科は「同じ呼吸器/接触感染contact transmission 接触感染(contact transmission)contact transmission(接触感染) ウイルスでも、局所で終わるか全身に暴走するかは1つの分子スイッチ molecular switch 分子スイッチ(molecular switch) molecular switch(分子スイッチ) で決まる」という対比で読む。 コロナウイルスは通常、深部体温core body temperature 深部体温(core body temperature)core body temperature(深部体温) より数℃低い上気道粘膜に感染が局在し、ただの風邪で終わる——しかしSARS-CoV-2のようにACE2受容体を介して下気道の肺胞細胞まで感染範囲を広げる株が現れると、サイトカインストームcytokine storm サイトカインストーム(cytokine storm)cytokine storm(サイトカインストーム) によるARDS(急性呼吸窮迫症候群acute respiratory distress syndrome, ARDS急性呼吸窮迫症候群(acute respiratory distress syndrome, ARDS)acute respiratory distress syndrome, ARDS(急性呼吸窮迫症候群))にまで暴走する。フィロウイルスFiloviruses フィロウイルス(Filoviruses)Filoviruses(フィロウイルス) はそもそも血管内皮細胞 vascular endothelial cell 血管内皮細胞(vascular endothelial cell) vascular endothelial cell(血管内皮細胞) そのものを標的にするため、最初から全身の出血性ショック hemorrhagic shock 出血性ショック(hemorrhagic shock) hemorrhagic shock(出血性ショック) に直結する——同じ「エンベロープを持つ+/−鎖RNAウイルスの飛沫 respiratory droplets飛沫(respiratory droplets) respiratory droplets(飛沫)・接触感染contact transmission接触感染(contact transmission)contact transmission(接触感染)」でも、どの細胞に感染するかで運命が分かれる好例である。
コロナウイルス
構造・分類
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| ゲノム | 正鎖positive-sense (strand) 正鎖(positive-sense (strand))positive-sense (strand)(正鎖) ssRNA、エンベロープあり、らせん型ヌクレオカプシド nucleocapsidヌクレオカプシド(nucleocapsid) nucleocapsid(ヌクレオカプシド)(ヒトに感染する正鎖 positive-sense (strand) 正鎖(positive-sense (strand)) positive-sense (strand)(正鎖) RNAウイルスの多くは正20面体 icosahedral 正20面体(icosahedral) icosahedral(正20面体) で、コロナウイルス科Coronaviridae コロナウイルス科(Coronaviridae)Coronaviridae(コロナウイルス科) は例外的にらせん対称 helical symmetry らせん対称(helical symmetry) helical symmetry(らせん対称) をとる) |
| エンベロープ蛋白 | スパイクspike スパイク(spike)spike(スパイク) (S)蛋白、膜(M)蛋白、エンベロープ(E)蛋白 |
| 外観の由来 | S蛋白(ヘマグルチニンhemagglutinin (HA) ヘマグルチニン(hemagglutinin (HA))hemagglutinin (HA)(ヘマグルチニン) 様構造)が電子顕微鏡 electron microscopy, EM 電子顕微鏡(electron microscopy, EM) electron microscopy, EM(電子顕微鏡) 下で太陽・王冠(“corona”)のように見えることが名前の由来 |
| リザーバー | 鳥類birds鳥類(birds)birds(鳥類)・コウモリを含む小型哺乳類 mammal哺乳類(mammal) mammal(哺乳類) |
伝播・病原性
- 飛沫感染(咳・くしゃみ)が主——他に直接接触、媒介物fomites媒介物(fomites)fomites(媒介物)、まれに糞口感染
- 多くのコロナウイルスは上気道粘膜(鼻咽頭nasopharynx 鼻咽頭(nasopharynx)nasopharynx(鼻咽頭) の線毛細胞 ciliated cell線毛細胞(ciliated cell) ciliated cell(線毛細胞))に感染が限局する——鼻腔・鼻咽頭nasopharynx 鼻咽頭(nasopharynx)nasopharynx(鼻咽頭) の温度がおおよそ33〜35℃で深部体温 core body temperature 深部体温(core body temperature) core body temperature(深部体温) (約37℃)より数℃低く、この低温環境のほうが増殖に有利だからと説明される
- ⚠️ 33〜35℃は「鼻腔・鼻咽頭nasopharynx 鼻咽頭(nasopharynx)nasopharynx(鼻咽頭) の温度」であって、季節性コロナウイルスseasonal coronavirus 季節性コロナウイルス(seasonal coronavirus)seasonal coronavirus(季節性コロナウイルス) について測定された至適増殖温度 optimal growth temperature 至適増殖温度(optimal growth temperature) optimal growth temperature(至適増殖温度) としてそう決まっているわけではない。 上気道側の33℃前後と深部の37℃を並べて増殖が比較されているのはHCoV-229E・HCoV-NL63であり、HCoV-OC43・HCoV-HKU1の至適増殖温度 optimal growth temperature 至適増殖温度(optimal growth temperature) optimal growth temperature(至適増殖温度) そのものがこの範囲に測定されているのではない
- 感染は主に小児・乳児にみられる(普通感冒common cold 普通感冒(common cold)common cold(普通感冒) として)
- SARS株は下気道など他組織でも増殖可能で、ウイルス血症を介して播種し、より重篤な症状を来す
臨床像
| 疾患 | 特徴 |
|---|---|
| 普通感冒common cold普通感冒(common cold)common cold(普通感冒) | ライノウイルスRhinovirusライノウイルス(Rhinovirus)Rhinovirus(ライノウイルス)に次ぐ第2位の原因とされる。ライノウイルスRhinovirus ライノウイルス(Rhinovirus)Rhinovirus(ライノウイルス) より潜伏期が長い——系統的レビューの統合推定では中央値3.2日(95%CI 2.8〜3.7)に対しライノウイルス Rhinovirus ライノウイルス(Rhinovirus) Rhinovirus(ライノウイルス) は1.9日(95%CI 1.4〜2.4)1。流行は冬〜春(ライノウイルスRhinovirus ライノウイルス(Rhinovirus)Rhinovirus(ライノウイルス) とは逆) |
| 重症急性呼吸器症候群severe acute respiratory syndrome, SARS重症急性呼吸器症候群(severe acute respiratory syndrome, SARS)severe acute respiratory syndrome, SARS(重症急性呼吸器症候群)(SARS-CoV-1) | 急性気管支炎acute bronchitis 急性気管支炎(acute bronchitis)acute bronchitis(急性気管支炎) から急性呼吸窮迫症候群acute respiratory distress syndrome, ARDS急性呼吸窮迫症候群(acute respiratory distress syndrome, ARDS)acute respiratory distress syndrome, ARDS(急性呼吸窮迫症候群)に進展。インフルエンザ様症状flu-like symptoms インフルエンザ様症状(flu-like symptoms)flu-like symptoms(インフルエンザ様症状) (発熱・乾性咳嗽dry cough乾性咳嗽(dry cough)dry cough(乾性咳嗽)・呼吸困難・進行性低酸素血症)。胸部X線で斑状のびまん性間質浸潤影。致死率は最大10% |
| 中東呼吸器症候群Middle East respiratory syndrome, MERS中東呼吸器症候群(Middle East respiratory syndrome, MERS)Middle East respiratory syndrome, MERS(中東呼吸器症候群)(MERS-CoV) | 通称“Camel flu”。SARSの地域流行 endemic (local endemicity) 地域流行(endemic (local endemicity)) endemic (local endemicity)(地域流行) 版(中東・ラクダが関与) |
💡 潜伏期3.2日は「ヒトコロナウイルス」としてまとめられた統合推定である。 呼吸器ウイルスrespiratory virus 呼吸器ウイルス(respiratory virus)respiratory virus(呼吸器ウイルス) 9種を対象に文献436件から38件のデータを統合した系統的レビューの値で、季節性4種のいずれか単独の測定値ではない。SARSコロナウイルスだけは別区分として扱われ、中央値4.0日(95%CI 3.6〜4.4)と推定されている1。
⚠️ 同じ属でも「風邪」と「ARDSに至る重症肺炎 severe pneumonia重症肺炎(severe pneumonia) severe pneumonia(重症肺炎)」が共存する。 感染細胞の違い(上気道限局か、下気道までウイルス血症を介して波及するか)が臨床像を決める最大の分岐点 branch point 分岐点(branch point) branch point(分岐点) である。
SARS-CoV-2(COVID-19の原因ウイルス)
- SARS-CoV-1と遺伝的に近縁だが病原性はより高い
- 受容体はアンジオテンシン変換酵素2angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) アンジオテンシン変換酵素2(angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2))angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2)(アンジオテンシン変換酵素2) (Angiotensin-Converting Enzyme 2, ACE2)——II型肺胞上皮細胞type II alveolar epithelial cell (pneumocyte)II型肺胞上皮細胞(type II alveolar epithelial cell (pneumocyte))type II alveolar epithelial cell (pneumocyte)(II型肺胞上皮細胞)に発現
⚠️ SARS-CoV-2は「変異株variant strain 変異株(variant strain)variant strain(変異株) が既存の免疫をすり抜ける」ことを前提に理解する。 S蛋白の受容体結合ドメイン receptor-binding domain (RBD) 受容体結合ドメイン(receptor-binding domain (RBD)) receptor-binding domain (RBD)(受容体結合ドメイン) に変異が蓄積すると、既感染やワクチンで作られた中和抗体 neutralizing antibodies 中和抗体(neutralizing antibodies) neutralizing antibodies(中和抗体) が結合しにくくなる(免疫逃避 escape逃避(escape) escape(逃避))。2021年11月に同定されたOmicron株では、試験した治療用モノクローナル抗体のすべてが完全または部分的に無効化され、2回接種完了から5か月後の血清はOmicronをほとんど中和できなかった。ブースター接種boost vaccination ブースター接種(boost vaccination)boost vaccination(ブースター接種) で中和応答は回復するが、その抗体価 antibody titer 抗体価(antibody titer) antibody titer(抗体価) はDelta株に対する値より6〜23倍低い2。ワクチンの株更新と追加接種が繰り返されるのはこのためで、「一度打てば終わり」という他のウイルスのワクチンとは前提が違う。
flowchart TD
A["S蛋白がACE2に結合"] --> B["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='conformational change'>構造変化</span>→細胞内へ侵入"]
B --> C["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='uncoating'>脱殻</span>・細胞質内で複製"]
C --> D["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='positive-sense (strand)'>正鎖</span>ゲノムRNAから2本の<br>長鎖<span class='jp-term jp-term-diagram' title='polyprotein'>ポリタンパク質</span>を翻訳"]
D --> E["自己<span class='jp-term jp-term-diagram' title='Proteolytic enzyme'>タンパク質分解酵素</span>で切断<br>→複製・転写関連蛋白遊離"]
E --> F["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='RNA-dependent RNA polymerase'>RNA依存性RNAポリメラーゼ</span>が<br>全長<span class='jp-term jp-term-diagram' title='negative-sense (strand)'>負鎖</span>RNAを合成"]
F --> G["新たな<span class='jp-term jp-term-diagram' title='positive-sense (strand)'>正鎖</span>ゲノムRNA<br>→S・M・E・N蛋白を合成"]
G --> H["S・M・E蛋白は<span class='jp-term jp-term-diagram' title='Golgi apparatus'>ゴルジ体</span>へ、<br>N蛋白は細胞質で<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleocapsid'>ヌクレオカプシド</span>形成"]
H --> I["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='Golgi apparatus'>ゴルジ体</span>から出芽→<span class='jp-term jp-term-diagram' title='exocytosis'>エキソサイトーシス</span>で放出"]
- 臨床像: 無症状例も多い。咳嗽・発熱・上気道症状upper respiratory symptoms上気道症状(upper respiratory symptoms)upper respiratory symptoms(上気道症状)(嗅覚・味覚障害taste disturbance 味覚障害(taste disturbance)taste disturbance(味覚障害) を伴うことがある)。一部でサイトカインストームcytokine stormサイトカインストーム(cytokine storm)cytokine storm(サイトカインストーム)により生命を脅かす肺炎・呼吸困難に進展し、人工呼吸管理mechanical ventilation 人工呼吸管理(mechanical ventilation)mechanical ventilation(人工呼吸管理) を要するARDSに至る
⚠️ 「サイトカインストームcytokine stormサイトカインストーム(cytokine storm)cytokine storm(サイトカインストーム)」という言葉は、COVID-19では実測値と合わない。 重症・重篤COVID-19の25研究1,245例を統合すると血清IL-6の平均は36.7pg/mLにとどまり、本来のサイトカイン放出症候群 cytokine release syndrome (CRS) サイトカイン放出症候群(cytokine release syndrome (CRS)) cytokine release syndrome (CRS)(サイトカイン放出症候群) (3110.5pg/mL)の約100分の1、敗血症(983.6pg/mL)の27分の1、COVID-19以外のARDS(460pg/mL)の12分の1でしかなかった3。重症化に免疫応答が関わることは確かだが、「嵐」と呼べるほどのサイトカイン上昇は起きていない——この語を機序の説明として無批判に使わない。
- 診断:
- 核酸増幅検査nucleic acid amplification test, NAAT核酸増幅検査(nucleic acid amplification test, NAAT)nucleic acid amplification test, NAAT(核酸増幅検査):鼻咽頭 nasopharynx 鼻咽頭(nasopharynx) nasopharynx(鼻咽頭) スワブ swab スワブ(swab) swab(スワブ) でウイルスの遺伝物質 hereditary material 遺伝物質(hereditary material) hereditary material(遺伝物質) を検出。最も一般的なNAATはRT-PCR
- 血清学的検査:既感染を示す血清中抗体を検出
- 予防:ワクチンが中心
| ワクチンの種類Types of vaccinesワクチンの種類(Types of vaccines)Types of vaccines(ワクチンの種類) | 代表例 |
|---|---|
| mRNA(核酸)ワクチン | Pfizer-BioNTech、Moderna |
| ウイルスベクターviral vectors ウイルスベクター(viral vectors)viral vectors(ウイルスベクター) ワクチン | Oxford-AstraZeneca、Janssen、Sputnik |
| 不活化全粒子ワクチンinactivated whole-virion vaccine不活化全粒子ワクチン(inactivated whole-virion vaccine)inactivated whole-virion vaccine(不活化全粒子ワクチン) | Sinopharm、Sinovac、Covaxin、Covivac、Covlran |
| サブユニットワクチンsubunit vaccineサブユニットワクチン(subunit vaccine)subunit vaccine(サブユニットワクチン) | EpiVacCorona |
診断(コロナウイルス全般)
- 血清学:抗体検出 antibody detection抗体検出(antibody detection) antibody detection(抗体検出)
- PCR:確定診断
- 臨床所見clinical signs臨床所見(clinical signs)clinical signs(臨床所見)・画像(胸部X線)・流行地域endemic region 流行地域(endemic region)endemic region(流行地域) への渡航歴
治療
- 特異的治療なし:対症療法のみ
⚠️ COVID-19については「特異的治療なし」はもはや正しくない——ただし「誰に効くか」が重要。 RECOVERY試験(入院患者6,425例)でデキサメタゾンdexamethasoneデキサメタゾン(dexamethasone)dexamethasone(デキサメタゾン)は28日死亡を22.9%対25.7%(年齢調整率age-standardized rate 年齢調整率(age-standardized rate)age-standardized rate(年齢調整率) 比0.83)に減らしたが、その効果は病期で正反対に分かれた——侵襲的人工呼吸invasive mechanical ventilation 侵襲的人工呼吸(invasive mechanical ventilation)invasive mechanical ventilation(侵襲的人工呼吸) 管理下では29.3%対41.4%(率比rate ratio 率比(rate ratio)rate ratio(率比) 0.64)、酸素投与のみでは23.3%対26.2%(率比rate ratio 率比(rate ratio)rate ratio(率比) 0.82)と有益だった一方、呼吸補助を受けていない患者では17.8%対14.0%(率比rate ratio 率比(rate ratio)rate ratio(率比) 1.19)と有益ではなかった4。ウイルス増殖が主体の早期には抗ウイルス薬(レムデシビルremdesivirレムデシビル(remdesivir)remdesivir(レムデシビル)、ニルマトレルビルnirmatrelvirニルマトレルビル(nirmatrelvir)nirmatrelvir(ニルマトレルビル)/リトナビルritonavirリトナビル(ritonavir)ritonavir(リトナビル))、免疫病態が主体の後期にはステロイド・IL-6阻害薬という時期による使い分けが原則になる。なおSARS-CoV-1・MERS-CoVおよび普通感冒 common cold 普通感冒(common cold) common cold(普通感冒) 型のコロナウイルスには、依然として承認された特異的治療薬がない。
フィロウイルス
構造・分類
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| ゲノム | 負鎖ssRNAnegative-sense single-stranded RNA負鎖ssRNA(negative-sense single-stranded RNA)negative-sense single-stranded RNA(負鎖ssRNA)、エンベロープあり、らせん対称helical symmetryらせん対称(helical symmetry)helical symmetry(らせん対称) |
| 形態 | 電子顕微鏡electron microscopy, EM 電子顕微鏡(electron microscopy, EM)electron microscopy, EM(電子顕微鏡) で紐/投げ縄状 |
| 代表種 | Ebola virus、Marburg virus(症状は類似) |
| リザーバー | フルーツコウモリおよび霊長類(サル・類人猿・ヒト)と考えられている |
伝播・病原性
- サル→ヒトの感染に続きヒト→ヒト感染が成立する
- 体液(血液・分泌物)の直接接触が主要経路——医療従事者は特にリスクが高い
- 感染死亡者の遺体の取り扱いには特別な注意が必要(葬儀慣習を介した伝播が容易に起こる)
病原機序Pathogenesis 病原機序(Pathogenesis)Pathogenesis(病原機序) : Ebola virusは糖蛋白を介してNiemann-Pick C1(NPC1)膜蛋白に結合し細胞へ侵入する。
flowchart TD
A["ウイルス糖蛋白がNPC1に結合"] --> B["エンドサイトーシス"]
B --> C["エンベロープと<span class='jp-term jp-term-diagram' title='endosome'>エンドソーム</span>膜が融合"]
C --> D["ウイルス内容物が細胞質へ放出"]
D --> E["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='negative-sense single-stranded RNA'>負鎖ssRNA</span>を鋳型に<br>宿主リボソーム・tRNAでmRNA合成"]
E --> F["ウイルス蛋白の産生・プロセシング"]
F --> G["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='virion'>ビリオン</span>の組み立て・放出"]
臨床像
- ウイルス性出血熱viral hemorrhagic feverウイルス性出血熱(viral hemorrhagic fever)viral hemorrhagic fever(ウイルス性出血熱)の重症型を呈する
- 発熱
- 点状出血疹petechial rash点状出血疹(petechial rash)petechial rash(点状出血疹)
- 出血熱(致死的になりうる)
- 循環血漿量減少plasma volume depletion 循環血漿量減少(plasma volume depletion)plasma volume depletion(循環血漿量減少) 性(出血性)ショックまたは多臓器不全multiple organ failure (MOF)多臓器不全(multiple organ failure (MOF))multiple organ failure (MOF)(多臓器不全)により死に至る
⚠️ フィロウイルスFiloviruses フィロウイルス(Filoviruses)Filoviruses(フィロウイルス) はバイオセーフティレベル4 biosafety level 4 バイオセーフティレベル4(biosafety level 4) biosafety level 4(バイオセーフティレベル4) (BSL-4)の最高度の封じ込めを要する危険病原体。 WHOは、不活化していない検体の検査は最高度の封じ込め条件下で行い、輸送は三重包装 triple packaging system 三重包装(triple packaging system) triple packaging system(三重包装) を用いるとしている5。ウイルス培養viral cultureウイルス培養(viral culture)viral culture(ウイルス培養)・分離はBSL-4施設 biosafety level 4 (BSL-4) facility BSL-4施設(biosafety level 4 (BSL-4) facility) biosafety level 4 (BSL-4) facility(BSL-4施設) に限られる。致死率が高く医療従事者への伝播リスクも大きいため、疑い例suspected case 疑い例(suspected case)suspected case(疑い例) では標準予防策 standard precautions 標準予防策(standard precautions) standard precautions(標準予防策) を超えた厳重な個人防護具 personal protective equipment 個人防護具(personal protective equipment) personal protective equipment(個人防護具) と隔離体制 body plan 体制(body plan) body plan(体制) が必須になる。
診断(フィロウイルス)
- ELISA、PCR
- 不活化していない検体はBSL-4相当の最高度の封じ込め条件で扱う(不活化後の検体を用いたRT-PCRなどは、不活化手順を備えた検査室で行える)
治療・予防(フィロウイルス)
- 治療:対症療法のみ
- 予防:検疫quarantine検疫(quarantine)quarantine(検疫)——感染拡大を防ぐための強制隔離
⚠️ エボラについては「対症療法のみ・ワクチンなし」という記述はすでに古い。 ここは2019年前後に決着がついた領域である。
| 介入 | 内容 | 根拠 |
|---|---|---|
| ワクチン | rVSV-ZEBOV(Ervebo) ——水疱性口内炎 Stomatitis 口内炎(Stomatitis) Stomatitis(口内炎) ウイルスにEbola virus(種名Orthoebolavirus zairense、旧Zaire ebolavirus)の糖蛋白を載せた複製可能な生ワクチン。単回筋注、リング接種ring vaccination リング接種(ring vaccination)ring vaccination(リング接種) で用いる | ギニアのリング接種 ring vaccination リング接種(ring vaccination) ring vaccination(リング接種) クラスター cluster クラスター(cluster) cluster(クラスター) 無作為化試験で、無作為化randomized 無作為化(randomized)randomized(無作為化) 10日以降の発症が全117クラスター cluster クラスター(cluster) cluster(クラスター) の解析で即時接種者0例に対し23例(遅延接種群と未接種者)、有効率100%(95%CI 79.3-100.0)6 |
| 治療用モノクローナル抗体 | REGN-EB3(Inmazeb、3剤混合)とMAb114(Ebanga、単剤) | DRCの681例の無作為化試験(PALM)で28日死亡がMAb114 35.1%対ZMapp 49.7%(P=0.007)、REGN-EB3 33.5%対ZMapp対照群51.3%(P=0.002)といずれもZMappより優れた7 |
⚠️ これはEbola virus(Orthoebolavirus zairense)専用の武器である。 米国の添付文書は、Erveboは他のエボラウイルス ebolavirus エボラウイルス(ebolavirus) ebolavirus(エボラウイルス) 種やマールブルグウイルス Marburg virus マールブルグウイルス(Marburg virus) Marburg virus(マールブルグウイルス) を防がず、Inmazeb/Ebangaは他種への有効性が確立していないと明記し、適応もこの種に限っている8910。Sudan virus・Bundibugyo virus・マールブルグウイルスMarburg virus マールブルグウイルス(Marburg virus)Marburg virus(マールブルグウイルス) のいずれにも承認された製品は無い。2024年9月に始まったルワンダのマールブルグ病流行では、疑い例suspected case 疑い例(suspected case)suspected case(疑い例) 6,340人の検査から66例が確定し、そのうち51例(77%)が医療従事者、致死率は23%だった——治療はレムデシビル remdesivir レムデシビル(remdesivir) remdesivir(レムデシビル) とモノクローナル抗体MBP091を拡大アクセスexpanded access拡大アクセス(expanded access)expanded access(拡大アクセス)下で、ワクチンはChAd3-MARVを臨床試験clinical trial (clinical study)臨床試験(clinical trial (clinical study))clinical trial (clinical study)(臨床試験)として用いるほかなく、承認済みの製品は存在しなかった11。「エボラにはワクチンがある」と一括りにしない。
⚠️ 生存しても終わりではない——エボラは免疫特権部位 immune-privileged site 免疫特権部位(immune-privileged site) immune-privileged site(免疫特権部位) に居座り、数か月後に再燃 relapse再燃(relapse) relapse(再燃)・再伝播しうる。 シエラレオネの生存者 survivor 生存者(survivor) survivor(生存者) 210人の精液では27%がRT-PCR陽性で、退院後3か月以内では7人全員、4〜6か月で62%、7〜9か月で25%、10〜12か月で15%、16〜18か月で4%と徐々に低下し19か月以降は陰性だった12。血中ウイルスが消えた回復者の前房水aqueous humor (anterior chamber)前房水(aqueous humor (anterior chamber))aqueous humor (anterior chamber)(前房水)から発症14週後にウイルスが検出された重症ブドウ膜炎の例13、退院9か月後に髄液から高濃度のウイルスが検出された髄膜脳炎 meningoencephalitis 髄膜脳炎(meningoencephalitis) meningoencephalitis(髄膜脳炎) の再燃 relapse 再燃(relapse) relapse(再燃) 例14もある。生存者survivor 生存者(survivor)survivor(生存者) への長期フォローアップ Follow-up Routines フォローアップ(Follow-up Routines) Follow-up Routines(フォローアップ) と性行為に関する助言が流行終息 resolution 終息(resolution) resolution(終息) 後も必要になる理由がここにある。
まとめ
- コロナウイルスは正鎖 positive-sense (strand) 正鎖(positive-sense (strand)) positive-sense (strand)(正鎖) ssRNAでありながららせん型ヌクレオカプシド nucleocapsid ヌクレオカプシド(nucleocapsid) nucleocapsid(ヌクレオカプシド) を持つ(ヒトに感染する正鎖 positive-sense (strand) 正鎖(positive-sense (strand)) positive-sense (strand)(正鎖) RNAウイルスでは例外的)点が特徴で、通常は上気道限局性の普通感冒 common cold 普通感冒(common cold) common cold(普通感冒) を起こすが、SARS-CoV-1・MERS-CoV・SARS-CoV-2は下気道への播種によりARDSに至りうる。
- SARS-CoV-2はACE2受容体を介してII型肺胞上皮細胞 type II alveolar epithelial cell (pneumocyte) II型肺胞上皮細胞(type II alveolar epithelial cell (pneumocyte)) type II alveolar epithelial cell (pneumocyte)(II型肺胞上皮細胞) に感染し、細胞質内で全ライフサイクルを完結する。診断はRT-PCRを中心とするNAATと血清学、予防はmRNA・ウイルスベクターviral vectorsウイルスベクター(viral vectors)viral vectors(ウイルスベクター)・不活化・サブユニットの4系統のワクチンが実用化されている。
- フィロウイルスFiloviruses フィロウイルス(Filoviruses)Filoviruses(フィロウイルス) (Ebola virus・Marburg virus)はNPC1受容体 NPC1 receptor NPC1受容体(NPC1 receptor) NPC1 receptor(NPC1受容体) を介して細胞侵入 cell entry 細胞侵入(cell entry) cell entry(細胞侵入) し、血管内皮を標的に全身性の出血性ショック hemorrhagic shock出血性ショック(hemorrhagic shock) hemorrhagic shock(出血性ショック)・多臓器不全multiple organ failure (MOF) 多臓器不全(multiple organ failure (MOF))multiple organ failure (MOF)(多臓器不全) に至る最重症の出血熱を起こす。
- フィロウイルスFiloviruses フィロウイルス(Filoviruses)Filoviruses(フィロウイルス) は体液の直接接触(特に遺体・医療現場)で伝播し、BSL-4での検体取り扱いを要する最高度の危険病原体である。
- 「いずれの科も特異的治療薬はなく対症療法のみ」という古い整理はもはや当てはまらない——COVID-19では病期に応じた抗ウイルス薬とデキサメタゾン dexamethasone デキサメタゾン(dexamethasone) dexamethasone(デキサメタゾン) が確立し、Ebola virus(Orthoebolavirus zairense)にはrVSV-ZEBOV(Ervebo)とモノクローナル抗体(Inmazeb・Ebanga)が無作為化試験で有効性を示した。一方でSudan virus・Bundibugyo virus・マールブルグウイルスMarburg virusマールブルグウイルス(Marburg virus)Marburg virus(マールブルグウイルス)、SARS-CoV-1・MERS-CoV、普通感冒common cold 普通感冒(common cold)common cold(普通感冒) 型コロナウイルスには承認された特異的治療薬もワクチンも無く、検疫quarantine 検疫(quarantine)quarantine(検疫) と支持療法が中心のままである。
出典
- 1.Incubation periods of acute respiratory viral infections: a systematic review(The Lancet Infectious Diseases・2009)抄録を Europe PMC で確認した。呼吸器ウイルス9種について文献436件を検討し、うち38件のデータを統合して対数正規分布を当てはめた系統的レビューである。潜伏期の中央値はヒトコロナウイルスで3.2日(95%CI 2.8〜3.7)、ライノウイルスで1.9日(95%CI 1.4〜2.4)、インフルエンザAで1.4日(95%CI 1.3〜1.5)と推定された。⚠️ 統合された区分は「ヒトコロナウイルス」であって季節性4種のいずれか単独の推定値ではない(SARSコロナウイルスのみ別区分で4.0日、95%CI 3.6〜4.4)。全文は未取得で、抄録の範囲にとどまる。閲覧 2026-09-28
- 2.Considerable escape of SARS-CoV-2 Omicron to antibody neutralization(Nature(Planas D, et al.)・2022)2021年11月にボツワナで最初に同定されたOmicron株が、試験した全ての治療用モノクローナル抗体に対して完全または部分的に耐性だったこと、2回接種完了から5か月後のファイザー製・アストラゼネカ製ワクチン接種者の血清がOmicronをほとんど中和できなかったこと、ブースター接種で中和応答が回復するもののその抗体価はDelta株に対する値より6〜23倍低かったこと閲覧 2026-08-26
- 3.Cytokine elevation in severe and critical COVID-19: a rapid systematic review, meta-analysis, and comparison with other inflammatory syndromes(Lancet Respiratory Medicine(Leisman DE, et al.)・2020)重症・重篤COVID-19の25研究1,245例を統合した血清IL-6濃度の平均が36.7pg/mL(95%CI 21.6-62.3)にとどまり、サイトカイン放出症候群(3110.5pg/mL)の約100分の1、敗血症(983.6pg/mL)の27分の1、COVID-19以外のARDS(460pg/mL)の12分の1だったこと(いずれもp<0.0001)、この所見が「サイトカインストーム」という表現とIL-6阻害薬の適用根拠に疑問を投げかけること閲覧 2026-08-26
- 4.Dexamethasone in Hospitalized Patients with Covid-19(New England Journal of Medicine(RECOVERY Collaborative Group)・2021)入院COVID-19患者6,425例の無作為化試験でデキサメタゾン群の28日死亡が22.9%、通常治療群25.7%(年齢調整率比0.83)だったこと、内訳では侵襲的人工呼吸管理下の患者で29.3%対41.4%(率比0.64、95%CI 0.51-0.81)、酸素投与のみの患者で23.3%対26.2%(率比0.82、95%CI 0.72-0.94)と有益だった一方、呼吸補助を受けていない患者では17.8%対14.0%(率比1.19)と有益でなかったこと閲覧 2026-08-26
- 5.Ebola disease (fact sheet)(World Health Organization・2025)WHOのファクトシートで、不活化していない検体の検査は最高度の生物学的封じ込め条件下で行うべきこと、不活化していない生物学的検体の輸送には三重包装を用いることを逐語で確認した。承認されたワクチン・治療薬がEbola virus病に限られ、Sudan virusとBundibugyo virusには候補品が開発中で承認品は無いことも確認した閲覧 2026-10-02
- 6.Efficacy and effectiveness of an rVSV-vectored vaccine in preventing Ebola virus disease: final results from the Guinea ring vaccination, open-label, cluster-randomised trial (Ebola Ça Suffit!)(The Lancet(Henao-Restrepo AM, et al.)・2017)ギニアでのリング接種クラスター無作為化試験の最終結果で、無作為化部分では即時接種に割り付けた51クラスターの接触者・接触者の接触者4,539人のうち3,232人が適格で2,119人が即時接種を受け(遅延接種の47クラスターは4,557人、適格3,096人、21日後に2,041人が接種)、単回筋注のrVSV-ZEBOVについて無作為化10日以降のエボラウイルス病発症が即時接種群で0例だったのに対し遅延接種クラスターの適格者では16例(7クラスター)で、ワクチン有効率が100%(95%CI 68.9-100.0、p=0.0045)だったこと、非無作為化19クラスターを加えた全117クラスターの解析でも即時接種者0例に対し23例(11クラスター)で有効率100%(95%CI 79.3-100.0)だったこと、接種者は全体で5,837人であること、有害事象の87.5%が軽度だったこと閲覧 2026-08-26
- 7.A Randomized, Controlled Trial of Ebola Virus Disease Therapeutics(New England Journal of Medicine(Mulangu S, et al.、PALM Consortium Study Team)・2019)コンゴ民主共和国で681例を対象にZMapp・レムデシビル・MAb114・REGN-EB3を比較した無作為化試験(PALM)で、28日死亡がMAb114群35.1%(61/174)対ZMapp群49.7%(84/169、P=0.007)、REGN-EB3群33.5%(52/155)対ZMapp対照群51.3%(79/154、P=0.002)とMAb114とREGN-EB3がいずれもZMappより優れていたこと、中間解析の結果を受けて以後の割付がこの2群に限定されたこと閲覧 2026-08-26
- 8.ERVEBO (Ebola Zaire Vaccine, Live) injectable suspension, for intramuscular use(DailyMed(U.S. National Library of Medicine)/Merck Sharp & Dohme・2026)米国の電子添付文書で、適応が生後12か月以上のZaire ebolavirusによる疾患の予防であり、使用上の制限として「ERVEBO does not protect against other species of Ebolavirus or Marburgvirus」と明記されていることを確認した閲覧 2026-10-02
- 9.INMAZEB (atoltivimab, maftivimab, and odesivimab-ebgn) injection, for intravenous use(DailyMed(U.S. National Library of Medicine)/Regeneron Pharmaceuticals・2024)米国の電子添付文書(Revised 12/2024)で、適応がOrthoebolavirus zairenseによる感染症の治療であること、Orthoebolavirus属・Orthomarburgvirus属の他の種への有効性は確立していないと使用上の制限に明記されていることを確認した閲覧 2026-10-02
- 10.EBANGA (ansuvimab-zykl) for injection, for intravenous use(DailyMed(U.S. National Library of Medicine)/Emergent BioDefense Operations Lansing・2026)米国の電子添付文書(SPL第4版、2026年8月17日公開)で、適応がOrthoebolavirus zairenseによる感染症の治療であること、「The efficacy of EBANGA has not been established for other species of the Orthoebolavirus and Orthomarburgvirus genera」と他種への有効性が確立していないと明記されていることを確認した閲覧 2026-10-02
- 11.Marburg Virus Disease in Rwanda, 2024 - Public Health and Clinical Responses(New England Journal of Medicine・2025)2024年9月27日にルワンダがマールブルグ病の流行を報告し、疑い例6,340人の検査から66例が検査確定、そのうち51例(77%)が医療従事者だったこと、流行全体の致死率が23%(66例中15死亡)だったこと、レムデシビルとモノクローナル抗体MBP091が拡大アクセス下で、ChAd3-MARVワクチンが臨床試験下で用いられたこと(=承認済みのマールブルグ用ワクチン・治療薬が存在しないこと)閲覧 2026-08-26
- 12.Ebola RNA Persistence in Semen of Ebola Virus Disease Survivors - Final Report(New England Journal of Medicine(Deen GF, et al.)・2017)シエラレオネのエボラ生存者210人の精液検体でRT-PCR陽性が57人(27%)だったこと、退院後3か月以内に採取した7人全員が陽性、4〜6か月で62%(26/42)、7〜9か月で25%(15/60)、10〜12か月で15%(4/26)、13〜15か月で11%(4/38)、16〜18か月で4%(1/25)と時間とともに低下し、19か月以降では陽性者がいなかったこと閲覧 2026-08-26
- 13.Persistence of Ebola Virus in Ocular Fluid during Convalescence(New England Journal of Medicine(Varkey JB, et al.)・2015)エボラウイルス病から回復し血中ウイルスが消失した患者で、急性期発症から14週後に発症した重症片眼性ブドウ膜炎の前房水からエボラウイルスが検出された一方、同時期の結膜・涙液は陰性だったこと——回復後も免疫特権部位にウイルスが残存しうること閲覧 2026-08-26
- 14.Late Ebola virus relapse causing meningoencephalitis: a case report(The Lancet(Jacobs M, et al.)・2016)エボラウイルス病から回復した医療従事者が退院9か月後に髄膜脳炎で再燃し、髄液から高濃度のエボラウイルスが検出された症例報告——中枢神経が持続感染部位となり遅発性の再燃を起こしうること閲覧 2026-08-26