生化学 · 8/3
ヌクレオチドの構造と機能;食事由来ヌクレオチドの運命;尿酸の生成・排泄とその代謝的役割;プリン・ピリミジンヌクレオチドの合成と分解;細胞増殖抑制薬のヌクレオチド代謝への影響
Structure and function of nucleotides; fate of dietary nucleotides; formation and elimination of uric acid and its metabolic role; synthesis and degradation of purine and pyrimidine nucleotides; effects of cytostatic drugs on nucleotide metabolism — L II
🧠 プリンヌクレオチドpurine nucleotide プリンヌクレオチド(purine nucleotide)purine nucleotide(プリンヌクレオチド) は「デノボ合成de novo synthesisデノボ合成(de novo synthesis)de novo synthesis(デノボ合成)」と「サルベージsalvage サルベージ(salvage)salvage(サルベージ) (再利用)」の2つの入口で作られ、分解は最終的に尿酸に集約される、と読む。 ピリミジンは逆に、まず塩基骨格を作ってからリボース ribose リボース(ribose) ribose(リボース) を付ける点でプリンと合成順序が違う。デノボ合成de novo synthesis デノボ合成(de novo synthesis)de novo synthesis(デノボ合成) の律速酵素 rate-limiting enzyme 律速酵素(rate-limiting enzyme) rate-limiting enzyme(律速酵素) と、そこを狙う細胞増殖抑制薬 cytostatics 細胞増殖抑制薬(cytostatics) cytostatics(細胞増殖抑制薬) (葉酸拮抗薬antifolate (folate antagonist)葉酸拮抗薬(antifolate (folate antagonist))antifolate (folate antagonist)(葉酸拮抗薬)・代謝拮抗薬Antimetabolites代謝拮抗薬(Antimetabolites)Antimetabolites(代謝拮抗薬))の対応関係が臨床の要。食事性プリン負荷も尿酸値を上げうる。
ヌクレオチドの構造と機能
ヌクレオチドは、含窒素塩基nitrogenous base 含窒素塩基(nitrogenous base)nitrogenous base(含窒素塩基) (プリンまたはピリミジン)+五炭糖 pentose 五炭糖(pentose) pentose(五炭糖) (リボースribose リボース(ribose)ribose(リボース) またはデオキシリボース riboseリボース(ribose) ribose(リボース))+リン酸基 phosphate group リン酸基(phosphate group) phosphate group(リン酸基) からなる。1
| 役割 | 例 |
|---|---|
| 核酸の構成単位 | DNADNA(deoxyribonucleic acid)・RNARNA(ribonucleic acid) |
| エネルギー通貨ATP is the energy currencyエネルギー通貨(ATP is the energy currency)ATP is the energy currency(エネルギー通貨) | ATP、GTP |
| 補酵素coenzyme 補酵素(coenzyme)coenzyme(補酵素) の構成成分 | NAD⁺、FADFAD(flavin adenine dinucleotide)、CoA |
| シグナル分子 | cAMPcAMP(cyclic adenosine monophosphate)、cGMP |
| 糖・脂質代謝lipid metabolism 脂質代謝(lipid metabolism)lipid metabolism(脂質代謝) の活性化中間体 | UDP-グルコースUDP-glucoseUDP-グルコース(UDP-glucose)UDP-glucose(UDP-グルコース)、CDP-ジアシルグリセロール diacylglycerol (DAG)ジアシルグリセロール(diacylglycerol (DAG)) diacylglycerol (DAG)(ジアシルグリセロール) |
食事由来ヌクレオチドの運命
食事中の核酸は消化管でヌクレアーゼ・ホスファターゼ・ヌクレオシダーゼnucleosidase ヌクレオシダーゼ(nucleosidase)nucleosidase(ヌクレオシダーゼ) により分解され、塩基・リボースriboseリボース(ribose)ribose(リボース)・リン酸に分解される。
⭐ 食事中の核酸・ヌクレオチドは消化後に吸収・代謝され、一部は尿酸産生に寄与する。 体内のヌクレオチドプールは主にデノボ合成de novo synthesisデノボ合成(de novo synthesis)de novo synthesis(デノボ合成)と内因性塩基のサルベージ経路salvage pathwayサルベージ経路(salvage pathway)salvage pathway(サルベージ経路)で維持されるが、食事性ヌクレオチドを多く摂ると血清尿酸が一過性に上昇しうる。2
プリンヌクレオチドの合成
デノボ合成
プリン環は、リボース-5-リン酸ribose-5-phosphate リボース-5-リン酸(ribose-5-phosphate)ribose-5-phosphate(リボース-5-リン酸) から出発し、PRPPを土台として、その上に段階的に環を組み立てる(ピリミジン合成pyrimidine synthesis ピリミジン合成(pyrimidine synthesis)pyrimidine synthesis(ピリミジン合成) と違い、塩基を単独で作ってからリボース ribose リボース(ribose) ribose(リボース) に付けるのではなく、リボースribose リボース(ribose)ribose(リボース) の上で環を作る点が特徴)。最初の完成産物はイノシンinosine イノシン(inosine)inosine(イノシン) 酸(IMP)で、ここからAMPとGMPに分岐する。
flowchart TD
R5P["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='ribose-5-phosphate'>リボース-5-リン酸</span>"] -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='phosphoribosyl pyrophosphate'>PRPP</span>合成酵素<br>ATP → AMP"| PRPP["5-ホスホリボシル-1-<span class='jp-term jp-term-diagram' title='pyrophosphate'>ピロリン酸</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='phosphoribosyl pyrophosphate'>PRPP</span>"]
PRPP -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='phosphoribosyl pyrophosphate'>PRPP</span>アミドトランスフェラーゼ<br>グルタミン → グルタミン酸・PPiを放出<br>律速・AMP・GMPで<span class='jp-term jp-term-diagram' title='feedback inhibition'>フィードバック阻害</span>"| PRA["5-<span class='jp-term jp-term-diagram' title='phosphoribosylamine'>ホスホリボシルアミン</span>"]
PRA -->|"続く複数段階の酵素反応<br>グリシン・グルタミン・<span class='jp-term jp-term-diagram' title='aspartate'>アスパラギン酸</span>・CO₂・<span class='jp-term jp-term-diagram' title='formyl group'>ホルミル基</span>(葉酸由来)で環を組み立てる"| IMP["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='inosine'>イノシン</span>酸<br>IMP"]
IMP -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='adenylosuccinate'>アデニロコハク酸</span>合成酵素<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='aspartate'>アスパラギン酸</span>・GTP → GDP"| SAMP["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='adenylosuccinate'>アデニロコハク酸</span>"]
SAMP -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='adenylosuccinate'>アデニロコハク酸</span><span class='jp-term jp-term-diagram' title='lyase'>リアーゼ</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='fumarate'>フマル酸</span>を放出"| AMP["AMP"]
IMP -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='IMP dehydrogenase'>IMP脱水素酵素</span><br>NAD⁺ → NADH"| XMP["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='xanthosine monophosphate (XMP)'>キサントシン一リン酸</span><br>XMP"]
XMP -->|"GMP合成酵素<br>グルタミン・ATP → AMP+PPi"| GMP["GMP"]
| 段階 | 性質 |
|---|---|
| 律速段階rate-limiting step律速段階(rate-limiting step)rate-limiting step(律速段階) | PRPPPRPP(phosphoribosyl pyrophosphate)アミドトランスフェラーゼ。プリンヌクレオチドpurine nucleotide プリンヌクレオチド(purine nucleotide)purine nucleotide(プリンヌクレオチド) (AMP・GMP)によるフィードバック阻害 feedback inhibition フィードバック阻害(feedback inhibition) feedback inhibition(フィードバック阻害) を受ける |
| 最初の完成産物 | IMP(イノシンinosine イノシン(inosine)inosine(イノシン) 酸) |
| IMP→AMP | アスパラギン酸aspartate アスパラギン酸(aspartate)aspartate(アスパラギン酸) が窒素を供与(アデニロコハク酸adenylosuccinate アデニロコハク酸(adenylosuccinate)adenylosuccinate(アデニロコハク酸) を経由、GTPを消費) |
| IMP→GMP | グルタミンが窒素を供与(XMPを経由、ATPを消費) |
💡 AMP合成にはGTP、GMP合成にはATPが必要——これが相互のバランスを取る。 一方のヌクレオチドが豊富だと、そのエネルギーがもう一方の合成に使われるため、AMPとGMPの産生量が自動的に釣り合う仕組みになっている。
サルベージ経路
分解された塩基(プリン塩基purine baseプリン塩基(purine base)purine base(プリン塩基))を、PRPPと直接結合させて再びヌクレオチドに戻す省エネルギー経路。1
flowchart TD
HX["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='hypoxanthine'>ヒポキサンチン</span>"] -->|"HGPRT<br>PRPP → PPi"| IMP["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='inosine'>イノシン</span>酸<br>IMP"]
GUA["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='guanine'>グアニン</span>"] -->|"HGPRT<br>PRPP → PPi"| GMP["GMP"]
ADE["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='adenine'>アデニン</span>"] -->|"APRT<br>PRPP → PPi"| AMP["AMP"]
| 酵素 | 基質 | 欠損したとき |
|---|---|---|
| ヒポキサンチンhypoxanthine ヒポキサンチン(hypoxanthine)hypoxanthine(ヒポキサンチン) -グアニン guanine グアニン(guanine) guanine(グアニン) ホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRTHGPRT, hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase) | ヒポキサンチンhypoxanthineヒポキサンチン(hypoxanthine)hypoxanthine(ヒポキサンチン)・グアニンguanineグアニン(guanine)guanine(グアニン) | 完全欠損でLesch-Nyhan症候群Lesch-Nyhan syndromeLesch-Nyhan症候群(Lesch-Nyhan syndrome)Lesch-Nyhan syndrome(Lesch-Nyhan症候群) |
| アデニンadenine アデニン(adenine)adenine(アデニン) ホスホリボシルトランスフェラーゼ(APRT) | アデニンadenineアデニン(adenine)adenine(アデニン) | — |
⚠️ HGPRT完全欠損はLesch-Nyhan症候群Lesch-Nyhan syndromeLesch-Nyhan症候群(Lesch-Nyhan syndrome)Lesch-Nyhan syndrome(Lesch-Nyhan症候群)。 サルベージ経路salvage pathway サルベージ経路(salvage pathway)salvage pathway(サルベージ経路) が働かないと、使われなかった基質(PRPP)が蓄積してデノボ合成 de novo synthesis デノボ合成(de novo synthesis) de novo synthesis(デノボ合成) が過剰になり、再利用されない塩基は尿酸へ分解される。その結果、高尿酸血症hyperuricemia高尿酸血症(hyperuricemia)hyperuricemia(高尿酸血症)・痛風・自傷行動self-injurious behavior 自傷行動(self-injurious behavior)self-injurious behavior(自傷行動) を伴う神経症状を呈する。
プリンヌクレオチドの分解と尿酸
flowchart TD
AMP["AMP"] -->|"AMP<span class='jp-term jp-term-diagram' title='deaminase'>デアミナーゼ</span><br>NH₃を放出"| IMP["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='inosine'>イノシン</span>酸<br>IMP"]
AMP -->|"5'-<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleotidase'>ヌクレオチダーゼ</span><br>Piを放出"| ADO["アデノシン"]
ADO -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='adenosine deaminase (ADA)'>アデノシンデアミナーゼ</span><br>NH₃を放出"| INO["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='inosine'>イノシン</span>"]
IMP -->|"5'-<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleotidase'>ヌクレオチダーゼ</span><br>Piを放出"| INO
INO -->|"プリン<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleoside'>ヌクレオシド</span><span class='jp-term jp-term-diagram' title='phosphorylase'>ホスホリラーゼ</span><br>Pi → <span class='jp-term jp-term-diagram' title='ribose'>リボース</span>-1-リン酸"| HX["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='hypoxanthine'>ヒポキサンチン</span>"]
GMP["GMP"] -->|"5'-<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleotidase'>ヌクレオチダーゼ</span><br>Piを放出"| GUO["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='guanosine'>グアノシン</span>"]
GUO -->|"プリン<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleoside'>ヌクレオシド</span><span class='jp-term jp-term-diagram' title='phosphorylase'>ホスホリラーゼ</span><br>Pi → <span class='jp-term jp-term-diagram' title='ribose'>リボース</span>-1-リン酸"| GUA["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='guanine'>グアニン</span>"]
GUA -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='guanine'>グアニン</span><span class='jp-term jp-term-diagram' title='deaminase'>デアミナーゼ</span><br>NH₃を放出"| XAN["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='xanthine'>キサンチン</span>"]
HX -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='xanthine oxidase'>キサンチンオキシダーゼ</span><br>O₂ → H₂O₂<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='allopurinol'>アロプリノール</span>で阻害"| XAN
XAN -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='xanthine oxidase'>キサンチンオキシダーゼ</span><br>O₂ → H₂O₂<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='allopurinol'>アロプリノール</span>で阻害"| UA["尿酸"]
UA -.->|"尿酸オキシダーゼ(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='uricase'>ウリカーゼ</span>)<br>ヒトは欠く・多くの<span class='jp-term jp-term-diagram' title='mammal'>哺乳類</span>が持つ"| ALN["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='allantoin'>アラントイン</span>"]
- キサンチンオキシダーゼxanthine oxidaseキサンチンオキシダーゼ(xanthine oxidase)xanthine oxidase(キサンチンオキシダーゼ)がヒポキサンチン hypoxanthine ヒポキサンチン(hypoxanthine) hypoxanthine(ヒポキサンチン) →キサンチン xanthine キサンチン(xanthine) xanthine(キサンチン) →尿酸の両段階を触媒する。
- ヒトは尿酸をさらに分解する尿酸オキシダーゼ(ウリカーゼuricaseウリカーゼ(uricase)uricase(ウリカーゼ))を欠くため、尿酸が最終代謝産物 metabolite 代謝産物(metabolite) metabolite(代謝産物) として排泄される(多くの哺乳類 mammal 哺乳類(mammal) mammal(哺乳類) はウリカーゼ uricase ウリカーゼ(uricase) uricase(ウリカーゼ) でより水溶性の高いアラントイン allantoin アラントイン(allantoin) allantoin(アラントイン) まで分解できる)。1
- アデノシンデアミナーゼadenosine deaminase (ADA) アデノシンデアミナーゼ(adenosine deaminase (ADA))adenosine deaminase (ADA)(アデノシンデアミナーゼ) の欠損では、分解できないアデノシン・デオキシアデノシン由来の代謝物がリンパ球に毒性を示し、重症複合免疫不全症severe combined immunodeficiency重症複合免疫不全症(severe combined immunodeficiency)severe combined immunodeficiency(重症複合免疫不全症)の原因になる。
⚠️ 痛風は尿酸の溶解度の低さに起因する。 尿酸は水に溶けにくく、血中濃度が上昇すると関節腔 joint cavity 関節腔(joint cavity) joint cavity(関節腔) で結晶化 crystallization 結晶化(crystallization) crystallization(結晶化) し、急性炎症性関節炎acute inflammatory arthritis 急性炎症性関節炎(acute inflammatory arthritis)acute inflammatory arthritis(急性炎症性関節炎) (痛風発作gout flare痛風発作(gout flare)gout flare(痛風発作))を起こす。アロプリノールallopurinolアロプリノール(allopurinol)allopurinol(アロプリノール)はキサンチンオキシダーゼ xanthine oxidase キサンチンオキシダーゼ(xanthine oxidase) xanthine oxidase(キサンチンオキシダーゼ) を阻害し尿酸産生を抑える治療薬(キサンチンxanthineキサンチン(xanthine)xanthine(キサンチン)・ヒポキサンチンhypoxanthine ヒポキサンチン(hypoxanthine)hypoxanthine(ヒポキサンチン) はより水溶性が高く排泄されやすい)。米国リウマチ学会American College of Rheumatology 米国リウマチ学会(American College of Rheumatology)American College of Rheumatology(米国リウマチ学会) 2020年ガイドラインは、中等度〜重度のCKDCKD(chronic kidney disease)患者を含め、アロプリノールallopurinol アロプリノール(allopurinol)allopurinol(アロプリノール) を第一選択の尿酸降下薬 urate-lowering drug 尿酸降下薬(urate-lowering drug) urate-lowering drug(尿酸降下薬) とすることを強く推奨している。3
⚠️ アロプリノールallopurinol アロプリノール(allopurinol)allopurinol(アロプリノール) の安全性も同じ代謝経路から説明できる。
- チオプリン系薬との相互作用:6-メルカプトプリン6-merkaptopurine6-メルカプトプリン(6-merkaptopurine)6-merkaptopurine(6-メルカプトプリン)(アザチオプリンazathioprineアザチオプリン(azathioprine)azathioprine(アザチオプリン)の活性体)はキサンチンオキシダーゼ xanthine oxidase キサンチンオキシダーゼ(xanthine oxidase) xanthine oxidase(キサンチンオキシダーゼ) で不活化される。アロプリノールallopurinol アロプリノール(allopurinol)allopurinol(アロプリノール) を併用するとこの不活化が止まり、骨髄抑制などの毒性が強まるため、チオプリン系薬の大幅な減量が必要になる(減量幅は国ごとの添付文書で異なる。詳細はアロプリノールallopurinolアロプリノール(allopurinol)allopurinol(アロプリノール))。
- 重症薬疹severe cutaneous adverse reaction (SCAR)重症薬疹(severe cutaneous adverse reaction (SCAR))severe cutaneous adverse reaction (SCAR)(重症薬疹):HLAHLA(human leukocyte antigen)-B5801 保有者ではアロプリノール allopurinol アロプリノール(allopurinol) allopurinol(アロプリノール) 過敏症症候群 hypersensitivity syndrome (DRESS) 過敏症症候群(hypersensitivity syndrome (DRESS)) hypersensitivity syndrome (DRESS)(過敏症症候群) のリスクが著しく高い。同ガイドラインは、保有率の高い東南アジア系(漢民族・韓国系・タイ系など)とアフリカ系米国人の患者で、開始前の HLA-B5801 検査を条件付きで推奨している(それ以外の集団での一律検査は条件付きで推奨しない)。3
ピリミジンヌクレオチドの合成
プリンと異なり、ピリミジン環は先に完成させてからリボースribose リボース(ribose)ribose(リボース) -リン酸(PRPP)を付加する。
flowchart TD
GLN["グルタミン + HCO₃⁻"] -->|"カルバモイルリン酸合成酵素II(細胞質)<br>2 ATP → 2 ADP<br>律速"| CP["カルバモイルリン酸"]
CP -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='aspartate'>アスパラギン酸</span>カルバモイルトランスフェラーゼ<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='aspartate'>アスパラギン酸</span>が結合し Pi を放出"| CA["カルバモイル<span class='jp-term jp-term-diagram' title='aspartate'>アスパラギン酸</span>"]
CA -->|"ジヒドロオロターゼ<br>H₂O を放出・環を閉じる"| DHO["ジヒドロ<span class='jp-term jp-term-diagram' title='orotate'>オロト酸</span>"]
DHO -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='dihydroorotate dehydrogenase (DHODH)'>ジヒドロオロト酸脱水素酵素</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='inner mitochondrial membrane'>ミトコンドリア内膜</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='ubiquinone (coenzyme Q)'>ユビキノン</span> → ユビキノール"| ORO["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='orotate'>オロト酸</span><br>ピリミジン環の完成"]
ORO -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='orotate'>オロト酸</span>ホスホリボシルトランスフェラーゼ<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='phosphoribosyl pyrophosphate'>PRPP</span> → PPi"| OMP["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='orotidine monophosphate (OMP)'>オロチジン一リン酸</span><br>OMP"]
OMP -->|"OMP<span class='jp-term jp-term-diagram' title='decarboxylase'>脱炭酸酵素</span><br>CO₂を放出"| UMP["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='uridine monophosphate (UMP)'>ウリジン一リン酸</span><br>UMP"]
UMP -->|"キナーゼ<br>ATP → ADP"| UDP["UDP"]
UDP -->|"キナーゼ<br>ATP → ADP"| UTP["UTP"]
UTP -->|"CTP合成酵素<br>グルタミン・ATP<br>アミノ化"| CTP["CTP"]
| 段階 | 性質 |
|---|---|
| 律速段階rate-limiting step律速段階(rate-limiting step)rate-limiting step(律速段階) | カルバモイルリン酸合成酵素II(CPS-II、細胞質、グルタミン依存)。尿素回路urea cycle 尿素回路(urea cycle)urea cycle(尿素回路) のCPS-I(ミトコンドリア、アンモニア依存)とは別酵素(尿素回路urea cycle尿素回路(urea cycle)urea cycle(尿素回路)) |
| 環の完成 | オロト酸orotate オロト酸(orotate)orotate(オロト酸) が生成(ここまでリボース ribose リボース(ribose) ribose(リボース) は付いていない) |
| リボースribose リボース(ribose)ribose(リボース) 付加 | オロト酸orotate オロト酸(orotate)orotate(オロト酸) にPRPPからリボース ribose リボース(ribose) ribose(リボース) -リン酸が付いてOMPになる |
| 脱炭酸decarboxylation脱炭酸(decarboxylation)decarboxylation(脱炭酸) | OMP → UMP(ウリジル酸)。ここから他のピリミジンヌクレオチドが作られる |
💡 尿素回路urea cycle 尿素回路(urea cycle)urea cycle(尿素回路) とピリミジン合成 pyrimidine synthesis ピリミジン合成(pyrimidine synthesis) pyrimidine synthesis(ピリミジン合成) は「カルバモイルリン酸」でつながる。 尿素回路urea cycle 尿素回路(urea cycle)urea cycle(尿素回路) の障害(オルニチントランスカルバミラーゼornithine transcarbamylase (OTC) オルニチントランスカルバミラーゼ(ornithine transcarbamylase (OTC))ornithine transcarbamylase (OTC)(オルニチントランスカルバミラーゼ) 欠損など)でミトコンドリアのカルバモイルリン酸があふれると、細胞質のピリミジン合成 pyrimidine synthesis ピリミジン合成(pyrimidine synthesis) pyrimidine synthesis(ピリミジン合成) へ流れ込んでオロト酸 orotate オロト酸(orotate) orotate(オロト酸) が増え、尿中オロト酸 orotate オロト酸(orotate) orotate(オロト酸) が上昇する(尿素サイクル異常症urea cycle disorder尿素サイクル異常症(urea cycle disorder)urea cycle disorder(尿素サイクル異常症)の鑑別に使われる)。
リボヌクレオチド→デオキシリボヌクレオチド変換とチミジル酸合成
DNA合成にはデオキシリボヌクレオチド deoxyribonucleotide デオキシリボヌクレオチド(deoxyribonucleotide) deoxyribonucleotide(デオキシリボヌクレオチド) が必要。リボヌクレオチド還元酵素ribonucleotide reductaseリボヌクレオチド還元酵素(ribonucleotide reductase)ribonucleotide reductase(リボヌクレオチド還元酵素)がNDP(二リン酸)レベルでリボース ribose リボース(ribose) ribose(リボース) の2’-OHを還元しdNDPを作る。この酵素はデオキシヌクレオチド deoxynucleotide (dNTP) デオキシヌクレオチド(deoxynucleotide (dNTP)) deoxynucleotide (dNTP)(デオキシヌクレオチド) 産物によるアロステリック調節 allosteric regulation アロステリック調節(allosteric regulation) allosteric regulation(アロステリック調節) を受け、DNA合成に必要な4種のdNTPの供給バランスを保つ。
DNAに固有の塩基チミン thymine, T チミン(thymine, T) thymine, T(チミン) は、dUMPのメチル化で作られる。この反応でメチル基 methyl group メチル基(methyl group) methyl group(メチル基) を供与した葉酸はジヒドロ葉酸 dihydrofolate (DHF) ジヒドロ葉酸(dihydrofolate (DHF)) dihydrofolate (DHF)(ジヒドロ葉酸) になり、再びテトラヒドロ葉酸 tetrahydrofolate (THF) テトラヒドロ葉酸(tetrahydrofolate (THF)) tetrahydrofolate (THF)(テトラヒドロ葉酸) に戻さないと次の反応に使えない。
flowchart TD
NDP["リボ<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleoside'>ヌクレオシド</span>二リン酸<br>NDP"] -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='ribonucleotide reductase'>リボヌクレオチド還元酵素</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='reduced form'>還元型</span><span class='jp-term jp-term-diagram' title='thioredoxin'>チオレドキシン</span>(<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (reduced)'>NADPH</span>由来)<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='hydroxyurea'>ヒドロキシウレア</span>の標的"| DNDP["デオキシリボ<span class='jp-term jp-term-diagram' title='nucleoside'>ヌクレオシド</span>二リン酸<br>dNDP"]
DUMP["dUMP"] -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='thymidylate synthase'>チミジル酸合成酵素</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='fluorouracil'>5-フルオロウラシル</span>の標的"| DTMP["dTMP<br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='thymidylate'>チミジル酸</span>"]
MTHF["N⁵,N¹⁰-メチレン<span class='jp-term jp-term-diagram' title='tetrahydrofolate (THF)'>テトラヒドロ葉酸</span>"] -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='thymidylate synthase'>チミジル酸合成酵素</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='methyl group'>メチル基</span>を供与"| DHF["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='dihydrofolate (DHF)'>ジヒドロ葉酸</span>"]
DHF -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='dihydrofolate reductase (DHFR)'>ジヒドロ葉酸還元酵素</span><br><span class='jp-term jp-term-diagram' title='nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (reduced)'>NADPH</span> → NADP⁺<br>メトトレキサートの標的"| THF["<span class='jp-term jp-term-diagram' title='tetrahydrofolate (THF)'>テトラヒドロ葉酸</span>"]
THF -->|"<span class='jp-term jp-term-diagram' title='serine hydroxymethyltransferase (SHMT)'>セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ</span><br>セリン → グリシン"| MTHF
⭐ チミジル酸合成酵素thymidylate synthase チミジル酸合成酵素(thymidylate synthase)thymidylate synthase(チミジル酸合成酵素) 反応はテトラヒドロ葉酸 tetrahydrofolate (THF) テトラヒドロ葉酸(tetrahydrofolate (THF)) tetrahydrofolate (THF)(テトラヒドロ葉酸) を消費する、抗がん剤の主要標的。 dUMP→dTMPの反応でN⁵,N¹⁰-メチレンテトラヒドロ葉酸 tetrahydrofolate (THF) テトラヒドロ葉酸(tetrahydrofolate (THF)) tetrahydrofolate (THF)(テトラヒドロ葉酸) がメチル基 methyl group メチル基(methyl group) methyl group(メチル基) を供与しジヒドロ葉酸 dihydrofolate (DHF) ジヒドロ葉酸(dihydrofolate (DHF)) dihydrofolate (DHF)(ジヒドロ葉酸) になる(葉酸はテトラヒドロ葉酸 tetrahydrofolate (THF) テトラヒドロ葉酸(tetrahydrofolate (THF)) tetrahydrofolate (THF)(テトラヒドロ葉酸) への再還元が必要、葉酸系folate agents 葉酸系(folate agents)folate agents(葉酸系) の1炭素単位 one-carbon unit 炭素単位(one-carbon unit) one-carbon unit(炭素単位) 転移参照)。
細胞増殖抑制薬とヌクレオチド代謝
デノボ合成de novo synthesis デノボ合成(de novo synthesis)de novo synthesis(デノボ合成) 経路の各段階が、がん化学療法薬 chemotherapeutic agent (chemotherapeutic drug) 化学療法薬(chemotherapeutic agent (chemotherapeutic drug)) chemotherapeutic agent (chemotherapeutic drug)(化学療法薬) の標的になる(作用点target 作用点(target)target(作用点) は上の各反応図のラベルに示した)。
| 薬剤 | 標的 | 機序 |
|---|---|---|
| メトトレキサート | ジヒドロ葉酸還元酵素dihydrofolate reductase (DHFR)ジヒドロ葉酸還元酵素(dihydrofolate reductase (DHFR))dihydrofolate reductase (DHFR)(ジヒドロ葉酸還元酵素) | 葉酸の再還元(ジヒドロ葉酸dihydrofolate (DHF) ジヒドロ葉酸(dihydrofolate (DHF))dihydrofolate (DHF)(ジヒドロ葉酸) →テトラヒドロ葉酸 tetrahydrofolate (THF)テトラヒドロ葉酸(tetrahydrofolate (THF)) tetrahydrofolate (THF)(テトラヒドロ葉酸))を阻害 → チミジル酸thymidylateチミジル酸(thymidylate)thymidylate(チミジル酸)・プリン合成purine synthesis プリン合成(purine synthesis)purine synthesis(プリン合成) が停止 |
| 5-フルオロウラシルfluorouracil5-フルオロウラシル(fluorouracil)fluorouracil(5-フルオロウラシル)(5-FU) | チミジル酸合成酵素thymidylate synthaseチミジル酸合成酵素(thymidylate synthase)thymidylate synthase(チミジル酸合成酵素) | 代謝拮抗薬Antimetabolites代謝拮抗薬(Antimetabolites)Antimetabolites(代謝拮抗薬)。細胞内でFdUMPFdUMP(FdUMP (fluorodeoxyuridine monophosphate))に変換されてdUMPの代わりに酵素へ結合し、N⁵,N¹⁰-メチレンテトラヒドロ葉酸 tetrahydrofolate (THF) テトラヒドロ葉酸(tetrahydrofolate (THF)) tetrahydrofolate (THF)(テトラヒドロ葉酸) とともに共有結合複合体を作って不可逆的に阻害 → dTMP合成阻害 |
| 6-メルカプトプリン6-merkaptopurine6-メルカプトプリン(6-merkaptopurine)6-merkaptopurine(6-メルカプトプリン)、アザチオプリンazathioprineアザチオプリン(azathioprine)azathioprine(アザチオプリン) | プリンのデノボ合成 de novo synthesisデノボ合成(de novo synthesis) de novo synthesis(デノボ合成)・サルベージ経路salvage pathwayサルベージ経路(salvage pathway)salvage pathway(サルベージ経路) | プリン代謝拮抗薬purine analogs プリン代謝拮抗薬(purine analogs)purine analogs(プリン代謝拮抗薬) (アザチオプリンazathioprine アザチオプリン(azathioprine)azathioprine(アザチオプリン) は6-メルカプトプリン 6-merkaptopurine 6-メルカプトプリン(6-merkaptopurine) 6-merkaptopurine(6-メルカプトプリン) の前駆体)。HGPRTでヌクレオチド型に活性化され、IMP脱水素酵素IMP dehydrogenase IMP脱水素酵素(IMP dehydrogenase)IMP dehydrogenase(IMP脱水素酵素) などを阻害 |
| ヒドロキシウレアhydroxyureaヒドロキシウレア(hydroxyurea)hydroxyurea(ヒドロキシウレア) | リボヌクレオチド還元酵素ribonucleotide reductaseリボヌクレオチド還元酵素(ribonucleotide reductase)ribonucleotide reductase(リボヌクレオチド還元酵素) | dNTP産生を阻害しDNA合成を止める |
💡 これらの薬はすべて「急速に分裂する細胞(腫瘍・骨髄・粘膜)」を狙う。 ヌクレオチド合成阻害はDNA複製を必要とする細胞に選択的に影響するため、抗がん剤としての効果と同時に、骨髄抑制・粘膜炎mucositis 粘膜炎(mucositis)mucositis(粘膜炎) などの副作用(正常な急速増殖細胞への影響)も説明できる。
まとめ
- ヌクレオチドは核酸・エネルギー通貨ATP is the energy currencyエネルギー通貨(ATP is the energy currency)ATP is the energy currency(エネルギー通貨)・補酵素coenzyme補酵素(coenzyme)coenzyme(補酵素)・活性化中間体として多機能。食事性プリン負荷も尿酸産生に寄与しうる。
- プリンはPRPP上でデノボ合成 de novo synthesis デノボ合成(de novo synthesis) de novo synthesis(デノボ合成) (律速:PRPPアミドトランスフェラーゼ)されIMP→AMP/GMPに分岐。サルベージ経路salvage pathway サルベージ経路(salvage pathway)salvage pathway(サルベージ経路) (HGPRT・APRT)は省エネ的再利用で、HGPRT欠損はLesch-Nyhan症候群 Lesch-Nyhan syndromeLesch-Nyhan症候群(Lesch-Nyhan syndrome) Lesch-Nyhan syndrome(Lesch-Nyhan症候群)。
- プリン分解purine degradation プリン分解(purine degradation)purine degradation(プリン分解) はヒポキサンチン hypoxanthineヒポキサンチン(hypoxanthine) hypoxanthine(ヒポキサンチン)/グアニンguanine グアニン(guanine)guanine(グアニン) →キサンチン xanthine キサンチン(xanthine) xanthine(キサンチン) →尿酸(キサンチンオキシダーゼxanthine oxidaseキサンチンオキシダーゼ(xanthine oxidase)xanthine oxidase(キサンチンオキシダーゼ))。ヒトはウリカーゼ uricase ウリカーゼ(uricase) uricase(ウリカーゼ) を欠くため尿酸が最終産物、痛風・アロプリノールallopurinol アロプリノール(allopurinol)allopurinol(アロプリノール) の理解の鍵。アロプリノールallopurinol アロプリノール(allopurinol)allopurinol(アロプリノール) はチオプリン系薬の不活化も止めるため併用時は大幅減量が要る。
- ピリミジンは環を先に作ってからリボース ribose リボース(ribose) ribose(リボース) を付加(CPS-II律速)。dTMP合成は葉酸依存で抗がん剤の標的。
- リボヌクレオチド還元酵素ribonucleotide reductase リボヌクレオチド還元酵素(ribonucleotide reductase)ribonucleotide reductase(リボヌクレオチド還元酵素) がdNTPを供給し、DNA合成に必要な塩基バランスを保つ。
- 細胞増殖抑制薬cytostatics 細胞増殖抑制薬(cytostatics)cytostatics(細胞増殖抑制薬) (メトトレキサート・5-FU5-FU(5-fluorouracil)・6-メルカプトプリン6-merkaptopurine6-メルカプトプリン(6-merkaptopurine)6-merkaptopurine(6-メルカプトプリン)・ヒドロキシウレアhydroxyureaヒドロキシウレア(hydroxyurea)hydroxyurea(ヒドロキシウレア))はヌクレオチド合成の各段階を狙い、急速増殖細胞を選択的に障害する。
出典
- 1.From purines to purinergic signalling: molecular functions and human diseases(Signal Transduction and Targeted Therapy・2021)プリンヌクレオチドのデノボ合成・サルベージ・分解と、ヒトで尿酸が最終産物となる代謝経路閲覧 2026-08-20
- 2.A high dietary nucleotide intake for 2 weeks increases uric acid and markers of immune response in young adults: A randomised controlled trial(Clinical Nutrition ESPEN・2022)食事性ヌクレオチド負荷が血清尿酸を上昇させうること閲覧 2026-08-20
- 3.2020 American College of Rheumatology Guideline for the Management of Gout(American College of Rheumatology・2020)Consensus の抄録と全文抜粋で確認。アロプリノールを中等度〜重度のCKD患者を含めて第一選択の尿酸降下薬とすることは強い推奨。アロプリノール開始前のHLA-B*5801検査は東南アジア系(漢民族・韓国系・タイ系など)とアフリカ系米国人の患者で条件付き推奨、その他の集団での一律検査は条件付きで推奨されない。HLA-B*5801はアロプリノール過敏症症候群のリスクを著しく高める閲覧 2026-09-27