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  1. 2026 08.22

    分子細胞生物学(topics/mcb)の全80ノートを、Consensusの指摘文書なしで自己点検した。これまでのバッチと違い外部からの指摘リストが無いため、「読んで違和感があるか」ではなく『教科書が古びやすい類型』を先に列挙してから一次資料に当たる、という順序を強制した。類型は6つ——①カウント系の数値、②「〜のみ/常に」型の断定、③分類・命名の枠組み、④手法の位置づけ、⑤臨床応用の現況、⑥ノート内部の矛盾。⑥は外部知識が要らないため全80件で必須にした。80ノートすべてが着手前は `sources` 0件で、2〜19件(計366件)を新設した。検出できた誤りは大きく3種類ある。第一に**単純だが影響の大きい事実誤認**——アンピシリンが「翻訳装置を破壊する」(β-ラクタムなので細胞壁合成阻害)、メンケス症候群が「銅の食事性欠乏による代謝性疾患」(X連鎖劣性のATP7A変異)、ボルチモア分類が6群(正しくは7群でグループVII=dsDNA-RTが欠落)、ONPGが「オルト-ニトロフェニル-β-ガラクトシダーゼ」(酵素ではなく配糖体)など。第二に**古い定説のまま止まっていたもの**——Pol δ/ε の鎖分担(2007〜2008年にε=リーディング、δ=ラギングで決着済み)、テロメラーゼ活性化の機序(脱メチル化ではなくTERTプロモーター変異とTHOR領域の高メチル化)、CpGアイランドのメチル化状態(向きが逆)、遺伝子治療の「実験的技術である」(FDA承認20品目超、Casgevyが世界初のCRISPR承認薬)など。第三に**ノート内部およびノート間の矛盾**で、これが最も多く、外部知識なしで検出できた——58の「老化の9つの特徴」の下に8項目しかない、60でゲルゾリンが同一ノート内でゲル形成蛋白と切断蛋白の両方に分類されている、62のCOP-Iの方向が61の表と正面から食い違う、59のミトコンドリアの機能「カスパーゼの貯蔵」が53・54と矛盾する、など。過剰な書き換えを抑えるため『既定は変更しない/文体改善のための書き換えはしない/修正ゼロでもよい/無理に出典数を稼がない』という歯止めを置き、実際に38(膜受容体)は事実誤りゼロでカウントの補足のみ、というノートも出た。**確認できなかった項目は憶測で書き換えず記載を残した**(28のヒドロキシプロリン尿中排泄40%、56のADAM17によるRIPK3リン酸化、58のHayflick限界50〜60回、24のリボソーム構成蛋白数など)。80ノートを16のサブエージェントに5件ずつ割り当てて並列処理し、親側で見出し数・wikilink増減・lint・出典id重複を全件再検証している。並列作業の副作用として『同一論文に別々のid』が4組発生したため統一した。

    • トピックChemical structure of nucleotides; primary and secondary structure of nucleic acids (DNA and different types of RNA)「syn型・anti型は回転の自由度がなく相互変換不可能」を訂正——プリンヌクレオシドは溶液中でsyn⇄antiの動的平衡にあり、NMRで存在比が定量されている。同ノートのZ型DNA表が「プリンはsyn、B型はanti」と書いており内部矛盾でもあった。「ヌクレオチド間の結合はエステル1つと酸無水物2つ」も訂正(これはヌクレオシド三リン酸1分子内のリン酸鎖の話で、ヌクレオチド間は3′,5′-ホスホジエステル結合)。B型の10塩基対/回転が繊維X線回折の値で、溶液中の実測は10.4±0.1であることを追記。
    • トピックCondensation of the genetic material in pro- and eukaryotic cells; the role of topoisomerases and chromatin proteins「トポイソメラーゼII(DNAジャイレース)が負の超らせんを導入」が真核生物には当てはまらないことを明示(負の超らせんを導入できるのは細菌ジャイレースのみで、高等真核生物には存在しない=キノロンの選択毒性の根拠)。「コンデンシン-ATPaseはSMCヒストン蛋白質ファミリー」を訂正(同ノート前段でSMCを非ヒストンに分類済みの内部矛盾)。30 nm線維の階層モデルについて、ChromEMTでは細胞内クロマチンが直径5〜24 nmの不規則な鎖であり規則的線維は観察されないことを、5段階モデルを残したうえで追記。
    • トピックStructure of the human genome: coding and regulatory sequences; noncoding genomic sequences: introns, pseudogenes, repetitive sequences (only for EM-students)本ノート最大の誤り「ヒトゲノムのうちRNAをコードするのは1.5〜2%」を訂正——1.5〜2%は蛋白コード配列の割合で、ENCODEによればゲノムの約4分の3が転写されうる。「テロメラーゼは胚性幹細胞でのみ発現」も訂正(正常卵巣・精巣は陽性、腫瘍生検101検体中90検体が陽性)。偽遺伝子を「3タイプ」と書いて表が4行という内部矛盾、および孤発型偽遺伝子の「機能喪失変異(例:熱)」という意味不明な訳語を修正。T2T-CHM13でセントロメア反復がゲノムの6.2%を占めることを追記。
    • トピックThe role of genetic variations in the pathogenesis of diseases; methods to study genetic factors「0.1〜0.5%(約300万塩基対)=約99.5%同一」の数字が噛み合っていない点を、数え方の違いとして整理(300万塩基は0.1%側、99.5%は0.5%側)。「頻度1%を境に変異/多型」という枠組みが臨床遺伝学では2015年のACMG/AMPガイドラインで5段階分類に置き換わっていることを、旧枠組みを残したうえで追記。GWASが「ゲノム全体を読む」のではなくタグSNPアレイによる間接的検出であり希少バリアント・構造変異を取りこぼすことを、UK Biobank 490,640人のWGSと対比して明示。
    • トピックPrinciples of the semiconservative DNA replication; replication fork, leading and lagging strand synthesisラギング鎖の表の「3′→5′方向にしか進めないため」が直前の本文「ポリメラーゼは5′→3′のみ」と矛盾していた点を修正。岡崎フラグメント長が酵素固有の値ではなく真核生物ではヌクレオソーム反復長に一致し、連結部がヌクレオソーム中央付近に偏ることを追記。ヒトの複製起点が最大150 kbの幅を持つ「開始ゾーン」内での確率的開始であり、oriCのような単一点ではないため一意に数えられないことを明示。
    • トピックComparison of DNA-replication in pro- and eukaryotesPol δ/ε の鎖分担を現行の理解へ更新——表は「δ=リーディング+ラギング両方、ε=修復」だったが、2007〜2008年の低忠実度変異型ポリメラーゼ実験でε=リーディング鎖、δ=ラギング鎖(δの複製の90%超がラギング鎖鋳型)と決着している。「真核は全起点で同時に開始」を訂正(約40 kb間隔の小クラスタ単位で順次発火)。複製起点「1000超」をini-seqの実測25,000か所超へ(桁が1つ以上違う)。大腸菌の複製速度も生体内実測(550〜750 nt/秒)へ。
    • トピックTelomeric repeat sequences: replication of the telomeric regions of eukaryotic chromosomes; functions and importance of the telomerase「腫瘍細胞はプロモーターを脱メチル化してテロメラーゼを発現する」という方向が現在の理解と逆であることを明示——主役はTERTプロモーター変異(汎癌30,773例の11.3%、皮膚メラノーマ82%)とTHOR領域の高メチル化(低メチル化ではない)。「胚性幹細胞・始原生殖細胞・癌細胞でのみ機能する」の「でのみ」も補正(CD34陽性造血幹細胞、抗原刺激後のナイーブCD4 T細胞)。ALT(癌の10〜15%、ATRX欠損を伴い抗テロメラーゼ薬が効かない)が欠落していたため追加。表で同じものが2行に分かれていた重複も統合。
    • トピックThe most important types of DNA damage; repair of base deamination (only for EM-students)「DNA損傷は常に2本鎖の一方のみ」が同ノートの二本鎖切断・鎖間架橋の節と正面から食い違っていた点を3箇所修正。DNA自然崩壊の主要3経路のうち酸化が6分類に立っていなかったため、8-oxoGとMTH1/OGG1/MUTYHの3段構え、MUTYH両アレル変異=MUTYH関連ポリポーシスを追加。脱アミノ化の表に5-メチルシトシン→チミンが無く本文と不一致だった行を補い、CpGトランジションが全点突然変異の約3分の1であることを追記。なお『1日あたり約10,000箇所の脱プリン化』はLindahlの古典的推定だが原著抄録に数値が無く、そのまま残した。
    • トピックFormation and repair of thymine dimers; mismatch repair (only for EM-students)「原核生物のみが持つ直接修復(DNA光回復酵素)」が二重に誤りであることを訂正——光回復酵素は菌類・植物・魚類・有袋類にもあり、逆にヒトを含む有胎盤類は遺伝子ごと失っている。ヒトに残る直接修復=MGMTが欠落していたため追加し、膠芽腫206例の45%でプロモーターがメチル化しその群だけがテモゾロミドの上乗せを得たという臨床的逆転関係を明示。「真核生物のミスマッチ修復は詳細未解明」も更新(PCNAに活性化されたMLH1-PMS2が新生鎖の既存ニックを手がかりに鎖識別する機構が解明済み)。dMMR/MSI-Highへの免疫療法(12腫瘍型で奏効率53%)も追加。
    • トピックTypes of point mutations; mechanisms of their development; possible effects of DNA sequence variations on the corresponding protein「頻度1%で変異と多型を分ける」枠組みがACMG/AMP 2015で廃止され5段階分類に置き換わったことを、旧表を残したうえで追記。「サイレント変異=影響なし」の断定を訂正(MDR1の同義SNPは稀コドンによる共翻訳的フォールディングのタイミング変化でP糖蛋白の立体構造と薬物相互作用を変える)。「挿入・欠失=フレームシフト」も3の倍数はインフレームである旨を補正。de novo変異率(1世代1ヌクレオチドあたり1.20×10⁻⁸、ばらつきはほぼ父の年齢のみで説明され1歳につき約2変異増)を追加。
    • トピックStructure and function of the RNA-polymerase of E. coli; initiation and termination of transcription in prokaryotes大腸菌RNAポリメラーゼのωサブユニットが欠落していた点を補正——コア酵素はα₂ββ′ω、ホロ酵素はα₂ββ′ωσ。あわせて「組み立てを助ける」のはσではなくω(真核RPB6の相同体)であること、「σは最小サブユニット」も誤り(σ70約70 kDa>α約36.5 kDa>ω約10 kDa)であることを明示。σ解離のタイミングがノート内で「最初のヌクレオチド合成後」と「約10 nt合成後」に分裂していた矛盾を、半減期4〜7秒の確率過程として統合。ρ依存性終結の「Rho因子がポリペプチド鎖のループを形成」も訂正(RNA鎖)。
    • トピックCharacterization, role and synthesis of different types of RNA「ゲノムの90%超が転写される」を3箇所訂正——ENCODEの原著は約4分の3(75%)で、「生化学的機能割り当て80%」との混同。lncRNAを「約200 nt」から「200 ntを超える」へ直し、circRNAの行を新設(CDR1asがmiR-7結合部位63個を持つスポンジ)。「rRNA・tRNAの遺伝子はいずれも核小体に集簇」が後段の「Pol IIIが核質でtRNAを合成」と矛盾していた点、節見出しが「原核生物型」なのに内容が全て真核だった点、「原核生物:核内リボヌクレアーゼD」(原核生物に核はない)を修正。
    • トピックRegulation of transcription in prokaryotes, definition of operon; positive and negative regulation (only for EM-students)「ヒト消化管内の大腸菌がヒトのラクトース分解を可能にしている」を訂正——ヒトの乳糖分解は小腸刷子縁のラクターゼ(LCT産物)が担い、離乳後の活性低下が成人型乳糖非持続症。「ヒトはトリプトファンを細菌の助けを借りて合成できる」も訂正(必須アミノ酸で生合成経路を持たない)。「オペロンは原核生物のみに存在する」も、C. elegansに約1,000個のオペロンがあり全遺伝子の約15%が含まれることを、元の記述を残したうえで追記。trpオペロンのアテニュエーションが欠落していたため補い、コリプレッサーの因果の逆転も修正。
    • トピックStructure of the eukaryotic genes, initiation and termination of transcription in eukaryotesTATAボックスの位置づけを実測へ——ヒトのコアプロモーターの約76%はTATA様配列を欠き、コンセンサスINRを持つのは約46%でTATAより優勢。「4要素が必ず揃う」わけではないことを明示。高等真核生物の主要な調節点であるプロモーター近傍ポーズ(NELF/DSIF、P-TEFb/CDK9によるSer2リン酸化)が欠落していたため追加。終結機構が実質トルピードモデルなのに名称もXrn2も無かった点を補い、伸長速度との速度競合が終結位置を決めることを追記。ノート11のω追加に合わせて原核ホロ酵素の表記も統一。
    • トピックRegulation of the transcription in eukaryotes (only for EM-students)メディエーターのサブユニット数「約20」を26(1.4 MDa)へ補正。「メディエーター=エンハンサーに結合する複合体」も不正確なため訂正——メディエーター自身に配列特異的DNA結合活性はなく、エンハンサー結合転写因子に呼ばれて橋渡しをする。相分離による転写調節の層が丸ごと欠落していたため、メディエーターがIDRに富み相分離能を持つこと、スーパーエンハンサー上でBRD4とMED1が液滴様凝縮体を形成することを追加。
    • トピックProcessing of the eukaryotic mRNAmermaidノードの脱字(本文と食い違う `c3'スプライス部位`)を修正。m6Aが第4の加工層であること(ヒト7,000超遺伝子・12,000超部位、終止コドン周辺と長い内部エキソンに集中)を追加。「U5=3′スプライス部位結合」「U4・U6=触媒活性」という記述を、3′部位認識はU2AFが担いU5は両エキソン末端を整列させること、U4は触媒活性を持たずU6を覆うシャペロンであることとして補正。U12型(マイナースプライソソーム)の存在も追記。
    • トピックFunction and application of PCR and real-time PCR「プライマーは人工の一本鎖DNA(自然界のような通常の二本鎖RNAではない)」を訂正——天然のプライマーはプライマーゼが作る一本鎖RNA。mermaidのアニーリング温度68℃が本文の50〜72℃/55℃前後と食い違っていた点を統一。相対定量を「定性的」、絶対定量のみ「定量的」としていた表を書き直した(2^(-ΔΔCt)は変化倍率を出す定量法)。デジタルPCR(検量線不要、qPCR比でCV 37〜86%低下)とCRISPRベース検出(SHERLOCKはアトモル感度・1塩基識別)を追加。
    • トピックMethods for the investigation of genetic mutations and polymorphisms (RFLP, allele-specific PCR, DNA-sequencing and primer extension)プライマー伸長法の説明「異なる蛍光で標識したプライマーを用いて、どのプライマーが結合するかを見る」を訂正——プライマーは1本で、4色に色分けしたddNTPを取り込ませ産物の色で塩基を読む。「プロファイリード活性」という崩れた語を「校正活性を持たないポリメラーゼを使うので3′末端のミスマッチは修正されない」という正しい機序へ。3′-/5′-エキソヌクレアーゼの向き(3′→5′、5′→3′)を明記し、後者が岡崎フラグメントではなくRNAプライマーの除去であることを補正。サンガー法の実装の変遷とNGSへの位置づけの変化も追記。
    • トピックGeneration and application of recombinant DNA, reporter- and expression vectors「アンピシリン(β-ラクタム系)は翻訳装置を破壊する」を訂正——細胞壁ペプチドグリカン架橋のトランスペプチダーゼ阻害。「制限酵素切断で遊離3′-OHと5′-OH」も訂正(5′-リン酸。リガーゼが繋ぐ相手そのものの誤り)。「トランスフェクション(ウイルス様粒子を用い…)」も訂正し、トランスフェクション(非ウイルス的)/トランスダクション(ウイルスベクター)/形質転換(細菌)の3語を区別。レポーターにGFPが完全に欠落していたため発光系と蛍光系の2系統を追加し、Gibsonアセンブリへの移行も追記。
    • トピックRegulation of eukaryotic gene expression at post-transcriptional level (alternative splicing, RNA editing, regulation of RNA stability, RNA quality control) (only for EM-students)「転写後調節は真核生物にのみ存在する」を緩め、細菌のリボスイッチ・sRNA・アテニュエーションを提示。真核生物固有なのは核/細胞質の分離とスプライシングに由来する層であることを明示。タイトルにあるのに本文が欠落していた2項目(RNA安定性の調節=脱アデニル化律速・ARE・m6A→YTHDF2、およびRNA品質管理=NMD)を補完。HIVの本文で伏せられていた「特異的蛋白質」をRev(RRE結合、CRM1経由)と明示(まとめだけがRevに言及しており本文と不整合だった)。ヒトの複数エキソン遺伝子の約95%が選択的スプライシングを受けることも追加。
    • トピックRegulation of eukaryotic gene expression by RNA interference (miRNA, siRNA)「パッセンジャー鎖が標的mRNAに結合する」を本文2箇所で訂正——RISCに残って標的を読むのはガイド鎖で、パッセンジャー鎖はAgo2に切断・廃棄される。「Dicerがdsdsを中央で切断」も訂正(末端から測って切る分子定規、PAZ〜RNase III間 約65Å ≒ 25 bp)。「miRNA→翻訳阻害」の単純化も、リボソームプロファイリングで蛋白産生低下の84%以上がmRNA量低下で説明されることを添えて補正。Drosha・Exportin-5が無名だった点を補い、siRNA医薬(パチシラン、2018年承認の世界初のRNAi医薬)を追加。
    • トピックEpigenetic regulation of eukaryotic transcription: the role of DNA methylation and histone modifications「メチル化は通常CpGアイランドで起こる」を訂正——向きが逆で、バルクDNAのCpGは大半がメチル化、CpGアイランドは正常組織では非メチル化(不活性X・インプリント座位を除く)。「メチル化=発現抑制」の一律化も、gene body内部のメチル化が発現と正の相関を示すことを添えて補正。能動的脱メチル化「メチル基の直接除去」も訂正(5mCから直接メチル基を外す酵素は無く、TETによる5mC→5hmC→5fC→5caCの酸化+除去修復)。表で「脱アセチル化」の行の効果欄がアセチル化の説明になっていた矛盾も解消。
    • トピックThe genetic code; structure and function of tRNAs; aminoacyl-tRNA synthetases; codon-anticodon connections「アミノ酸の数だけアミノアシルtRNA合成酵素が存在する」に例外を追記——グラム陽性菌・シアノバクテリア・古細菌・オルガネラはGlnRSを持たず、GatCABアミドトランスフェラーゼによる誤アシル化+アミド化が唯一の供給路(枯草菌では破壊が致死)。遺伝暗号の例外(UGA→セレノシステイン、UAG→ピロリジン)が皆無だったため表で追加し、ヒトにセレノ蛋白が実在することも明示。ミトコンドリア暗号・繊毛虫などの例外、クラスI/クラスIIの区分も追記。
    • トピックThe structure of prokaryotic and eukaryotic ribosomes; the ribosome cycle; binding of tRNA to ribosomesリボソームがリボザイムであることが一切書かれていなかったため追加(ペプチジル転移中心は23S rRNAドメインVのみで構成され、形成されるペプチド結合の約18Å以内に蛋白側鎖が存在しない)。2014年の統一命名法(uS/uL、b・e接頭辞)も旧命名を残して追記。リボソームサイクルが「IF-3の多寡」だけで説明されていた点を補正——終結後複合体を割るのは細菌ではRRF+EF-G+GTP+IF3、真核ではABCE1。なお構成蛋白数(原核54、真核80〜82)は参照した構造解析論文の抄録に記載が無く、現行値のまま残した。
    • トピックInitiation of the translation in pro- and eukaryotes; regulation of eukaryotic translation; the role of phosphorylation of eIF2α冒頭が「原核はシャイン・ダルガーノ配列」と書いているのに原核の節にSDが一度も出てこなかった内部ギャップを、16S rRNA 3′末端との塩基対合として補完。「eIFのα-サブユニット」をeIF2αSer51へ修正。「GDPをGTPと交換できない」の実体である交換因子eIF2Bが登場していなかったため追加し、4つのeIF2αキナーゼ(PERK/PKR/GCN2/HRI)と統合的ストレス応答を明示。「翻訳を全面停止」の断定も、ATF4がuORFの使い分けによりストレス時にむしろ翻訳が上がることを添えて補正。コザック配列とリーキースキャニングも追加。
    • トピックElongation and termination of pro- and eukaryotic translation; pharmacological inhibitors of translation伸長の三者複合体を「tRNAiMet+GTP結合eIF2」としていた本文を訂正——同じ節のmermaidは正しく「EF1α-GTP」と書いており、本文だけが開始の三者複合体と取り違えていた。「EF-Tu(熱不安定性)、EF-T(熱安定性)」の表記も補正(熱安定側はEF-Ts)。ストレプトグラミンの「50SのP部位に結合」を訂正し、B群は出口トンネル、A群はペプチジル転移酵素中心に結合してA・P両部位のtRNA占有を妨げることを明示。スペクチノマイシンも小サブユニット頭部のswivelを立体的に固定して転座を阻害すると具体化。
    • トピックPost-translational modifications of proteinsリシルオキシダーゼの補因子「銅→ノルロイシン」を訂正(Cu(II)とLTQ=リシンチロシルキノン。ノルロイシンは架橋産物名の混入)。架橋の相手「リジン/プロリン」も訂正(アリシン同士、またはリジン/ヒドロキシリジン。プロリンは関与しない)。N-型糖鎖付加の酵素「N-アセチル基転移酵素」をオリゴ糖転移酵素(OST)へ。O-型糖鎖付加の「ゴルジ体内、O-GlcNAc転移酵素により付加」も2系統の混同として分離——ムチン型はppGalNAc-Tがゴルジで開始し、OGTは核・細胞質で働く。
    • トピックTypes, structure and synthesis of collagenメンケス症候群を「リシルオキシダーゼに必要な銅の食事性欠乏」「代謝性疾患」としていた記述を訂正——X連鎖劣性のATP7A変異による銅代謝異常症で、分類ごと遺伝性へ移した。プロリル水酸化酵素の生成物にH₂O₂が挙がっていた点も訂正(Hyp・コハク酸・CO₂)。コラーゲンの型の総数(28メンバー)とエーラス・ダンロス症候群の2017年国際分類(13亜型)を、元の4型・Villefranche分類を残したうえで位置づけとして追記。なお『ヒドロキシプロリンの40%が尿中に分泌される』は一次資料で確認も反証もできず、憶測での書き換えを避けて残した。
    • トピックInvestigation of gene expression by real-time PCR and DNA-microarray methodologyTaqManプローブの「アニーリング中(プローブがDNAポリメラーゼにより結合したとき)クエンチャーが除去される」を2点訂正——プローブは相補性により自力でアニーリングし、増幅(伸長)中にTaqの5′→3′エキソヌクレアーゼ活性が分解する。「閾値サイクル(Cт)」もMIQE 2.0でCq(quantification cycle)が正式名称となったことを旧名を残して追記。マイクロアレイがRNA-seqに置き換わった位置づけ(背景ノイズ・ダイナミックレンジ・スプライシングや融合遺伝子の検出)を、アレイの記述を削らずに補った。
    • トピックDefinition of proteostasis; types of intracellular protein degradation「N末端則(N-end rule)」が2019年にN-degron pathwayへ改称提唱されたこと(20アミノ酸すべてが文脈次第で不安定化N末端残基になりうると判明したため、およびC-デグロン経路が対として加わったため)を旧名を残して追記。「ユビキチンは細胞質蛋白質をプロテアソームでの分解のために標識する」という限定型の断定も、鎖の繋ぎ方が8種でK48鎖→プロテアソーム/K63鎖→リソソームと行き先が分かれることを添えて補正。CMAとeMIがKFERQモチーフ依存で単一蛋白を選択的に分解することも補強。
    • トピックStructure and function of the proteasome; role of immune-proteasome and TAP (only for EM-students)表の「β3=キモトリプシン様」を訂正——7種のβのうち触媒活性を持つのはβ1・β2・β5の3つのみで、キモトリプシン様はβ5。まとめの `β1/β2/β3` も同時に修正(表と本文の内部整合)。20Sコアのサブユニット数を28((α1-7,β1-7)×2)と明記。免疫プロテアソームの触媒サブユニット(β1i/β2i/β5i)と誘導因子(IFN-γ・TNF-α)、およびTAPがTAP1/TAP2のヘテロ二量体でありペプチド装填複合体が7サブユニットからなることを具体化した(元ノートはPLCの中身を一切書いていなかった)。
    • トピックTypes, mechanism and role of autophagy「ULK1→Beclin1→PIP3」の脂質の取り違えを訂正——オートファゴソーム形成に必要なのはPI3P(PtdIns3P)であってPIP3ではない。しかも原文は「PIP3タンパク質」と書いており脂質を蛋白と書く二重の誤りだった。CMA受容体をLAMP-2Aと特定し、加齢によるCMA低下の実体がLAMP-2A量の減少であることも追記。本文「選択的オートファジーもオートファゴソームを使う」とまとめ「マクロオートファジー=非選択的なバルク分解」の矛盾を、2つの軸が直交することとして解消。癌における役割が発癌の段階で逆転することも数値つきで補正。
    • トピックLytic and lysogenic replication cycles of bacteriophages (only for EM-students)「RecAがλリプレッサー/LexAを蛋白質分解する」の機構を訂正——cIもLexAも分子内自己切断で、RecAは反応速度を上げるコプロテアーゼであり通常のプロテアーゼではない。「2つのリプレッサー二量体(cI+croリプレッサー)」も訂正(別々の蛋白質でそれぞれホモ二量体を作り同じO_R部位を奪い合う。親和性の順序も逆)。溶原サイクル冒頭「ファージDNAは複製されず」と段階4「プロファージとともに複製する」の矛盾、まとめの「宿主DNAをヒドロキシメチルシトシン化により保護」(保護されるのはファージDNA側)、膜と壁の混在も解消。
    • トピックClassification of animal viruses; structure and replication of retroviruses (only for EM-students)ボルチモア分類が6群になっていた点を訂正——正しくは7群で、グループVII=dsDNA-RT(HBV等ヘパドナウイルス)が欠落していた。グループIの記述が挙例のポックス・ヘルペスの両方に当てはまらない点(いずれも自前のDNAポリメラーゼをコードし、ポックスは核に入らない)、グループIIの3行が「宿主DNAポリメラーゼで複製」の直後に「RNAポリメラーゼによりdsDNAへ変換」と壊れていた点を修正。「(ランダムな組み込み)」も訂正(HIVは活発な転写単位内部、MLVは転写開始点近傍を好む)。ICTV分類体系の改訂も追記。
    • トピックPrinciples of human gene therapy (in vivo vs. ex vivo methods, gene augmentation, CRISPR/Cas9 system) (only for EM-students)最も古びていたノート。「実験的技術である」を訂正(2024年時点でFDA承認20品目超、うちrAAV製品7品目、定価1人400万米ドル超)。AAV行の「染色体19番へ組み込み可能/免疫応答なし」が3点とも誤りであることを明示——chr19部位特異的組み込みはrepを持つ野生型AAVの話で治療用rAAVはほぼエピソーム、255試験のメタ解析で38.7%が中和抗体で被験者選別、高用量では肝毒性・血栓性微小血管症の致死例(8試験計11例の死亡)。レンチ/レトロウイルスベクターの挿入変異(SCID-X1試験のLMO2上流35 kb組み込み→T-ALL)が全く書かれていなかったため追加。Casgevyが世界初のCRISPR承認薬でありBCL11Aエンハンサー破壊による抑制解除であること、塩基編集・プライム編集も世代表として追加した。
    • トピックBiomedical application of genetic engineering processes (transgenic animals; knock-out, knock-in and knock-down techniques; cloning) (only for EM-students)CRISPRに一切触れておらず手法の位置づけが2013年以前で止まっていた点を補った——ノックアウト=「ES細胞+相同組換え+キメラ」のみだったところへ、ZFN→TALEN→CRISPRの世代交代と、Cas9 mRNA+sgRNAの受精卵共注入で両アレル変異マウスが80%得られることを、ES細胞ルートを消さずに追記。塩基編集(二本鎖切断・ドナー不要、約5塩基の窓、修正率15〜75%、indel通常≤1%)とプライム編集(12種類すべての点変異、既知疾患関連変異の最大89%)も追加。
    • トピックNuclear receptors: steroid, thyroid, retinoid and Ah receptorsベンゾ[a]ピレンを「ハロゲン化芳香族炭化水素」としていた記述を訂正(多環芳香族炭化水素。ハロゲン化はダイオキシン側)。核内受容体スーパーファミリーがヒト48個であることを追記し、AhRがbHLH/PASクラスでこの48個に含まれないため「機序上の相似形」として覚えるべきことを、元の記述を消さずに明示した。
    • トピックClassification and function of membrane receptors点検したが現行コンセンサスとのずれは見つからず、事実誤りの修正はゼロ。3分類が冒頭・本文・まとめで一致しており内部矛盾も無かった。欠落していたカウント系の数値のみ補った——ヒトGPCR配列800個超、非嗅覚の機能的GPCR 342個、GRAFS 5大ファミリー、FDA承認薬475剤(約34%)が108個のGPCRに作用し、非嗅覚GPCRの224個(56%)は臨床試験未着手。
    • トピックTypes and functions of GTP-binding proteins in signalingGタンパク質αサブユニットの4大ファミリーが誤っていた点を訂正——ノートは「Gs/Gi/Gq/Gt」としていたが標準分類はGs・Gi/o・Gq/11・G12/13で、Gtは独立ファミリーではなくGiファミリーの一員、逆にG12/13が表から欠落していた。「Raf自身もRasの下流で活性化される小分子G-タンパク質である」も訂正(RafはRasのエフェクターであるSer/Thrキナーゼ。ノート40にも同じ誤りが波及していた)。化学名の誤り2点(ホスホイノシトール-4,5-ビスリン酸→ホスファチジルイノシトール、AMPホスホジエステラーゼ→cAMP)も修正。
    • トピックActivation mechanisms of serine / threonine protein-kinases with examples「Raf自身は小分子G-タンパク質である」が同一段落の「MAP3キナーゼファミリーの一員」とノート内で矛盾していた点を訂正。「TGFβ(transformation growth factor β)」の略語展開も修正(transforming)。PDK1のアロステリック活性化因子が「ホスファチジルイノシトール3-リン酸」と読める記載も訂正——PDK1はPtdIns(3,4,5)P3にKD 1.6 nMで結合し、PtdIns3PやPIP2には低親和性。ヒトキノームが518遺伝子であることも追加。
    • トピックcAMP signaling pathway; regulation of gene expression by cAMPcAMPの直接標的がPKAしか出てこなかった点を補い、Epac(Rap1/Rap2のGEF)を追加。環状ヌクレオチド依存性チャネルとcAMPホスホジエステラーゼによる終息機構も追記した。ノート39・40で見つかった「AMPホスホジエステラーゼ」型の誤記はこのノートには波及していなかった。本文中で行途中に割れていた語(ヒスト/ンアセチル基転移酵素)の表示崩れも修復。
    • トピックPhosphatidylinositol signaling pathways「クラスI.Bの活性化:受容体チロシンキナーゼ(例:インスリン受容体)」を訂正——PI3Kγ(クラスIB)は三量体Gタンパク質のβγサブユニット(とRas)で活性化される。直前の表(βγ+p110γ)と矛盾していた内部矛盾でもある。「不活性型PDK1がPI 3-キナーゼによりリン酸化される」も訂正——PI3Kは脂質キナーゼで蛋白質はリン酸化しない。PDK1はもともと活性を持ちPHドメインでPIP3に結合して形質膜に恒常局在し、動くのはPKBの方(Thr308=PDK1/Ser473=mTORC2)。
    • トピックNFκB and TGFβ signaling「p50:NF-κB1とNF-κB2からなる」を訂正——p50はNF-κB1(前駆体p105)由来、p52はNF-κB2(前駆体p100)由来で、同ノート後半の「p52=成熟NF-κB2」と矛盾していた。「p65:RelA、RelB、c-Relからなる」もp65=RelAそのものなので「Rel型サブユニット群」へ整理。「SARAが受容体に結合しR-SMADをリン酸化する」も訂正——SARAはキナーゼではなくFYVEドメインの足場で、リン酸化するのはtype I受容体のSer/Thrキナーゼ。mermaidも同じ誤りだったため同時修正。
    • トピックStructure and function of tyrosine kinase receptors, the Erkl / Erk2 MAP kinase cascade「細胞外シグナルがない状態では、RTKは二量体化しておらず単量体として別々に存在する」という断定に例外を追記——インスリン受容体ファミリーはリガンド非存在下でも恒常的二量体で、リガンドの役割は二量体化ではなく立体構造の切り替え。細胞外領域はジスルフィド結合した二量体として結晶構造が解かれている。ノート39・40で見つかった「Raf=Gタンパク質」型の誤りはこのノートには波及していなかった。
    • トピックInsulin signalingAS160の項の「GLUT4の合成とその形質膜への転位を誘導する」を訂正——インスリンが誘導するのは新規合成ではなく既存のGLUT4貯蔵小胞のトランスロケーション。IRSがIRS-1だけでなくファミリーであり、IRS-1欠損(インスリン抵抗性+成長遅延)とIRS-2欠損(肝インスリン抵抗性と代償性β細胞過形成の欠如による2型糖尿病)で表現型が異なることも追加。ノート44と整合させ、インスリン受容体がα₂β₂の恒常的二量体である点も明記。
    • トピックIntegrating role of mTOR, and its effects on translationサブユニット略号の展開が3つ誤っていた点を訂正——Raptorは regulatory associated protein of mTOR、Rictorは rapamycin-insensitive companion of mTOR、Protorは protein observed with Rictor。「エネルギーの存在(Akt経由)」も訂正(伝えるのはAMPKで、TSC2に加えRaptorの保存2セリンを直接リン酸化する)。mTORC2の記述が細胞骨格調節因子のみで最も確立したAkt Ser473リン酸化が欠落していた点も補い、Ragulator・Sestrin2によるアミノ酸センシングも追加。
    • トピックRole of AMPK in the regulation of the metabolism and autophagy表の「PP2A・PP2C、PKA、PKC——いずれもThr172残基を脱リン酸化する」という論理的にありえない記述を訂正——PKA/PKCはキナーゼで脱リン酸化できない。PKAはα1-Ser485/α2-Ser491をリン酸化し、別途cAMP上昇がCaMKKを阻害してThr172リン酸化を減らす。「ATPの役割」の2箇条が実質重複していた壊れた記述も、AMPがThr172の脱リン酸化を妨げATPが促進するという本来の点へ補正。ULK1のリン酸化部位(AMPKがSer317/Ser777、mTORC1がSer757)も特定した。
    • トピックMechanisms of cellular oxygen sensing; adaption to hypoxia枠組み自体は正しかったが3つの層がまるごと欠落していたため補った——①FIH-1(CADの保存アスパラギンをヒドロキシル化してp300/CBP結合を阻む。PHD=安定性、FIH-1=転写活性の二段構え)②HIF-1αとHIF-2αの分業(EPOはHIF-2α依存でHIF-1α非依存、解糖系はHIF-1α依存)③臨床応用(ロキサデュスタットでHb +1.9 g/dL、ベルズチファンのVHL病関連腎細胞癌で奏効率49%)。ジオキシゲナーゼの化学量論「1分子の酸素が基質に取り込まれ」も訂正(O₂の2原子は分かれ1原子が基質へ、1原子がコハク酸へ)。
    • トピックRegulation of the cell cycle in the G1 phase, transition to S phaseサイクリン/CDK対応表は全行正しく番号の取り違えは無かった。「阻害性リン酸化はWee1が媒介」を訂正——Wee1が付けるのはTyr15のみで、Thr14の主要キナーゼは膜結合性のMyt1。CAKをCdk7-サイクリンH-MAT1の三量体と具体化し、CIP/KIPのCdk4,6-サイクリンDに対する作用が純粋な阻害ではなく会合促進(p21で35倍、p27で80倍)であることを表を残したうえで補足。CDK4/6阻害薬(PALOMA-2でPFS 24.8 vs 14.5か月)も臨床接続として追加。
    • トピックRegulation of the cell cycle in the G2 and M phases見出し「MPFは後期まで有糸分裂を指揮する」と総括表「MPF:中期まで」の食い違いを、サイクリンB1の分解が紡錘体チェックポイントにより中期→後期移行まで遅らされるという同一の事実として整理。「APCは(ユビキチンリガーゼにより)分解の標的とする」も訂正(APC/C自身がE3ユビキチンリガーゼ)。「APCはMPFの分解」も訂正(壊れるのはサイクリンBでCdk1は残る)。共役因子Cdc20/Cdh1が完全に欠落していたため追加し、セパラーゼ・SACの実体(MCC)も具体化した。
    • トピックMolecular sensors detecting DNA damage and completion of DNA replication during the cell cycle14-3-3σの向きが逆だった点を訂正——本文「細胞質中でMPFを不活性化し核内へ転位させる」を「細胞質に隔離し核内への移行を阻止する」へ(原著の prevent them from entering the nucleus の読み違いと思われる)。mermaidノードも同時修正。センサーの実体(DSB側はMRN複合体→ATM、ssDNA側はRPA-ssDNA→ATRIP→ATR)とγH2AX→MDC1→RNF8/RNF168→53BP1のメディエーター連鎖を補い、表題にある「DNA複製完了の検知」に対応する記述が本文に無かった点も複製ストレス応答として補完した。
    • トピックMolecular background of tumor generation「INK蛋白質はRb蛋白質を阻害する」を訂正——INK4が阻害するのはCDK4/6で、結果としてRbは低リン酸化=活性型のまま保たれる。同ノートのmermaid「p16INK4aがCdk4,6:サイクリンDを阻害」と矛盾していた。がんの特徴(hallmarks of cancer)が全く無かったため2000年版6つ/2011年版/2022年版の3世代を年次つきで追加。「腫瘍抑制遺伝子の変異は劣性」にTP53の優性阻害・機能獲得という例外を追記し、レトロウイルスの⚠️が本文と矛盾していた点も解消した。
    • トピックStructure and function of the apoptosome, DISC and PIDDosome complexes「DISCは……デス受容体である」という定義の誤りを訂正——DISCは受容体そのものではなく、オリゴマー化した受容体+FADD+プロカスパーゼ8/10の複合体。「2つのアダプター蛋白質——プロカスパーゼ8/10とFADD」もアダプターはFADDのみ。アポトソームの七量体構造を追加し、PIDDソームについて現在もっとも確かな生理的引き金が中心体数の増加であり、カスパーゼ2→MDM2切断→p53安定化→p21依存性の細胞周期停止というアポトーシス以外の経路に至ることを、古い理解を消さずに併記した。
    • トピックMembers of the Bcl-2 superfamily and their roles in various apoptotic pathways, the „survival signal”「BH3onlyはBak/Baxを直接活性化するのではなく」という断定が3か所(冒頭・本文・まとめ)に複製されていたが、現在の理解では誤りであることを明示——Bid/BimのBH3ペプチドはBaxを直接活性化し、抗アポトーシス因子の阻害だけでは直接活性化因子が無い限りアポトーシス誘導に不十分。脱抑制モデルは残したうえで直接活性化型(Bid/Bim/Puma)と増感型(Bad/Noxa)の表を追加。BH3ミメティック(ナビトクラクスの血小板減少とベネトクラクスの選択性)も追加し、Bidの「カスパーゼ非依存性経路」が経路全体ではなくBidを切る段階のみを指すことも明記した。
    • トピックFunction and activation of apoptotic caspases, role of granzyme B「IAP蛋白質はカスパーゼの活性化に結合・阻害できる」がファミリー全体には当てはまらないことを明示——ヒトで直接カスパーゼを阻害できるのはおそらくXIAPのみで、cIAP1/2は主にユビキチンリガーゼ。表題にあるグランザイムBの記述が1行しかなく不正確だった点も補正——無傷の細胞内ではグランザイムB単独でプロカスパーゼ3を完全には活性化できず、ミトコンドリアからのシトクロムc・Smac・HtrA2放出で初めて自己プロセシングが進む。Smac/DIABLO・HtrA2、AIFによるカスパーゼ非依存性経路も追加。
    • トピックTypes of non-apoptotic programmed cell death (only for EM-students)「カスパーゼ1依存性の孔」を訂正——孔を作るのはガスデルミンDのN末端断片で、カスパーゼ4/5/11(細胞質LPS直接認識)も切断する。同ノートのmermaidと後段の「ガスデルミン孔」と食い違う内部矛盾でもあった。「AIFがMIFにより核へ転位する」(向きが逆)、「A20が複合体にMLKLを活性化させる」(A20はRIPK3のK63ユビキチン化を制限するブレーキ)も訂正。NCCD 2018が分子基準で十数種を定義していることを、元の4様式を残して追記。なお『ADAM17もRIPK3をリン酸化する』は支持する抄録が皆無だったが、置き換え先を特定できなかったため記載を残した。
    • トピックRegulation of p53 levels and activity; role of p53 in determining the cell’s fate「ストレスのない細胞におけるp53の自己調節」という見出しなのに自己調節ループそのものが書かれておらずMdm2がp53の標的遺伝子であることに一切言及が無かった点を補完。G1停止の実行分子p21が本文に無く下の補足にだけ登場していた不整合も解消。Li-Fraumeni症候群の記載が皆無だったため追加し、p53標的遺伝子の表もノート内に既出の標的と検証済みのものだけで新設した。
    • トピックMolecular mechanisms involved in aging (only for EM-students)「老化の9つの特徴」という見出しの下に8項目しかなかった点を補正——欠けていたのは蛋白質恒常性の喪失(loss of proteostasis)で、まとめの箇条書きも同じ8項目を「9つ」と呼んでいた。数え直せば分かる誤りである。あわせて2023年にCell誌で12項目へ拡張されたこと(マクロオートファジー不全・慢性炎症・ディスバイオーシスの追加)を、9つを一切消さずに「置き換えではなく拡張」として表つきで上乗せした。がんでのテロメラーゼ活性化も実数(不死化細胞株100中98、腫瘍生検101中90、正常体細胞50中0)で補強。
    • トピックPrinciples of the organization of the eukaryotic cells; compartmentation; main features of subcellular organelles原核/真核比較表の「細胞骨格:存在しない」を補正——FtsZ(チューブリン相同体、Zリング)とMreB/Mbl(アクチン相同体)が知られており、両者を分ける本質は区画化の有無であることを、元の記述を消さずに位置づけとして明示。ミトコンドリアの機能「カスパーゼの貯蔵」も訂正——同フォルダのノート53・54が一貫してシトクロムc放出→アポトソーム→カスパーゼ9としており、ノートをまたいだ矛盾だった。染色体の塩基対数もT2T-CHM13の3.055 Gbへ補正。
    • トピックStructure of cytoskeleton; structure and function of motor proteins「ゲル形成蛋白質(ゲルゾリンなど)が2本の繊維を大きな角度で保持する」を訂正——同じノートの8行下ではフィラミンをゲル形成、ゲルゾリンを切断蛋白質として挙げており、ゲルゾリンは架橋しない。「繊毛:ネキシンなし=滑るのみ/鞭毛:ネキシンあり=曲がる」も、2行上と6行下ではネキシンが滑りを制限する架橋として登場する矛盾で、そもそもこの対比は繊毛vs鞭毛ではなく同じ軸糸の連結の有無の話であるため対比軸ごと差し替えた。ミオシンの「3つの型」も18クラス以上ある旨を、元の3型を残して補足。
    • トピックThe protein secretory pathway; role of the rab cycle in the regulation of vesicular transport「REPがプレニル基をRabへ転移する」を訂正——転移を触媒するのはRabゲラニルゲラニル転移酵素で、REPは未修飾Rabを酵素へ提示する役(ただし転移はREPの参加に絶対的に依存する)。「NSF=ATP加水分解のエネルギーで界面からH₂Oを排除」「SNAPはSNARE複合体を安定化」も訂正——NSFはα-SNAPとともにcis-SNARE複合体を解体するATPaseで、融合の駆動力はSNARE会合そのもの。「AP4:あまり知られていない」も、積み荷がATG9Aで欠損がSPG47/50/51/52であることを添えて更新した。
    • トピックEndo- and exocytosis「エキソサイトーシスは通常ゴルジからPMへ(COP-I小胞による)」を訂正——COP-Iはゴルジ→ERの逆行性専用で、ノート61の表と正面から矛盾していた。「Rabは……モータータンパク質であり」も訂正(低分子量GTPaseで、エフェクター経由でモーターに繋ぐ。これもノート61と矛盾)。「コルタクチンはダイニンに結合し」も訂正(結合相手はダイナミン2)。「エンドサイトーシスは3種類」という断定にカベオラとマクロピノサイトーシスを、元の3分類を残して補足した。
    • トピックFormation of the proteome of subcellular organelles; principles and mechanisms of protein sorting (only for EM-students)「ペルオキシソーム=酸素を用いて有機基質を還元するオキシゲナーゼ」という二重の誤りを訂正——オキシダーゼが基質を酸化する(ノート65は正しく書いており内部矛盾でもあった)。「RIP、regulated intermembrane proteolysis」もintramembrane(膜内切断)へ。「ERへの返送シグナル=C末端の負電荷と疎水性(Lys, Leu, Arg)」も訂正——LysとArgは塩基性で、実体は内腔側KDELと膜貫通型のKKXX二重リジン。
    • トピックProtein targeting in the secretory pathway (only for EM-students)「全ての膜貫通蛋白質はERに取り込まれ」という断定に例外を追記——ミトコンドリア/ペルオキシソーム膜蛋白質はER非経由で、テールアンカー型はSRPが使えず翻訳後にGet3/TRC40経路で挿入される。「SRPが疎水性セグメントを走査し開始転移シグナルを見分ける」も、実際に側方ゲートで疎水性ドメインを膜へ送るのはSec61であることを原文を残して補正。ERリトリーバルシグナルが一般名詞のままだった点をKDEL/HDELと受容体ERD2として具体化した。
    • トピックProtein targeting into mitochondria and peroxisomes; uptake of substrates into lysosomes (only for EM-students)「約1500のミトコンドリア蛋白質のうちミトコンドリア内で合成されるのはわずか10個」の両方の数字を訂正——MitoCarta3.0でヒト1,136遺伝子、mtDNA由来は13個で99%が核コード。「SAM=外膜蛋白質の折り畳み」もβ-バレル型専用と具体化し、TIM22とOXAも追加。Zellweger症候群の記載が皆無だったため追加(ZS/NALD/乳児Refsum病は同一連続体、CG1=PEX1が最大群、PEX7変異だけPTS2経路が選択的に障害)。I細胞病とM6P経路も補った。
    • トピックNuclear import and export of macromolecules (only for EM-students)「各NPCは約30種のヌクレオポリン」が出芽酵母由来の古い数字であることを補正(ヒトNPCは約110 MDa・約1,000分子・約34種)。「輸出はRan-GTPのエネルギーを要するが輸入は要さない」という断定も、同ノートの輸入サイクル図が最終段でRan-GAPによる加水分解を置いており矛盾していた点を含めて整理——輸入の転位段階も輸出も複数の基質でGTP加水分解を要さず、実際にエネルギーを消費しているのはRan-GTP勾配(核内が細胞質の約1,000倍)の維持である。
    • トピックEndoplasmic reticulum stress, connection between the Unfolded Protein Response (UPR) and apoptosis「D5R(デス受容体)」の綴りを訂正(DR5=death receptor 5/TRAIL-R2。コーパス全体でこのノート3箇所のみの表記でvault独自の用語決定ではないことを確認済み)。「GADD34(eIF2を脱リン酸化するホスファターゼ)」も訂正——GADD34はPP1の調節サブユニットで、脱リン酸化するのは触媒サブユニットPP1c、部位はeIF2αのSer51。XBP1スプライシングの詳細(26塩基イントロン、リガーゼはRtcB)、RIDD、ATF6を切るのがSREBPと同じS1P/S2Pであることも補足した。
    • トピックProtein quality control in the endoplasmic reticulum; the fate of misfolded proteins; ERADユビキチン化と脱グリコシル化の順序が本文とmermaid・番号列で食い違っていた内部矛盾を解消——膜からの引き抜きにはまずポリユビキチン化が必要で、脱グリコシル化は細胞質のPNGaseが後段で行う。匿名のままだった「AAA-ATPaseファミリーの六量体ATPase」「少なくとも4つの内在性膜蛋白質からなる複合体」「マンノシダーゼ」をp97/VCP-Ufd1-Npl4、Hrd1複合体、ER ManI+EDEMとして具体化。なお『最大80%が折り畳みに失敗する』は抄録で裏が取れず数値はそのまま残し、本文が持っていた「一部の型では」という限定が冒頭とまとめで落ちていた内部不整合だけを補った。
    • トピックCharacteristics of the metabolome of subcellular organelles; maintenance of the internal milieu of subcellular organelles「ERは自身の還元性中間体のプールを持つ」の論理が逆である点を訂正——ジスルフィド結合を作らせているのは酸化力で、ERのE_GSHは−208±4 mV、細胞質は−310 mVより負。まとめの記述が冒頭の「ERは細胞質より酸化的」と矛盾していた。「その酵素の1つがグルタチオンであり」も訂正(トリペプチドで酵素ではない)。「ミトコンドリア=酸化的」も内部ミリューとしては逆であること(マトリックスも膜間腔もグルタチオンプールは高度に還元されている)を、代謝の話との混同として整理した。
    • トピックRole of the extracellular matrix in signal transduction (e.g., integrin receptors), role of the extracellular matrix in the formation of metastasis (only for EM-students)「サブユニットの型は異なる遺伝子によってコードされるのではなく、翻訳後修飾によって達成される」を訂正——α・βは別々の遺伝子産物で、直前の箇条書き(18種・8種・24の結合対)とも矛盾していた。「化学療法は主に緩徐に非対称分裂する細胞を標的とする」も向きが逆で、同じ段落の後半「緩徐分裂細胞が化学療法で死滅しない場合」と矛盾——緩徐分裂・標識保持性細胞は従来型化学療法を生き延びる能力が数倍高い。RGD含有接着蛋白質がフィブロネクチン等より広いことも補足した。
    • トピックMethods in cell biology: cell culturing, cell fractionation, in vivo microscopy, flow cytometry, FACS (only for EM-students)「初代培養…約40〜50継代/分裂」の単位を訂正——Hayflick限界は継代回数ではなく集団倍加数(約50 population doubling)で、一様な50倍加は最後まで生き残ったクローンの結果である。「光学顕微鏡は回折のため解像度が限定される」に具体数(Abbe限界約200 nm、実用約250 nm)と超解像法(STED/PALM/STORM、生細胞62 nm)を追加。本文「蛍光マーカーを用いるフローサイトメトリー=FACS」と後段「FACS=分取するもの」の矛盾も、分取機構の有無で切り分けた。
    • トピックQuantification of proteins by biuret reaction and Ellmann-methodEllman法のモル吸光係数について、実習の13,600(Ellman 1959)が広く使われてきた一方で推奨値が412 nmで25度14,150・37度13,800 M⁻¹cm⁻¹であることを、実習値を残して追記。黄色発色種を「TNB(酸)」からTNB²⁻(dianion)へ修正。「システインを含む蛋白質は陽性」という断定も、DTNBが検出するのは接近可能な遊離チオールのみであること(GAPDH四量体でDTNBに即応するSHは2個、8 M尿素変性で+7個)を添えて補正。εの単位表記の内部不整合も整えた。
    • トピックInvestigation of subcellular cell fractions「分画遠心法は密度の違いを利用する」を訂正——分けているのは沈降速度(大きさが支配的)で、密度で分けるなら密度勾配遠心。4分画表が理想化されすぎている点も、古典的5分画とマーカーが複数画分にまたがる実測を添えて補足。基質がp-ニトロフェノールなのに「反応の産物はビリルビンのモノ/ジグルクロニド」と書かれていた内部矛盾も、実習の産物と生体内の代表反応を切り分けて解消。UGTの潜在活性(触媒ドメインがER内腔側にありTriton X-100で初めて全活性)も追記した。
    • トピックInvestigation of the gene expression in prokaryotes: induction of β-galactosidase in E. coliONPGを「オルト-ニトロフェニル-β-ガラクトシダーゼ」としていた化学名の取り違えを訂正——正しくはo-ニトロフェニル-β-D-ガラクトピラノシドで、酵素ではなく配糖体。LacYの「ガラクトシダーゼパーミアーゼ」も訂正(ラクトース/β-ガラクトシドパーミアーゼで、ガラクトシド/H⁺シンポーター)。lacリプレッサーを外す誘導物質がラクトースではなくアロラクトースである点も明示し、基底発現が誘導の前提になること、IPTGがチオ配糖体のため分解されないことも補った。
    • トピックPurification of a bacterially expressed protein by affinity chromatography「DNaseが全ての型のDNA+RNAを分解し」を訂正(DNaseはRNAに作用せず、粘度上昇の原因は放出された染色体DNA)。Ni²⁺がどう樹脂に保持されているかの記述が欠落していたため、NTAが四座配位子で2座が残って生体高分子が可逆結合すること、イミダゾール溶出がヒスチジン側鎖と同じ配位座の奪い合いであることを追加。「1段階で高純度」という断定も、SlyDやトリオースリン酸イソメラーゼがHisタグIMACの一般的夾雑物であり実務ではIEX/SECを重ねることを添えて補正した。
    • トピックSDS-polyacrylamide gel electrophoresis and Western blot「SDSにより各蛋白質はほぼ同じ電荷を持つ」を訂正——SDSはg/g基準で同一量が結合し(飽和時1.4 g SDS/g、2残基あたり1分子)、一定になるのは総電荷ではなく電荷/質量比。ノート冒頭が既に「同じ電荷密度」と書いており内部矛盾でもあった。本文が還元剤・加熱に触れないまま図に「SDS+DTT+加熱」がある不整合、ブロッキング段階の欠落も補い、見かけの分子量が糖鎖付加・リン酸化でずれること、ECLが発色法の最大500倍であることも追記した。
    • トピックIn silico tools in molecular biologyツールの現況を実地に確認し、NEBcutterがV2.0(nc2.neb.com)から現行V3.0(nc3.neb.com)へ移行していることを明記(OMIM・NCBI Gene/dbSNP・Primer-BLASTはいずれも名称・位置づけとも現行のまま稼働で変更不要と確認)。構造予測がAlphaFold以降で一変している点が反映されていなかったため、CASP14とAlphaFold DBの2億1,400万構造を追記。「SNP=集団の1%超/点変異=1%未満」の二分法についてもACMG/AMP 2015の5段階分類を追記した(同じvault内のmcb/04・mcb/10は既にこの注記を持っており、77だけ抜けていた)。
    • トピックGenotyping of the TAS2R38 tasting receptor by PCR-RFLP冒頭のフレーミングだけがtaster/non-taskerの割り当てを逆にしていた点を、本文3か所の多数派に合わせて修正。原因も特定した——前半のT/tはメンデル式の対立遺伝子記号(T=優性=PAV)、後半のT/CはSNP部位の塩基(T=AVI側)で、同じ「T」が逆のものを指していた。3つの多型(A49P・V262A・I296V)とハプロタイプ(PAV/AVI)を一次資料で確認し、3か所の寄与が同等でないこと、世界で5種のハプロタイプがありPTC感受性の分散の55〜85%しか説明できないことも追記。なお§3と§4の断片長は別プロトコルで、数値はどちらも消さず矛盾の指摘にとどめた。
    • トピックAnalysis and generation of a recombinant DNA「アンピシリン(βラクタム系抗生物質→翻訳機構を破壊する)」を訂正(PBP阻害による細胞壁合成阻害。vault内のtopics/medical-microbiology-y2/1-16が既に正しく記載しておりコーパス内矛盾でもあった)。「制限酵素は切断の結果、遊離の3′ OHと5′ OH基を形成する」も訂正——産物は3′-OHと5′-リン酸で、次段落の「リガーゼは3′-OHと5′-リン酸をつなぐ」と真っ向から矛盾していた。「水平遺伝子伝達=取り込まれたプラスミドが細菌ゲノムへ組み込まれること」という定義の誤り、SP6プロモーターの説明も修正した。
    • トピックIn vitro transcription and translation「二層構造:1本の試験管には全成分、もう1本にはRNAポリメラーゼを含めない(対照)」という読み違いを訂正——コムギ胚芽系でいう二層(バイレイヤー)法は翻訳混合液と基質混合液の界面を通じて基質を連続供給しバッチ法の10倍超の収量を得る反応形式で、対照実験のことではない。元の対照の記述は残したうえで両者を分けた。オメガ配列の実体(TMV RNA 5′リーダー由来67ヌクレオチドで、5′キャップの有無によらず翻訳が2〜10倍)も裏取りして具体化した。
  2. 2026 08.21

    法医学(topics/forensic)の全33ノートについて、Consensusが指摘した医学的な誤り・古さを Europe PMC で裏取りしたうえで反映し、出典を付けた。33ノートすべてが着手前は `sources` 0件で、3〜7件(計141件)を新設した。採用しなかった指摘は主に2型ある——①根拠文献が Europe PMC に収載されていない低位誌のもの(死後変化系の01・02・04では参照リストの大半がこれに該当し、02では10件中1件しか検証できなかった)、②授業由来の分類・表を丸ごと置換する提案(検死官の評決表、胃心臓反射、老人性心筋変性、触診の温度×硬さ表など。これらは保持し、注記で限界を書く形にした)。Consensusが挙げていない一次資料を `npm run papers` で探し当てて差し替えた例も多い(Henssge 1988/1992/2000、Panjabi 1998、Vercellotti 2009、Karger 2002、Gibbon 2025、Corban 2014 ほか)。なお `src/content/topics/forensic-medicine-y5/consensus/` の19番と20番のファイルは中身が入れ替わっている(19番のファイルに飲酒運転、20番のファイルに性犯罪被害者診察の指摘)ため、内容で対応づけて適用した。

    • トピックDefinition of death. Post-mortem changes大脳皮質ニューロンが「完全な酸素欠乏から3〜7分で死滅する」を訂正。重度虚血の2〜5分後に無酸素性脱汲が始まるが、この段階はまだ可逆的で不可逆的細胞死の確定はその後である(Dreier 2018, Ann Neurol)。「脳(幹)死は事実上、個体死と同義」を削除し、脳全体の不可逆的かつ完全な機能喪失へ。植物状態を「深昏睡状態」としていた記載を、覚醒能と睡眠覚醒周期が保たれるUWSへ訂正し最小意識状態との区別を追記(Yamamoto 2025)。死体冷却の「約0.8°C/時間」を非線形・断熱条件依存へ(Henssge 1992)。
    • トピックThe early post-mortem interval死体痙攣を「死後硬直とは全く異なる別のプロセス」と断定していた記載を、独立した現象かどうかに議論があり終末期の神経筋活動が早期硬直で固定されたものという連続的理解も提案されている旨へ訂正(Mittal 2026)。直腸温の「最初の3〜4時間は1°C/時間」を二重指数関数的で一定でないと明示(Henssge 1992)。「体温低下は最も有用な指標」を、体温単独より死斑・死後硬直・骨格筋の興奮性を組み合わせた複合法のほうが推定幅が狭いことへ(Henssge 2000)。排尿・精液排出の「ほぼすべての死亡例で」という過剰断定を緩和。
    • トピックThe late post-mortem interval. Estimation of post-mortem interval死蝋の「水中で発見された遺体に最も多い」をさまざまな環境で生じる旨へ、「軟部組織の完全な変化は2年以内」を数百年持続しうる保存的変化へ訂正(Ubelaker 2011)。白骨化「1〜2年以内」の一律断定を緩和(Weisensee 2024)。浸漬・埋葬は「腐敗を遅らせる」だけでなく地表とは別の様式で分解する旨(Pittner 2020)。ミイラ化の条件に乾燥・通風・閉鎖環境を加え、着衣は乾燥を遅らせる方向に働くことを追記(Ceciliason 2023)。
    • トピックEstimating the time of death冷却速度の「約0.8°C/時間」と「環境温度+5°C付近で緩やかになる」を訂正し、Henssgeのノモグラム法とその的中率(実際の死後経過時間が95%信頼区間に入ったのは72.8%、Laplace 2021)を追記。触診の温度×硬さ表と死斑の表に、実際の推定幅がはるかに広い旨の注記(Stigter 2024)。腐敗の進行が初期体温・昆虫の侵入・保管期間で加速すること(Lanzinger 2026)。硝子体液カリウム・超生体反応を含む複合法へ。
    • トピックDetermining the cause of death. Medico-legal investigation of death「病理解剖は変化の記載にとどまる」という対比を、目的の違い(疾患過程の解明 対 司法への応用)へ訂正し両者がしばしば重なることを追記(Kotabagi 2005)。死因診断の情報源に毒物・組織・画像・DNAの補助検査を追加し、肉眼で死因が決まらない症例では組織検査が最終判断を決めること(法医解剖87例で組織検査待ちの23例中21例、Mukherjee 2025)を明記。解剖直後の暫定判断と最終報告の診断が17%で変わる実測を追加(Shergill 2024)。
    • トピックThe autopsy臨床解剖の執刀者を「病理医または法医学専門家1名」から「病理専門医、またはその監督下の研修医」へ訂正(欧州病理学会の実施基準 Alfsen 2022)。同基準が法医解剖を対象外としていることを根拠に、臨床解剖と法医解剖を同義語として扱えないことを明示。執刀者数の基準が法域依存であることと、専任病理医1人あたり年50件・最終報告3週間(追加検査があれば6週間)という最低基準を追記。
    • トピックMethods of identification. Identification of decomposed or skeletonized remains年齢推定の「成人では±5年」を撤回し、実測の誤差幅(人類学的方法4〜25年、歯科的方法2.5〜12.5年、DNAメチル化等±3〜10年、Rojas-Torres 2025)へ。頭蓋縫合と歯の咬耗が最も好まれない方法であること(Garvin 2012)、腸骨耳状面の適用率92%・第4肋骨16%(Morandini 2025)を追記。閉鎖孔による性別判定の正答率が約46〜75%にとどまること(Rennie 2023)。「人種・民族」を人口集団親和性へ改め、報告書に載せること自体に議論がある旨(Gibbon 2025)。身長回帰式の集団依存性(Vercellotti 2009)。
    • トピックSudden death of cardiovascular disorders突然死の定義を目撃例1時間未満・非目撃例24時間未満の二本立てへ(Sheppard 2023)。「自然死が非常に急速である場合、その原因はほぼ常に心血管系」を撤回——院外心停止として届け出られた死亡の40%は実際には突然でも予期しないものでもなく、WHO基準を満たした突然心臓死の約半数は不整脈死でなかった(POST SCD 2018)。陰性剖検にSADSの語と分子剖検・遺族評価を追加。心室肥大や軽度冠動脈疾患などの意義不明所見を死因と読む誤り(Papadakis 2013)。睡眠時無呼吸のリスクが既存心疾患の有無で異なること(Martinez 2024)。「拘束型/閉塞性」という用語の誤りを訂正。
    • トピックSudden death of respiratory and gastrointestinal disorders「呼吸器領域における突然死の主因は血管性」を訂正。肺塞栓症の危険因子を実測へ置換(不動・外傷・手術・帝王切開・精神疾患、曝露から8〜15日がピーク、致死例の87.6%が両側肺門部閉塞、Chen 2023)。死因統計での過小評価(剖検1.6%対統計0.3%、Christensen 2025)と救急での見逃し(Lucena 2009)。消化器の節から「血管性の機序」の限定を外し、最多の機序が消化管穿孔で78.4%に消化器疾患の既往が無いこと(Abderrahim 2022)を追記。
    • トピックSudden infant death剖検の胸腔内点状出血「約70%」を実測(胸腺89.5%・胸膜80%・心外膜79.9%)へ訂正し、「非特異的」という一律断定も是正——非SIDS死亡でも約半数にみられる一方、3部位すべてにあればSIDSを84.9%予測する(Goldwater 2008)。危険因子の重みをアンブレラレビューの等価オッズ比へ(頭部被覆11.01が最大、Kim 2024)。病因仮説の羅列をトリプルリスクモデルと覚醒反応障害中心の整理へ(Carlin 2017)。
    • トピックChild abuse. Safeguarding children身体的虐待の定義から「加害者には人格障害や精神疾患を有する例が多い」という一般化を削除し、評価が損傷の性状・受傷機転との整合・発達段階・多職種評価に基づくこと、AHTの診断が医学的結論であって加害者の意図についての法的判断ではないこと(Choudhary 2018)へ。単独で虐待性と非虐待性を区別できる骨折は無いこと(Kemp 2008)と、歩行前乳児の長管骨骨折のオッズ比15.12(Marletta 2026)。性的虐待の定義を成人加害者に限定しない形へ。
    • トピックTerminology of injuries. Types of injuries帽子のつばラインの法則を補助所見へ格下げ。ベルリンの剖検78例では外耳孔より下方の骨折がむしろ他害例に有意に多く法則と逆で、つばライン帯はどの受傷機転でも大半の症例で巻き込まれていた(Poli 2026)。殴打を支持する追加基準として骨折の左側優位と裂創の数(Kremer 2008)を明記。切創の「通常は皮膚全層を貫く」、刺創の「体腔穿通性」という定義要件の誤りを訂正。
    • トピックSelf-inflicted injury鑑別表の「現場に凶器が残るか」の向きが逆だったのを訂正——凶器が近くに無いことのほうが他害の典型像である(Manso 2021)。ためらい傷を自殺例の74%、防御創を他害例の61%という実測へ(Racette 2008)。体幹前面の刺創の長軸方向、骨・軟骨に達する創、創の部位という予測因子を追加(Brunel 2010)。「遺書は約50%で存在」は検証できず数値を外した。
    • トピックInjury patterns. Documentation of injuries and marks of injury靴底パターンが「加害者の同定」につながるという記載を、受傷機転の推定や履物の評価へ訂正。咬傷分析について、系統的レビューの3分の1が統計学的に有意な結果を示さず咬傷分析のみに依拠しないよう警告していること(Christoloukas 2024)を明記。防御創の部位を実測(手80%・前腕65%・手指40%)と凶器別の性状差(Das 2025)で補強。治療前の写真記録の重要性(Verhoff 2012)。
    • トピックHead and neck injuries脳振盪を「脳浮腫を伴って生じる」「構造的損傷を伴わない意識消失」から、通常は構造的損傷を伴わない一過性の脳機能障害(意識消失は必須でない)へ訂正。びまん性軸索損傷の確定が画像ではなくβ-APP免疫染色による病理診断であること(Davceva 2026)、従来染色での検出率が生存72時間以降に急増すること(Rungruangsak 2021)。硬膜下血腫を一律「緩徐」としていた記載を急性/慢性で分けた。穿通性頸部外傷のゾーン別アプローチが放棄されつつあること(Loss 2025)。
    • トピックSpinal, chest and abdominal injuriesむち打ちを「頸部の過伸展によって生じる」から、第1相で上位頸椎が屈曲し下位頸椎が過伸展するS字状変形を含む二相性運動へ訂正(Panjabi 1998)。CTでの動揺分節と臨床的な奇異呼吸の区別(Seok 2023)。左下位肋骨骨折と脾損傷の対応づけに、実質臓器損傷との関連は中位肋骨のほうが強い点を追加(Rostas 2017)。CPR後骨折の頻度を実測へ(肋骨66.1%・胸骨52.8%、Yamaguchi 2017)。「腎臓と脾臓は血管茎のみで固定されている」という解剖学的誤りを訂正。
    • トピックGunshot injuries出口創を「星芒状・すす等の随伴物質を認めない」と断定していた記載を訂正。shored exit wound では出口創にも擦過輪が生じる(Nishshanka 2026)。bullet wipe は射距離によらず入口創の周囲に残り、煤は接射〜30.5 cmで視認・274 cmでは消失する(Hlavaty 2019)。一時空洞が効くのは主にライフル弾で、非変形の拳銃弾では損傷は弾道に沿う(Stefanopoulos 2017)。射距離と発射残渣量の関係が非線形であること(Cecchetto 2011)。
    • トピックDifferentiation of accident, suicide, or homicide in gunshot injuries「可動範囲内で説明できなければならない」という必要条件的な書き方を緩和し、剖検624例の実測を追加——自殺の89%が接射・近接射(他殺は7.5%)、複数創は自殺5.6%対他殺53.9%、右側頭部の自殺で下向きの弾道は6%(Karger 2002)。眼への銃創でも自殺例は存在するため部位だけで否定しない旨。他害側・自殺側に振れる変数を多変量解析から追加(Karlsson 1999)。現場工作の範囲を血痕分布・遺書・供述・デジタル証拠まで拡張。
    • トピックSexual assault: examination requirements, evidential samples, and documentation診察者を産婦人科医に寄せていた記載を、SANE・法医学看護師を含む「特別な訓練を受けた者」へ改め、重複した診察を避けるべきこと(Ludes 2018)を追記。法医学医が明らかにすべきことを「性交渉の有無」「有形力の有無」という二択から、申告された接触を裏づける所見の評価へ改め、損傷が乏しくても性暴力は否定できない旨を明記。採取されたキットがDNA検査へ提出されない問題(Campbell 2017)。血液検体を紙袋保存と読める記載を訂正。
    • トピックDriving under the influence: drink and drive problems, Widmark's formulaBAC段階表の「結膜下出血」「心房細動」を段階所見から外し、Dubowskiの段階表が個人差を反映して各段階の濃度範囲を意図的に重ねてあること、同じ濃度でも上昇相か下降相かで障害が違うこと(Mellanby効果)を明記(Jones 2024)。致死濃度の目安を実測(中央値3.6‰、90%範囲2.1〜5.0‰)へ。Widmark係数の実測幅(女性0.44〜0.80、男性0.60〜0.87、Seidl 2000)と全身水分量版の優位(Maskell 2020)。逆算が消失相にあることを前提とする旨(Szecsi 2021)。
    • トピックRoad traffic injuries被害者割合の表を普遍値として読ませない注記を追加(歩行者は低所得国45%・高所得国18%、Naci 2009)。歩行者損傷を一次・二次・三次の3段階へ改めた。小児歩行者では年齢によって重症部位が変わりWaddellの三徴が当てはまらないこと(Halari 2022)。バンパー高が上がると下肢損傷が脛骨・膝靱帯から大腿骨へ移ること(Matsui 2005)。むち打ちの単純な過屈曲・過伸展モデルをS字状変形の二相性へ(Panjabi 1998)。
    • トピックRailway injuries, aircraft fatalities線路上で発見された遺体が鉄道外傷による死亡とは限らない旨と、法医病理・法化学・繊維鑑定・遺伝子検査・現場検証を組み合わせる必要性(Amadasi 2023)。航空機事故で「火災が最大の死亡要因のひとつ」という書き方を訂正——一般航空の致死事故で死亡したパイロット559例では鈍的外傷が主死因の86.0%(Wiegmann 2003)。シートベルトと与圧破壊の断定を緩和。調査主体を医療従事者限定から多職種へ。毒物検査に一酸化炭素ヘモグロビンとシアンを追加(Chaturvedi 2010)。
    • トピックClassification of asphyxia, signs of asphyxia溺水を「気道の閉塞」の下位分類から独立した大分類へ移し、標準化された4分類(suffocation/strangulation/mechanical asphyxia/drowning)へ再構成(Sauvageau 2010)。CO中毒・シアン中毒は酸素の移送・利用の障害という別の軸で整理。古典的窒息徴候が非特異的であることと、頸部圧迫による死亡の38%で点状出血を欠く実測(Qin 2025)。頸部の層状剥離の必要性と、決定的な単一所見・手法が無いこと(Porzionato 2024)。
    • トピックTypes of mechanical asphyxial mechanism溺水を独立分類へ、外傷性窒息と体位性窒息を機械的窒息の下で並列へ(Sauvageau 2010)。縊頸と索条絞頸の鑑別表を典型像として書き直し、深頸筋出血の部位差(縊頸は胸鎖乳突筋、索条絞頸は胸骨舌骨筋・胸骨甲状筋)、出血斑の分布、死亡様式を実測で追加(縊頸141例対索条絞頸178例、Jing 2016)。喉頭・舌骨の骨折を認めるのは約17%にとどまる旨。索状痕の生活反応判定の限界(Mansueto 2022)。
    • トピックImmersion deaths: evidence of immersion. Post-mortem artefact and immersion「血中アルコール濃度は必ず確認」を毒物学的検査全般へ。入水前後の自然死について「稀」「心血管疾患が多い」という頻度の断定を緩和。溺水に固有といえる肉眼所見は引き揚げ直後の完全な外部泡沫のみで、他の徴候はすべて溺水以外の水中死亡でもみられる実測(Schneppe 2021)。珪藻検査の証拠価値が確立していないこと(Tyr 2025)と、定量・水試料採取条件・分類同定という要件(Ludes 2025)。
    • トピックPathological diagnosis of drowning. The role of alcohol in drowningアルコールを「間接的な促進因子」に限定していた記載を訂正。致死性溺水の49.46%に関与(Hamilton 2018)、アルコール寄与割合0.31(Alpert 2022)で、気道保持能の低下という直接的な経路も含む多因子として整理。危険因子は男性・ボート・救命胴衣未着用・単独遊泳。死後所見は所見ごとに科学的根拠の強さが異なり、溺水していない浸水遺体という対照群の不足で知見が確立していない旨(Tyr 2024)。
    • トピックInjury caused by heat. Cold injury, hypothermia熱傷深達度の定義を訂正(第3度=皮膚全層、第4度=皮下脂肪以深)し、「第2度B=表皮再生不能・皮膚移植が必要」という断定を緩和。小児の熱傷面積評価にLund and Browder chartを追記。虐待による熱湯損傷の意図性指標5項目(Shields 2025)。熱射病で受動的冷却より能動的冷却(冷水・氷水浸漬が最速)が推奨され体温に作用する薬物は避けるべきこと(Barletta 2025)。低体温の病期分類を改訂スイス病期分類へ——深部体温でなく心停止リスク、AVPU、震えは病期規定徴候から除外(Musi 2021)。ECLS搬送基準を年齢・併存疾患別へ(Paal 2022)。
    • トピックElectrical injury致死機序を心室細動主体へ改め、「直流は心室細動ではなく心静止を起こす」が今も残る誤った定説であること、致死量の電流なら通常1〜2秒で心室細動に至り通電が長いほど危険になるわけではないこと(Kroll 2023)を明記。リヒテンベルク図形が皮膚の一過性の毛細血管拡張であって熱傷ではなく、常在もしないこと(Byard 2023、Pulagura 2025)。電撃損傷例の約3分の2で体表に典型的な電撃痕を認めないこと(Jin 2021)。
    • トピックPrinciples of toxicology致死量を「全ての被験者が死亡する用量」としていた定義とLD50の定義を訂正。血液採取を腸骨・大腿静脈の並列から末梢静脈優先へ改め、中枢血は末梢血が得られない場合の補助資料と位置づけた。採取部位による濃度差(中枢/末梢1.3、長い死後経過では動脈/静脈2.0、Zilg 2017)と、手術側の大腿血でロピバカインが対側の24倍という警告(Oura 2023)。臨床の治療域を死後の参照値として使えないこと(Stephenson 2024、剖検57,903例のLauniainen 2014)。
    • トピックCommonly misused drugs and drug-related deathコカインの死因を「呼吸中枢・循環中枢の抑制」で説明していた記載を心血管系の機序へ訂正し、心毒性が血中濃度と独立していること(死後49例中、完全剖検43例の14例に有意な心疾患、Pilgrim 2013)を追記。メタンフェタミンの心室性不整脈ハザード比1.90(Noubiap 2025)。オピオイド死の41.88%に胃内容の誤嚥があり、誤嚥例では血中濃度がむしろ低いこと(Nicolakis 2020)。LSDの4段階グレード表を重症度による整理へ改め、LSD単独の毒性死が43例中1例にとどまる実測(Darke 2024)。
    • トピックCarbon-monoxide poisoning. Arsenic, cyanide, lead and methanol poisoningメタノール毒性の主因をホルムアルデヒドからギ酸へ訂正し、ギ酸濃度が罹病率・死亡率と直接相関しシトクロム酸化酵素を阻害して眼毒性を起こすこと、12〜24時間の潜伏期があること、解毒補助が葉酸ではなく静注ホリナートであることを明記(AACT実施指針 Barceloux 2002)。「嫌気性代謝でも生成される」を内因性の微量存在と経口摂取が中毒の主因である旨へ。COのシトクロムオキシダーゼ結合に関する断定と高気圧酸素療法のCOHb閾値を緩和。ヒ素の「2形態」を複数の化学種へ、「唯一信頼できる死後変化」という断定を緩和。鉛の好塩基性斑点を「DNAの残骸」とする誤った説明を訂正し、δ-アミノレブリン酸脱水酵素とフェロケラターゼの阻害を追記(Balali-Mood 2021)。煙吸入例へのヒドロキソコバラミン経験的投与の根拠が限定的であること(Jin 2025)。
    • トピックScene examination and evidence recovery. Examination on the scene汚染防止を個人防護具からchain of custody(個別包装・封印・記録・追跡管理)まで広げた。死斑・死後硬直・腐敗変化による死後経過時間の評価が現場では暫定的にとどまる旨。点状出血の機序を静脈圧上昇だけでなく低酸素性内皮障害を含む複数因子へ改め、出現頻度が致死性絞頸の91%に対し非致死性では4%(Sundwall 2025)、検出が時間と部位に左右されること(受傷から平均26時間対61時間、結膜は早期・耳後部は長く残る、Babigian 2026)を追記。
    • トピックForensic DNA analysisPCRが「理論上無制限に増幅できる」という記載を、分解検体では増幅産物の長さそのものが制限される旨へ訂正(Pajnič 2025)。「法医DNA鑑定はコード配列を調べない」という断定を、目的が個人識別にあることと、NGSによりSTRの長さだけでなく配列多型も読まれるようになっている旨へ(Matute 2025)。劣化検体の代替をmtDNAだけとせず、SNP・InDel・miniSTRを併記。InDelの利点(低変異率・短い増幅産物・スタターがない)と分解検体でSTRを上回る検出数(Liu 2022)。mtDNAと核DNAの同時判定(Peng 2025)。
  3. 2026 08.21

    婦人科(topics/gynecology)の全40ノートについて、Consensusが指摘した医学的な誤り・古さを Europe PMC で裏取りしたうえで反映し、出典を付けた。40ノートすべてが着手前は `sources` 0件で、2〜8件(計183件)を新設した。方向が逆だった記載(乳房発育から3年『以内』/『経っても』、TOAのドレナージを抗菌薬不応時にのみ行う、PFMTは軽症のみ有効)や、定義そのものが違っていた記載(FIGO 2023のIA1に『低異型度』条件を付けていた、ICに筋層浸潤なしの要件が抜けていた、葉状腫瘍のマージンを一律1cmとしていた)を優先して直した。採用しなかった指摘は主に3型ある——①Consensusの提示文献が学会抄録・非収載誌で数値を検証できないもの、②Consensus自身が『提示文献には根拠がない』と認めているだけで記載自体は標準的に正しいもの(FIGO 2021外陰癌の病期表、砂粒体、腹膜偽粘液腫の虫垂原発、MTXの授乳禁忌など)、③vaultの方針決定と衝突するもの。③の代表がPCOS→PMOS改称で、Consensusは複数ノートで繰り返し『PMOSはPCOSの誤記』と指摘してくるが、これは検索コーパスが改称前の文献で構成されているために生じる系統的な指摘であり、全件不採用にした(review-flagsに記録)。27〜40の14ノートはサブエージェントに並列で担当させ、親側で見出し数・wikilink増減・lint・出典id重複を全件再検証している。

    • トピックPrimary amenorrhea原発性無月経の定義で方向が逆だった記載を訂正——「乳房発育から3年**以内**に初経がない」を「3年**経っても**初経がない」へ(乳房発育が10歳未満なら5年)。CAISの性腺摘出時期を、前悪性病変6.14%・悪性1.3%でいずれも思春期後という実測に基づき思春期後まで待つ方針とし、46,XY完全型性腺形成不全(診断時に摘出)と書き分けた(Barros 2021)。
    • トピックSecondary amenorrhea早発卵巣不全の診断基準からエストラジオール低値を削除し、FSH >25 IU/L の単回測定で足りることを明示(ESHRE 2024)。プロラクチン測定のhook effectを追記。
    • トピックStein-Leventhal syndrome (PMOS)PCOS→PMOS改称を、56組織・14,360人が参加した多段階の国際コンセンサスとして位置づけ直した(vaultの `lancet-pmos-rename-2026` のclaimにあった「22,000件超」は抄録の実数と食い違うためreview-flagsへ)。思春期の『at risk』カテゴリー、レトロゾールのIPDメタ解析の実数を追加。
    • トピックDysfunctional uterine bleedingPALM-COEINへの読み替え表からAUB-Cが抜けていたのを補った。トラネキサム酸の出血量減少26〜60%と活動性VTEでの禁忌、LNG-IUSがトラネキサム酸より優ること、過多月経の最大20%に遺伝性出血性疾患があることを追加。
    • トピックDysmenorrhea. Premenstrual tensionドロスピレノン配合COCの効果量を実数へ(SMD −0.41、中止のOR 3.41、全有害事象のOR 2.31)。
    • トピックCauses of infertility. The infertile couple妊娠可能期間をWilcox 1995の実測へ(排卵日に終わる6日間、排卵日当日は0.33)。性交後の仰臥位安静の根拠がIUIに限られ、メタ解析は有意差なしであることを明記。
    • トピックExaminations and treatment in infertility治療を原因別に段階づけ、原因不明不妊の第一選択がIUI-OSであることを明示。IVFとIUI-OSの直接比較(50.3% vs 43.2%、HR 1.19で有意差なし、Lai 2024)を追加。Consensus指摘の対応で誤って追加した `###` 見出しは箇条書きへ変換した。
    • トピックHormonal contraception. Intrauterine devicesVTEリスクを製剤別に整理——貼付剤・腟リングは経口以上、DMPAは上昇、LNG-IUS・低用量POPは上昇させない。LNG-IUD vs 銅IUD(Liu 2024)、UPA(Glasier 2010)、緊急避妊としてのLNG-IUDについてTurok 2021とCochrane 2023の食い違いを併記した。
    • トピックBarrier and chemical contraceptives. Natural contraceptive methodsノノキシノール-9の性器病変RR 1.18、女性用コンドームが男性用と同等であることのRCT根拠、FABMの失敗率がSensiplan 1.8からPersona 25.6まで大きく開くことを追加。
    • トピックPuberty8歳未満の二次性徴の大半が正常変異で、4〜6か月での進行速度が鑑別点であること(AAP)を追加。乳房発育の平均年齢が10年あたり約3か月早まっていること、15歳(原発性無月経)と16歳(遅発思春期)が別の枠組みであることを書き分けた。
    • トピックPediatric gynecologyノート01と同じ方向逆転(「乳房発育から3年以内」)を訂正。思春期早発でのMRI適応を男児全例・6歳未満女児で必須、6〜8歳女児は未確立と整理。Turner症候群のエストロゲン開始11〜12歳・2〜3年かけた漸増・経皮エストラジオール優先・結合型エストロゲンは非推奨を追加。
    • トピックMenopauseNAMS 2023が**推奨していない**非ホルモン療法(冷却・誘因回避・運動・ヨガ)を明示。MHTの血管運動症状抑制約75%に対し非ホルモン薬は40〜65%。CGHFBCによる乳癌リスクの定量(E+PでRR 2.08、50歳から5年で約50人に1人)を追加。
    • トピックInflammatory disorders of the vulva and vagina細菌性腟症の男性パートナー治療を2025年NEJMのRCTで更新——12週再発35% vs 63%、女性のみ治療が劣るため試験が早期中止。再発率が3〜6か月で50%超であること、外陰腟カンジダ症の gold standard が培養であること、妊娠中のフルコナゾールを追記。
    • トピックSexually transmitted diseases in female性暴力被害後の抗菌薬予防を「地域により大きく異なり流動的」と枠組み直した(アイルランドのクラミジアPEP 75.1%、HIV PEP 11.0%)。CDC 2021が淋菌の二剤併用を外した論拠、尖圭コンジローマの第一選択(イミキモド・ポドフィロトキシン)、先天梅毒+261%を追加。
    • トピックBenign lesions of the vulva and vagina硬化性苔癬の癌リスクを定量(SIR 16.2(扁平上皮癌)・8.5(前癌病変)で追跡期間とともに減衰しない、累積VSCC 6.7%、VIN合併の有無で18.8% vs 2.8%)。生検適応を広げ、カルシニューリン阻害薬を代替として、Bartholin腺嚢胞にWord catheterを造袋術より先に置いた。
    • トピックMalignant tumors of the vulva and vaginaHPV非依存の前駆病変をdVINだけに限定していたのを訂正——p53野生型の一群(VAAD/DEVIL/VAM、PIK3CA・HRAS変化)が存在し、p16とp53の免疫染色を定型的に行う(Parra-Herran 2022)。dVIN由来の癌はHSIL由来より再発が多く死亡率も高いこと、乳房外Paget病の外陰型は70.3%が表皮内なのに34%が再発するため低侵襲治療+綿密な監視へ向かっていること(Kibbi 2024)を追加。Consensusが問題視したFIGO 2021外陰癌の病期表は、Consensus自身が『提示文献に病期表は載っていない』と認めており実際にFIGO 2021どおりなので変更しなかった。
    • トピックEtiology and precancerous states of cervical cancerCIN 2を「中間の重症度」ではなく性質の違う病変の寄せ集めとして書き直した(HPV E4陽性はLSIL 41%からCIN 3で3%へ低下、p16広範+E4陰性の生検は85%がLEEPでもHSIL以上)。コルポ下生検の陰性を最終結論にしない根拠を追加——細胞診HSILで生検陰性の49例中67.3%がLEEPでHSIL以上(浸潤癌4例含む)、コルポの感度はLSIL+で0.92/HSIL+で0.68。CIN 2の管理を年齢とHPV型で層別化(25〜40歳では24.9%に潜在CIN 3+)。
    • トピックSymptoms, signs and screening of cervical cancer警告症状の重みを実測で差をつけた(閉経後出血のOR 43、55歳以上のPPV 4.6%、それ以外の症状は単独では高リスクといえない)。一次hrHPV優先の根拠をスウェーデンの政策試験で具体化(浸潤癌17%減、HPV陰性者1.3/10万人年 vs 細胞診正常9.1、代償はコルポ紹介7.5% vs 6.9%)。HPV陽性・細胞診陰性が安全域でないこと(16/18陽性で318.2/10万人年)と拡張ジェノタイピングによる型別トリアージを追加。
    • トピックStaging and therapy of cervical cancer. Pathology早期癌の手術を2つの試験で方向づけた——SHAPE(低リスクでは単純子宮全摘が根治的子宮全摘に非劣性、3年骨盤内再発2.52% vs 2.17%、尿失禁4.7% vs 11.0%)とLACC(低侵襲根治的子宮全摘は開腹より4.5年無病生存が劣る、86.0% vs 96.5%)。いずれもノートに欠けていた。週1回シスプラチン40 mg/m²の上乗せ効果、根治的腟式子宮頸部摘出術の実数(再発3.4%・うち43%は5年以降、早産46%)、KEYNOTE-826、組織型別予後(SEER)を追加し、MSI/MMRとPD-L1を同列に並べていた記述をPD-L1中心へ改めた。
    • トピックBenign diseases of the uterus子宮内膜ポリープに盲目的D&Cを用いないこと(level A)、外来子宮鏡が診断精度・費用対効果とも最良であること、無症候性ポリープを一律に切除しないこと(閉経後は2 cm超またはリスク因子)、不妊女性への定型的切除が支持されないことを追加(Vitale 2021)。Asherman症候群の原因に子宮鏡下手術・子宮動脈塞栓術・子宮結核を加え、**再癒着予防も最適治療もエビデンスが不足している**ことを明示。筋腫は妊孕性への影響が主に粘膜下に限られること、治療の実態が手術に偏り比較試験が乏しいことを補った。
    • トピックEtiology and precancerous states of corporal cancer (hyperplasias)リスク因子表を「因果の強さの序列」と読ませない注記を追加——53因子・171メタ解析のアンブレラレビューで強いエビデンスと判定されたのは3つだけ(閉経前BMI RR 1.49、ウエスト・ヒップ比 RR 1.21、経産 RR 0.66)。高血圧が独立因子として弱いこと、喫煙の逆相関が観察研究由来であることを明記。PMOSの機序を黄体期プロゲステロン不足だけに還元していた記述を是正(名称は維持)。4分子群の臨床適用をリスク層別化・補助療法判断に限定し、PORTEC-3の実数(5年無再発生存 p53異常48%/POLE 98%、化学放射線が有効なのはp53異常型のみ)を追加。
    • トピックSymptoms signs and screening of corporal cancer「2026年ACOG更新はTVUSと生検の組合せを推奨」という帰属を撤回し、どちらから入ってもよいという確立した枠組みへ書き換えた(当該文書の抄録では推奨内容を確認できないためreview-flagsへ)。Lynch症候群の監視が国際的に不一致であること、生検の感度57.1%・経腟超音波34.4%で死亡率低下のデータがなく最も確実なのはリスク低減手術であることを追加。
    • トピックStaging and therapy of corporal cancer. PathologyFIGO 2023の病期表を原典で精密化——IA1から誤った「低異型度」条件を削除、IA3を「子宮限局+同時性の低異型度類内膜卵巣病変」へ、ICに**筋層浸潤がない**という要件を明示、IIIA1/2・IIIB1/2・IIIC1/2のi/ii(微小/肉眼的転移)を反映。攻撃的組織型に高異型度類内膜癌・混合型が含まれることを補った。分子分類は表記の修飾ではなく**病期そのものが変わる**(I・II期でp53abnは上がりPOLEmutは下がる)と訂正。免疫療法の上乗せを進行・再発例に限定し、RUBYとメタ解析の実数、HER2陽性漿液性癌へのトラスツズマブ(8.0→12.6か月)を追加。
    • トピックFunctional cysts of ovariesRMIを古典的指標と位置づけ、閉経後ではIOTA ADNEX 10%がRMI1(閾値250)より感度13.9%ポイント高く新標準とすべきとされていること(ROCkeTS)を追加。単純嚢胞の陰性所見としての強さを定量(50歳以上でも尤度比0.10、3年絶対リスク0〜0.5/1000)し、根拠不明だった『2025年RCOG更新で≤3 cmは追跡不要』の帰属を外した。保存的管理の安全性をIOTA5で裏づけ(2年で20.2%が自然消失、浸潤癌0.4%)。超音波所見表から裏づけの弱い『可動性』『固定』を外した。
    • トピックBenign neoplasms of ovariesMeigs症候群を卵巣線維腫に限定していた記述を性索間質性腫瘍全般へ広げ、**CA-125が上昇しうるため卵巣癌と紛らわしい**ことを明示。Brenner腫瘍が偶発発見中心(9例中7例)でWalthard細胞巣を伴い粘液性嚢胞腺腫と併存しうることを追加。成熟嚢胞性奇形腫を「若年女性の卵巣胚細胞腫瘍の69%」と実数化し、卵巣温存の判断軸としてovarian crescent signを導入した。
    • トピックEtiology, clinical presentation and screening of ovarian tumorsHGSCの卵管起源を「多くは」に保ち、すべてのSTICが癌化するわけでもすべてのHGSCがSTIC由来でもないこと、STICの意義が明確なのはBRCA変異保有者でHGSCの85〜90%を占める一般集団では相対的に不明確であることを追加。検診の害を定量(癌のない女性の1〜3%が手術、その3〜15%に主要合併症)。RRSOの適応閾値を生涯リスク4〜5%超と明記し、対象遺伝子にBRIP1・RAD51C/D・Lynch関連を追加、**RRSO後51歳までのHRT**という欠けていた項目を補い、高リスク監視がdownstagingまでで生存利益は未証明であることを示した。
    • トピックStaging and therapy of ovarian neoplasms. PathologyFIGO IIIA1に細胞診・組織診による証明が必要(画像だけでIIIA1としない)ことを明示し、IVBの定義を具体化。ベバシズマブを「併用のみでは無効、維持まで継続して初めてPFSが延びる(14.1 vs 10.3か月)」と方向を補正し、最終解析でITT全体のOSは改善しない(IV期のみ改善)ことを追記。SOLO1のPARP維持(56.0 vs 13.8か月)、CA-125単独で再発治療を開始しない根拠(OV05/55955)、R0の定義と全例遺伝子検査を追加。
    • トピックEndometriosis and adenomyosis経腟超音波(特異度)とMRI(感度)の使い分けを具体化し、普遍的に受け入れられた重症度分類も標準撮像プロトコルも存在しないことを明記。治療表の妊孕性温存行を訂正——ホルモン抑制療法は妊娠希望例には使えず、手術は自然妊娠率を上げうるが卵巣予備能に負の影響がある。不妊の機序が癒着だけでなく慢性炎症・卵巣予備能低下・内膜受容性低下にわたること、腺筋症は画像の進歩で生殖年齢に臨床診断でき内膜症・筋腫との併存が多いことを追加。診断遅延の年数はどの抄録にも無かったため定性記述にとどめた。
    • トピックNormal and abnormal positions of the vagina and uterus (genital prolapse) and their treatment骨盤底筋訓練を「軽症で特に有用」から Stage I〜III で症状軽減・病期1段階改善へ訂正する一方、**周術期にPFMTを足す上乗せ効果は10件中9件のRCTで示されていない**ことを追加。ペッサリーの装着成功率90%超・継続率約60%、無症状例の最長60か月で最大40%が安定または改善、正常女性の最大40%がStage 2であるため病期の数字だけで治療適応を決めないことを明示。POP-Qの6点測定と手技、手術適応の4条件を具体化した。
    • トピックUrinary incontinence22ガイドライン横断で必須とされる基本評価5項目を明示。PORTRET 12年追跡でITTに有意差が出ない理由が理学療法群の86.9%の手術クロスオーバーであること、post hocでは絶対差50.6%で手術有利であることを追加。AUA/SUFUのindex/non-index患者の枠組み、ESTEEMでスリングへの行動療法上乗せがMCIDに届かない(−13.4点、MCID 35点)ことを追記し、無出典だった過活動膀胱の記述をAUA/SUFU 2024の内容へ置き換えた。
    • トピックPelvic inflammatory disease卵管卵巣膿瘍のドレナージを「抗菌薬不応・増大・破裂疑い」に限定していた記述を訂正——**診断時から抗菌薬に加えて併用**し、骨盤内貯留3 cm超は適応(grade B)、重症敗血症型は手術、それ以外は経腟超音波ガイド下穿刺。複雑性PIDの静注レジメンと抗嫌気性菌カバー、メトロニダゾール併用のRCT実数(30日後の子宮内膜嫌気性菌 8% vs 21%)、Mycoplasma genitalium(PIDの10〜25%、NAAT+マクロライド耐性変異検索、モキシフロキサシン)を追加。外来レジメンの地域差も併記した。
    • トピックPelvic pain経腟超音波単独で異所性妊娠を除外できないこと(不確定例は腹腔鏡、未破裂安定例はメトトレキサート)をフロー図に反映。卵巣捻転に術前確定所見が存在せずDoppler単独で判断しない、腹腔鏡の約50%は捻転陰性、壊死様外観でも温存する、小児・思春期では最大46%が正常卵巣に生じることを追加。癒着剥離をレビューではなくRCT本体で否定的に具体化(12か月VAS差3ポイント、p=0.53)。慢性骨盤痛の薬物療法を学際的管理の補助的位置づけへ限定した。
    • トピックEctopic pregnancy判別域3,000 mIU/mLの診断能が感度35%・特異度58%にとどまること、異所性妊娠519例でhCGは病変径とも破裂とも相関せず来院時22.9%に破裂所見・14.4%が循環不安定であることを追加し、**hCG低値を理由に超音波を遅らせない**と明示。同時妊娠を自然約1/30,000→ART後約1/1,000と数値化。メトトレキサートの成功率(初回hCG<5,000でも単回完全消退77.9%)を追加した。
    • トピックBreast diseases葉状腫瘍のマージンを「境界悪性・悪性は一律1 cm」としていたのをWHO grade別に書き分けた——良性は断端陽性でも再切除不要(陰性断端が得られればマージン幅と再発は無相関)、境界悪性は10 mm目標、リンパ節郭清・系統的乳房切除は行わない。乳頭分泌は初期画像陰性で終わらせずMRIへ(原因同定56〜61%、NPV 87〜98.2%)。線維腺腫は一致・異型なしなら画像フォロー不要。「…を伴えば悪性を除外する」という誤読を招く表現を「悪性を疑い除外のための精査を行う」へ修正した。
    • トピックBreast cancerUSPSTF単独だった検診記述に23ガイドラインの系統的レビューとEUSOBI(定期マンモグラフィで乳癌死亡率を少なくとも20%低下)を加え、高リスクMRIの3条件と開始年齢(25〜30歳)を具体化。コア針生検と手術標本の一致率がER 96.7%/PR 93.2%/HER2判定100%に対しグレード72.6%・Ki-67 70.5%と落ちること、サブタイプ別頻度と予後、免疫療法が乳癌全体に効く薬ではないことを追加。非浸潤性小葉腫瘍を「浸潤癌そのものではなく両側乳癌リスクの指標」と明確化した。
    • トピックGynecologic operation techniques (D and C, conisation, hysterectomy, hysteroscopy)円錐切除の術式選択を「治療失敗 vs 早産」のトレードオフとして表化(LLETZ基準でCKCは失敗OR 0.63だが早産OR 2.27、焼灼法は早産を増やさないが失敗が多い)し、産科リスクを決めるのが術式ではなく**円錐の深さ**であることを追加。子宮鏡の灌流液不足量を数値化(生食1,000〜2,500 mLで厳重監視、2,500 mL以上で中止、高齢・心腎疾患では750 mL)。子宮摘出経路をACOG 701の階層(低侵襲優先→経腟第一選択→不可なら腹腔鏡)で明示し、D&Cの遠隔合併症として次回妊娠の早産を追記した。
    • トピックVirilism and hirsutism赤旗に**閉経後発症**を追加し、閉経後のテストステロン>5 nmol/Lを腫瘍除外の目安として明示。原因表に頻度列を新設(PMOS 80〜90%、特発性5〜10%、非古典型CAH 1〜10%)。アンドロゲン値と多毛症の重症度の相関が乏しく**テストステロン正常でも多毛症・PMOSを否定できない**ことを追加。治療にネットワークメタ解析の効果量(抗アンドロゲン −1.29/COC −0.94/インスリン抵抗性改善薬 −0.62)とCochrane(157試験10,550人でメトホルミンは無効、生活介入はBMIを下げても多毛症スコアは改善せず)を入れた。ConsensusのPMOS→PCOS指摘は不採用。
    • トピックHydatidiform molep57免疫染色が分けるのは「全奇胎かそれ以外か」だけで、**p57陰性は全奇胎の確定ではない**(母性11番染色体の残存・喪失、家族性両親性奇胎、モザイク)こと、部分奇胎と非奇胎の区別にはSTR genotypingが要ることを追加。超音波の診断正確度44.38%・形態診断65.97%(κ=0.364)で形態単独に頼らないことを明示。hCG追跡短縮のエビデンス(正常化後GTN 0.2%、56日未満正常化なら確認1回で足りる)を追記した。
    • トピックChoriocarcinoma「組織採取は常には必要でない」の適用範囲を**胞状奇胎後GTNに限定**——絨毛癌一般・PSTT・ETTでは組織診断が重く、子宮外病変では免疫染色・genotypingによる妊娠性/非妊娠性の判定が治療に直結する。WHO 5〜6点では70〜80%が初回単剤に抵抗性(ただし救済で全生存ほぼ100%)であることを数値で補強し、リスク表に転帰の目安列を追加。超高リスクGTNの死亡予測因子と脳転移への照射併用、FIGO≥12でのレジメン別奏効を追記した。
    • トピックPrinciples of cancer therapy併用療法の根拠3点を明示し、**投与順序でも効果が変わる**細胞周期依存性薬剤耐性を追加。耐性が薬剤排出・標的変化・DNA修復亢進・アポトーシス回避・微小環境にわたる多層機序であること、反復照射の選択圧で放射線抵抗性形質が出現することを追記。効果判定では径だけで分子標的薬を測りきれないこと、免疫療法の偽増悪とiRECIST(**試験用**の枠組みである点を明記)、新病変単独の進行が生存延長と関連しないことを追加した。
  4. 2026 08.20

    麻酔科学A-01〜A-10をConsensusレビューと照合し、体液・酸塩基、各種ショック、輸液、敗血症、呼吸不全の主要主張を更新して検証済み引用を追加した。

  5. 2026 08.20

    麻酔科学A-11〜A-19・B-01をConsensusレビューと照合し、呼吸救急、蘇生、ICUケア、薬理、急性腎障害の記述を更新して検証済み引用を追加した。

  6. 2026 08.20

    麻酔科学B-02〜B-11をConsensusレビューと照合し、消化器・代謝・循環・外傷・凝固・神経救急の主要主張を更新して検証済み引用を追加した。

  7. 2026 08.20

    麻酔科学B-12〜B-20をConsensusレビューと照合し、POCUS、電解質、周術期評価、麻酔薬、区域麻酔、疼痛管理の安全事項を更新して検証済み引用を追加した。

  8. 2026 08.20

    生化学01-01〜03-06をConsensusレビューと照合し、アミノ酸・タンパク質、酵素反応、エネルギー代謝の記述を更新して検証済み引用を追加した。

  9. 2026 08.20

    生化学04-01〜05-11をConsensusレビューと照合し、糖質・脂質代謝、糖尿病、リポタンパク、胆汁酸の記述を更新して検証済み引用を追加した。

  10. 2026 08.20

    生化学06-01〜10-02をConsensusレビューと照合し、ステロイド・窒素・ヘム・統合代謝、輸送体・イオンチャネルの記述を更新して検証済み引用を追加した。