微生物学 · 5/26
性器の常在菌叢。性感染症の病原体（一覧）
Normal flora of the genital tract. Pathogens of sexually transmitted diseases (list)
🧠 性器の常在菌叢normal flora of the genital tract 性器の常在菌叢（normal flora of the genital tract）normal flora of the genital tract（性器の常在菌叢） は「乳酸菌lactic acid bacteria 乳酸菌（lactic acid bacteria）lactic acid bacteria（乳酸菌） が支配する酸性環境」という一言で理解できる。 Lactobacillus属が糖をグリコーゲンから乳酸に分解して腟内pHを酸性（約3.8〜4.5）に保つことで、病原菌の定着を防ぐバリアとして働く。性感染症の起因体Pathogens of sexually transmitted diseases 性感染症の起因体（Pathogens of sexually transmitted diseases）Pathogens of sexually transmitted diseases（性感染症の起因体） は、このバリアを回避・突破して定着する外来病原体という位置づけで対比的に読む。
性器の常在菌叢
主に好気性菌 aerobic bacteria 好気性菌（aerobic bacteria） aerobic bacteria（好気性菌） からなる。
| 菌 | 特記事項 |
|---|---|
| Lactobacillus属 | 最も重要な常在菌——乳酸産生により腟内を酸性に保ち病原菌の定着を防ぐと考えられている1 |
| Streptococcus agalactiae（B群レンサ球菌） | 常在菌だが妊娠中の保菌は新生児感染 congenital infections 新生児感染（congenital infections） congenital infections（新生児感染） のリスクとなる（5/24参照） |
| viridans streptococci（口腔レンサ球菌viridans streptococci 口腔レンサ球菌（viridans streptococci）viridans streptococci（口腔レンサ球菌） 群） | 常在菌の一部として検出される |
| ブドウ球菌属Staphylococcusブドウ球菌属（Staphylococcus）Staphylococcus（ブドウ球菌属）、Bifidobacterium属、Clostridium属 | 常在菌叢の構成菌 |
| Staphylococcus saprophyticus | 常在菌だが性活動期 active phase 活動期（active phase） active phase（活動期） の若年女性の急性膀胱炎 acute cystitis 急性膀胱炎（acute cystitis） acute cystitis（急性膀胱炎） の主因にもなる |
性感染症の起因体
| 分類 | 病原体 | 疾患 |
|---|---|---|
| 細菌 | Chlamydia trachomatis | 非淋菌性尿道炎nongonococcal urethritis, NGU非淋菌性尿道炎（nongonococcal urethritis, NGU）nongonococcal urethritis, NGU（非淋菌性尿道炎）・骨盤内炎症性疾患pelvic inflammatory disease, PID骨盤内炎症性疾患（pelvic inflammatory disease, PID）pelvic inflammatory disease, PID（骨盤内炎症性疾患） |
| 細菌 | Treponema pallidum | 梅毒 |
| 細菌 | Haemophilus ducreyi | 軟性下疳chancroid軟性下疳（chancroid）chancroid（軟性下疳） |
| 細菌 | Neisseria gonorrhoeae | 淋病gonorrhea淋病（gonorrhea）gonorrhea（淋病）2 |
| 細菌 | Mycoplasma属、Ureaplasma urealyticum | 非淋菌性尿道炎nongonococcal urethritis, NGU非淋菌性尿道炎（nongonococcal urethritis, NGU）nongonococcal urethritis, NGU（非淋菌性尿道炎） |
| 寄生虫 | Trichomonas vaginalis | 腟トリコモナス症 trichomoniasisトリコモナス症（trichomoniasis） trichomoniasis（トリコモナス症） |
| ウイルス | HSV-1/2（単純ヘルペスウイルスherpes simplex virus, HSV単純ヘルペスウイルス（herpes simplex virus, HSV）herpes simplex virus, HSV（単純ヘルペスウイルス）, herpes simplex virus） | 性器ヘルペスgenital herpes性器ヘルペス（genital herpes）genital herpes（性器ヘルペス） |
| ウイルス | CMV（サイトメガロウイルスcytomegalovirus, CMVサイトメガロウイルス（cytomegalovirus, CMV）cytomegalovirus, CMV（サイトメガロウイルス）, cytomegalovirus） | 性行為感染も一経路 |
| ウイルス | HPV（ヒトパピローマウイルス, human papillomavirus） | 尖圭コンジローマcondyloma acuminatum尖圭コンジローマ（condyloma acuminatum）condyloma acuminatum（尖圭コンジローマ）、子宮頸癌cervical cancer子宮頸癌（cervical cancer）cervical cancer（子宮頸癌） |
| ウイルス | HIV（ヒト免疫不全ウイルスhuman immunodeficiency virus, HIVヒト免疫不全ウイルス（human immunodeficiency virus, HIV）human immunodeficiency virus, HIV（ヒト免疫不全ウイルス）, human immunodeficiency virus） | 後天性免疫不全症候群acquired immunodeficiency syndrome, AIDS後天性免疫不全症候群（acquired immunodeficiency syndrome, AIDS）acquired immunodeficiency syndrome, AIDS（後天性免疫不全症候群） |
| ウイルス | HBV（B型肝炎ウイルス, hepatitis B virus）、HCV（C型肝炎ウイルスhepatitis C virus (HCV)C型肝炎ウイルス（hepatitis C virus (HCV)）hepatitis C virus (HCV)（C型肝炎ウイルス）, hepatitis C virus） | ウイルス性肝炎viral hepatitisウイルス性肝炎（viral hepatitis）viral hepatitis（ウイルス性肝炎） |
細菌性STDの診断・治療
| 病原体 | 検体 | 診断法 | 治療 |
|---|---|---|---|
| 梅毒トレポネーマTreponema pallidum梅毒トレポネーマ（Treponema pallidum）Treponema pallidum（梅毒トレポネーマ） | 一次下疳の滲出液、血清 | 暗視野顕微鏡dark-field microscopy 暗視野顕微鏡（dark-field microscopy）dark-field microscopy（暗視野顕微鏡） （滲出液）／血清学：IgM・IgG＋ウエスタンブロット Western blot (WB) ウエスタンブロット（Western blot (WB)） Western blot (WB)（ウエスタンブロット） 確認。非特異検査nonspecific test非特異検査（nonspecific test）nonspecific test（非特異検査）（RPR＝rapid plasma reagin、VDRL＝venereal disease research laboratory、Wasserman反応）はスクリーニング用（早期・晩期に偽陰性がありうる、定量法で治療効果・再感染reinfection 再感染（reinfection）reinfection（再感染） をモニター）／特異検査specific test特異検査（specific test）specific test（特異検査）（TPHA＝Treponema pallidum hemagglutination assay、TPI＝Treponema pallidum immobilization test、FTA-ABS＝fluorescent treponemal antibody-absorption test）は定性のみ。神経梅毒neurosyphilis 神経梅毒（neurosyphilis）neurosyphilis（神経梅毒） では髄液からのPCR（polymerase chain reaction）も可 | ペニシリン筋注、数日間 |
| 淋菌 | 性器分泌物 | 固定塗抹＋グラム染色、Thayer-Martin培地での培養＋薬剤感受性試験 antimicrobial susceptibility testing薬剤感受性試験（antimicrobial susceptibility testing） antimicrobial susceptibility testing（薬剤感受性試験）、PCR | セフトリアキソン単剤・高用量筋注（米国CDC 2020年改訂：500 mg単回、体重150 kg以上は1 g）——アジスロマイシン併用は薬剤圧 antimicrobial pressure 薬剤圧（antimicrobial pressure） antimicrobial pressure（薬剤圧） と耐性拡大への懸念から推奨から外れた2 |
| Mycoplasma、Ureaplasma | 性器由来の細胞 | 液体培地での培養＋薬剤感受性試験 antimicrobial susceptibility testing薬剤感受性試験（antimicrobial susceptibility testing） antimicrobial susceptibility testing（薬剤感受性試験）、PCR | ドキシサイクリン、アジスロマイシン——M. genitaliumは培養が事実上不可能でNAATが唯一実用的な診断法であり、マクロライド耐性変異macrolide resistance mutation マクロライド耐性変異（macrolide resistance mutation）macrolide resistance mutation（マクロライド耐性変異） （23S rRNA）を同時に調べて薬剤を選ぶ耐性ガイド治療 resistance-guided therapy 耐性ガイド治療（resistance-guided therapy） resistance-guided therapy（耐性ガイド治療） が推奨される3 |
| Chlamydia trachomatis | 性器由来の検体 | PCR（培養は組織培養が必要で煩雑） | ドキシサイクリン、アジスロマイシン |
⭐ 梅毒血清診断 serodiagnosis 血清診断（serodiagnosis） serodiagnosis（血清診断） は「非特異＝スクリーニング・定量」「特異＝確認・定性のみ」の二段構えで理解する。 RPR/VDRLは安価で治療効果のモニターに向くが偽陽性・偽陰性がありうるため、TPHA/FTA-ABSのような特異検査 specific test 特異検査（specific test） specific test（特異検査） で確定する——詳細な機序は2/29を参照。
⚠️ この「非特異→特異」の順序は「従来アルゴリズム」であって、唯一の方法ではない。 自動化されたトレポネーマ免疫測定法 immunoassay 免疫測定法（immunoassay） immunoassay（免疫測定法） を先に行いRPRで確認する逆順アルゴリズムreverse sequence algorithm逆順アルゴリズム（reverse sequence algorithm）reverse sequence algorithm（逆順アルゴリズム）が、大規模genome mutation 大規模（genome mutation）genome mutation（大規模） 検査室・血液センターを中心に広まりつつある——2015年の米国調査でも従来法が多数派だが逆順法が15.9%を占めた4。
💡 HPVは唯一「発癌性carcinogenicity発癌性（carcinogenicity）carcinogenicity（発癌性）」を持つSTD起因体としてこのリストの中で特別な位置を占める。 高リスク型high-risk HPV 高リスク型（high-risk HPV）high-risk HPV（高リスク型） HPVの持続感染 persistent infection 持続感染（persistent infection） persistent infection（持続感染） はE6/E7蛋白E7 protein E7蛋白（E7 protein）E7 protein（E7蛋白） によるp53・Rb不活化を介して子宮頸癌 cervical cancer 子宮頸癌（cervical cancer） cervical cancer（子宮頸癌） へ進展しうる——詳細は3/18参照。
まとめ
- 性器の常在菌叢normal flora of the genital tract 性器の常在菌叢（normal flora of the genital tract）normal flora of the genital tract（性器の常在菌叢） はLactobacillus属を主体とする酸性環境がバリアとして機能し、S. agalactiae・viridans streptococci・S. saprophyticusなどが構成菌となる。
- 性感染症の起因体Pathogens of sexually transmitted diseases 性感染症の起因体（Pathogens of sexually transmitted diseases）Pathogens of sexually transmitted diseases（性感染症の起因体） は細菌（Chlamydia trachomatis、Treponema pallidum、Haemophilus ducreyi、Neisseria gonorrhoeae、Mycoplasma/Ureaplasma）、寄生虫、ウイルス（HSV、CMV、HPV、HIV、HBV/HCV）に大別される。
- 梅毒の血清診断 serodiagnosis 血清診断（serodiagnosis） serodiagnosis（血清診断） は非特異検査 nonspecific test 非特異検査（nonspecific test） nonspecific test（非特異検査） （RPR/VDRL、スクリーニング・定量）と特異検査 specific test 特異検査（specific test） specific test（特異検査） （TPHA/FTA-ABS、確認・定性）の二段構えで行う。
- 淋菌はThayer-Martin培地での培養、クラミジア・マイコプラズマMycoplasmaマイコプラズマ（Mycoplasma）Mycoplasma（マイコプラズマ）・ウレアプラズマUreaplasma ウレアプラズマ（Ureaplasma）Ureaplasma（ウレアプラズマ） はPCRが診断の主体となる。
- HPVは子宮頸癌 cervical cancer 子宮頸癌（cervical cancer） cervical cancer（子宮頸癌） の原因として、他のSTD起因体と異なり発癌性 carcinogenicity 発癌性（carcinogenicity） carcinogenicity（発癌性） を持つ点が特徴的。
出典
- 1.Vaginal microbiome of reproductive-age women（Proceedings of the National Academy of Sciences・2011）Europe PMC の抄録と PMC の全文（PMC3063603）の緒言で確認した。無症状の北米女性396人の腟細菌叢は5群に分かれ、4群はLactobacillus iners・crispatus・gasseri・jenseniiのいずれかが優占し、乳酸菌の少ない第5群も含めて乳酸の産生という機能は全群で保たれていたこと。緒言は腟の乳酸菌が「lowering the environmental pH through lactic acid production」、殺菌・静菌物質の産生、競合的排除によって細菌性腟症・カンジダ症・性感染症・尿路感染症・HIV感染から守る役割を担うと考えられているとしていること。腟pHの平均は白人4.2±0.3、アジア人4.4±0.59、黒人4.7±1.04、ヒスパニック5.0±0.59であったこと。閲覧 2026-09-27
- 2.Update to CDC's Treatment Guidelines for Gonococcal Infection, 2020（Centers for Disease Control and Prevention (CDC) / MMWR・2020）淋菌感染の単回治療はセフトリアキソン500 mg（体重150 kg以上は1 g）単回筋注で、アジスロマイシン併用は薬剤圧・耐性拡大への懸念から推奨から外れたこと、クラミジア未除外時はドキシサイクリン7日間を追加することを確認した閲覧 2026-08-26
- 3.2021 European guideline on the management of Mycoplasma genitalium infections（2022）Mycoplasma genitalium は非淋菌性尿道炎・子宮頸管炎・骨盤内炎症性疾患の起因菌として確立しており、診断は核酸増幅検査で行い、同時にマクロライド耐性変異（23S rRNA）を検査して薬剤を選ぶ耐性ガイド治療を行うことを確認した閲覧 2026-08-26
- 4.CDC Laboratory Recommendations for Syphilis Testing, United States, 2024（Centers for Disease Control and Prevention（MMWR Recommendations and Reports）・2024）梅毒血清検査は非トレポネーマ検査で開始しトレポネーマ検査で確認する従来アルゴリズムに加え、自動化されたトレポネーマ免疫測定法を先に行いRPRで確認する逆順アルゴリズム（reverse sequence algorithm）が普及しつつあることを確認した閲覧 2026-08-26