微生物学 · 5/2
腹部感染(腹膜炎・胆嚢炎・胆管炎)を起こす細菌(一覧)とその診断
Bacteria causing abdominal infections (peritonitis, cholecystitis, cholangitis) (list) and their diagnosis
🧠 腹部感染の起因菌は「内因性=自分の腸内フローラ enteric microbiota 腸内フローラ(enteric microbiota) enteric microbiota(腸内フローラ) が漏れ出た結果」であるという一点で理解する。 腹膜炎・胆嚢炎・胆管炎Cholecystitis/cholangitis 胆嚢炎・胆管炎(Cholecystitis/cholangitis)Cholecystitis/cholangitis(胆嚢炎・胆管炎) はいずれも腸管内容物や胆汁が本来無菌の体腔(腹腔・胆道)に流出/逆行することで成立する感染であり、外から新しい菌が侵入するわけではない。そのため起因菌は好気性の腸内細菌科(E. coliなど)と偏性嫌気性菌 obligate anaerobes 偏性嫌気性菌(obligate anaerobes) obligate anaerobes(偏性嫌気性菌) (Bacteroidesなど)の混合感染mixed infection (polymicrobial infection)混合感染(mixed infection (polymicrobial infection))mixed infection (polymicrobial infection)(混合感染)になりやすく、これが悪臭とガス産生という腹腔内膿瘍 intra-abdominal abscess 腹腔内膿瘍(intra-abdominal abscess) intra-abdominal abscess(腹腔内膿瘍) に特徴的な所見を生む。感染経路の違い(穿孔による直接汚染 vs 胆道の逆行性感染 retrograde infection逆行性感染(retrograde infection) retrograde infection(逆行性感染))で主要菌がやや異なる点を押さえる。
混合感染としての性質
- 内因性感染endogenous infection内因性感染(endogenous infection)endogenous infection(内因性感染):腸内フローラ enteric microbiota 腸内フローラ(enteric microbiota) enteric microbiota(腸内フローラ) に由来する
- 混合感染mixed infection (polymicrobial infection)混合感染(mixed infection (polymicrobial infection))mixed infection (polymicrobial infection)(混合感染):好気性・通性嫌気性菌facultative anaerobe 通性嫌気性菌(facultative anaerobe)facultative anaerobe(通性嫌気性菌) と偏性嫌気性菌 obligate anaerobes 偏性嫌気性菌(obligate anaerobes) obligate anaerobes(偏性嫌気性菌) が同時に関与する
- 好気性・通性嫌気性菌facultative anaerobe 通性嫌気性菌(facultative anaerobe)facultative anaerobe(通性嫌気性菌) :E. coliをはじめとする腸内細菌科(上位upper 上位(upper)upper(上位) 分類は2016年に目レベルでEnterobacterales目へ再編された1)
- 偏性嫌気性菌obligate anaerobes 偏性嫌気性菌(obligate anaerobes)obligate anaerobes(偏性嫌気性菌) :Bacteroides、Fusobacterium、Clostridium など
💡 悪臭・ガス産生は嫌気性菌混合感染 mixed infection (polymicrobial infection) 混合感染(mixed infection (polymicrobial infection)) mixed infection (polymicrobial infection)(混合感染) のサイン Signサイン(Sign) Sign(サイン)。 偏性嫌気性菌obligate anaerobes 偏性嫌気性菌(obligate anaerobes)obligate anaerobes(偏性嫌気性菌) の代謝産物 metabolite 代謝産物(metabolite) metabolite(代謝産物) (揮発性volatility 揮発性(volatility)volatility(揮発性) 脂肪酸など)が特有の悪臭を、糖代謝glucose metabolism 糖代謝(glucose metabolism)glucose metabolism(糖代謝) がガス産生を生む。腹腔内膿瘍intra-abdominal abscess 腹腔内膿瘍(intra-abdominal abscess)intra-abdominal abscess(腹腔内膿瘍) でこれらの所見があれば嫌気性菌の関与を強く疑い、経験的治療empiric therapy 経験的治療(empiric therapy)empiric therapy(経験的治療) にも嫌気性菌カバーを含める根拠になる。
腹膜炎
穿孔を契機に発症する——虫垂炎、消化性潰瘍、大腸癌、骨盤内炎症性疾患pelvic inflammatory disease, PID骨盤内炎症性疾患(pelvic inflammatory disease, PID)pelvic inflammatory disease, PID(骨盤内炎症性疾患)など。
| 起因菌 |
|---|
| S. pneumoniae |
| Enterococcus sp.(例:E. faecalis) |
| Clostridium perfringens |
| E. coli |
| Bacteroides fragilis |
⚠️ 表の「Bacteroides fragilis」は今も正しい名だが、同属の他菌種は分子系統解析 molecular phylogenetic analysis 分子系統解析(molecular phylogenetic analysis) molecular phylogenetic analysis(分子系統解析) で再編されている。 腹腔内感染intra-abdominal infection 腹腔内感染(intra-abdominal infection)intra-abdominal infection(腹腔内感染) の嫌気性起因菌として一括りに扱われやすいBacteroides属のうち、B. distasonis・B. goldsteinii・B. merdaeは2006年に新属*Parabacteroidesへ2、腸内で高頻度に検出されるB. vulgatus*・B. doreiなどは2019年の系統ゲノム解析 genome sequencing ゲノム解析(genome sequencing) genome sequencing(ゲノム解析) で*Phocaeicola属へ再分類された3。B. fragilis自体はBacteroides*属の基準種 type species 基準種(type species) type species(基準種) であり名称も臨床的な重要性も変わらない——旧名は検査室レポート・教科書に今も残るため対応づけて覚える。
胆嚢炎・胆管炎
腸管からの逆行性感染retrograde infection逆行性感染(retrograde infection)retrograde infection(逆行性感染)によって成立する。
⚠️ Enterococcus(表のE. faecalis)を経験的にカバーするかどうかは市中発症 community-onset 市中発症(community-onset) community-onset(市中発症) か医療関連かで変わる。 腹腔内感染intra-abdominal infection 腹腔内感染(intra-abdominal infection)intra-abdominal infection(腹腔内感染) における腸球菌の臨床的意義は議論があるが、腸球菌感染が確認された症例、とくに術後の腹腔内感染 intra-abdominal infection 腹腔内感染(intra-abdominal infection) intra-abdominal infection(腹腔内感染) では腸球菌のカバーを常に検討すべきと報告されている4。一方、市中発症community-onset市中発症(community-onset)community-onset(市中発症)・低リスクの感染では腸球菌を全例で経験的にカバーする必要はないとされ、表に挙げたEnterococcusは医療関連・術後・再発例で重みを増す起因菌として読む。
診断
| 疾患 | 検体 |
|---|---|
| 腹膜炎 | 血液培養、腹水(穿刺・洗浄) |
| 胆嚢炎 | 胆嚢からの検体 |
| 胆管炎 | 肝生検liver biopsy肝生検(liver biopsy)liver biopsy(肝生検)、血液培養 |
まとめ
- 腹部感染(腹膜炎・胆嚢炎・胆管炎Cholecystitis/cholangitis胆嚢炎・胆管炎(Cholecystitis/cholangitis)Cholecystitis/cholangitis(胆嚢炎・胆管炎))はいずれも内因性・混合(好気性+嫌気性)感染で、腸内フローラenteric microbiota 腸内フローラ(enteric microbiota)enteric microbiota(腸内フローラ) の漏出/逆行が原因である。
- 腹膜炎は穿孔(虫垂炎・潰瘍・大腸癌・PIDなど)を契機に、S. pneumoniae、Enterococcus、C. perfringens、E. coli、Bacteroides fragilisが主な起因菌となる。
- 胆嚢炎・胆管炎Cholecystitis/cholangitis 胆嚢炎・胆管炎(Cholecystitis/cholangitis)Cholecystitis/cholangitis(胆嚢炎・胆管炎) は腸管からの逆行性感染 retrograde infection 逆行性感染(retrograde infection) retrograde infection(逆行性感染) で、Klebsiella、Proteus、E. faecalis、E. coliが主な起因菌となる。
- 嫌気性菌混合感染 mixed infection (polymicrobial infection) 混合感染(mixed infection (polymicrobial infection)) mixed infection (polymicrobial infection)(混合感染) は悪臭とガス産生を特徴とし、経験的治療empiric therapy 経験的治療(empiric therapy)empiric therapy(経験的治療) で見落とさないことが重要。
- 診断は腹膜炎=血液培養+腹水、胆嚢炎=胆嚢検体、胆管炎=肝生検 liver biopsy 肝生検(liver biopsy) liver biopsy(肝生検) +血液培養で行う。
出典
- 1.Genome-based phylogeny and taxonomy of the 'Enterobacteriales': proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov.(International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology・2016)比較ゲノム解析により、E. coliなど腹部感染の代表的な好気性起因菌が属する腸内細菌科(Enterobacteriaceae)を含む旧「Enterobacteriales」目が2016年に7科からなるEnterobacterales目へ再編されたことを確認した閲覧 2026-08-26
- 2.Reclassification of Bacteroides distasonis, Bacteroides goldsteinii and Bacteroides merdae as Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. nov., Parabacteroides goldsteinii comb. nov. and Parabacteroides merdae comb. nov.(International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology・2006)腹腔内感染の混合嫌気性菌として一括りに扱われがちなBacteroides属の一部(B. distasonis・B. goldsteinii・B. merdae)は16S rRNA解析により2006年に新属Parabacteroidesへ再分類された閲覧 2026-08-26
- 3.Analysis of 1,000 Type-Strain Genomes Improves Taxonomic Classification of Bacteroidetes(Frontiers in Microbiology・2019)1,000株超の基準株ゲノムを用いた系統ゲノム解析により、腸内で高頻度に検出されるBacteroides vulgatus・B. dorei・B. massiliensisなどがPhocaeicola属へ新組み合わせとして移されたことが2019年に示された閲覧 2026-08-26
- 4.WSES/GAIS/SIS-E/WSIS/AAST global clinical pathways for patients with intra-abdominal infections(World Society of Emergency Surgery / World Journal of Emergency Surgery・2021)グラム陽性菌の中で腸球菌属(Enterococcus)が腹腔内感染で重要な役割を果たしうること、腸球菌感染が確認された症例、とくに術後の腹腔内感染では腸球菌のカバーを常に検討すべきであること、グリコペプチド耐性の獲得がこれら菌の治療・制御に深刻な影響を与えていることを確認した閲覧 2026-08-26